3.3. Culture-independent assessment

3.3. Culture-independent assessment of archaeal diversity in food-grade salts
All culture-based techniques have the important drawback that a medium with a define composition may not suit the requirement of all species. To overcome this constraint, a metagenomic analysis was performed to provide complementary information about the archaeal diversity in food-grade salts. A preliminary optimization of the DNA
extraction stepwas performed. Themost efficient extractionmethod involved the dissolution of food-grade salt in SW 12%, cell concentration on a 0.2 μm filter, lysis with a solution containing SDS 10% and proteinase K, followed by the DNA purification with phenol/chloroform and
precipitation with isopentanol (data not shown). This method successfully
achieved 16S rRNA geneamplification for eight food-grade salts: La
Baleine coarse, Lac Rose, Palm Island black, Camargue, Dead Sea, Hâlen
Môn, Maras and Black Sea salts. The PowerSoil® DNA isolation kit

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.3. วัฒนธรรมอิสระประเมินของ archaeal ความหลากหลายในอาหารเกรดเกลือเทคนิคตามวัฒนธรรมทั้งหมดมีข้อเสียเปรียบสำคัญที่สื่อกับองค์ประกอบที่กำหนดอาจไม่ตรงกับความต้องการของสปีชีส์ทั้งหมด เพื่อเอาชนะข้อจำกัดนี้ วิเคราะห์ metagenomic ที่ดำเนินการเพื่อให้ข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับ archaeal ความหลากหลายในอาหารเกรดเกลือ เพิ่มประสิทธิภาพเบื้องต้นของดีเอ็นเอstepwas แยกดำเนินการ เกี่ยวข้อง extractionmethod มีประสิทธิภาพ Themost ยุบเกลืออาหารเกรดในตะวันตกเฉียงใต้ 12% ความเข้มข้นของเซลล์บนกรอง μm, lysis ด้วยโซลูชันที่ประกอบด้วย 10% SDS และ proteinase K, 0.2 ตามฟอกดีเอ็นเอกับวาง/คลอโรฟอร์ม และฝนกับ isopentanol (ข้อมูลไม่แสดง) วิธีการนี้สำเร็จรับ 16S rRNA geneamplification สำหรับเกลืออาหารเกรดแปด: ลาBaleine หยาบ Lac Rose ปาล์มเกาะดำ Camargue เดดซี Hâlenเกลือ Môn, Maras และทะเลดำ ชุดแยก DNA PowerSoil ®

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.3 วัฒนธรรมการประเมินที่เป็นอิสระของความหลากหลาย archaeal
เกลือในอาหารเกรดทั้งหมดเทคนิคการเพาะเลี้ยงที่ใช้มีอุปสรรคที่สำคัญที่เป็นสื่อที่มีองค์ประกอบที่กำหนดอาจจะไม่เหมาะกับความต้องการของทุกชนิด เพื่อเอาชนะข้อ จำกัด นี้การวิเคราะห์ Metagenomic ได้ดำเนินการที่จะให้ข้อมูลที่สมบูรณ์เกี่ยวกับความหลากหลาย archaeal เกลือในอาหารเกรด เพิ่มประสิทธิภาพเบื้องต้นของดีเอ็นเอสกัด stepwas ดำเนินการ
extractionmethod มีประสิทธิภาพ Themost ที่เกี่ยวข้องกับการสลายตัวของเกลืออาหารเกรดใน SW 12% ความเข้มข้นของเซลล์ใน 0.2 ไมครอนกรอง lysis กับการแก้ปัญหาที่มี SDS 10% และโปร K ตามด้วยการทำให้บริสุทธิ์ของดีเอ็นเอที่มีฟีนอลคลอโรฟอร์ม /
และการเร่งรัดกับisopentanol ( ไม่ได้แสดงข้อมูล) วิธีการนี้จะประสบความสำเร็จในการประสบความสำเร็จ 16S rRNA geneamplification แปดเกลืออาหารเกรด: La Baleine หยาบ Lac โรสเกาะปาล์มสีดำ Camargue, ทะเลเดดซี Halen Mon, มาร์เรสและสีดำเกลือทะเล ชุดการแยกดีเอ็นเอPowerSoil®

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.3 . การประเมินความหลากหลายของวัฒนธรรมที่เป็นอิสระ archaeal เกลือเกรดอาหาร
ทั้งหมดวัฒนธรรมพื้นฐานเทคนิคมีอุปสรรค์สำคัญที่สื่อกับนิยามองค์ประกอบ อาจไม่เหมาะกับความต้องการของทุกชนิด เพื่อเอาชนะข้อจำกัดนี้ การวิเคราะห์เมตาจีโนมิคได้ให้เสริมข้อมูลเกี่ยวกับความหลากหลาย archaeal ในเกลือเกรดอาหารการเพิ่มประสิทธิภาพเบื้องต้นของการสกัดดีเอ็นเอ
คือการปฏิบัติ extractionmethod มีประสิทธิภาพมากที่สุดที่เกี่ยวข้องกับการละลายของเกลือในอาหารเกรด SW 12 % เซลล์ความเข้มข้น 0.2 M μกรอง , การสลายด้วยโซลูชั่นที่มี SDS 10 % และโปรตีน K ตามด้วยดีเอ็นเอบริสุทธิ์กับฟีนอล / คลอโรฟอร์มและ
ฝนกับ isopentanol ( ข้อมูลไม่แสดง ) วิธีนี้เรียบร้อยแล้ว
รับเบส 16S rRNA geneamplification 8 เกลืออาหารเกรด : ลา
baleine หยาบ แลค โรส เกาะปาล์มดำ กามาร์ก ตายทะเล H âเลน
M เป็นการ N Maras และเกลือทะเลสีดำ การ powersoil ®ดีเอ็นเอแยกชุด