16S rDNA sequencingThe 16S rDNA seq

16S rDNA sequencing

The 16S rDNA sequences were edited using the Staden software, and the BLAST algorithm (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov) was used to compare the sequences with other sequences previously deposited in the GenBank database. The sequences were aligned to those of type strains using the MEGA 5.2 software. Following the alignment, a dendrogram was constructed using the neighbor-joining method with 1000 bootstrap replicates, the Tamura three-parameter model, and the Gamma (G) distribution (Fig. 1) in the same software.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

16S rDNA ลำดับการ 16S rDNA ลำดับถูกแก้ไขโดยใช้ซอฟต์แวร์ Staden และอัลกอริทึมระเบิด (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov) ใช้ในการเปรียบเทียบลำดับ มีลำดับอื่น ๆ ฝากไว้ก่อนหน้านี้ ในฐานข้อมูลของ GenBank ลำดับที่สอดคล้องกับชนิดสายพันธุ์ที่ใช้ซอฟต์แวร์ 5.2 ล้าน ต่อการจัดตำแหน่ง dendrogram ถูกสร้างขึ้นโดยใช้วิธีการเพื่อนบ้านเข้าร่วม ด้วยเหมือนกับเริ่มต้น 1000 แบบสามพารามิเตอร์ทา และการแจกแจงแกมมา (G) (รูปที่ 1) ในซอฟต์แวร์เดียวกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

16S rDNA ลำดับ

ลำดับ 16S rDNA ถูกแก้ไขโดยใช้ซอฟต์แวร์ Staden และขั้นตอนวิธีการระเบิด (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov) ถูกใช้ในการเปรียบเทียบลำดับวนเวียนอยู่กับคนอื่น ๆ ก่อนหน้านี้ฝากไว้ในฐานข้อมูลของ GenBank ลำดับถูกจัดชิดกับบรรดาของชนิดสายพันธุ์โดยใช้ซอฟแวร์ 5.2 MEGA ต่อไปนี้การจัดตำแหน่งเป็น dendrogram ถูกสร้างขึ้นโดยใช้วิธีเพื่อนบ้านเข้าด้วยซ้ำ 1000 บูตที่ทามูระรูปแบบสามพารามิเตอร์และ (G) แจกแจงแกมมา (รูปที่ 1). ในซอฟต์แวร์เดียวกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับ 16S rDNAการลำดับ 16S rDNA ถูกแก้ไข โดยใช้ซอฟต์แวร์ staden และระเบิดของ http://blast.ncbi.nlm.nih.gov ) ถูกนำมาใช้เพื่อเปรียบเทียบลำดับกับลำดับอื่น ๆก่อนหน้านี้ฝากในขนาดของฐานข้อมูล ลำดับของชนิดสายพันธุ์ ชิดกับผู้ใช้ Mega 5.2 ซอฟต์แวร์ ตามแนว มีพันธุกรรมที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้เพื่อนบ้านร่วมด้วยวิธีบูตสแตรป , ซ้ำ , ทามูระสามพารามิเตอร์โมเดล และแกมมา ( g ) การกระจาย ( รูปที่ 1 ) ในซอฟต์แวร์เดียวกัน