rarely be identified beyond the species (or even genus) level,
often impeding inferences on infraspecific processes. On the
other hand, extinct lineages or genotypes cannot be detected
when relying exclusively on samples taken from living specimens,
precluding a direct spatiotemporal analysis. An elegant
solution to this problem has been provided by analysing soil
diaspore banks, which represent living records from past
populations. Successful studies based on these ‘time capsules’
include the circumarctic cotton grass
Eriophorum vaginatum
(McGraw, 1993), the local endemic ground plum
Astragalus
bibullatus
(Morris
et al
., 2002) or the temperate fern
Athyrium
filix-femina
(Schneller, 1998). Even though one viable seed
recovered from a permafrost deposit was claimed to be at least
10 000 yr old (Porsild
et al
., 1967), a
c
. 1300-yr-old lotus fruit
from China seems to be the oldest germinated and directly
14
C-dated fruit known (Shen-Miller, 2002). Unfortunately,
however, such living archives are limited to the few taxa that
produce persistent diaspores and are generally not older than
a few centuries. Therefore, palaeogenetics represents the most
direct approach to unravel the evolutionary history of plant
populations.
Here, we summarize the recent development achieved in
plant aDNA research, examine conditions necessary for the
preservation of DNA in plant tissue and indicate promising
fields of research. We deliberately refrain from thoroughly
dealing with the issue of authenticity, as it has been extensively
elaborated elsewhere (Austin
et al
., 1997; Yang, 1997; Wayne
et al
., 1999; Cooper & Poinar, 2000; Hummel, 2003; Pääbo
et al
., 2004). One of our aims is to show that intraspecific
aDNA studies in plants could provide a link between palaeoecology,
population genetics and phylogeography, which
should improve our understanding of past population processes
in plants.
Publication record of aDNA
A literature search on ISI Web of Science carried out in
October 2004, using ‘ancient DNA’ as search term, retrieved
537 entries. This is by no means exhaustive but it should be
representative of the literature available in the field. Forty-six
of these were excluded as being erroneously listed or just
replies to other articles. Well-known publications on Miocene
plant sequences, on the first archaeo-anthropological DNA
study, and on DNA extraction from the extinct quagga were
not retrieved using this key word combination and therefore
were manually added, giving a total of 496 papers. There
was a continuous, exponential increase in the number of
publications over time. The diversity of organisms investigated
was relatively low, with the bulk of the efforts focusing on
humans (35%), other vertebrate taxa (28%) and microorganisms
(9%; Fig. 1). Only 35 studies (7%) dealt with plant
species, which is less than the 55 review or opinion articles. It
