RD typing
Many RDs represent unique event polymorphisms due to re-
laxed selection (Hershberg et al., 2008) that allows for slightly deleterious
mutations to accumulate. Therefore RDs can act as
unambiguous markers for genetic lineages (Brosch et al., 2002;
Mostowy et al., 2002; Tsolaki et al., 2004) as long as they are the
result of a deletion that was independent from the recombination
of insertion sequences (Alland et al., 2007). Lineages defined by
RDs were shown to be associated with different geographical regions
(Gagneux and Small, 2007; Reed et al., 2009). While, in contrast
to SNPs, determination of RDs in the laboratory is easy and
straightforward also on a small scale, RDs share the main disadvantages
of SNPs. The genetic distance between two groups of strains
is impossible to determine only on basis of absence and presence of
RDs, and their discriminatory power is limited for lineages that do
not exhibit the assayed RDs.
ถนนพิมพ์ใน RDs แสดงเหตุการณ์เฉพาะ polymorphisms จาก re-เลือก laxed (Hershberg et al., 2008) ที่อนุญาตให้ร้ายเล็กน้อยการกลายพันธุ์เพื่อสะสม ดังนั้น RDs สามารถทำหน้าที่เป็นเครื่องหมายที่ชัดเจนสำหรับเชื้อชาติพันธุกรรม (Brosch et al., 2002Mostowy และ al., 2002 Tsolaki et al., 2004) ตราบใดที่มีการผลของการลบที่มีอิสระจาก recombination ที่แทรกลำดับ (Alland et al., 2007) เชื้อชาติ defined โดยมีแสดง RDs จะเชื่อมโยงกับภูมิภาคทางภูมิศาสตร์(Gagneux และขนาดเล็ก 2007 Reed et al., 2009) ในขณะที่ ในทางตรงข้ามการ SNPs ความมุ่งมั่นของ RDs ในห้องปฏิบัติการได้อย่างง่าย ๆ และตรงไปตรงมายังบนมาตราส่วนขนาดเล็ก RDs ร่วมเสียหลักของ SNPs ระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่าง 2 กลุ่มของสายพันธุ์ไม่สามารถกำหนดเฉพาะบนพื้นฐานของการขาดงานและสถานะของRDs และอำนาจโจ่งแจ้งไม่จำกัดเชื้อชาติที่ทำไม่แสดง assayed RDs.
การแปล กรุณารอสักครู่..

พิมพ์ RD
RDs
หลายคนเป็นตัวแทนของความหลากหลายเหตุการณ์ที่ไม่ซ้ำอีกครั้งเนื่องจากการเลือกlaxed (Hershberg et al., 2008)
ที่ช่วยให้การอันตรายเล็กน้อยกลายพันธุ์ที่จะสะสม ดังนั้น RDs
สามารถทำหน้าที่เป็นตัวบ่งชี้ที่ชัดเจนสำหรับlineages ทางพันธุกรรม (Brosch, et al., 2002;
Mostowy, et al., 2002;. Tsolaki, et al, 2004) ตราบใดที่พวกเขาเป็นผลมาจากการลบที่เป็นอิสระจากการรวมตัวกันอีกที่แทรกลำดับ (Alland et al., 2007) lineages นิยามโดยRDs มีการแสดงที่จะเชื่อมโยงกับพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน(Gagneux และขนาดเล็ก 2007. กก et al, 2009) ในขณะที่ในทางตรงกันข้ามการ SNPs กำหนด RDs ในห้องปฏิบัติการเป็นเรื่องง่ายและยังตรงไปตรงมาในขนาดเล็ก, RDs แบ่งปันข้อเสียที่สำคัญของSNPs ระยะทางพันธุกรรมระหว่างกลุ่มที่สองของสายพันธุ์ที่เป็นไปไม่ได้ที่จะตรวจสอบเฉพาะบนพื้นฐานของการขาดและการปรากฏตัวของRDs และอำนาจการเลือกปฏิบัติของพวกเขาจะถูก จำกัด สำหรับ lineages ที่ไม่ได้แสดงRDs assayed
การแปล กรุณารอสักครู่..

ข. พิมพ์
หลาย RDS แสดงเหตุการณ์เฉพาะพันธุ์เนื่องจาก Re -
laxed เลือก ( hershberg et al . , 2008 ) ที่ช่วยให้เล็กน้อยคง
การกลายพันธุ์เพื่อสะสม ดังนั้น RDS สามารถแสดงเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม ( พันธุ์
ชัดเจนสำหรับ บอร์ช et al . , 2002 ;
mostowy et al . , 2002 ; tsolaki et al . , 2004 ) ตราบเท่าที่พวกเขา
ผลของการลบที่อิสระจากการ
ในการแทรกลำดับ ( alland et al . , 2007 ) เมื่อเดอจึงเน็ดโดย
RDS มีการแสดงที่จะเชื่อมโยงกับที่แตกต่างกันทางภูมิศาสตร์ภูมิภาค
( gagneux และขนาดเล็ก , 2007 ; รีด et al . , 2009 ) ในขณะที่ในทางตรงกันข้าม
เพื่อ snps การหา RDS ในปฏิบัติการที่ง่ายและตรงไปตรงมา
ยังในขนาดเล็ก , RDS แบ่งปัน ข้อเสียหลักของ snps
. ระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่างสองกลุ่มของสายพันธุ์
มันเป็นไปไม่ได้ที่จะตรวจสอบเฉพาะบนพื้นฐานของการขาดและการแสดงตนของ
RDS , และอำนาจการเลือกปฏิบัติของพวกเขาถูก จำกัด สำหรับพันธุ์ที่
ไม่แสดงปริมาณ RDS .
การแปล กรุณารอสักครู่..
