Strain SR14.14T was isolated from t

Strain SR14.14T was isolated from the rhizospheric soil of rubber tree using the spread plate method on starch casein agar,6 supplemented with ketokonazole (100 μg ml−1) and nalidixic acid (25 μg ml−1). The plates were incubated at 28 °C for 2 weeks. The strain was purified and maintained on glucose yeast extract (GYE) agar (containing glucose 1.0% (w/v), yeast extract 1.0% (w/v) and agar 1.5% (w/v)) at room temperature. Suspensions of spores or mycelium were stored at −20 °C in 20% glycerol and lyophilized for long-term preservation. Sphaerisporangium album DSM 45172T was used in this study for comparison purposes.

Cultural characteristics were determined using 14-days culture on ISP media 2, 3, 4 and 5 of Shirling and Gottlieb7 (Difco, Detroit, MI, USA) oatmeal-nitrate agar (JCM medium 52; Difco) and yeast-starch agar (JCM medium 42; Difco) at 27 °C. The color of mycelium and soluble pigment were determined by comparison with the color of chips in the Color Harmony Manual.8 The morphological characteristics were observed by light microscopy and scanning electron microscopy (JEOL-JSM 5600 LV, Japan) of 14-day-old cultures grown on ISP medium 3. Motility was observed with a light microscope using cells grown on ISP medium 2 for 14 days and incubated in soil-extracted solution (5 g garden soil in 25 ml distilled water, mixed well and filtered through a 0.22-μm Millipore membrane (Millipore, Darmstadt, Germany)) for 30 min.

The utilization of a variety of substrates as sole carbon sources was tested using the basal inorganic nitrogen medium9 supplemented with a final concentration of 1% (v/v) of the filter sterile-tested carbon sources. Catalase and oxidase activities were determined with 3% (v/v) hydrogen peroxide solution and 1% tetramethyl p-phenylenediamine dihydrochloride solution, respectively. Growth at various pH values and the tolerance of NaCl were examined on ISP medium 2. The temperature range for growth was determined on ISP medium 2 using a temperature gradient incubator (Tokyo Kagaku Sangyo, Tokyo, Japan) between 5 and 50 °C. Enzyme activity profiles were carried out using the API ZYM (bioMèrieux) test kits. Melanin pigment was examined on ISP medium 7.7 The production of hydrogen sulfide was detected using lead acetate strips. Hydrolysis of casein, gelatin and nitrate reduction was examined by following the methods of Gordon and Mihm.10

Biomass used for chemotaxonomic analyses was obtained from cultures grown in shake flasks of ISP medium 2 for 10 days at 27 °C. The cells were harvested by centrifugation and washed three times with distilled water before freeze-drying. Standard procedures were used to determine the isomers of diaminopimelic acid.11, 12 The acyl type of the cell wall was analyzed according to the method of Uchida and Aida.13 Whole-cell sugars were analyzed according to the method of Becker et al.11 Polar lipids were examined using two-dimensional TLC and identified by the method of Minnikin et al.14 Menaquinones were extracted and purified by the method of Collins et al.,15 and isoprene units were subsequently analyzed by LC/MS (JMS-T100LP, JEOL) with a PEGASIL ODS column (2ø × 50 mm; Senshu, Tokyo, Japan) using methanol/2-propanol (7:3). Mycolic acids were detected by TLC according to the method of Tomiyasu.16 The G+C content (mol%) of the DNA was determined by HPLC according to the method of Tamaoka and Komagata.17 The cellular fatty acid composition was analyzed by TechnoSuruga (Shizuoka, Japan) according to the instructions of the Microbial Identification System (MIDI, version 4.5) using a gas chromatograph (model HP6890; Hewlett Packard, Palo Alto, CA, USA) and identified with the ACTIN1 database. DNA–DNA relatedness was measured fluorometrically using the microplate hybridization method.18

The phylogenetic position of the isolate SR14.14T was determined based on 16S rRNA gene sequence. Genomic DNA was isolated and purified from biomass following the method of Kieser et al.19 The 16S rRNA gene was amplified as described by Duangmal et al.20 The PCR products were sequenced (First Base, Seri Kembangan, Malaysia) using universal primers.21 The resultant 16S rRNA gene sequence was aligned with the corresponding sequences of representatives of the genus Sphaerisporangium and related genera, retrieved from the GenBank databases, using the CLUSTAL X22 and PHYDIT programs (http://plaza.snu.ac.kr/~jchun/phydit/). Phylogenetic trees were inferred by the least-squares,23 maximum-parsimony24 and neighbor-joining25 tree-making algorithms from the PHYLIP suite of programs26 and TREECON software.27 The resultant phylogenetic trees were viewed by TREEVIEW program.28

