ใน 24 ชั่วโมงแรก ทารกแรกเกิดอาจต้องเปลี่ยนผ้าอ้อมอย่างน้อยวันละ 6 – 8 ครั้ง แต่ถ้าได้กินนมผสม ก็อาจเปลี่ยนผ้าอ้อมถึงวันละ 10 ครั้ง เพราะในนมผสมมีของเหลวมากกว่านมแม่ ทารกแรกเกิดจะมีการขับถ่ายอุจจาระ วันละ 1-2 ครั้ง หลังเกิด อุจจาระที่ออกมาครั้งแรก เรียกว่า ขี้เทา (meconium) ซึ่งการที่ทารกแรกเกิดขับถ่ายขี้เทาออกมา จะเป็นสัญญาณที่ดี แสดงให้เห็นว่าระบบขับถ่ายทำงานปกติ อุจจาระที่ขับถ่ายออกมาครั้งแรกจะมีสีดำคล้ายน้ำมันดิน ซึ่งถูกสร้างขึ้นจาก เมือก น้ำคร่ำ และทุกสิ่งทุกอย่างที่ทารกแรกเกิดกินเข้าไปขณะที่อยู่ในมดลูกของแม่
ถ้าทารกแรกเกิดกินนมแม่ที่สร้างขึ้นครั้งแรก เรียกว่า นมน้ำนมเหลืองหรือหัวน้ำนม (Colostrum) จะช่วยป้องกันการติดเชื้อ และช่วยขับขี้เทา (meconium) ออก เมื่อสามวันหลังจากคลอดแล้ว อุจจาระของทารกแรกเกิดจะค่อยๆเปลี่ยนแปลงไป โดยอุจจาระของทารกแรกเกิดจะมีสีอ่อนลงวันต่อวัน คือ จะเปลี่ยนจากสีเขียวปนสีน้ำตาล เป็นสีเหลืองสว่างหรือสีเหลืองมัสตาร์ด สังเกตเห็นว่าพื้นผิวของอุจจาระจะเหนียวน้อยลง และเตรียมจะกลายเป็นสีเหลือง มีกลิ่นหอมหวานเล็กน้อย อุจจาระอาจมีลักษณะเป็นเม็ดคล้ายโฮลเกรนมัสตาร์ด (มัสตาร์ด แบบเมล็ดบดหยาบ)
ทารกแรกเกิดที่กินนมขวดมักจะอุจจาระไม่กี่ครั้งต่อวัน แต่ก็สามารถอุจจาระได้ตั้งแต่หนึ่งครั้งต่อวันไปจนถึง หลายครั้งต่อวัน เช่นเดียวกับอุจจาระของทารกแรกเกิดที่กินนมแม่ โดยสีจะแตกต่าง คือจากสีเหลืองอ่อนเป็นสีน้ำตาลอมเหลือง อุจจาระของทารกแรกเกิดอาจเหมือนผู้ใหญ่ถ้าให้กินนมผสม คือ อุจจาระจะใหญ่ คล้ายแป้งเปียก และกลิ่นแรงกว่า โดยนมผสมไม่สามารถย่อยสลายได้เต็มที่เหมือนกับนมแม่ซึ่งหมายความว่าทารกแรกเกิดที่กินนมขวดมีแนวโน้มที่จะท้องผูกง่าย และถ้าอุจจาระของทารกแรกเกิดมีเมือกสีขาวหรือลายเส้นหรือเกล็ดสีแดง ซึ่งสีแดงในอุจจาระ เป็นสัญลักษณ์ของเลือด บ่งบอกได้ว่ามีปัญหา