n the lead up to our prominent 2nd

n the lead up to our prominent 2nd Annual Microbiology & Infectious Diseases Asia Congress we interviewed Swaine Chen, Singapore NRF Fellow from the National University of Singapore and Genome Institute of Singapore. In his research, Swaine is taking an evolutionary approach to integrate high throughput sequencing technologies into the daily life of microbiologists. As a model, he is using urinary tract infection caused by Escherichia coli. Swaine will be presenting 'Understanding Sequence Variation and Function of fimS, a Crucial Regulatory Element of UPEC Virulence, Through Mutagenesis and Next-Generation Sequencing’ at the 2nd Annual Microbiology & Infectious Diseases Asia Congress.

When asked what he believed to be the importance of researching fimS, Swaine commented:

FimS is important because it controls the regulation of the fim operon. The fim operon is basically the most important thing we currently know that enables E. coli to cause urinary tract infection; it’s the major virulence factor. Urinary tract infection, in turn, is responsible for a lot of antibiotic prescriptions worldwide, so it’s contributing a lot to antibiotic resistance as well – it’s got both public health implications as well as causing suffering for the individual patients. So of course we want to understand how the fim operon, which is so important for UTI, is regulated so we can figure out how to treat the disease. That’s why understanding the fimS genetic element, which is responsible for fim regulation, is so important.

With Swaine currently taking an evolutionary approach to help microbiologists integrate high throughput sequencing technologies into their research, when asked why he thinks this sequencing technology is so important for microbiology research, he stated:

Sequencing technology I think is very important for all aspects of biology at this point. I don’t think that it is particularly more important for microbiology, but I do think about sequencing technology as something that currently benefits microbiology perhaps slightly more than it does other fields. Sequencing technology is currently scaled very well for us - our genome sizes are smaller; we can get hundreds of genomes in single labs, which is out of reach if you wanted to do that with cancer genomes or human genomes. Therefore, almost all microbiology labs are able to have an awful lot of genomic information, and that increases the number of people we have with access to data and the freedom to think about the best way to use the sequencing technology and draw insights into what’s going on with the disease. The other thing is that for microbiology we can have truly complete full genome information. Especially with PacBio machines, we get not only complete, full assemblies, but we can also get epigenetic information genome-wide; this is still very difficult to do for a full human genome or cancer genome. So we still have a little bit of scaling to do for those diseases. That will happen of course, and the impact of sequencing will then be just as great on those fields. But if there is any argument that sequencing technology is helping microbiology more than other fields, I think this would be it.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