Cultural characteristics were determined using 14-days culture on ISP media 2, 3, 4 and 5 of Shirling and Gottlieb7 (Difco, Detroit, MI, USA) oatmeal-nitrate agar (JCM medium 52; Difco) and yeast-starch agar (JCM medium 42; Difco) at 27 °C. The color of mycelium and soluble pigment were determined by comparison with the color of chips in the Color Harmony Manual.8 The morphological characteristics were observed by light microscopy and scanning electron microscopy (JEOL-JSM 5600 LV, Japan) of 14-day-old cultures grown on ISP medium 3. Motility was observed with a light microscope using cells grown on ISP medium 2 for 14 days and incubated in soil-extracted solution (5 g garden soil in 25 ml distilled water, mixed well and filtered through a 0.22-μm Millipore membrane (Millipore, Darmstadt, Germany)) for 30 min.

The utilization of a variety of substrates as sole carbon sources was tested using the basal inorganic nitrogen medium9 supplemented with a final concentration of 1% (v/v) of the filter sterile-tested carbon sources. Catalase and oxidase activities were determined with 3% (v/v) hydrogen peroxide solution and 1% tetramethyl p-phenylenediamine dihydrochloride solution, respectively. Growth at various pH values and the tolerance of NaCl were examined on ISP medium 2. The temperature range for growth was determined on ISP medium 2 using a temperature gradient incubator (Tokyo Kagaku Sangyo, Tokyo, Japan) between 5 and 50 °C. Enzyme activity profiles were carried out using the API ZYM (bioMèrieux) test kits. Melanin pigment was examined on ISP medium 7.7 The production of hydrogen sulfide was detected using lead acetate strips. Hydrolysis of casein, gelatin and nitrate reduction was examined by following the methods of Gordon and Mihm.10

Biomass used for chemotaxonomic analyses was obtained from cultures grown in shake flasks of ISP medium 2 for 10 days at 27 °C. The cells were harvested by centrifugation and washed three times with distilled water before freeze-drying. Standard procedures were used to determine the isomers of diaminopimelic acid.11, 12 The acyl type of the cell wall was analyzed according to the method of Uchida and Aida.13 Whole-cell sugars were analyzed according to the method of Becker et al.11 Polar lipids were examined using two-dimensional TLC and identified by the method of Minnikin et al.14 Menaquinones were extracted and purified by the method of Collins et al.,15 and isoprene units were subsequently analyzed by LC/MS (JMS-T100LP, JEOL) with a PEGASIL ODS column (2ø × 50 mm; Senshu, Tokyo, Japan) using methanol/2-propanol (7:3). Mycolic acids were detected by TLC according to the method of Tomiyasu.16 The G+C content (mol%) of the DNA was determined by HPLC according to the method of Tamaoka and Komagata.17 The cellular fatty acid composition was analyzed by TechnoSuruga (Shizuoka, Japan) according to the instructions of the Microbial Identification System (MIDI, version 4.5) using a gas chromatograph (model HP6890; Hewlett Packard, Palo Alto, CA, USA) and identified with the ACTIN1 database. DNA–DNA relatedness was measured fluorometrically using the microplate hybridization method.18

The phylogenetic position of the isolate SR14.14T was determined based on 16S rRNA gene sequence. Genomic DNA was isolated and purified from biomass following the method of Kieser et al.19 The 16S rRNA gene was amplified as described by Duangmal et al.20 The PCR products were sequenced (First Base, Seri Kembangan, Malaysia) using universal primers.21 The resultant 16S rRNA gene sequence was aligned with the corresponding sequences of representatives of the genus Sphaerisporangium and related genera, retrieved from the GenBank databases, using the CLUSTAL X22 and PHYDIT programs (http://plaza.snu.ac.kr/~jchun/phydit/). Phylogenetic trees were inferred by the least-squares,23 maximum-parsimony24 and neighbor-joining25 tree-making algorithms from the PHYLIP suite of programs26 and TREECON software.27 The resultant phylogenetic trees were viewed by TREEVIEW program.28

0/5000

จาก: -

เป็น: -

ผลลัพธ์ (ไทย) 1: [สำเนา]

คัดลอก!

