Like non-specific general diffusion pores, also specific LamB forms trimeric
pore structures in the outer membrane of bacteria. However, high-resolution crystal
structures from the groups of Schirmer and Rosenbusch showed that in contrast to the
16 stranded antiparallel β-barrel of e.g. OmpF monomers, LamB monomers are made
of an 18 stranded antiparallel β-barrel (Dutzler et al., 1996; Meyer et al., 1997;
Schirmer et al., 1995). Long loops protruding from the structure into the cell exterior
and short turns directed towards the periplasm were also identified. As for OmpF-type
porins, a constriction zone (pore narrowing) is formed by the inward folded loop L3.
But with LamB, additional loops, namely the loops L1 and L6, further restrict the
channel width.
The most remarkable attribute identified in the X-ray LamB structure was a
successive sequence of aromatic residues including Trp74, Tyr41, Tyr6
, Trp420, Trp358
,
Phe227 that are arranged inside the channel along a left-handed helical path. This
stretch of aromatic residues was named the “greasy slide” and actually is believed to
be the structural element responsible for substrate binding and specificity. A chain of
polar residues (namely, Arg8
, Arg33, Glu43, Arg82, Arg109, Asp111, Asp116), the socalled
polar track, is also situated around the constriction site and plays an important
role in maltose and maltodextrin translocation. Figure 1.5 shows a cross-sectional
representation of the LamB monomer that gives an idea about the relative location of
its internal greasy slide and polar track
Like non-specific general diffusion pores, also specific LamB forms trimericpore structures in the outer membrane of bacteria. However, high-resolution crystalstructures from the groups of Schirmer and Rosenbusch showed that in contrast to the16 stranded antiparallel β-barrel of e.g. OmpF monomers, LamB monomers are madeof an 18 stranded antiparallel β-barrel (Dutzler et al., 1996; Meyer et al., 1997;Schirmer et al., 1995). Long loops protruding from the structure into the cell exteriorand short turns directed towards the periplasm were also identified. As for OmpF-typeporins, a constriction zone (pore narrowing) is formed by the inward folded loop L3.But with LamB, additional loops, namely the loops L1 and L6, further restrict thechannel width.The most remarkable attribute identified in the X-ray LamB structure was asuccessive sequence of aromatic residues including Trp74, Tyr41, Tyr6, Trp420, Trp358,Phe227 that are arranged inside the channel along a left-handed helical path. Thisstretch of aromatic residues was named the “greasy slide” and actually is believed tobe the structural element responsible for substrate binding and specificity. A chain ofpolar residues (namely, Arg8, Arg33, Glu43, Arg82, Arg109, Asp111, Asp116), the socalledpolar track, is also situated around the constriction site and plays an importantrole in maltose and maltodextrin translocation. Figure 1.5 shows a cross-sectionalrepresentation of the LamB monomer that gives an idea about the relative location ofits internal greasy slide and polar track
การแปล กรุณารอสักครู่..
เช่นเดียวกับที่ไม่เฉพาะเจาะจงรูขุมขนการแพร่กระจายโดยทั่วไปยัง LAMB เฉพาะรูปแบบ trimeric
โครงสร้างรูขุมขนในเยื่อหุ้มชั้นนอกของเชื้อแบคทีเรีย แต่ความละเอียดสูงคริสตัล
โครงสร้างจากกลุ่มของ Schirmer และ Rosenbusch แสดงให้เห็นว่าในทางตรงกันข้ามกับ
16 ควั่น antiparallel β-บาร์เรลเช่น OmpF โมโนเมอร์, โมโนเมอร์เนื้อแกะจะทำ
ของ 18 ควั่น antiparallel β-บาร์เรล (Dutzler et al., 1996 ; เมเยอร์, et al, 1997;.
Schirmer, et al, 1995). ลูปยาวยื่นออกมาจากโครงสร้างภายนอกเข้าไปในเซลล์
และเปลี่ยนสั้นโดยตรงต่อ periplasm ยังถูกระบุ สำหรับ OmpF ชนิด
porins โซนหดตัว (รูขุมขนตีบ) จะเกิดขึ้นโดย L3 ห่วงพับเข้าด้านใน.
