in C. reinhardtii (Molnar et al., 2

in C. reinhardtii (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Yamasaki
et al., 2013; Voshall et al., 2014) and in V. carteri (Li et al., 2014),
and potential endogenous targets have been predicted by computational
approaches (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Li
et al., 2014; Voshall et al., 2014). However, target gene identification
is a challenging problem (Thomas et al., 2010; Voshall et al.,
2014) and the false-positive prediction rate for miRNA targets in
microalgae is currently unknown. Interestingly, most characterized
land plant miRNAs appear to regulate transcripts with highly complementary
binding sites and preferentially trigger their endonucleolytic
cleavage by Argonaute proteins (Bartel, 2009; Axtell,
2013; Rogers and Chen, 2013). This also appears to be the case
for some miRNAs in both C. reinhardtii and V. carteri, where
expected target RNA cleavage products have been experimentally
detected (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Li et al., 2014;
Voshall et al., 2014). Yet, very few of the reported Chlamydomonas
or Volvox miRNAs have identifiable targets with near perfect complementarity
(Molnar et al., 2007; Li et al., 2014; Voshall et al.,
2014) and recent evidence suggests that miRNA regulation of transcript
expression in Chlamydomonas may operate, at least for certain
targets, by translation repression (Ma et al., 2013; Yamasaki
et al., 2013; Voshall et al., 2014).
In summary, the RNA interference mechanism appears to be
entirely absent from some microalgae and its biological role(s) in
the species that possess core RNAi machinery components is
poorly understood. Limited evidence suggests that a siRNA pathway
may operate as a defense mechanism against transposon
mobilization and, possibly, in antiviral immunity. A miRNA pathway,
when present, may contribute to endogenous gene regulation.
However, the identification of genuine miRNA targets remains
challenging and, to date, no specific metabolic or physiological process
controlled or modulated by miRNAs has been clearly defined
in microalgae. Other possible functions of RNAi in phenomena such
as heterochromatin formation, DNA methylation, DNA repair, or
maintenance of genome stability, to our knowledge, have not been
explored in these aquatic organisms.
5. Gene silencing mechanisms and biofuel/biomaterial
production
Algae exhibit the potential for manufacturing a wide range of
biofuel precursors and bioproducts, and advances in algal genomics,
genetic engineering and synthetic biology may facilitate the
development of industrial strains suitable to specific production
purposes. However, a serious limitation to strain improvement is
our incomplete understanding of gene and metabolic network regulation
in most algal species. In many eukaryotes, gene silencing
mechanisms have been implicated in context-dependent reversible
gene repression, a critical component of gene networks
involved in stress responses and in developmental programs
(Law and Jacobsen, 2010; Bannister and Kouzarides, 2011;
Ohsawa et al., 2013; Derkacheva and Hennig, 2014). Interestingly,
most microalgae accumulate biofuel-precursor compounds, such
as starch and triacylglycerols (TAGs), primarily under stress conditions
(Hu et al., 2008; Radakovits et al., 2010; La Russa et al., 2012;
Liu and Benning, 2013). Transcriptome analyses in C. reinhardtii
