A traditional concept in bacterial

A traditional concept in bacterial genetics states that housekeeping genes, those involved in basic metabolic functions needed for maintenance of the cell, are encoded in the chromosome, whereas genes required for dealing with challenging environmental conditions are located in plasmids. Exceptions to this rule have emerged from genomic sequence data of bacteria with multipartite genomes. The genome sequence of R. etli CFN42 predicts the presence of panC and panB genes clustered together on the 642 kb plasmid p42f and a second copy of panB on plasmid p42e. They encode putative pantothenate biosynthesis enzymes (pantoate-β-alanine ligase and 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, respectively). Due to their ubiquitous distribution and relevance in the central metabolism of the cell, these genes are considered part of the core genome; thus, their occurrence in a plasmid is noteworthy. In this study we investigate the contribution of these genes to pantothenate biosynthesis, examine whether their presence in plasmids is a prevalent characteristic of the Rhizobiales with multipartite genomes, and assess the possibility that the panCB genes may have reached plasmids by horizontal gene transfer.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แนวคิดดั้งเดิมในแบคทีเรียพันธุศาสตร์แจ้งว่า แฟกซ์ยีน ส่วนฟังก์ชั่นพื้นฐานที่จำเป็นสำหรับการบำรุงรักษาของเซลล์ เผาผลาญจะถูกเข้ารหัสในโครโมโซม ในขณะที่ยีนที่จำเป็นสำหรับการจัดการกับความท้าทายด้านสิ่งแวดล้อม เงื่อนไขอยู่ใน plasmids ข้อยกเว้นกฎนี้จะโผล่ออกมาจากข้อมูลลำดับจีโนมของแบคทีเรียกับ multipartite genomes ลำดับพันธุ R. etli CFN42 ทำนายการมีอยู่ของยีน panC และ panB คลัสเตอร์กัน p42f plasmid 642 kb และสำเนาสองของ panB บน plasmid p42e พวกเขาเข้ารหัส pantothenate อ้างว่าฝาสังเคราะห์เอนไซม์ (ligase pantoate-อะลานีนβและ 3-เมทิล-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase ตามลำดับ) เนื่องจากการกระจายอยู่ทุกหนแห่งและในการเผาผลาญเซลล์กลาง ยีนเหล่านี้จะเป็นส่วนหนึ่งของพันธุหลัก ดังนั้น เกิดใน plasmid เป็นสำคัญ ในการศึกษานี้ เราตรวจสอบสัดส่วนของยีนเหล่านี้ในการสังเคราะห์ pantothenate ตรวจสอบว่าสถานะของตนใน plasmids เป็นลักษณะที่แพร่หลายของ Rhizobiales กับ multipartite genomes และประเมินความเป็นไปได้ว่า ยีน panCB อาจถึง plasmids โดยการถ่ายทอดยีนในแนวนอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แนวคิดแบบดั้งเดิมในพันธุกรรมแบคทีเรียระบุว่ายีนดูแลทำความสะอาดผู้ที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญอาหารฟังก์ชั่นพื้นฐานที่จำเป็นสำหรับการบำรุงรักษาเซลล์ที่มีการเข้ารหัสในโครโมโซมในขณะที่ยีนที่จำเป็นสำหรับการรับมือกับสภาพแวดล้อมที่ท้าทายอยู่ในพลาสมิด ข้อยกเว้นกฎนี้ได้โผล่ออกมาจากข้อมูลลำดับจีโนมของเชื้อแบคทีเรียที่มีจีโนม multipartite ลำดับจีโนมของอาร์ etli CFN42 คาดการณ์การปรากฏตัวของ Panc และยีน panB คลัสเตอร์ร่วมกันใน p42f พลาสมิด 642 กิโลไบต์และสำเนาที่สองของ panB บนพลาสมิด p42e พวกเขาเข้ารหัสเอนไซม์สังเคราะห์แพนโทธีสมมุติ (pantoate-β-อะลานีนลิกาเซและ 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase ตามลำดับ) เนื่องจากการกระจายแพร่หลายและความเกี่ยวข้องของพวกเขาในการเผาผลาญอาหารกลางของเซลล์ยีนเหล่านี้เป็นส่วนหนึ่งของจีโนมการพิจารณาหลัก; จึงเกิดขึ้นในพลาสมิดเป็นที่น่าสังเกต ในการศึกษานี้เราจะตรวจสอบผลงานของยีนเหล่านี้เพื่อการสังเคราะห์แพนโทธีการตรวจสอบว่าพวกเขาอยู่ในพลาสมิดเป็นลักษณะที่แพร่หลายของ Rhizobi​​ales กับจีโนม multipartite และประเมินความเป็นไปได้ว่ายีน panCB อาจจะไปถึงพลาสมิดโดยการถ่ายโอนยีนแนวนอน