แต่ด้วยเนื้อแกะ, ลูปเพิ่มเติมคือลูป L1 และ L6 ต่อการ จำกัด
ความกว้างช่อง.
คุณลักษณะที่โดดเด่นที่สุดที่ระบุไว้ใน โครงสร้าง LAMB X-ray เป็น
ลำดับต่อเนื่องของตกค้างหอมรวมทั้ง Trp74, Tyr41, Tyr6
, Trp420, Trp358
,
Phe227 ที่จะจัดภายในช่องทางตามเส้นทางลานมือซ้าย นี้
ยืดของตกค้างหอมเป็นชื่อ "สไลด์เลี่ยน" และที่จริงก็เชื่อว่าจะ
เป็นองค์ประกอบโครงสร้างผู้รับผิดชอบสำหรับพื้นผิวที่มีผลผูกพันและความจำเพาะ ห่วงโซ่ของ
ตกค้างขั้วโลก (กล่าวคือ Arg8
, Arg33, Glu43, Arg82, Arg109, Asp111, Asp116) ที่ socalled
ติดตามขั้วโลกยังตั้งอยู่รอบเว็บไซต์รัดและมีบทบาทสำคัญ
ในบทบาทมอลโตสและ maltodextrin โยกย้าย รูปที่ 1.5 แสดงให้เห็นถึงตัด
เป็นตัวแทนของโมโนเมอร์เนื้อแกะที่ช่วยให้ความคิดเกี่ยวกับสถานที่ที่ญาติของ
สไลด์เลี่ยนภายในและติดตามขั้วโลก
การแปล กรุณารอสักครู่..
ชอบชนิดกระจายทั่วไปรู ยังแกะเฉพาะรูปแบบ trimericโครงสร้างรูพรุนในเนื้อเยื่อชั้นนอกของแบคทีเรีย อย่างไรก็ตาม ความละเอียดสูง คริสตัลโครงสร้างของกลุ่มและ rosenbusch เชอร์เมอร์พบว่าในทางตรงกันข้ามกับ16 ไปทิศทางตรงกันข้ามบีตา - บาร์เรล เช่นแกะแบบทำ ompf โมโนเมอร์จาก 18 ไปทิศทางตรงกันข้ามบีตา - บาร์เรล ( dutzler et al . , 1996 ; เมเยอร์ et al . , 1997 ;เชอร์เมอร์ et al . , 1995 ) ลูปยาวยื่นออกมาจากโครงสร้างภายนอกเข้าไปในเซลล์และสั้นเปิดโดยตรงต่อ periplasm ยังระบุ ตามประเภท ompfporins , โซนตีบ ( ลดรูขุมขน ) เกิดจากด้านในพับวง L3 .แต่กับแกะ ลูป ลูปเพิ่มเติมคือ L1 และ l6 เพิ่มเติม จำกัดความกว้างช่องสัญญาณที่น่าทึ่งที่สุดที่ระบุไว้ในแอตทริบิวต์เอกซเรย์โครงสร้างเป็นแกะลำดับต่อเนื่องของตกค้าง รวมทั้ง trp74 tyr41 tyr6 , หอม ,trp420 trp358 , ,,phe227 ที่จัดเรียงอยู่ในช่องทางตามมือซ้าย 5 เส้นทาง นี้ยืดตกค้างหอมเป็นชื่อ " เลี่ยนเลื่อน " และเป็นจริง เชื่อว่าเป็นองค์ประกอบของโครงสร้างพื้นผิวและรับผิดชอบ binding specificity ห่วงโซ่ของขั้วโลก ( arg8 ตกค้างคือarg33 glu43 arg82 , , , , arg109 asp111 ) , , , asp116 ลากข้างติดตามขั้วโลกยังตั้งอยู่รอบ ๆเว็บไซต์และการเล่นที่สำคัญบทบาทในมอลโตสและ maltodextrin โยกย้าย . รูปที่ 1.5 แสดงภาคตัดขวางการเป็นตัวแทนของลูกแกะ มอนอเมอร์ที่ช่วยให้ความคิดเกี่ยวกับสถานที่ตั้งของญาติสไลด์ลื่นของภายใน และติดตาม โพลาร์
การแปล กรุณารอสักครู่..