n ขึ้นนำไปสู่การประสบความสำเร็จที่ 2 ประจำปีจุลชีววิทยาและโรคติดเชื้อในเอเชียการมีเพศสัมพันธ์ของเราที่เราสัมภาษณ์ Swaine เฉิสิงคโปร์ NRF เพื่อนจากมหาวิทยาลัยแห่งชาติสิงคโปร์และสถาบันจีโนมของสิงคโปร์ ในงานวิจัยของเขาคือการ Swaine วิธีการวิวัฒนาการเพื่อบูรณาการเทคโนโลยีลำดับอัตราความเร็วสูงเข้ามาในชีวิตประจำวันของจุลชีววิทยา ในฐานะที่เป็นรูปแบบที่เขาจะใช้การติดเชื้อทางเดินปัสสาวะที่เกิดจากเชื้อ Escherichia coli Swaine จะนำเสนอ 'การทำความเข้าใจลำดับรูปแบบและฟังก์ชั่นของ FIMS, องค์ประกอบที่สำคัญของการกำกับดูแล UPEC ความรุนแรงผ่านกลายพันธุ์และ Next-Generation ลำดับ' ที่ 2 ประจำปีจุลชีววิทยาและโรคติดเชื้อเอเชียสภาคองเกรส. เมื่อถามว่าสิ่งที่เขาเชื่อว่าจะเป็นความสำคัญของการ วิจัย FIMS, Swaine แสดงความคิดเห็น: FIMS เป็นสิ่งสำคัญเพราะมันจะควบคุมกฎระเบียบของ operon FIM operon FIM นั้นเป็นสิ่งที่สำคัญที่สุดขณะนี้เรารู้ว่าช่วยให้เชื้อ E. coli ที่จะทำให้เกิดการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะ; มันเป็นปัจจัยที่สำคัญเป็นพิเศษ ติดเชื้อทางเดินปัสสาวะในที่สุดก็จะเป็นผู้รับผิดชอบจำนวนมากของยาปฏิชีวนะทั่วโลกจึงเอื้อจำนวนมากที่จะต้านทานยาปฏิชีวนะเช่นกัน - มันมีผลกระทบด้านสุขภาพทั้งภาครัฐเช่นเดียวกับที่ก่อให้เกิดความทุกข์ทรมานให้กับผู้ป่วยแต่ละราย ดังนั้นแน่นอนว่าเราต้องการที่จะเข้าใจวิธีการ operon FIM ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญสำหรับ UTI, การควบคุมเพื่อให้เราสามารถคิดออกว่าจะรักษาโรค นั่นเป็นเหตุผลที่การทำความเข้าใจองค์ประกอบทางพันธุกรรม FIMS ซึ่งเป็นผู้รับผิดชอบสำหรับการควบคุม FIM, เป็นสิ่งสำคัญดังนั้น. ด้วย Swaine ขณะนี้มีการวิวัฒนาการที่จะช่วยให้นักจุลชีววิทยารวมเทคโนโลยีลำดับอัตราความเร็วสูงในการวิจัยของพวกเขาเมื่อถามว่าทำไมเขาคิดว่าเทคโนโลยีลำดับนี้เพื่อให้เป็นสิ่งสำคัญสำหรับ การวิจัยทางจุลชีววิทยาเขารับรู้: เทคโนโลยีลำดับผมคิดว่าเป็นสิ่งสำคัญมากสำหรับทุกแง่มุมของชีววิทยาที่จุดนี้ ฉันไม่คิดว่ามันเป็นสิ่งที่สำคัญมากขึ้นโดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับจุลชีววิทยา แต่ฉันไม่คิดว่าเกี่ยวกับเทคโนโลยีการจัดลำดับว่าเป็นสิ่งที่เป็นประโยชน์ทางจุลชีววิทยาปัจจุบันอาจจะน้อยกว่าที่มันไม่สาขาอื่น ๆ เทคโนโลยีลำดับในปัจจุบันคือการปรับขนาดได้เป็นอย่างดีสำหรับเรา - ขนาดจีโนมของเรามีขนาดเล็ก; เราจะได้รับร้อยของจีโนมในห้องปฏิบัติการเดียวซึ่งเป็นออกจากการเข้าถึงถ้าคุณต้องการที่จะทำกับจีโนมของโรคมะเร็งหรือจีโนมของมนุษย์ ดังนั้นเกือบทุกห้องปฏิบัติการจุลชีววิทยาสามารถที่จะมีมากอันยิ่งใหญ่ของข้อมูลจีโนมและเพิ่มจำนวนของคนที่เรามีกับการเข้าถึงข้อมูลและเสรีภาพในการคิดเกี่ยวกับวิธีที่ดีที่สุดที่จะใช้เทคโนโลยีการจัดลำดับและวาดข้อมูลเชิงลึกในสิ่งที่เกิดขึ้น กับการเกิดโรค สิ่งอื่น ๆ ที่เป็นที่สำหรับจุลชีววิทยาที่เราสามารถมีข้อมูลจีโนมที่สมบูรณ์อย่างแท้จริงเต็มรูปแบบ โดยเฉพาะอย่างยิ่งกับเครื่อง PacBio ที่เราได้รับไม่เพียง แต่ที่สมบูรณ์ประกอบเต็ม แต่เรายังสามารถได้รับข้อมูล epigenetic จีโนมทั้ง; นี้ยังคงเป็นเรื่องยากมากที่จะทำสำหรับจีโนมมนุษย์เต็มหรือจีโนมโรคมะเร็ง ดังนั้นเราจึงยังคงมีนิด ๆ หน่อย ๆ ของการปรับขนาดที่จะทำสำหรับโรคเหล่านั้น ที่จะเกิดขึ้นแน่นอนและผลกระทบของการจัดลำดับจากนั้นจะเป็นเพียงที่ดีในเขตข้อมูลเหล่านั้น แต่ถ้ามีข้อโต้แย้งใด ๆ ว่าเทคโนโลยีจะช่วยให้การจัดลำดับจุลชีววิทยามากกว่าสาขาอื่น ๆ ผมคิดว่านี่จะเป็นมัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ฉันพาขึ้นของเราเด่นประจำปี&จุลชีววิทยาโรคติดเชื้อเอเชียคองเกรส เราสัมภาษณ์ swaine เฉินเพื่อน NRF สิงคโปร์ จากมหาวิทยาลัยแห่งชาติสถาบันจีโนม ของสิงคโปร์ และสิงคโปร์ ในงานวิจัยของเขา swaine คือการมีวิธีการวิวัฒนาการสูง throughput sequencing เพื่อบูรณาการเทคโนโลยีในชีวิตประจําวันของ microbiologists . เป็นแบบเขาใช้ การติดเชื้อทางเดินปัสสาวะที่เกิดจากเชื้อ Escherichia coli swaine จะนำเสนอความเข้าใจของลำดับการเปลี่ยนแปลงและการทำงานของ fims เป็นองค์ประกอบสำคัญของ upec กฎระเบียบและความรุนแรง ผ่านการรุ่นถัดไปลำดับที่ 2 ประจำปี&จุลชีววิทยาโรคติดเชื้อรัฐสภาเอเชีย

