Two novel actinobacteria, strains M

Two novel actinobacteria, strains MUSC 135T and MUSC 137, were isolated from mangrove soil
at Tanjung Lumpur, Malaysia. The 16S rRNA gene sequence similarity and DNA–DNA
relatedness between strains MUSC 135T and MUSC 137 were 100% and 83±3.2 %,
confirming that these two strains should be classified in the same species. Strain MUSC 135T
exhibited a broad-spectrum bacteriocin against the pathogens meticillin-resistant Staphylococcus
aureus (MRSA) strain ATCC BAA-44, Salmonella typhi ATCC 19430T and Aeromonas
hydrophila ATCC 7966T. A polyphasic approach was used to study the taxonomy of MUSC 135T,
and it showed a range of phylogenetic and chemotaxonomic properties consistent with those of
the genus Streptomyces. The diamino acid of the cell-wall peptidoglycan was LL-diaminopimelic
acid. The predominant menaquinones were MK-9(H6), MK-9(H4) and MK-9(H8). Polar lipids
detected were a lipid, an aminolipid, a phospholipid, phosphatidylinositol, phosphatidylethanolamine
and two glycolipids. The predominant cellular fatty acids (.10.0 %) were anteiso-C15 : 0
(20.8 %), iso-C16 : 0 (18.0 %), iso-C15 : 0 (12.2 %) and anteiso-C17 : 0 (11.6 %). The whole-cell
sugars were ribose, glucose and mannose. These results suggested that MUSC 135T should be
placed within the genus Streptomyces. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene
sequence exhibited that the most closely related strains were Streptomyces cinereospinus NBRC
15397T (99.18% similarity), Streptomyces mexicanus NBRC 100915T (99.17 %) and
Streptomyces coeruleofuscus NBRC 12757T (98.97 %). DNA–DNA relatedness between
MUSC 135T and closely related type strains ranged from 26.3±2.1 to 49.6±2.5 %. BOX-PCR
fingerprint comparisons showed that MUSC 135T exhibited a unique DNA profile. The DNA G+C
content determined was 70.7±0.3 mol%. Based on our polyphasic study of MUSC 135T, the
strain merits assignment to a novel species, for which the name Streptomyces pluripotens sp. nov.
is proposed. The type strain is MUSC 135T (5MCCC 1K00252T5DSM 42140T).
Mangrove forests are highly dynamic ecosystems that
provide vital protection to the coastline of tidal zones in
tropical and subtropical areas. These ecosystems are home
to diverse flora and fauna of marine, freshwater and
terrestrial species (Jennerjahn & Ittekkot, 2002). In contrast
to the well-documented species diversity of larger animals
and plants in these mangrove ecosystems, surprisingly little
Abbreviation: MRSA, meticillin-resistant Staphylococcus aureus.
The GenBank/EMBL/DDBJ accession numbers for the 16S rRNA gene
sequences of strains MUSC 135T and MUSC 137 are KF195922 and
KF311015.
Three supplementary figures and two supplementary tables are available
with the online version of this paper.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2014), 64, 3297–3306 DOI 10.1099/ijs.0.065045-0
065045 G

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Actinobacteria นวนิยายสอง ไหล่ 135T และ 137 ไหล่ สายพันธุ์ที่แยกจากดินป่าชายเลนที่ตัน มาเลเซีย ความคล้ายคลึงของลำดับยีน 16S rRNA และดีเอ็นเอดีเอ็นเอrelatedness ระหว่างสายพันธุ์ 135T ไหล่และไหล่ 137 ได้ 100% และ 83±3.2%ยืนยันว่า ควรจำแนกสายพันธุ์เหล่านี้สองในสายพันธุ์เดียวกัน สายพันธุ์ไหล่ 135Tแสดงคเทสามารถต่อเชื้อโรค Staphylococcus meticillin ทนหมอเทศข้างลาย (MRSA) สายพันธุ์ ATCC บา-44, Salmonella typhi ATCC 19430T และ Aeromonashydrophila ATCC 7966 ต. วิธี polyphasic ที่ใช้ในการศึกษาการจำแนกประเภทของไหล่ 135Tและพบว่า phylogenetic และ chemotaxonomic คุณสมบัติที่หลากหลายสอดคล้องกับของประเภท Streptomyces กรด diamino ของการเปบทิโดไกลแคนของผนังเซลล์ถูก LL diaminopimelicกรด Menaquinones เด่นได้ MK-9(H6), MK-9(H4) และ MK-9(H8) ไขมันที่ขั้วโลกพบได้ในไขมัน การ aminolipid เรียม phosphatidylinositol, phosphatidylethanolamineและสอง glycolipids กรดไขมันเซลล์เด่น (.10.0%) anteiso-C15: 0(20.8%), iso C16: 0 (18.0%), iso C15: 0 (12.2%) และ anteiso-C17: 0 (11.6%) เซลล์ทั้งหมดน้ำตาลมีน้ำตาล กลูโคส และ mannose ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำว่า ควรจะไหล่ 135Tวางอยู่ในสกุล Streptomyces วิเคราะห์ phylogenetic อิงยีน 16S rRNAลำดับแสดงว่า สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมากที่สุดถูก Streptomyces cinereospinus NBRC15397T (99.18% similarity), Streptomyces mexicanus NBRC 100915T (99.17 %) andStreptomyces coeruleofuscus NBRC 12757T (98.97 %). DNA–DNA relatedness betweenMUSC 135T and closely related type strains ranged from 26.3±2.1 to 49.6±2.5 %. BOX-PCRfingerprint comparisons showed that MUSC 135T exhibited a unique DNA profile. The DNA G+Ccontent determined was 70.7±0.3 mol%. Based on our polyphasic study of MUSC 135T, thestrain merits assignment to a novel species, for which the name Streptomyces pluripotens sp. nov.is proposed. The type strain is MUSC 135T (5MCCC 1K00252T5DSM 42140T).Mangrove forests are highly dynamic ecosystems thatprovide vital protection to the coastline of tidal zones intropical and subtropical areas. These ecosystems are hometo diverse flora and fauna of marine, freshwater andterrestrial species (Jennerjahn & Ittekkot, 2002). In contrastto the well-documented species diversity of larger animalsand plants in these mangrove ecosystems, surprisingly littleAbbreviation: MRSA, meticillin-resistant Staphylococcus aureus.The GenBank/EMBL/DDBJ accession numbers for the 16S rRNA genesequences of strains MUSC 135T and MUSC 137 are KF195922 andKF311015.Three supplementary figures and two supplementary tables are availablewith the online version of this paper.International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2014), 64, 3297–3306 DOI 10.1099/ijs.0.065045-0065045 G

