The present study is focused on the

The present study is focused on the development of a cultivation-independent molecular approach for specific detection of bioluminescent bacteria within microbial communities by direct amplification of luxA gene from environmental DNA

A new set of primers ,specifically targeting free-living bioluminescent bacteria , was designed on the base of luxA sequences available from the public database

Meso - and bathypelagic seawater samples were collected from two stations in TyrrhenianSea at the depths of 500 and 2750 m.

The same seawater samples also were used to isolate bioluminescent bacteria that were further subjected to luxA and 16S rRNA gene sequencing

PCR products obtained by amplification with designed primers were cloned , and the phylogenetic affiliation of 40 clones was determined.

All of them were clustered into three groups , only distantly related to the Photobacterium phosphoreum and Photobacterium kishitanii clades

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาครั้งนี้มุ่งเน้นไปที่การพัฒนาของการเพาะปลูกอิสระวิธีโมเลกุลสำหรับการตรวจสอบที่เฉพาะเจาะจงของแบคทีเรียเรืองแสงภายในชุมชนจุลินทรีย์โดยใช้เครื่องขยายเสียงโดยตรงของ Luxa ยีนจากดีเอ็นเอสิ่งแวดล้อมชุดใหม่ของไพรเมอร์โดยเฉพาะการกำหนดเป้าหมายฟรีที่อาศัยอยู่แบคทีเรียเรืองแสงได้รับการออกแบบใน ฐานของ Luxa ลำดับใช้ได้จากฐานข้อมูลสาธารณะMeso -. และตัวอย่างน้ำทะเล bathypelagic ถูกเก็บรวบรวมจากสองสถานีใน TyrrhenianSea ที่ระดับความลึก 500 และ 2,750 เมตรตัวอย่างน้ำทะเลเดียวกันยังถูกนำมาใช้เพื่อแยกเชื้อแบคทีเรียเรืองแสงที่ถูกยัดเยียดต่อไป Luxa และ 16S rRNA ยีนลำดับผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ที่ได้รับจากการขยายด้วยไพรเมอร์ได้รับการออกแบบถูกโคลนและความร่วมมือ phylogenetic 40 โคลนถูกกำหนด. พวกเขาทั้งหมดถูกคลัสเตอร์เป็นสามกลุ่มเท่านั้นที่ห่างไกลที่เกี่ยวข้องกับเรียม Photobacterium และ Photobacterium kishitanii clades

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษาครั้งนี้มุ่งเน้นการพัฒนาวิธีการปลูกอิสระโมเลกุลเฉพาะการตรวจหาไบโอลูมิเนสเซนต์แบคทีเรียภายในชุมชนโดยจุลินทรีย์ขยายโดยตรงของยีนดีเอ็นเอ luxa จากสิ่งแวดล้อมชุดใหม่ของไพรเมอร์เจาะจงเป้าหมายแบคทีเรียอิสระไบโอลูมิเนสเซนต์ ถูกออกแบบบนฐานของลำดับ luxa ที่มีอยู่จากฐานข้อมูลสาธารณะเมโส - และตัวอย่างน้ำทะเล bathypelagic เก็บจากสถานีใน tyrrheniansea ที่ระดับความลึก 500 และ 750 เมตรตัวอย่างน้ำทะเลเดียวกันยังถูกใช้เพื่อแยกไบโอลูมิเนสเซนต์แบคทีเรียที่ถูกเพิ่มเติมภายใต้ luxa ลำดับเบส 16S rRNA ยีนและผลิตภัณฑ์ที่ได้จากการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอด้วยไพรเมอร์ที่ออกแบบถูกโคลนและความสัมพันธ์ phylogenetic 40 โคลนถูกกำหนดไว้ทั้งหมดของพวกเขามีการจัดกลุ่มออกเป็น 3 กลุ่ม แต่ส่วนลึกที่เกี่ยวข้องกับ phosphoreum โฟโตแบคทีเรียม และ kishitanii clades โฟโตแบคทีเรียม