Strain SR14.14T was isolated from the rhizospheric soil of rubber tree using the spread plate method on starch casein agar,6 supplemented with ketokonazole (100 μg ml−1) and nalidixic acid (25 μg ml−1). The plates were incubated at 28 °C for 2 weeks. The strain was purified and maintained on glucose yeast extract (GYE) agar (containing glucose 1.0% (w/v), yeast extract 1.0% (w/v) and agar 1.5% (w/v)) at room temperature. Suspensions of spores or mycelium were stored at −20 °C in 20% glycerol and lyophilized for long-term preservation. Sphaerisporangium album DSM 45172T was used in this study for comparison purposes.Cultural characteristics were determined using 14-days culture on ISP media 2, 3, 4 and 5 of Shirling and Gottlieb7 (Difco, Detroit, MI, USA) oatmeal-nitrate agar (JCM medium 52; Difco) and yeast-starch agar (JCM medium 42; Difco) at 27 °C. The color of mycelium and soluble pigment were determined by comparison with the color of chips in the Color Harmony Manual.8 The morphological characteristics were observed by light microscopy and scanning electron microscopy (JEOL-JSM 5600 LV, Japan) of 14-day-old cultures grown on ISP medium 3. Motility was observed with a light microscope using cells grown on ISP medium 2 for 14 days and incubated in soil-extracted solution (5 g garden soil in 25 ml distilled water, mixed well and filtered through a 0.22-μm Millipore membrane (Millipore, Darmstadt, Germany)) for 30 min.The utilization of a variety of substrates as sole carbon sources was tested using the basal inorganic nitrogen medium9 supplemented with a final concentration of 1% (v/v) of the filter sterile-tested carbon sources. Catalase and oxidase activities were determined with 3% (v/v) hydrogen peroxide solution and 1% tetramethyl p-phenylenediamine dihydrochloride solution, respectively. Growth at various pH values and the tolerance of NaCl were examined on ISP medium 2. The temperature range for growth was determined on ISP medium 2 using a temperature gradient incubator (Tokyo Kagaku Sangyo, Tokyo, Japan) between 5 and 50 °C. Enzyme activity profiles were carried out using the API ZYM (bioMèrieux) test kits. Melanin pigment was examined on ISP medium 7.7 The production of hydrogen sulfide was detected using lead acetate strips. Hydrolysis of casein, gelatin and nitrate reduction was examined by following the methods of Gordon and Mihm.10Biomass used for chemotaxonomic analyses was obtained from cultures grown in shake flasks of ISP medium 2 for 10 days at 27 °C. The cells were harvested by centrifugation and washed three times with distilled water before freeze-drying. Standard procedures were used to determine the isomers of diaminopimelic acid.11, 12 The acyl type of the cell wall was analyzed according to the method of Uchida and Aida.13 Whole-cell sugars were analyzed according to the method of Becker et al.11 Polar lipids were examined using two-dimensional TLC and identified by the method of Minnikin et al.14 Menaquinones were extracted and purified by the method of Collins et al.,15 and isoprene units were subsequently analyzed by LC/MS (JMS-T100LP, JEOL) with a PEGASIL ODS column (2ø × 50 mm; Senshu, Tokyo, Japan) using methanol/2-propanol (7:3). Mycolic acids were detected by TLC according to the method of Tomiyasu.16 The G+C content (mol%) of the DNA was determined by HPLC according to the method of Tamaoka and Komagata.17 The cellular fatty acid composition was analyzed by TechnoSuruga (Shizuoka, Japan) according to the instructions of the Microbial Identification System (MIDI, version 4.5) using a gas chromatograph (model HP6890; Hewlett Packard, Palo Alto, CA, USA) and identified with the ACTIN1 database. DNA–DNA relatedness was measured fluorometrically using the microplate hybridization method.18The phylogenetic position of the isolate SR14.14T was determined based on 16S rRNA gene sequence. Genomic DNA was isolated and purified from biomass following the method of Kieser et al.19 The 16S rRNA gene was amplified as described by Duangmal et al.20 The PCR products were sequenced (First Base, Seri Kembangan, Malaysia) using universal primers.21 The resultant 16S rRNA gene sequence was aligned with the corresponding sequences of representatives of the genus Sphaerisporangium and related genera, retrieved from the GenBank databases, using the CLUSTAL X22 and PHYDIT programs (http://plaza.snu.ac.kr/~jchun/phydit/). Phylogenetic trees were inferred by the least-squares,23 maximum-parsimony24 and neighbor-joining25 tree-making algorithms from the PHYLIP suite of programs26 and TREECON software.27 The resultant phylogenetic trees were viewed by TREEVIEW program.28

การแปล กรุณารอสักครู่..

