Evaluation of the electrostatic pro

Evaluation of the electrostatic properties of biomolecules has become a standard practice in molecular biophysics. Foremost among the models used to elucidate the electrostatic potential is the Poisson-Boltzmann equation; however, existing methods for solving this equation have limited the scope of accurate electrostatic calculations to relatively small biomolecular systems. Here we present the application of numerical methods to enable the trivially parallel solution of the Poisson-Boltzmann equation for supramolecular structures that are orders of magnitude larger in size. As a demonstration of this methodology, electrostatic potentials have been calculated for large microtubule and ribosome structures. The results point to the likely role of electrostatics in a variety of activities of these structures.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ประเมินคุณสมบัติสถิตชื่อโมเลกุลชีวภาพได้กลายเป็น มาตรฐานปฏิบัติในชีวฟิสิกส์ได้โมเลกุล ระหว่างแบบจำลองที่ใช้ elucidate เป็นงานสำคัญเป็นสมการตัวโบลทซ์มานน์ปัว อย่างไรก็ตาม วิธีที่มีอยู่สำหรับการแก้สมการนี้ได้จำกัดขอบเขตถูกต้องคำนวณงานระบบวทคร ๕๐๘ ค่อนข้างเล็ก ที่นี่เรานำเสนอโปรแกรมประยุกต์วิธีเลขให้โซลูชั่น trivially ขนานของตัวโบลทซ์มานน์ปัวสมการโครงสร้าง supramolecular ที่มีขนาดใหญ่ขนาดของใบสั่ง เป็นการสาธิตวิธีนี้ มีการศักยภาพงานคำนวณขนาดใหญ่ไมโครทิวบูลและโครงสร้างของไรโบโซม ผลชี้ไปแนวโน้มบทบาทของ electrostatics ในหลากหลายกิจกรรมของโครงสร้าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การประเมินคุณสมบัติของสารชีวโมเลกุลไฟฟ้าสถิตได้กลายเป็นมาตรฐานการปฏิบัติในระดับโมเลกุลชีวฟิสิกส์ สำคัญที่สุดในหมู่รุ่นที่ใช้ในการอธิบายศักยภาพไฟฟ้าสถิตเป็นสมการปัวซอง-Boltzmann; แต่วิธีการที่มีอยู่สำหรับการแก้สมการนี​​้ได้รับการ จำกัด ขอบเขตของการคำนวณที่ถูกต้องให้กับไฟฟ้าสถิตค่อนข้างระบบชีวโมเลกุลขนาดเล็ก ที่นี่เรานำเสนอการประยุกต์ใช้วิธีการเชิงตัวเลขเพื่อให้การแก้ปัญหาขนานนิดของสม Poisson-Boltzmann สำหรับโครงสร้าง supramolecular ที่มีคำสั่งของขนาดขนาดใหญ่ ขณะที่การสาธิตวิธีการนี​​้ศักยภาพไฟฟ้าสถิตได้รับการคำนวณสำหรับ microtubule ขนาดใหญ่และโครงสร้างไรโบโซม ชี้กับบทบาทที่มีแนวโน้มของผลการไฟฟ้าสถิตในกิจกรรมที่หลากหลายของโครงสร้างเหล่านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การประเมินคุณสมบัติของไฟฟ้าสถิตของชีวโมเลกุล ได้กลายเป็นมาตรฐานการปฏิบัติในโมเลกุลฟิสิกส์ . ชั้นดีของแบบจำลองเพื่อศึกษาศักยภาพคือ Boltzmann สมการปัวซง อย่างไรก็ตาม มีอยู่วิธีการแก้สมการนี้ได้จำกัดขอบเขตของการคำนวณที่ถูกต้องระบบไฟฟ้าสถิต ชีวโมเลกุล ค่อนข้างเล็กที่นี่เรานำเสนอการใช้วิธีเชิงตัวเลขเพื่อเปิดใช้งานเล็กๆ น้อยๆ ของปัวซงสมการ Boltzmann เส้นขนานโซลูชั่นสำหรับโครงสร้าง supramolecular ที่คำสั่งของขนาดใหญ่ในขนาด เป็นการสาธิตวิธีนี้ศักยภาพไฟฟ้าสถิตได้ถูกคำนวณสำหรับไมโครทูบูลขนาดใหญ่และโครงสร้างไรโบโซม .ผลลัพธ์ชี้ไปที่แนวโน้มบทบาทของไฟฟ้าสถิตในความหลากหลายของกิจกรรมของโครงสร้างเหล่านี้