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สองนวนิยายแอคติโนมัยสีทสายพันธุ์และสมม 135t สมม 137 , ที่แยกได้จากดินบริเวณป่าชายเลนที่ตันจุง กัวลาลัมเปอร์ , มาเลเซีย การลำดับเบส 16S rRNA ยีนและดีเอ็นเอ ( DNA คล้ายคลึงสัมพันธ์ระหว่างนักศึกษาและสายพันธุ์ 135t สมม 137 100% และ 83 ± 3.2 %ยืนยันว่าทั้งสองสายพันธุ์ที่ควรจัดอยู่ในสปีชีส์เดียวกัน 135t สมมเมื่อยมีเหล่านี้กับเชื้อโรคดื้อยาเมทิซิลลินเชื้อแบคทีริโอซินaureus ( MRSA ) สายพันธุ์ ATCC baa-44 Salmonella ที่ได้รับเชื้อและเชื้อ 19430tใน 7966t polyphasic เชื้อ วิธีการที่ใช้ในการศึกษาอนุกรมวิธานของ 135t สมม ,และมันมีช่วงของและคุณสมบัติต่างๆ chemotaxonomic สอดคล้องกับบรรดาของสกุล Streptomyces . การ diamino กรดของผนังเซลล์คือจะ diaminopimelic เปปติโดไกลแคนกรด การ menaquinones เด่นเป็น mk-9 ( H6 ) mk-9 ( H4 ) และ mk-9 ( h8 ) ขั้วโลกลิพิดตรวจพบไขมัน , aminolipid ป phosphatidylethanolamine ฟอสฟาทิดิลอิโนซิทอล , , ,และสองไกลโคลิปิด . โดดของเซลล์กรดไขมัน ( 10.0% ) anteiso-c15 : 0( 20.8% ) iso-c16 : 0 ( ร้อยละ 18.7 ) iso-c15 : 0 ( 12.2 % ) และ anteiso-c17 : 0 ( 11.6% ) เซลล์ทั้งหมดน้ำตาลไรโบส คือ กลูโคส และ แมนโนส . ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า สมม 135t ควรวางอยู่ภายในสกุล Streptomyces . การวิเคราะห์ 16S rRNA phylogenetic ขึ้นอยู่กับยีนลำดับ พบว่าส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด cinereospinus nbrc Streptomyces สายพันธุ์15397t ( 99.18 % ความเหมือน ) , Streptomyces mexicanus nbrc 100915t ( 99.17 % ) และcoeruleofuscus Streptomyces nbrc 12757t ( 98.97 % ) ดีเอ็นเอ ( DNA แบ่งงานกันทำระหว่าง135t สมมและสายพันธุ์ชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดระหว่างจำกัด± 1 49.6 ± 2.5 % box-pcrการเปรียบเทียบลายนิ้วมือ พบว่า นักศึกษา 135t มี DNA ที่ไม่ซ้ำกัน ดีเอ็นเอ G + cเนื้อหาที่กำหนดได้ด้วย± 0.3 mol % จากการศึกษาของเรา polyphasic ของนักศึกษา 135t ,ความเครียดจึงมอบหมายให้นิยายชนิดที่ชื่อ pluripotens Streptomyces sp .คือการเสนอ ประเภทเมื่อย สมม 135t ( 5mccc 1k00252t5dsm 42140t )ป่าชายเลนเป็นระบบนิเวศแบบไดนามิกสูง ว่าให้การป้องกันที่สำคัญเพื่อชายฝั่งของน้ำขึ้นน้ำลงในโซนพื้นที่เขตร้อนและกึ่งเขตร้อน ระบบนิเวศเหล่านี้ที่บ้านฟลอร่าที่หลากหลายและสัตว์ทะเลและน้ำจืดกล้วยไม้ดินชนิด ( jennerjahn & ittekkot , 2002 ) ในทางตรงกันข้ามให้ข้อมูลความหลากชนิดของสัตว์ขนาดใหญ่และพืชในระบบนิเวศป่าชายเลน เหล่านี้เพียงเล็กน้อยอย่างแปลกใจตัวย่อ : MRSA ดื้อยาเมทิซิลลิน Staphylococcus aureus .ขนาด / สัตว / ddbj หมายเลขภาคยานุวัติสำหรับเบส 16S rRNA ยีนลำดับของสายพันธุ์และมี kf195922 สมม 135t สมม 137 และkf311015 .สามตัวเลขและตารางที่มีสองเพิ่มเติมเสริมกับออนไลน์รุ่นของบทความนี้วารสารนานาชาติของระบบและวิวัฒนาการจุลชีววิทยา ( 2014 ) , 64 , 3306 ดอย 10.1099/ijs.0.065045-0 ถ่ายโอนฯ065045 กรัม