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:[สำเนา]

คัดลอก!

SR14.14T สายพันธุ์ที่แยกได้จากดิน rhizospheric ของต้นไม้ยางแผ่นโดยใช้วิธีการแพร่กระจายในอาหารเลี้ยงเชื้อแป้งเคซีน, 6 เสริมด้วย ketokonazole (100 ไมโครกรัมต่อมิลลิลิตร-1) และกรด nalidixic (25 ไมโครกรัมต่อมิลลิลิตร-1) แผ่นถูกบ่มที่ 28 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 2 สัปดาห์ สายพันธุ์บริสุทธิ์และการบำรุงรักษาในสารสกัดจากยีสต์กลูโคส (GYE) วุ้น (ที่มีระดับน้ำตาล 1.0% (w / v), สารสกัดจากยีสต์ 1.0% (w / v) และวุ้น 1.5% (w / v)) ที่อุณหภูมิห้อง สปอร์แขวนลอยหรือเส้นใยถูกเก็บไว้ที่อุณหภูมิ -20 องศาเซลเซียสในกลีเซอรีน 20% และแห้งสำหรับการเก็บรักษาในระยะยาว อัลบั้ม Sphaerisporangium DSM 45172T ถูกใช้ในการศึกษาครั้งนี้เพื่อการเปรียบเทียบ. ลักษณะทางวัฒนธรรมที่ได้รับการพิจารณาโดยใช้วัฒนธรรม 14 วันในสื่อ ISP 2, 3, 4 และ 5 ของ Shirling และ Gottlieb7 (Difco, ดีทรอยต์, มิชิแกนสหรัฐอเมริกา) ข้าวโอ๊ต-ไนเตรตวุ้น ( กลาง JCM 52; Difco) และยีสต์แป้งวุ้น (กลาง 42 JCM; Difco) ที่ 27 ° C สีของเส้นใยที่ละลายน้ำได้และเม็ดสีที่ได้รับการพิจารณาโดยเปรียบเทียบกับสีของชิปในความสามัคคีสี Manual.8 ลักษณะทางสัณฐานวิทยาถูกตั้งข้อสังเกตโดยใช้กล้องจุลทรรศน์แสงและกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนสแกน (JEOL JSM-5600 LV, ญี่ปุ่น) 14 วันเก่า วัฒนธรรมที่ปลูกในกลาง ISP 3. การเคลื่อนไหวก็สังเกตเห็นด้วยกล้องจุลทรรศน์โดยใช้เซลล์ที่ปลูกในกลาง ISP 2 เป็นเวลา 14 วันและบ่มในการแก้ปัญหาดินสกัด (5 กรัมดินสวนใน 25 มล. น้ำกลั่นผสมดีและกรองผ่าน 0.22- ไมโครเมตรคเมมเบรน (ค, Darmstadt, เยอรมนี)) เป็นเวลา 30 นาที. การใช้ประโยชน์จากความหลากหลายของพื้นผิวที่เป็นแหล่งคาร์บอน แต่เพียงผู้เดียวที่ได้รับการทดสอบโดยใช้ฐาน medium9 นินทรีย์ไนโตรเจนเสริมที่มีความเข้มข้นสุดท้ายของ 1% (v / v) ของตัวกรอง ผ่านการฆ่าเชื้อทดสอบแหล่งคาร์บอน กิจกรรม catalase และ oxidase ได้รับการพิจารณามี 3% (v / v) การแก้ปัญหาไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์และ 1% tetramethyl พี Phenylenediamine dihydrochloride วิธีการแก้ปัญหาตามลำดับ การเจริญเติบโตที่ค่าพีเอชที่หลากหลายและความอดทนของโซเดียมคลอไรด์มีการตรวจสอบในสื่อ ISP 2. ช่วงอุณหภูมิสำหรับการเจริญเติบโตที่ถูกกำหนดในสื่อ ISP 2 โดยใช้ตู้อบอุณหภูมิลาด (โตเกียว Kagaku Sangyo โตเกียวประเทศญี่ปุ่น) ระหว่างวันที่ 5 และ 50 องศาเซลเซียส รูปแบบการทำงานของเอนไซม์ที่ถูกดำเนินการโดยใช้ Zym API (Biomerieux) ชุดทดสอบ เม็ดสีเมลานินได้รับการตรวจสอบในกลาง 7.7 ISP การผลิตของไฮโดรเจนซัลไฟด์ที่ตรวจพบโดยใช้แผ่นตะกั่วอะซิเตท