b) Phylogenetic analysis of the 18S

b) Phylogenetic analysis of the 18S and ITS1 rDNA sequences
To identify the nearest phylogenetic neighbors,
each partial sequence of 18S and ITS1 rDNA genes from
yeast strains TB2-1 and TW1-3, was compared to sequences
in the NCBI GenBank database (www.ncbi.nlm.nih.gov) using
the homology search tool (blastn) (Altschul et al., 1997).
To produce phylogenetic trees, sequences were aligned using
the CLUSTAL W multiple sequence alignment program
(version 1.81) (Thompson et al., 1994) and edited manually.
Alignments were performed using several yeasts that were
closely related to yeast strains TB2-1 and TW1-3, based on
information obtained using the BLAST search. Phylogenetic
trees were constructed using MEGA, version 3.1 (Kumar et
al., 2004).
Isolation of Thermotolerant Yeasts

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขการวิเคราะห์ phylogenetic 18S และลำดับ rDNA ITS1
เพื่อระบุการบ้าน phylogenetic,
แต่ละลำดับบางส่วน 18S และยีน rDNA ITS1 จาก
ยีสต์สายพันธุ์ TB2-1 และ TW1 3 ถูกเปรียบเทียบกับลำดับ
ใน NCBI GenBank ฐานข้อมูล (www.ncbi.nlm.nih.gov) ใช้
homology ค้นหาเครื่องมือ (blastn) (Altschul และ al., 1997) .
ผลิตต้นไม้ phylogenetic ลำดับถูกจัดใช้
CLUSTAL W
(version 1.81) โปรแกรมจัดลำดับหลาย (ทอมป์สันและ al., 1994) และแก้ไขด้วยตนเอง.
จัดแนวดำเนินใช้ yeasts หลายที่
เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับยีสต์ TB2 1 TW1-3 ตาม
ข้อมูลได้โดยใช้การค้นหาระเบิด Phylogenetic
ต้นไม้ถูกสร้างโดยใช้ร็อค เวอร์ชัน 3.1 (Kumar et
al., 2004) .
Yeasts แยก Thermotolerant

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข) การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของลำดับ 18S rDNA และ ITS1
เพื่อระบุสายวิวัฒนาการเพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุด
ของแต่ละลำดับบางส่วนของยีน 18S และ ITS1 rDNA จาก
ยีสต์ TB2-1 และ TW1-3 ถูกเมื่อเทียบกับลำดับ
ในฐานข้อมูล NCBI GenBank (www ncbi.nlm.nih.gov) โดยใช้
เครื่องมือในการค้นหาที่คล้ายคลึงกัน (ไทด์) (Altschul et al., 1997)
เพื่อผลิตต้นไม้ลำดับถูกจัดชิดโดยใช้
W โปรแกรม CLUSTAL ลำดับหลายจัดตำแหน่ง
(รุ่น 1.81) (ธ อมป์สันและคณะ , 1994) และแก้ไขด้วยตนเอง
Alignments ถูกดำเนินการโดยใช้หลายยีสต์ที่
เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสายพันธุ์ยีสต์ TB2-1 และ TW1-3 อยู่บนพื้นฐานของ
ข้อมูลที่ได้รับโดยใช้การค้นหาระเบิด phylogenetic
ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ MEGA, รุ่น 3.1 (Kumar และ
al., 2004)
การแยกยีสต์ทนร้อน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข ) การวิเคราะห์ชนิดของชนิดและพบ its1
หาเพื่อนบ้าน ซึ่งใกล้ที่สุด
แต่ละลำดับ 18S rDNA และบางส่วน its1 ยีนจาก
สายพันธุ์ยีสต์และ tb2-1 tw1-3 ถูกเปรียบเทียบกับลำดับ
ใน ncbi ขนาดฐานข้อมูล ( www.ncbi . nlm . NIH . gov ) ใช้เป็นเครื่องมือค้นหา ( blastn
( แอลเชิล et al . , 1997 ) .
ผลิตต้นไม้ phylogenetic ลำดับ ชิดใช้
การ clustal W หลายลำดับจัดโปรแกรม
( รุ่น 1.81 ) ( Thompson et al . , 1994 ) และแก้ไขด้วยตนเอง การใช้ยีสต์ได้

หลายที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ยีสต์และ tb2-1 tw1-3 ขึ้นอยู่กับ
ข้อมูลโดยใช้การค้นหาระเบิด ต้นไม้ phylogenetic
ถูกสร้างโดยใช้ร็อค รุ่น 3.1 ( Kumar et
al . , 2004 ) .
การแยกยีสต์ทนร้อน