ไม่ค่อยระบุนอกเหนือจากพันธุ์ (หรือแม้แต่สกุล) ระดับมัก impeding inferences กระบวนการ infraspecific ในการไม่สามารถตรวจพบมืออื่น ๆ เชื้อชาติสูญ หรือศึกษาจีโนไทป์เมื่ออาศัยบนถ่ายจากห้องนั่งเล่นไว้เป็นตัวอย่าง ตัวอย่างprecluding การวิเคราะห์ spatiotemporal โดยตรง สวยงามมีการให้แก้ไขปัญหานี้ โดยการวิเคราะห์ดินdiaspore ธนาคาร ซึ่งแสดงระเบียนใช้สอยจากอดีตประชากร สำเร็จการศึกษาตามเหล่านี้ 'ยาแคปซูลเวลา'รวมหญ้าฝ้าย circumarcticEriophorum vaginatum(McGraw, 1993) ท้องถิ่นตรวจดินพลัมAstragalusbibullatus(มอร์ริสet al., 2002) หรือเฟิร์นแจ่มAthyriumอย่างไร femina filix(Schneller, 1998) เมล็ดหนึ่งแม้ทำงานได้กู้คืนจาก permafrost ฝากได้อ้างว่า อย่างน้อย10 000 ปีเก่า (Porsildet al, 1967), การc. ผลไม้บัวอายุ 1300 ปีจากประเทศจีนดูเหมือน จะ เก่าที่สุดเปลือกงอกตรง14C ลงผลไม้เรียก (Shen-มิลเลอร์ 2002) อับอย่างไรก็ตาม เช่นเก็บของนั่งเล่นมีจำกัด taxa ไม่กี่ที่diaspores แบบถาวรและมีอายุโดยทั่วไปไม่เกินกี่ศตวรรษ ดังนั้น palaeogenetics ถึงมากที่สุดวิธีการคลี่คลายประวัติวิวัฒนาการของพืชโดยตรงประชากรที่นี่ เราสรุปการพัฒนาล่าสุดที่ทำได้พืชวิจัยแอดนา ตรวจสอบเงื่อนไขที่จำเป็นสำหรับการอนุรักษ์ของดีเอ็นเอในพืชเนื้อเยื่อ และระบุสัญญาเขตข้อมูลของการวิจัย เราจงใจละเว้นการอย่างละเอียดการจัดการกับปัญหาของแท้ เหมือนได้อย่างกว้างขวางelaborated อื่น (Austinet al., 1997 ยาง 1997 Wayneet al., 1999 คูเปอร์ & Poinar, 2000 Hummel, 2003 Pääboet al., 2004) จุดมุ่งหมายของเราคือการแสดงที่ intraspecificแอดนาศึกษาในพืชอาจมีการเชื่อมโยงระหว่าง palaeoecologyพันธุศาสตร์เชิงประชากรและ phylogeography ซึ่งควรปรับปรุงเราเข้าใจอดีตประชากรกระบวนการในพืชบันทึกสิ่งพิมพ์ของแอดนาเอกสารประกอบการค้นหาบนเว็บวิทยาศาสตร์ ISI ดำเนินใน2547 ตุลาคม การใช้ 'ดีเอ็นเอโบราณ' เป็นคำที่ค้นหา เรียกรายการ 537 นี้โดยไม่หมดแรง แต่มันควรเป็นตัวแทนของวรรณคดีที่ใช้ในฟิลด์ สี่สิบหกเหล่านี้ถูกแยกออก เป็นการแสดงผล หรือเพียงตอบกลับบทความ สิ่งพิมพ์ที่รู้จักกันดีใน Mioceneโรงงานลำดับ DNA archaeo พัณฑ์แรกศึกษา และบนดีเอ็นเอแยกจาก quagga สูญได้ไม่เรียกใช้ชุดคำนี้ดังนั้นได้ด้วยตนเองเพิ่ม ให้จำนวน 496 เอกสารทาง มีมีการเพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่อง เนนในจำนวนสิ่งพิมพ์ช่วงเวลา ความหลากหลายของสิ่งมีชีวิตที่ตรวจสอบค่อนข้างต่ำ มีจำนวนมากของความพยายามที่มุ่งเน้นมนุษย์ (35%), หลอด taxa (28%) และจุลินทรีย์อื่น ๆ(9% Fig. 1) ศึกษาเฉพาะ 35 (7%) ได้ติดต่อกับโรงงานพันธุ์ ซึ่งน้อยกว่า 55 บทความบทวิจารณ์หรือความเห็น มัน
การแปล กรุณารอสักครู่..

ไม่ค่อยจะมีการระบุเกินกว่าสายพันธุ์ (หรือแม้กระทั่งสกุล) ระดับ
มักจะขัดขวางการหาข้อสรุปเกี่ยวกับกระบวนการ infraspecific บน
มืออื่น ๆ ที่ lineages สูญพันธุ์หรือสายพันธุ์ที่ไม่สามารถตรวจพบ
เมื่ออาศัยเฉพาะในกลุ่มตัวอย่างที่นำมาจากตัวอย่างที่มีชีวิต
precluding วิเคราะห์ spatiotemporal โดยตรง สง่างาม
วิธีการแก้ปัญหานี้ได้รับการให้บริการโดยการวิเคราะห์ดิน
ธนาคาร diaspore ซึ่งเป็นตัวแทนของบันทึกที่อยู่อาศัยจากที่ผ่านมา
ประชากร การศึกษาที่ประสบความสำเร็จขึ้นอยู่กับเหล่านี้ 'แคปซูลเวลา'
รวมถึงหญ้าฝ้าย circumarctic
Eriophorum vaginatum
(McGraw, 1993), พื้นถิ่นท้องถิ่นพลัม
Astragalus
bibullatus
(มอร์ริส
, et al
., 2002) หรือพอสมควรเฟิร์น
Athyrium
filix-Femina
(Schneller, 1998) . แม้ว่าหนึ่งเมล็ดทำงานได้
หายไปจากการฝากเงิน permafrost ถูกอ้างว่ามีอย่างน้อย
10 000 ปีเก่า (Porsild
, et al
., 1967)
ค
ผลไม้บัว-1300 ปีเก่า
จากประเทศจีนน่าจะเป็นที่เก่าแก่ที่สุดและงอกโดยตรง
14
ผลไม้ C-ลงวันที่เป็นที่รู้จักกัน (Shen-มิลเลอร์, 2002) แต่น่าเสียดายที่
แต่ที่เก็บที่อยู่อาศัยดังกล่าวจะถูก จำกัด ให้แท็กซ่าไม่กี่แห่งที่
ผลิต diaspores ถาวรและมักจะมีไม่เกิน
สองสามศตวรรษ ดังนั้น palaeogenetics หมายถึงมากที่สุด
วิธีการโดยตรงในการคลี่คลายประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของพืช
ประชากร.
