Background: In national evaluations

Background: In national evaluations, direct genomic breeding values can be considered as correlated traits to
those for which phenotypes are available for traditional estimation of breeding values. For this purpose, estimates of
the accuracy of direct genomic breeding values expressed as genetic correlations between traits and their
respective direct genomic breeding values are required.
Methods: We derived direct genomic breeding values for 2239 registered Limousin and 2703 registered Simmental
beef cattle genotyped with either the Illumina BovineSNP50 BeadChip or the Illumina BovineHD BeadChip. For the
264 Simmental animals that were genotyped with the BovineHD BeadChip, genotypes for markers present on the
BovineSNP50 BeadChip were extracted. Deregressed estimated breeding values were used as observations in
weighted analyses that estimated marker effects to derive direct genomic breeding values for each breed. For each
breed, genotyped individuals were clustered into five groups using K-means clustering, with the aim of increasing
within-group and decreasing between-group pedigree relationships. Cross-validation was performed five times for
each breed, using four groups for training and the fifth group for validation. For each trait, we then applied a
weighted bivariate analysis of the direct genomic breeding values of genotyped animals from all five validation sets
and their corresponding deregressed estimated breeding values to estimate variance and covariance components.
Results: After minimizing relationships between training and validation groups, estimated genetic correlations
between each trait and its direct genomic breeding values ranged from 0.39 to 0.76 in Limousin and from 0.29 to
0.65 in Simmental. The efficiency of selection based on direct genomic breeding values relative to selection based
on parent average information ranged from 0.68 to 1.28 in genotyped Limousin and from 0.51 to 1.44 in genotyped
Simmental animals. The efficiencies were higher for 323 non-genotyped young Simmental animals, born after
January 2012, and ranged from 0.60 to 2.04.
Conclusions: Direct genomic breeding values show promise for routine use by Limousin and Simmental breeders
to improve the accuracy of predicted genetic merit of their animals at a young age and increase response to
selection. Benefits from selecting on direct genomic breeding values are greater for breeders who use natural
mating sires in their herds than for those who use artificial insemination sires. Producers with unregistered
commercial Limousin and Simmental cattle could also benefit from being able to identify genetically superior
animals in their herds, an opportunity that has in the past been limited to seed stock animals.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: ในการประเมินแห่งชาติ ค่าพันธุ์ genomic โดยตรงถือได้ว่าเป็นลักษณะ correlated กับผู้ที่ฟีมีการประเมินค่าการผสมพันธุ์แบบดั้งเดิม สำหรับวัตถุประสงค์นี้ ประเมินของความถูกต้องของ genomic พันธุ์ตรงค่าที่แสดงเป็นความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างลักษณะ และความค่าพันธุ์ genomic ตรงนั้น ๆ จำเป็นต้องใช้วิธีการ: เรามาค่าพันธุ์ตรง genomic 2239 ลงทะเบียน Limousin และ 2703 ลงทะเบียน Simmentalเนื้อวัว genotyped Illumina BovineSNP50 BeadChip หรือ Illumina BovineHD BeadChip สำหรับการสัตว์ Simmental 264 ที่ genotyped กับ BovineHD BeadChip