AbstractUnderstanding linkage block

Abstract
Understanding linkage block size and molecular mechanisms of recombination suppression is important for plant breeding.
Previously large linkage blocks ranging from 14 megabases to 27 megabases were observed around the rice blast resistance
gene Pi-ta in rice cultivars and backcross progeny involving an indica and japonica cross. In the present study, the same
linkage block was further examined in 456 random recombinant individuals of rice involving 5 crosses ranging from F2 to F10
generation, with and without Pi-ta containing genomic indica regions with both indica and japonica germplasm. Simple
sequence repeat markers spanning the entire chromosome 12 were used to detect recombination break points and to
delimit physical size of linkage blocks. Large linkage blocks ranging from 4.1 megabases to 10 megabases were predicted
from recombinant individuals involving genomic regions of indica and japonica. However, a significantly reduced block from
less than 800 kb to 2.1megabases was identified from crosses of indica with indica rice regardless of the existence of Pi-ta.
These findings suggest that crosses of indica and japonica rice have significant recombination suppression near the
centromere on chromosome 12.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อขนาดบล็อกเชื่อมโยงทำความเข้าใจและกลไกระดับโมเลกุลของ recombination ปราบปรามเป็นสำคัญสำหรับการผสมพันธุ์ของพืชก่อนหน้านี้ มีบล็อกเชื่อมโยงขนาดใหญ่ตั้งแต่ 14 megabases 27 megabases สุภัครอบต่อต้านระเบิดข้าวยีนพี่ตา พันธุ์ข้าวและลูกหลานที่ไหม้เป็น indica และ japonica ข้าม ในการศึกษาปัจจุบัน เหมือนกันบล็อกเชื่อมโยงถูกตรวจสอบเพิ่มเติมใน 456 บุคคล recombinant สุ่มข้าวที่เกี่ยวข้องกับตัด 5 ตั้งแต่ F2 ถึง F10รุ่น มี และไม่ มี Pi-ตา ประกอบด้วยภูมิภาค genomic indica กับ indica และ japonica germplasm ง่ายลำดับซ้ำรัฐโครโมโซมทั้งหมด 12 เครื่องหมายใช้ในการตรวจหาจุดแบ่ง recombination และจำกัดขนาดจริงของบล็อกเชื่อมโยง ตั้งแต่ 4.1 megabases 10 megabases บล็อกเชื่อมโยงขนาดใหญ่ได้คาดการณ์จาก recombinant บุคคลเกี่ยวข้องกับภูมิภาค genomic indica และ japonica อย่างไรก็ตาม บล็อกลดลงอย่างมีนัยสำคัญจากต่ำกว่า 800 kb 2.1megabases ที่ระบุจากตัด indica ข้าว indica ไม่ดำรงอยู่ของผีตาผลการวิจัยเหล่านี้แนะนำว่า ตัดข้าว indica และ japonica มี recombination สำคัญปราบปรามใกล้centromere บนโครโมโซม 12

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อการเชื่อมโยงความเข้าใจบล็อกขนาดและกลไกระดับโมเลกุลของการปราบปรามการรวมตัวกันเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการปรับปรุงพันธุ์พืช.
ก่อนหน้านี้บล็อกการเชื่อมโยงที่มีขนาดใหญ่ตั้งแต่ 14 megabases 27 megabases
ถูกตั้งข้อสังเกตรอบต้านทานระเบิดข้าวยีนPi ตาพันธุ์ข้าวและลูกหลาน backcross เกี่ยวข้องกับ indica และ japonica ข้าม. ในการศึกษาปัจจุบันเดียวกันบล็อกการเชื่อมโยงได้ตรวจสอบต่อไปใน 456 บุคคล recombinant สุ่มของข้าวที่เกี่ยวข้องกับ 5 ไม้กางเขนตั้งแต่ F2 เพื่อ F10 รุ่นที่มีและไม่มีพี่ตาที่มีส่วนผสมของภูมิภาค indica จีโนมที่มีทั้งเชื้อพันธุกรรมและ indica japonica ง่ายเครื่องหมายซ้ำลำดับซึ่งประกอบไปด้วยโครโมโซมทั้ง 12 ถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบรวมตัวกันอีกจุดพักและคั่นขนาดทางกายภาพของบล็อกการเชื่อมโยง บล็อกการเชื่อมโยงขนาดใหญ่ตั้งแต่ 4.1 ถึง 10 megabases megabases ถูกคาดการณ์จากบุคคลที่เกี่ยวข้องกับrecombinant ภูมิภาคของจีโนมและ indica japonica แต่บล็อกลดลงอย่างมากจากน้อยกว่า 800 กิโลไบต์เพื่อ 2.1megabases ถูกระบุจากไม้กางเขนของ indica ข้าว indica โดยไม่คำนึงถึงการดำรงอยู่ของพี่ตา. การค้นพบนี้ชี้ให้เห็นว่าไม้กางเขนของ indica และข้าว japonica มีการปราบปรามรวมตัวกันอีกที่สำคัญใกล้centromere บน โครโมโซม 12

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

นามธรรม
เข้าใจการเชื่อมโยงบล็อกขนาดและกลไกระดับโมเลกุลของการปราบปรามการสำคัญสำหรับการปรับปรุงพันธุ์พืช โดยก่อนหน้านี้
บล็อกขนาดใหญ่ตั้งแต่ 14 megabases 27 megabases พบรอบไหม้ข้าวต้านทาน
ยีนในข้าวพันธุ์ดตาและลูกหลานกลับจากญี่ปุ่นที่เกี่ยวข้องกับและข้าม ในการศึกษาเดียวกัน
การเชื่อมโยงบล็อกเพิ่มเติมตรวจสอบ 456 บุคคลสุ่มยีนของข้าวที่เกี่ยวข้องกับ 5 ข้ามตั้งแต่ F2 กับ F10
รุ่นที่มีและไม่มีพีต้าที่มีจีโนมจากภูมิภาคทั้งจากญี่ปุ่นและเชื้อพันธุกรรม ง่าย
ลำดับย้ำเครื่องหมายครอบคลุมทั้งโครโมโซม 12 ถูกใช้เพื่อตรวจสอบจุดพักและการจำกัดจำนวน

ขนาดทางกายภาพของการเชื่อมโยงบล็อกบล็อกการเชื่อมต่อขนาดใหญ่ตั้งแต่ 4.1 megabases 10 megabases ถูกคาดการณ์จากบุคคลที่เกี่ยวข้องกับคอม
จีโนมภูมิภาคและของจากญี่ปุ่น . อย่างไรก็ตาม การลดป้องกันจาก
น้อยกว่า 800 2.1megabases บางครั้งจะถูกระบุจากคู่ผสมจากกับข้าว Indica โดยไม่คำนึงถึงชีวิตของ pi
TAจากการศึกษาครั้งนี้มีข้อเสนอแนะว่า คู่ผสมจากข้าวญี่ปุ่นและการปราบปรามมีความใกล้
เซนโตรเมียร์โครโมโซม 12