ที่นี่เราสรุปการพัฒนาที่ผ่านมาประสบความสำเร็จใน
การวิจัยพืชadnÃตรวจสอบเงื่อนไขที่จำเป็นสำหรับ
การเก็บรักษาของดีเอ็นเอในเนื้อเยื่อพืชและบ่งบอกถึงแนวโน้ม
ด้านการวิจัย เราจงใจละเว้นจากการได้อย่างทั่วถึง
การจัดการกับปัญหาของความถูกต้องตามที่มันได้รับการอย่างกว้างขวาง
เนื้อหาอื่น ๆ (ออสติน
, et al
, 1997;. ยาง 1997; เวย์น
และคณะ
, 1999;. คูเปอร์และ Poinar 2000; ฮัมเมล, 2003; Pääbo
และ อัล
., 2004) หนึ่งในจุดมุ่งหมายของเราคือการแสดงให้เห็นว่าสำนวน
การศึกษาadnÃในพืชสามารถให้การเชื่อมโยงระหว่าง palaeoecology,
พันธุศาสตร์ประชากรและ phylogeography ซึ่ง
ควรจะปรับปรุงความเข้าใจของเราของกระบวนการที่ผ่านมาประชากร
ในพืช.
บันทึกสิ่งพิมพ์ของadnÃ
ค้นหาวรรณกรรมเกี่ยวกับ ISI เว็บของวิทยาศาสตร์ดำเนิน ออกมาใน
เดือนตุลาคมปี 2004 โดยใช้ 'ดีเอ็นเอโบราณ' เป็นคำที่ค้นหาเรียก
537 รายการ นี้โดยไม่มีหมายถึงหมดจด แต่มันควรจะเป็น
ตัวแทนของวรรณกรรมที่มีอยู่ในสนาม สี่สิบหก
ของเหล่านี้ได้รับการยกเว้นตามที่ถูกระบุอย่างไม่ถูกต้องหรือเพียงแค่
ตอบกลับไปยังบทความอื่น ๆ สิ่งพิมพ์ที่รู้จักกันดีในยุค
ลำดับพืชบนดีเอ็นเอโบราณมานุษยวิทยาครั้งแรก
การศึกษาและการสกัดดีเอ็นเอจาก Quagga สูญพันธุ์ได้
ไม่ดึงมาโดยใช้การรวมคำสำคัญนี้และดังนั้นจึง
มีการเพิ่มด้วยตนเองให้ทั้งหมด 496 เอกสาร มี
อย่างต่อเนื่องได้เพิ่มขึ้นชี้แจงในจำนวน
สิ่งพิมพ์เมื่อเวลาผ่านไป ความหลากหลายของสิ่งมีชีวิตที่มีการสอบสวน
ค่อนข้างต่ำที่มีจำนวนมากของความพยายามที่มุ่งเน้นไปที่
มนุษย์ (35%), แท็กซ่าเลี้ยงลูกด้วยนมอื่น ๆ (28%) และจุลินทรีย์
(9%. รูปที่ 1) เพียง 35 การศึกษา (7%) จัดการกับพืช
ชนิดซึ่งน้อยกว่าการตรวจสอบ 55 หรือบทความแสดงความคิดเห็น มัน
การแปล กรุณารอสักครู่..