เมื่อถามสิ่งที่เขาเชื่อว่าเป็น fims ความสำคัญของการวิจัย ,swaine แสดงความคิดเห็น :

fims เป็นสิ่งสำคัญเพราะมันควบคุมระเบียบของ FIM โอเปอรอน . FIM โอเปอรอนเป็นพื้นฐานที่สำคัญที่สุด ขณะนี้เราทราบว่าช่วยให้เชื้ออีโคไลสาเหตุการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะ มันเป็นปัจจัยของโรคที่สำคัญ การติดเชื้อทางเดินปัสสาวะจะ รับผิดชอบมากของใบสั่งยาปฏิชีวนะทั่วโลกแล้วมันเกิดมากกับความต้านทานยาปฏิชีวนะเช่นกันซึ่งมีทั้งสาธารณสุขผลกระทบตลอดจนก่อให้เกิดความทุกข์ทรมานในผู้ป่วยแต่ละราย ดังนั้นแน่นอนว่าเราอยากจะรู้ว่า FIM โอเปอรอน ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญสำหรับ UTI , การควบคุมดังนั้นเราสามารถหาวิธีที่จะรักษาโรค นั่นเป็นเหตุผลที่เข้าใจ fims องค์ประกอบทางพันธุกรรม ,ซึ่งเป็นผู้รับผิดชอบในการควบคุม FIM , สำคัญมาก

พร้อม swaine ในปัจจุบันใช้วิธีการวิวัฒนาการเพื่อช่วย microbiologists รวมสูง throughput sequencing เทคโนโลยีในการวิจัยของตน เมื่อถามว่าทำไมเขาคิดว่านี้ลำดับเทคโนโลยีเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการวิจัยจุลชีววิทยา :

เขากล่าวลำดับเทคโนโลยี ผมคิดว่าเป็นสิ่งที่สำคัญมากสำหรับทุก ๆ ด้านชีววิทยา ณจุดนี้ ผมไม่คิดว่ามันเป็นโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่สำคัญสำหรับจุลชีววิทยา แต่ผมคิดเกี่ยวกับการเป็นสิ่งที่เทคโนโลยีในปัจจุบันประโยชน์จุลชีววิทยาบางทีเล็กน้อยกว่ามันเขตข้อมูลอื่น ๆ เทคโนโลยีในปัจจุบันการปรับดีสำหรับเรา - ขนาดจีโนมของเรามีขนาดเล็ก ;เราสามารถได้รับหลายร้อยของจีโนมใน Labs เดียวซึ่งเป็นออกจากการเข้าถึง ถ้าคุณต้องการที่จะทำแบบนั้นกับจีโนมมะเร็ง หรือมนุษย์จีโนม . ดังนั้นเกือบทุกห้องปฏิบัติการจุลชีววิทยาสามารถมีมากอันยิ่งใหญ่ของข้อมูลจีโนมและที่เพิ่มจำนวนคนได้เข้าถึงข้อมูลและเสรีภาพที่จะคิดเกี่ยวกับวิธีที่ดีที่สุดในการใช้เทคโนโลยีและข้อมูลเชิงลึกในการวาดอะไรกับโรค อีกเรื่องก็คือว่า เราสามารถมีความสมบูรณ์อย่างแท้จริงสำหรับจุลชีววิทยาเต็มข้อมูลจีโนม . โดยเฉพาะกับเครื่อง pacbio เราได้รับไม่เพียง แต่ที่สมบูรณ์เต็มรูปแบบ แอสเซมบลีแต่เรายังสามารถได้รับข้อมูล genome-wide Epigenetic นี้ยังคงเป็นเรื่องยากมากที่จะทำสำหรับมนุษย์เต็มพันธุกรรมหรือจีโนมมะเร็ง ดังนั้นเราจึงยังคงมีนิด ๆหน่อย ๆของการทำให้โรคเหล่านั้น นั่นจะเกิดขึ้นแน่นอน และผลกระทบของการจะเป็นเพียงที่ดีในเขตข้อมูลเหล่านั้นแต่หากมีการโต้แย้งว่าเทคโนโลยีช่วยการจุลชีววิทยามากกว่าสาขาอื่น ๆที่ฉันคิดว่านี้จะเป็น .