For our dating analyses, we added s

For our dating analyses, we added samples of an additional 10
primate taxa to our alignment of NAD5, NAD6, and cytochrome B
coding regions, including another four platyrrhines (Aotus, Saimiri,Callithrix, and Saguinus), three cercopithecoids (Theropithecus,
Papio, and Macaca), two hominoids (Pan and Homo), and Tarsius
(Table 2). We used the software BEAUTi v1.8.0 (Drummond and
Rambaut, 2007) to create the XML input files used by BEAST. For
those inputs, we constrained the phylogenetic relationships among
the taxa in the alignment to be those well documented in many
other studies of primate evolutionary history (e.g., Perelman
et al., 2011; Pozzi et al., 2014). Thus, we set Pan and Homo as sister
taxa; Papio and Theropithecus as sister taxa; Hominoidea and
Cercopithecoidea as sister clades; Catarrhini and Platyrrhini as
sister clades; and Tarsius as the sister taxon to all anthropoids.
Additionally, within the platyrrhines, we constrained
cebids (Aotus + Cebus + Saimiri + Callithrix + Saguinus), callitrichines
(Callithrix + Saguinus), atelids (Alouatta + Lagothrix + Ateles), atelines
(Lagothrix + Ateles), and Ateles all as monophyletic. Finally,
based on the results of our maximum likelihood and Bayesian
phylogenetic analyses of the 27-taxon alignment (see below), we
constrained certain relationships within Ateles to also be monophyletic,
including A. fusciceps + A. geoffroyi and A. belzebuth + A.
chamek. However, because our different phylogenetic analyses suggested
somewhat different relationships among A. fusciceps + A.
geoffroyi, A. paniscus, A. hybridus, and A. belzebuth + A. chamek, we
imposed no monophyly constraints on combinations of those taxa.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สำหรับวิเคราะห์หาคู่ของเรา เราได้เพิ่มตัวอย่างที่ 10 เพิ่มเติมtaxa ประชาชนมอบให้ตำแหน่งของเรา NAD5, NAD6 และ cytochrome Bรหัสภูมิภาค รวมถึงอีกสี่ platyrrhines (Aotus, Saimiri, Callithrix และ Saguinus), 3 cercopithecoids (TheropithecusPapio และ Macaca), สอง hominoids (Pan และกะเทย), และการประชุม(ตารางที่ 2) เราใช้ v1.8.0 BEAUTi ซอฟต์แวร์ (ดรัม และRambaut, 2007) การสร้างแฟ้มป้อนข้อมูล XML ใช้สัตว์ สำหรับอินพุตที่ เราจำกัดความสัมพันธ์ phylogenetic ระหว่างtaxa ในตำแหน่งเป็นผู้จัดในดีศึกษาประวัติวิวัฒนาการถือ (เช่น อรีอื่น ๆร้อยเอ็ด al., 2011 Pozzi et al., 2014) ดังนั้น การที่เราตั้งแพนและตุ๊ดเป็นน้องสาวtaxa Papio และ Theropithecus เป็นน้องสาว taxa Hominoidea และCercopithecoidea เป็นน้องสาว clades Catarrhini และ Platyrrhini เป็นน้อง clades และประชุมเป็นเครือ taxon การ anthropoids ทั้งหมดนอกจากนี้ ภายใน platyrrhines เราจำกัดcebids (Aotus Cebus + Saimiri + Callithrix + Saguinus) callitrichines(Callithrix + Saguinus), atelids (Alouatta + Lagothrix + Ateles), atelines(Lagothrix + Ateles), และ Ateles ทั้งหมดเป็น monophyletic สุดท้ายขึ้นอยู่กับผลลัพธ์ของทฤษฎีและความเป็นไปได้สูงสุดของเราวิเคราะห์ phylogenetic ของตำแหน่ง 27 taxon (ดูด้านล่าง), เราจำกัดบางความสัมพันธ์ใน Ateles ยัง เป็น monophyleticรวมทั้ง A. fusciceps A. geoffroyi และ A. belzebuth + อ.chamek อย่างไรก็ตาม เนื่องจากเราวิเคราะห์ phylogenetic อื่นแนะนำความสัมพันธ์ที่ค่อนข้างแตกต่างกันระหว่าง A. fusciceps + อ.geoffroyi, A. paniscus, A. hybridus และอ. belzebuth + A. chamek เรากำหนดข้อจำกัดเกี่ยวกับชุดของ taxa ที่ monophyly ไม่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สำหรับการวิเคราะห์ของเราเดทเราเพิ่มจำนวนอีก 10
ลิงซ่ากับแนวของเรา nad5 nad6 , และไซโตโครม b
รหัสภูมิภาค รวมถึงอีก 4 platyrrhines ( aotus saimiri callithrix , , , และ saguinus ) , สาม cercopithecoids ( theropithecus
papio , และ macaca ) สอง hominoids ( กระทะและโฮโม ) และ tarsius
( ตารางที่ 2 ) เราใช้ซอฟต์แวร์ v1.8.0 บิวตี้ ( ดรัมมอนด์และ rambaut
,2007 ) ในการสร้าง XML ไฟล์เข้าใช้โดยสัตว์ สำหรับ
ปัจจัยเหล่านั้น เราจำกัดการยืนยันความสัมพันธ์ระหว่าง
ซ่าในการเป็นผู้จัดดีในมากของลิงวิวัฒนาการประวัติศาสตร์
การศึกษาอื่น ๆ ( เช่น เพเรลแมน
et al . , 2011 ; pozzi et al . , 2010 ) ดังนั้นเราจึงตั้งกระทะและโฮโมน้องสาว
papio theropithecus ซ่า ; และเป็นพี่สาวและเอปและ
;cercopithecoidea เป็น clades น้องสาว ; catarrhini platyrrhini
clades และเป็นน้องสาว และ tarsius เป็นน้องสาวชนิดทั้งหมดแอนโธรพอยด์ .
นอกจากนี้ ภายใน platyrrhines เราบังคับ
cebids ( aotus cebus saimiri callithrix saguinus ) callitrichines
( callithrix saguinus ) atelids ( alouatta lagothrix ateles ) atelines
( lagothrix ateles ) ateles ทั้งหมดเป็น monophyletic . ในที่สุด
ขึ้นอยู่กับผลของความน่าจะเป็นสูงสุดของเราและคชกรรมการวิเคราะห์ phylogenetic
27 ชนิดแนว ( ดูด้านล่าง ) เรา
บังคับความสัมพันธ์ภายใน ateles ยังต้อง monophyletic
รวมทั้ง . fusciceps . geoffroyi , และ belzebuth .
chamek . แต่เนื่องจากการวิเคราะห์ของเราที่แตกต่าง ซึ่งมีความสัมพันธ์ค่อนข้างแตกต่างระหว่าง fusciceps
. .
geoffroyi Apaniscus อ. hybridus และ . belzebuth . chamek ที่กําหนด ไม่มีข้อจำกัด เรา
monophyly บนชุดของซ่า .