ศึกษาจีโนไทป์สำหรับแสดงเครื่องหมายใน การBovineSNP50 BeadChip ถูกสกัด พันธุ์ deregressed ประเมินค่าถูกใช้เป็นข้อสังเกตในวิเคราะห์ถ่วงน้ำหนักที่ประเมินผลเครื่องหมายสามารถรับค่าพันธุ์ตรง genomic สำหรับแต่ละสายพันธุ์ สำหรับแต่ละสายพันธุ์ บุคคล genotyped ถูกจับกลุ่มเป็น 5 กลุ่มโดยใช้วิธีการ K คลัสเตอร์ มีจุดประสงค์เพื่อเพิ่มภายในกลุ่มและความสัมพันธ์ระหว่างกลุ่มเลือดลดลง ตรวจสอบระหว่างทำห้าครั้งสำหรับแต่ละสายพันธุ์ ใช้ 4 กลุ่มสำหรับการฝึกอบรมและกลุ่มห้าสำหรับการตรวจสอบ ติดละ เราแล้วใช้การวิเคราะห์ bivariate ถ่วงน้ำหนักของค่าตรง genomic พันธุ์สัตว์ genotyped จากชุดตรวจสอบห้าทั้งหมดและความสอดคล้อง deregressed ประเมินค่าการผสมพันธุ์เพื่อประเมินส่วนประกอบความแปรปรวนและความแปรปรวนร่วมResults: After minimizing relationships between training and validation groups, estimated genetic correlationsbetween each trait and its direct genomic breeding values ranged from 0.39 to 0.76 in Limousin and from 0.29 to0.65 in Simmental. The efficiency of selection based on direct genomic breeding values relative to selection basedon parent average information ranged from 0.68 to 1.28 in genotyped Limousin and from 0.51 to 1.44 in genotypedSimmental animals. The efficiencies were higher for 323 non-genotyped young Simmental animals, born afterJanuary 2012, and ranged from 0.60 to 2.04.Conclusions: Direct genomic breeding values show promise for routine use by Limousin and Simmental breedersto improve the accuracy of predicted genetic merit of their animals at a young age and increase response toselection. Benefits from selecting on direct genomic breeding values are greater for breeders who use naturalmating sires in their herds than for those who use artificial insemination sires. Producers with unregisteredcommercial Limousin and Simmental cattle could also benefit from being able to identify genetically superioranimals in their herds, an opportunity that has in the past been limited to seed stock animals.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประวัติความเป็นมาในการประเมินผลระดับชาติคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงถือได้ว่าเป็นลักษณะความสัมพันธ์กับผู้ที่ phenotypes ที่มีอยู่สำหรับการประมาณค่าแบบดั้งเดิมของคุณค่าการผสมพันธุ์
เพื่อจุดประสงค์นี้ประมาณการของความถูกต้องของคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงแสดงเป็นความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างลักษณะของพวกเขาและคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมที่เกี่ยวข้องโดยตรงจะต้อง. วิธีการ: เราได้รับคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรง 2239 จดทะเบียนลีมูและ 2703 ลงทะเบียน Simmental โคเนื้อ genotyped กับทั้ง Illumina BovineSNP50 BeadChip หรือ Illumina BovineHD BeadChip สำหรับ264 Simmental สัตว์ที่ถูก genotyped กับ BovineHD BeadChip, ยีนเครื่องหมายอยู่บนBovineSNP50 BeadChip ถูกสกัด Deregressed ประมาณค่าพันธุ์ถูกนำมาใช้เป็นข้อสังเกตในการถ่วงน้ำหนักวิเคราะห์ว่าผลกระทบเครื่องหมายโดยประมาณที่จะได้รับคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงแต่ละสายพันธุ์ สำหรับแต่ละสายพันธุ์บุคคล genotyped ถูกคลัสเตอร์เป็นห้ากลุ่มโดยใช้การจัดกลุ่ม K-หมายถึงมีวัตถุประสงค์ของการเพิ่มขึ้นภายในกลุ่มและการลดลงระหว่างกลุ่มความสัมพันธ์สายเลือด การตรวจสอบข้ามได้ดำเนินการครั้งที่ห้าสำหรับแต่ละสายพันธุ์โดยใช้สี่กลุ่มสำหรับการฝึกอบรมและกลุ่มที่ห้าสำหรับการตรวจสอบ สำหรับลักษณะแต่ละครั้งเราแล้วนำไปใช้วิเคราะห์ bivariate ถ่วงน้ำหนักของคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงของสัตว์ genotyped