The list of putative applications of the derivative
methods to pressure-induced conformational studies
is certainly longer. However, the interpretation of the
results remains sometimes di¤cult ^ even at atmospheric
pressure ^ as pointed out by Kornblatt et al.:
`How do the various aromatic residues of a protein
contribute to the overall UV spectrum of the protein?'
[50]. The overall derivative spectrum of a protein
is the sum of the individual derivative spectra
just as the overall UV spectrum of a protein is the
sum of its component parts. In a deep study on two
proteins as models: the 7 kDa Sso 7d from S. solfataricus
(already mentioned above) and mutants from
the 13 kDa iso-1-cytochrome c from Saccharomyces
cerevisiae, the Kornblatt group used fourth derivative
spectroscopy to evaluate the spectral contribution.
The Sso 7d protein has two tyrosines and one
tryptophan; the mutant forms of the 13 kDa iso-1-
cytochrome c contain a single tryptophan and three
tyrosines. They found that, if the tryptophan spectrum
was not exceptional, the comparable tyrosine
spectra were more complex: the derivative spectrum
of individual tyrosines does not correspond to that
expected on the basis of concentration. The individual
tyrosines spectra of proteins may or may not
di¡er from those in water or other solvents.
The e¡ects of pressure on fourth derivative spectra
(much as the same temperature e¡ects) are interpreted
with di¤culty. In order to have as accurate
as possible a view on the pressure e¡ects on the protein
structure, other techniques should be applied
simultaneously. The fourth derivative method must
be used jointly, when possible, with other spectroscopic
methods such as £uorescence, 8-anilinonaphthalene-
1-sulfonate binding, CD, Fourier transform
infrared or Raman. This has been generally the case
for most of the examples given above.
รายการของโปรแกรมประยุกต์ putative ของอนุพันธ์วิธีการทำให้เกิดความดันศึกษา conformationalมีความยาวแน่นอน อย่างไรก็ตาม การตีความการผลลัพธ์ยังคงบาง di¤cult ^ แม้ในบรรยากาศความดัน ^ ที่ชี้ให้เห็นโดย Kornblatt et al.:' ไรตกหอมต่าง ๆ ของโปรตีนนำไปสู่คลื่น UV โดยรวมของโปรตีน?'[50] การสเปกตรัมอนุพันธ์รวมกับโปรตีนเป็นผลรวมของแรมสเป็คตราการพัฒนาแต่ละเพียง UV รวมสเปกตรัมของโปรตีนเป็นผลรวมของส่วนประกอบของ ในการศึกษาลึก 2โปรตีนเป็นรุ่น: 7 kDa Sso 7d จาก S. solfataricus(แล้วดังกล่าวข้างต้น) และสายพันธุ์จาก13 kDa iso-1-cytochrome c จาก Saccharomycescerevisiae กลุ่ม Kornblatt ใช้อนุพันธ์อันดับสี่กประเมินผลสเปกตรัมโปรตีน 7d Sso มี tyrosines สองและหนึ่งทริปโตเฟน แบบกลายพันธุ์ iso 13 kDa-1 -cytochrome c ประกอบด้วยทริปโตเฟนเดียวและสามtyrosines พวกเขาพบว่า ถ้าสเปกตรัมทริปโตเฟนไม่โดดเด่น tyrosine เปรียบเทียบได้แรมสเป็คตราซับซ้อน: สเปกตรัมอนุพันธ์ของแต่ละ tyrosines ไม่ตรงกับที่คาดว่าตามความเข้มข้น แต่ละคนtyrosines แรมสเป็คตราของโปรตีนอาจ หรืออาจไม่di¡er จากในน้ำหรือสารทำละลายอื่น ๆE¡ects ของความดันบนสี่พัฒนาแรมสเป็คตรา(ถึง e¡ects อุณหภูมิเดียวกัน) การแปลความหมายwith di¤culty. In order to have as accurateas possible a view on the pressure e¡ects on the proteinstructure, other techniques should be appliedsimultaneously. The fourth derivative method mustbe used jointly, when possible, with other spectroscopicmethods such as £uorescence, 8-anilinonaphthalene-1-sulfonate binding, CD, Fourier transforminfrared or Raman. This has been generally the casefor most of the examples given above.
การแปล กรุณารอสักครู่..