การย่อยสลายของเคซีนเจลาตินและการลดไนเตรตได้รับการตรวจสอบโดยวิธีการดังต่อไปนี้กอร์ดอนและ Mihm.10 ชีวมวลที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์ chemotaxonomic ที่ได้รับจากวัฒนธรรมที่ปลูกในขวดสั่นของกลาง ISP 2 เป็นเวลา 10 วันที่ 27 ° C เซลล์ที่ถูกเก็บเกี่ยวโดยการหมุนเหวี่ยงและล้างสามครั้งด้วยน้ำกลั่นก่อนที่จะแช่แข็งแห้ง ขั้นตอนมาตรฐานถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบสารอินทรีย์ของ acid.11 diaminopimelic 12 ชนิด acyl ของผนังเซลล์ได้รับการวิเคราะห์ตามวิธีการของอุจิและ Aida.13 น้ำตาลทั้งเซลล์ที่ได้มาวิเคราะห์ตามวิธีการของ Becker et al.11 ไขมันขั้วโลกมีการตรวจสอบโดยใช้ TLC สองมิติและระบุวิธีการ Minnikin et al.14 Menaquinones ถูกสกัดและทำให้บริสุทธิ์โดยวิธีการของคอลลิน et al., 15 และหน่วย isoprene วิเคราะห์ภายหลังจาก LC / MS (JMS-T100LP, JEOL) กับคอลัมน์ ODS PEGASIL (2O × 50 มม Senshu โตเกียวประเทศญี่ปุ่น) โดยใช้เมทานอล / 2-propanol (7: 3) กรด Mycolic ถูกตรวจพบโดย TLC ตามวิธีการของ Tomiyasu.16 G + C เนื้อหา (mol%) ของดีเอ็นเอถูกกำหนดโดยวิธี HPLC ตามวิธีการของ Tamaoka Komagata.17 และองค์ประกอบของกรดไขมันที่โทรศัพท์มือถือได้รับการวิเคราะห์โดย TechnoSuruga ( ชิซูโอกะ, ญี่ปุ่น) ตามคำแนะนำของจุลินทรีย์ระบบบัตร (MIDI, รุ่น 4.5) โดยใช้ก๊าซ Chromatograph (รุ่น HP6890; Hewlett Packard, Palo Alto, CA, USA) และยึดติดกับฐานข้อมูล ACTIN1 ความสัมพันธ์ดีเอ็นเอดีเอ็นเอวัดโดยใช้ฟลูออเรผสมพันธุ์ microplate method.18 phylogenetic ตำแหน่งของแยก SR14.14T ถูกกำหนดขึ้นอยู่กับลำดับของยีน 16S rRNA ดีเอ็นเอจีโนมเป็นโดดเดี่ยวและบริสุทธิ์จากชีวมวลดังต่อไปนี้วิธีการ Kieser et al.19 16S rRNA ยีนถูกขยายตามที่อธิบาย Duangmal et al.20 ผลิตภัณฑ์ PCR มีลำดับขั้นตอน (ตอนแรกฐานเสรี Kembangan มาเลเซีย) โดยใช้ primers.21 สากล ผล 16S rRNA ลำดับยีนสอดคล้องกับลำดับที่สอดคล้องกันของตัวแทนของประเภท Sphaerisporangium และจำพวกที่เกี่ยวข้องเรียกข้อมูลจากฐานข้อมูล GenBank โดยใช้ Clustal X22 และโปรแกรม PHYDIT (http://plaza.snu.ac.kr/~jchun / phydit /) ต้นไม้ที่ถูกอ้างถึงโดยสี่เหลี่ยมอย่างน้อย 23 สูงสุด parsimony24 และเพื่อนบ้าน joining25 ทำต้นไม้จากอัลกอริทึม PHYLIP ชุด programs26 และ TREECON software.27 ต้นไม้ผลที่ถูกมองโดย TREEVIEW program.28

การแปล กรุณารอสักครู่..

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:[สำเนา]

คัดลอก!

What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?What are you doing?

การแปล กรุณารอสักครู่..

ภาษาอื่น ๆ

การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.