จากทั่วทุกห้าชุดการตรวจสอบและคุณค่าการผสมพันธุ์ประมาณderegressed ที่สอดคล้องกันของพวกเขาที่จะประเมินความแปรปรวนและส่วนประกอบแปรปรวน. ผล: หลังจากการลดความสัมพันธ์ระหว่างกลุ่มการฝึกอบรมและการตรวจสอบ ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมโดยประมาณระหว่างแต่ละลักษณะและคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงอยู่ในช่วง0.39-0.76 ในลีมูและที่จะ 0.29 จาก0.65 ใน Simmental ประสิทธิภาพของการเลือกบนพื้นฐานของคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงที่สัมพันธ์กับการเลือกขึ้นอยู่กับข้อมูลที่ผู้ปกครองเฉลี่ยอยู่ในช่วง 0.68-1.28 ใน genotyped ลีมูและ 0.51-1.44 ใน genotyped สัตว์ Simmental ประสิทธิภาพสูงสำหรับ 323 ที่ไม่ genotyped สัตว์ Simmental หนุ่มสาวที่เกิดหลังเดือนมกราคมปี2012 และอยู่ในช่วง 0.60-2.04. สรุป: ตรงคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมแสดงสัญญาสำหรับการใช้งานประจำวันโดยลีมูและพ่อพันธุ์แม่พันธุ์ Simmental เพื่อปรับปรุงความถูกต้องของบุญทางพันธุกรรมที่คาดการณ์ของ สัตว์ของพวกเขาในวัยหนุ่มสาวและเพิ่มการตอบสนองต่อการเลือก ประโยชน์ที่ได้รับจากการเลือกในคุณค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงมากขึ้นสำหรับพ่อพันธุ์แม่พันธุ์ที่ใช้ธรรมชาติตระกูลผสมพันธุ์ในฝูงของพวกเขามากกว่าสำหรับผู้ที่ใช้ตระกูลผสมเทียม ผู้ผลิตที่ไม่ได้จดทะเบียนกับลีมูในเชิงพาณิชย์และวัว Simmental ยังจะได้ประโยชน์จากความสามารถในการระบุที่เหนือกว่าทางพันธุกรรมสัตว์ในฝูงของพวกเขามีโอกาสที่มีในอดีตถูกจำกัด เมล็ดพันธุ์สัตว์สต็อก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประวัติ : ในการประเมินผลระดับชาติ การผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงค่า ถือได้ว่าเป็นผู้ที่มีลักษณะสัมพันธ์

เกิดมีอยู่ค่าดั้งเดิมของค่าการผสมพันธุ์ สำหรับวัตถุประสงค์นี้ การประเมินความถูกต้องของการผสมพันธุ์จีโนม
ตรงค่าสหสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างลักษณะ และแสดงเป็นค่าการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงของตน

วิธี ที่จําเป็นเราได้รับการผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงค่าลงทะเบียนและลงทะเบียนซิมเมนทอล 2239 ลีมูแซง 385
โค genotyped ใด Illumina bovinesnp50 beadchip หรือ Illumina bovinehd beadchip . สำหรับสัตว์ที่ถูก genotyped
264 ซิมเมนทอลกับ bovinehd beadchip พันธุ์สำหรับเครื่องหมาย , ของขวัญ
bovinesnp50 beadchip ถูกสกัดderegressed ค่าการผสมพันธุ์ที่ใช้เป็นข้อสังเกตในการวิเคราะห์ผลกระทบที่คาดว่า
ถ่วงน้ำหนักเพื่อให้ได้พันธุ์ที่มีเครื่องหมายตรงค่าสำหรับแต่ละสายพันธุ์ สำหรับแต่ละ
พันธุ์ genotyped บุคคลถูกแบบออกเป็น 5 กลุ่ม โดยใช้ k-means การจัดกลุ่มที่มีจุดมุ่งหมายของการเพิ่ม
ภายในกลุ่มและลดลงระหว่างความสัมพันธ์ของสายเลือดกรุ๊ปข้ามการตรวจสอบแบ่งเป็นห้าครั้ง
แต่ละพันธุ์ ใช้ 4 กลุ่มเพื่อการฝึกอบรม และกลุ่มที่ 5 สำหรับการตรวจสอบ สำหรับแต่ละลักษณะ เราก็ใช้ค่าถ่วงน้ำหนักของการวิเคราะห์ถดถอย
การผสมพันธุ์จีโนมของสัตว์โดยตรง genotyped ทั้งหมด 5 ชุด และจากการตรวจสอบที่สอดคล้องกันของพวกเขา
deregressed การผสมพันธุ์ค่าประมาณความแปรปรวนและส่วนประกอบ
ผลลัพธ์ : ความหลังจากการลดความสัมพันธ์ ระหว่างกลุ่มที่ฝึกและตรวจสอบความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม (
ระหว่างแต่ละลักษณะ และค่าการผสมพันธุ์จีโนมของมันโดยตรงตั้งแต่ 0.39 ถึง 0.76 ในโอกแลนด์และ 0.29

0.65 ในซิมเมนทอล . ประสิทธิภาพของการเลือกขึ้นอยู่กับพันธุ์จีโนมโดยตรงค่าสัมพันธ์กับลักษณะการต่อข้อมูลระหว่างผู้ปกครอง
เฉลี่ย 0.68 128 genotyped Libya และ 0.51 ถึง 1.44 ใน genotyped
สัตว์ซิมเมนทอล . ประสิทธิภาพสูงสำหรับ 323 genotyped หนุ่มซิมเมนทอลไม่ใช่สัตว์ เกิดหลังจาก
มกราคม 2555 อยู่ระหว่าง 0.60 ถึง 2.04 .
สรุป : การผสมพันธุ์จีโนมโดยตรงค่าแสดงสัญญาสำหรับใช้ประจำวันและพันธุ์ซิมเมนทอล
โดยโอกแลนด์