แทบจะระบุเกินชนิด ( หรือแม้แต่สกุล ) ระดับ
มักจะทำให้ใช้ในกระบวนการ infraspecific . บนมืออื่น ๆเมื่อ
, สูญพันธุ์ หรือเมื่อไม่สามารถตรวจพบ
เมื่อใช้เฉพาะในตัวอย่างจากชีวิตตัวอย่าง
เลโดยตรง spatiotemporal การวิเคราะห์ เป็นทางออกที่สวยงาม
ปัญหานี้ได้ถูกจัดไว้ให้ โดยวิเคราะห์ธนาคารส่วนแพร่พันธุ์ดิน
,ซึ่งเป็นตัวแทนของประชากรอาศัยอยู่จากประวัติที่ผ่านมา
สําเร็จการศึกษาจากเหล่านี้เวลาแคปซูล '
รวม circumarctic ฝ้ายหญ้า eriophorum vaginatum
( McGraw , 1993 ) , ท้องถิ่นถิ่นพื้นดินดีเลิศ
( bibullatus astragalus มอร์ริส
et al . , 2002 ) หรือเมืองหนาว athyrium เฟิร์น
filix เฟมิน่า
( schneller , 1998 ) ถึงแม้ว่าหนึ่งวางเมล็ด
หายจาก permafrost ฝากอ้างว่าอย่างน้อย 10 , 000 ปีเก่า ( porsild
et al . , 1967 ) ,
c
1300 ปีเก่าโลตัสผลไม้
จากจีนดูเหมือนจะเก่าแก่ที่สุดงอกและผลไม้โดยตรง
c-dated 14 รู้จัก ( Shen มิลเลอร์ , 2002 ) อับ ,
แต่จดหมายเหตุชีวิตดังกล่าวจะถูก จำกัด ไปไม่กี่และที่
ผลิตถาวร diaspores และโดยทั่วไปจะไม่แก่กว่า
ไม่กี่ศตวรรษดังนั้น palaeogenetics หมายถึงที่สุด
ตรงวิธีการแก้ประวัติวิวัฒนาการของประชากรพืช
.
ที่นี่ เราสรุปล่าสุด ความสำเร็จในการพัฒนาวิจัยพืช
แอดนา ตรวจสอบเงื่อนไขที่จำเป็นสำหรับ
รักษาดีเอ็นเอในเนื้อเยื่อพืชและระบุแนวโน้ม
สาขาวิจัย เราจงใจละเว้นจากทั่วถึง
การจัดการกับปัญหาแท้ตามที่ได้รับอย่างกว้างขวาง
elaborated ที่อื่น ( ออสติน
et al . , 1997 ; ยัง , 1997 ; เวย์น
et al . , 1999 ; Cooper & พอยนาร์ , 2000 ; ฮัมเมล , 2003 ; P ääโบ
et al . , 2004 ) หนึ่งในจุดมุ่งหมายของเราคือการแสดงที่เซ็นต์
แอดนา การศึกษาในพืชสามารถให้การเชื่อมโยงระหว่าง palaeoecology
, พันธุศาสตร์ประชากรและ phylogeography ซึ่ง
ควรปรับปรุงกระบวนการความเข้าใจของเราของประชากรในอดีต
ในพืชตีพิมพ์บันทึกของแอ็ดน่า
ค้นหาวรรณกรรมใน ISI Web ของวิทยาศาสตร์ออกมา
ตุลาคม 2547 , การใช้ดีเอ็นเอโบราณ ' ' เป็นคำค้นดึง
537 รายการ นี่คือโดยไม่มีหมายถึงหมดจดแต่ควรจะ
ตัวแทนวรรณกรรมที่มีอยู่ในเขต สี่สิบหก
เหล่านี้ถูกแยกออกเป็น ผลปรากฏ หรือแค่
ตอบกลับไปยังบทความอื่น ๆ สิ่งพิมพ์ที่รู้จักกันดีสมัยไมโอซีน
ลำดับต้นในวันแรกโบราณมานุษยวิทยาศึกษาดีเอ็นเอ
และการสกัดดีเอ็นเอจากควากก้าสูญพันธุ์ถูก
ไม่ได้เรียกใช้คำนี้รวมกันคีย์จึง
ถูกเพิ่มด้วยตนเอง ให้รวมแล้วเอกสาร มี
เป็นอย่างต่อเนื่องเพิ่มขึ้นชี้แจงในจำนวนของ
พิมพ์ตลอดเวลา ความหลากหลายของสิ่งมีชีวิตศึกษา
ต่ำค่อนข้างด้วยกลุ่มของความพยายามเน้น
มนุษย์ ( 35% ) และสัตว์มีกระดูกสันหลังอื่นๆ ( ร้อยละ 28 ) และจุลินทรีย์ ( 9
% ; รูปที่ 1 ) เพียง 35 การศึกษา ( ร้อยละ 7 ) จัดการกับชนิดพืช
ซึ่งน้อยกว่า 55 ทบทวนบทความหรือความคิดเห็น มัน
การแปล กรุณารอสักครู่..
