Aromaticity and hydrophobicity dete

Aromaticity and hydrophobicity determines the variation in codon usages (Lobry and Gautier, 1994). Aromaticity and hydrophobicity correlation analysis were related to the first two axes of COA and are used to determine whether selection pressure contributes to codon usage variation. Our analysis showed that aromaticity was negatively correlated to the axis 1 (r = −0.282, P b 0.001) and not related to axis 2. The GRAVY was positively correlated with axis 1 (r = 0.207, P b 0.017) and not correlated to axis 2. The AI was not correlated with axis 1 but was negatively correlated to axis 2 (r = −0.176, P b 0.044). The results indicate that the aromaticity, GRAVY and AI are associated with codon usage variation in RABV ‘G’ gene. By seeing the patterns in Nc, GC3, GRAVY, aromaticity and AI, mutational pressure is more important than natural selection pressure in case of RABV ‘G’ gene. More appropriately, CAI and Nc have not shown any significant correlation, suggesting minor involvement of natural selection (Supplementary Fig. 1A). Similar, pattern was observed in the analysis of ‘N’ gene of RABV suggesting that the mutational pressure is major player in the codon usage of RABV (Supplementary Fig. 1B).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Aromaticity และ hydrophobicity กำหนดเปลี่ยนแปลงในรหัสพันธุกรรมประเพณี (Lobry และ Gautier, 1994) Aromaticity และการวิเคราะห์สหสัมพันธ์ hydrophobicity เกี่ยวข้องกับแกนสองของ COA และจะใช้เพื่อกำหนดว่า ความดันเลือกก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงการใช้งานของรหัสพันธุกรรม วิเคราะห์พบว่า aromaticity ถูกส่งสัมพันธ์แกน 1 (r = −0.282, P b 0.001) และไม่เกี่ยวข้องกับแกน 2 น้ำเกรวี่มีความสัมพันธ์กับแกน 1 เชิงบวก (r = 0.207, P b 0.017) และไม่สัมพันธ์กับแกน 2 AI ไม่ได้สัมพันธ์กับแกน 1 แต่มีความสัมพันธ์ในเชิงลบแกน 2 (r = −0.176, P b 0.044) ผลการระบุเกี่ยวข้องกับรูปแบบการใช้งานรหัสพันธุกรรมในยีน RABV 'G' aromaticity น้ำเกรวี่และ AI โดยเห็นรูปแบบ Nc, GC3 น้ำเกรวี่ aromaticity และ AI, mutational ดันเป็นสำคัญมากกว่าความดันคัดเลือกโดยธรรมชาติในกรณียีน RABV 'G' เหมาะ CAI และ Nc มีไม่แสดงสหสัมพันธ์มีนัยสำคัญ การแนะนำการมีส่วนร่วมเล็กน้อยของการคัดเลือกโดยธรรมชาติ (รูปเสริม 1A) คล้าย รูปแบบถูกตรวจสอบในการวิเคราะห์ยีนเอ็นของ RABV แนะนำความดัน mutational เล่นหลักในการใช้งานรหัสพันธุกรรมของ RABV (รูปเสริม 1B)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เป็น aromatic และไฮโดรกำหนดรูปแบบในประเพณี codon (Lobry และโกติเยร์, 1994) เป็น aromatic และความสัมพันธ์ hydrophobicity การวิเคราะห์ที่เกี่ยวข้องกับทั้งสองแกนแรกของ COA และมีการใช้เพื่อตรวจสอบว่าดันเลือกที่ก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลง codon การใช้งาน การวิเคราะห์ของเราแสดงให้เห็นว่าเป็น aromatic มีความสัมพันธ์เชิงลบกับแกน 1 (r = -0.282, p B 0.001) และไม่เกี่ยวข้องกับแกน 2. น้ำเกรวี่มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับแกน 1 (r = 0.207, p B 0.017) และไม่ได้มีความสัมพันธ์กับ แกน 2. AI ไม่ได้มีความสัมพันธ์กับแกน 1 แต่เป็นความสัมพันธ์เชิงลบกับแกน 2 (r = -0.176, p B 0.044) ผลการวิจัยพบว่าเป็น aromatic ที่น้ำเกรวี่และ AI ที่เกี่ยวข้องกับรูปแบบการใช้งานใน codon ยีน RABV 'G' โดยเห็นในรูปแบบ NC, GC3 เกรวี่เป็น aromatic และ AI, ความดัน mutational มีความสำคัญมากกว่าความดันการคัดเลือกโดยธรรมชาติในกรณีของยีน RABV 'G' เพิ่มเติมอย่างเหมาะสมบทเรียนคอมพิวเตอร์ช่วยสอนและ Nc ยังไม่ได้แสดงความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญใด ๆ ที่แสดงให้เห็นการมีส่วนร่วมเล็ก ๆ น้อย ๆ ของการคัดเลือกโดยธรรมชาติ (เสริมรูป. 1A) ที่คล้ายกันรูปแบบที่เป็นข้อสังเกตในการวิเคราะห์ยีน 'N' ของ RABV บอกว่าความดัน mutational เป็นผู้เล่นหลักในการใช้งานของ codon RABV (การเสริมรูป. 1B)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พระบรมวงศ์เธอไม่ชอบเป็นตัวการส่งเสริมและการใช้ ( และ lobry โกติเยร์ , 1994 ) พระบรมวงศ์เธอ และการวิเคราะห์สหสัมพันธ์ไม่ชอบมีความสัมพันธ์กับสองแกนแรกของ COA และจะใช้เพื่อตรวจสอบว่า การจัดสรรการใช้งาน codon เปลี่ยนแปลงความดัน . การวิเคราะห์ของเราแสดงให้เห็นว่าความเป็นอะโรมาติกคือความสัมพันธ์กับแกน 1 ( r = − 0.282 P B 001 ) และไม่มีความสัมพันธ์กับแกน 2 น้ำเกรวี่มีความสัมพันธ์ทางบวก กับแกน 1 ( r = 0.207 P B 0.017 ) และไม่มีความสัมพันธ์กับแกน 2 ไอ ไม่มีความสัมพันธ์กับแกน 1 แต่ก็มีความสัมพันธ์กับแกน 2 ( r = − 0.236 , p B 0.044 ) ผลการศึกษาพบว่า พระบรมวงศ์เธอ , น้ำเกรวี่และ AI ที่เกี่ยวข้องกับการส่งเสริมการใช้ rabv " g " ยีน ได้เห็นรูปแบบใน NC gc3 , เกรวี่ , พระบรมวงศ์เธอและ AI , ความดันซึ่งเปลี่ยนแปลงสำคัญกว่าการเลือกธรรมชาติความดันในกรณีของ rabv " g " ยีน เพิ่มเติมอย่างเหมาะสมคอมพิวเตอร์ช่วยสอนและ NC ไม่ได้แสดงความสัมพันธ์ใด ๆ จะเกี่ยวข้องกับเล็กน้อยของการคัดเลือกโดยธรรมชาติ ( เพิ่มเติมรูปที่ 1A ) คล้ายรูปแบบพบว่าในการวิเคราะห์ยีนของ " N " rabv บอกว่าความดันซึ่งเปลี่ยนแปลงเป็นผู้เล่นหลักในการส่งเสริมการใช้ rabv ( เพิ่มเติมรูป 1B )