DNA Preparation and PCR Performance

DNA Preparation and PCR Performance Development of a DNA extraction method feasible for field application. We modified a variety of publicly and commercially available DNA extraction methodologies and kits to be usable in the absence of liquid nitrogen. Our test results show that a commercial Plant/Fungi DNA Isolation Kit when used with
our unique modifications explained in the materials and methods (section 2.2) provided high quality and sufficient yield of genomic DNA from fungi and bacteria. With these modifications, we were able to improve the DNA yield close to the levels with either liquid nitrogen or chemical usage, obtaining 13 mg and 65 mg of DNA per 50 mg of fungal and bacterial biomass, respectively (Table 3). While the quantity of microbial genomic DNA extracted by the improved method is not as effective as conventional in-lab
protocols, the yield obtained was sufficient for PCR based
diagnostics.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การเตรียมดีเอ็นเอและพัฒนาประสิทธิภาพของ PCR ดีเอ็นเอแยกวิธีเป็นไปได้สำหรับเขตข้อมูลโปรแกรมประยุกต์ เราปรับวิธีการสกัดดีเอ็นเอและชุดจะสามารถใช้ประโยชน์ได้ของไนโตรเจนเหลวพร้อมใช้งานในเชิงพาณิชย์ และสาธารณะ ผลการทดสอบของเราแสดงว่าค้าพืช/เชื้อราดีเอ็นเอแยกชุดเมื่อใช้กับปรับเปลี่ยนเฉพาะของเราที่อธิบายในวัสดุและวิธีการ (ส่วน 2.2) ให้คุณภาพและผลผลิตที่เพียงพอของ genomic DNA จากเชื้อราและแบคทีเรีย มีการปรับเปลี่ยนเหล่านี้ เราไม่สามารถปรับปรุงผลผลิตดีเอ็นเอใกล้ระดับไนโตรเจนเหลวหรือสารเคมีการใช้งาน ได้รับ 13 มิลลิกรัมและ 65 มิลลิกรัมของดีเอ็นเอต่อเชื้อแบคทีเรีย และเชื้อราชีวมวล 50 มก.ตามลำดับ (ตาราง 3) ในขณะที่ปริมาณของจุลินทรีย์ genomic DNA ที่สกัด โดยวิธีการปรับปรุงไม่มีประสิทธิภาพที่ธรรมดาในห้องปฏิบัติการโปรโตคอล ผลตอบแทนที่ได้รับก็เพียงพอสำหรับใช้ PCRวินิจฉัย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ดีเอ็นเอการเตรียมและ PCR การพัฒนาประสิทธิภาพการทำงานของวิธีการสกัดดีเอ็นเอความเป็นไปได้สำหรับการประยุกต์ใช้สนาม เรามีการปรับเปลี่ยนความหลากหลายของสาธารณชนและใช้ได้ในเชิงพาณิชย์วิธีการสกัดดีเอ็นเอและชุดที่จะใช้งานในกรณีที่ไม่มีไนโตรเจนเหลว ผลการทดสอบของเราแสดงให้เห็นว่าพืชในเชิงพาณิชย์ /
เชื้อราดีเอ็นเอแยกชุดเมื่อใช้กับการปรับเปลี่ยนเป็นเอกลักษณ์ของเราที่อธิบายไว้ในวัสดุและวิธีการ(มาตรา 2.2) ให้มีคุณภาพสูงและผลผลิตที่เพียงพอของดีเอ็นเอจากเชื้อราและแบคทีเรีย มีการปรับเปลี่ยนเหล่านี้เราสามารถที่จะเพิ่มผลผลิตดีเอ็นเอใกล้เคียงกับระดับที่มีทั้งไนโตรเจนเหลวหรือการใช้สารเคมีที่ได้รับ 13 มิลลิกรัมและ 65 มิลลิกรัมของดีเอ็นเอละ 50 มิลลิกรัมของเชื้อราและแบคทีเรียชีวมวลตามลำดับ (ตารางที่ 3) ในขณะที่ปริมาณของดีเอ็นเอของจุลินทรีย์สกัดโดยวิธีการที่ดีขึ้นไม่เป็นผลเช่นเดียวกับในห้องปฏิบัติการทั่วไปโปรโตคอลอัตราผลตอบแทนที่ได้รับก็เพียงพอสำหรับ PCR ตามการวินิจฉัย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การเตรียมดีเอ็นเอและการพัฒนาประสิทธิภาพของการสกัดดีเอ็นเอด้วยวิธี PCR ที่เป็นไปได้สำหรับเขตข้อมูลโปรแกรมประยุกต์ เราแก้ไขความหลากหลายของสาธารณชนและวิธีการสกัดดีเอ็นเอที่สามารถใช้ได้ในเชิงพาณิชย์และชุดเพื่อให้สามารถใช้งานได้ในการขาดงานของไนโตรเจนเหลว ผลการทดสอบของเราแสดงให้เห็นว่าการค้าพืช / เชื้อราเมื่อใช้กับ
ชุดการสกัดดีเอ็นเอการปรับเปลี่ยนเฉพาะของเรา อธิบายในวัสดุและวิธีการ ( มาตรา 2.2 ) ให้คุณภาพและผลผลิตที่เพียงพอของ genomic DNA จากเชื้อราและแบคทีเรีย กับการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้ เราก็สามารถที่จะเพิ่มผลผลิตดีเอ็นเอใกล้เคียงกับระดับด้วยไนโตรเจนเหลว หรือใช้สารเคมี ได้รับ 13 65 มิลลิกรัมต่อมิลลิกรัมและดีเอ็นเอของเชื้อรา แบคทีเรีย ปริมาณ 50 มิลลิกรัม ตามลำดับ ( ตารางที่ 3 )ในขณะที่ปริมาณของจุลินทรีย์ดีเอ็นเอที่สกัดโดยการปรับปรุงวิธีการไม่เป็นผลเป็นปกติในแล็บ
โปรโตคอล ผลตอบแทนที่ได้รับก็เพียงพอสำหรับตรวจวินิจฉัยตาม
.