Sequence alignment is a central too

Sequence alignment is a central tool in molecular biology. A Multiple sequence alignment (MSA) is a sequence alignment of three or more biological sequences, generally protein, DNA or RNA to identify regions of similarity that may be a consequence of functional, structural or evolutionary relationships between the sequences. High sequence similarity between molecules usually implies significant structural and functional similarities in an alignment. Three or more sequences of biologically relevant length can be difficult and are almost always time-consuming to align by hand, computational algorithms are used to produce and analyze the alignments. MSAs require more sophisticated methodologies because they are more computationally complex. A hidden markov model (HMM) is a probabilistic finite state machine which is widely used in biological sequence analysis. Profile HMMs are specific types of HMM used in biological sequence analysis. In this paper, we show how Profile HMMs can be useful for multiple sequence alignment. We test their applicability to the tasks of multiple alignments and find that they work well.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จัดลำดับเป็นเครื่องมือกลางในอณูชีววิทยา แบบจัดลำดับหลาย (MSA) เป็นการจัดลำดับของสาม หรือมากกว่าทางชีวภาพลำดับ โดยทั่วไปโปรตีน ดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอเพื่อระบุขอบเขตของความคล้ายคลึงกันซึ่งอาจเป็นผลมาจากการทำงาน โครงสร้าง หรือวิวัฒนาการความสัมพันธ์ระหว่างลำดับที่ ความคล้ายคลึงกันของลำดับสูงระหว่างโมเลกุลมักจะหมายถึงความเหมือนโครงสร้าง และการทำงานในตำแหน่งที่สำคัญ ลำดับที่สาม หรือมากกว่าความยาวที่เกี่ยวข้องชิ้นอาจเป็นเรื่องยาก และเป็นเกือบตลอดเวลาเวลาจัดตำแหน่งด้วยมือ อัลกอริทึมคำนวณใช้ในการผลิต และวิเคราะห์การจัดแนว MSAs ต้องประสบความซับซ้อนมากขึ้นเนื่องจากจะ computationally ยิ่งซับซ้อน แบบ markov ซ่อน (HMM) เป็นเครื่องสถานะจำกัด probabilistic ซึ่งใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์ทางชีวภาพ HMMs โพรไฟล์ HMM ที่ใช้ในการวิเคราะห์ทางชีวภาพบางชนิดได้ ในเอกสารนี้ เราแสดง HMMs โปรไฟล์จะมีประโยชน์สำหรับการจัดลำดับหลายตำแหน่ง เราทดสอบความเกี่ยวข้องของพวกเขากับงานของจัดแนวหลาย และพบว่า พวกเขาทำงานดี

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับการจัดเรียงเป็นเครื่องมือที่สำคัญในการอณูชีววิทยา ลำดับการจัดเรียงหลาย (MSA) เป็นลำดับการจัดเรียงของสามหรือมากกว่าลำดับทางชีวภาพโดยทั่วไปโปรตีนดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอที่จะระบุภูมิภาคของความคล้ายคลึงกันที่อาจจะเป็นผลมาจากการทำงานและความสัมพันธ์ของโครงสร้างหรือวิวัฒนาการระหว่างลำดับ เหมือนลำดับสูงระหว่างโมเลกุลจะแสดงถึงความคล้ายคลึงกันของโครงสร้างและการทำงานอย่างมีนัยสำคัญในการจัดตำแหน่ง สามหรือมากกว่าลำดับของความยาวทางชีวภาพอาจเป็นเรื่องยากและมักจะใช้เวลานานที่จะปรับด้วยมือขั้นตอนวิธีการคำนวณที่ใช้ในการผลิตและวิเคราะห์การจัดแนว MSAs ต้องใช้วิธีการที่ซับซ้อนมากขึ้นเพราะพวกเขามีความซับซ้อนมากขึ้นคอมพิวเตอร์ รูปแบบมาร์คอฟที่ซ่อนอยู่ (HMM) เป็นเครื่องสถานะ จำกัด น่าจะเป็นที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์ลำดับทางชีวภาพ HMMs โปรไฟล์เฉพาะประเภทของ HMM ใช้ในการวิเคราะห์ลำดับทางชีวภาพ ในบทความนี้เราแสดงให้เห็นว่าข้อมูลส่วนตัว HMMs จะมีประโยชน์สำหรับลำดับการจัดเรียงหลาย เราจะทดสอบการบังคับใช้ของพวกเขาให้กับงานของการจัดแนวหลายและพบว่าพวกเขาทำงานได้ดี

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การเรียงลำดับเป็นเครื่องมือกลางในชีววิทยาระดับโมเลกุล หลายลำดับฟี ( MSA ) เป็นลำดับจัดสามหรือมากกว่าลำดับทางชีวภาพโดยทั่วไปโปรตีน ดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอระบุภูมิภาคของความเหมือนที่อาจเป็นผลมาจากการทำงาน หรือ โครงสร้างความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการระหว่างผู้ความเหมือนของลำดับสูงระหว่างโมเลกุลโครงสร้างและการทำงานมักจะหมายถึงความคล้ายคลึงกันในแนว สามหรือมากกว่าลำดับทางชีววิทยาที่เกี่ยวข้อง ความยาวจะยากและใช้เวลานานเกือบตลอดเวลาเพื่อจัดด้วยมือและคอมพิวเตอร์ที่ใช้เพื่อผลิต และวิเคราะห์การจัดแนวมซาสต้องการที่ซับซ้อนมากขึ้นเพราะพวกเขาจะ computationally วิธีการซับซ้อนมากขึ้น ซ่อนมาร์คอฟแบบ ( อืม ) คือการจำกัดสภาพเครื่องจักรที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์ลำดับทางชีวภาพ รายละเอียด hmms เป็นประเภทเฉพาะของ - ใช้ในการวิเคราะห์ลำดับทางชีวภาพ ในบทความนี้เราจะแสดงวิธีการที่โปรไฟล์ hmms สามารถเป็นประโยชน์สำหรับหลาย ๆลำดับตำแหน่งเราทดสอบ การใช้ของพวกเขา งาน การ หลาย และพบว่าพวกเขาทำงานได้ดี