(reviewed by Liu and Benning, 2013) have revealed that a subset
of genes involved in TAG biosynthesis, such as those encoding certain
acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferases, display greatly
enhanced or almost exclusive expression in nitrogen-deprived
cells. These observations suggest that gene silencing mechanisms
may indeed be involved in modulating metabolic responses to
stress in microalgae. Specific genes for storage compound biosynthesis
appear to be repressed under normal environmental conditions,
when they may not be needed, and activated primarily under

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใน C. reinhardtii (Molnar et al., 2007 เจียว et al., 2007 Yamasakiร้อยเอ็ด al., 2013 Voshall et al., 2014) และใน V. carteri (Li et al., 2014),และได้รับการคาดการณ์เป้าหมาย endogenous โดยคำนวณวิธี (Molnar et al., 2007 เจียว et al., 2007 Liร้อยเอ็ด al., 2014 Voshall et al., 2014) อย่างไรก็ตาม เป้าหมายการระบุยีนปัญหาท้าทาย (Thomas et al., 2010 Voshall et al.,2014) และอัตราทำนายเท็จบวกสำหรับเป้าหมาย miRNA ในmicroalgae เป็นที่รู้จักในปัจจุบัน เป็นเรื่องน่าสนใจ สุดลักษณะmiRNAs จะ ควบคุมใบแสดงผลกับพืชบกสูงเสริมรวมไซต์ และโน้ตทริกเกอร์ endonucleolytic ของพวกเขาปริ โดยวิลเลียม Argonaute (Bartel, 2009 Axtell2013 โรเจอร์สและเฉิน 2013) นี้ยังปรากฏเป็น กรณีสำหรับบาง miRNAs และ V. carteri, C. reinhardtii ทั้งที่ผลิตภัณฑ์ปริอาร์เอ็นเอเป้าหมายที่คาดว่าจะได้รับ experimentallyตรวจพบ (Molnar et al., 2007 เจียว et al., 2007 Li et al., 2014Voshall et al., 2014) แต่ มากน้อยของ Chlamydomonas รายงานหรือ Volvox miRNAs เป้าหมายบุคคลที่ใกล้สมบูรณ์ complementarity(Molnar et al., 2007 Li et al., 2014 Voshall et al.,2014) และหลักฐานล่าสุดแนะนำระเบียบนั้น miRNA ของเสียงบรรยายอาจมีนิพจน์ Chlamydomonas น้อยแน่เป้าหมาย โดยปราบปรามแปล (Ma et al., 2013 Yamasakiร้อยเอ็ด al., 2013 Voshall et al., 2014)ในสรุป กลไกการแทรกแซงอาร์เอ็นเอที่ดูเหมือนจะ เป็นทั้งหมดมาจาก microalgae บางและบทบาทของชีวภาพในเป็นชนิดที่มีส่วนประกอบเครื่องจักรหลักของ RNAiเข้าใจงาน หลักฐานที่จำกัดแนะนำที่เป็นทางเดิน siRNAอาจมีเป็นกลไกป้องกันกับ transposonเคลื่อนไหว และ อาจจะ ภูมิคุ้มกันต้านไวรัส ทางเดิน miRNAเมื่อปัจจุบัน อาจนำไปสู่การควบคุมยีน endogenousอย่างไรก็ตาม รหัสของแท้ miRNA เป้าหมายยังคงท้าทาย และ วัน ที่ กระบวนการเผาผลาญ หรือสรีรวิทยาไม่เฉพาะควบคุม หรือสันทัดโดย miRNAs มีการกำหนดอย่างชัดเจนใน microalgae ฟังก์ชันอื่น ๆ สามารถของ RNAi ในปรากฏการณ์ดังกล่าวเป็นผู้แต่ง heterochromatin ปรับ ซ่อม แซมดีเอ็นเอ หรือไม่ได้บำรุงรักษาเสถียรภาพจีโนม การเพิ่มอุดมในสิ่งมีชีวิตเหล่านี้น้ำ5. ยีน silencing กลไกและเชื้อเพลิง ชีวภาพ/biomaterialผลิตสาหร่ายแสดงศักยภาพในการผลิตหลากหลายเชื้อเพลิงชีวภาพ precursors และ bioproducts และความก้าวหน้าใน algal genomicsพันธุวิศวกรรมและชีววิทยาสังเคราะห์อาจอำนวยความสะดวกการพัฒนาสายพันธุ์อุตสาหกรรมเหมาะสมกับการผลิตวัตถุประสงค์ อย่างไรก็ตาม มีจำกัดต้องใช้การปรับปรุงอย่างจริงจังเราเข้าใจที่สมบูรณ์ของยีนและการควบคุมเครือข่ายเผาผลาญในสายพันธ์สุด algal ในหลาย eukaryotes ยีน silencingกลไกมีการเกี่ยวข้องในการกลับขึ้นอยู่กับบริบทยีนปราบปราม ส่วนประกอบสำคัญของเครือข่ายยีนในการตอบสนองความเครียดและพัฒนาโปรแกรม(กฎหมายและจาบ 2010 เฟรแมนเทิ้ลและ Kouzarides, 2011Al. ร้อยเอ็ด Ohsawa, 2013 Derkacheva ก Hennig, 2014) เป็นเรื่องน่าสนใจmicroalgae ส่วนใหญ่สะสมเชื้อเพลิงชีวภาพสารตั้งต้นสารประกอบ เช่นเป็นแป้งและ triacylglycerols (TAGs), ภายใต้เงื่อนไขความเครียดหลัก(Hu et al., 2008 Radakovits et al., 2010 ลา Russa et al., 2012เล่าแล้ว Benning, 2013) Transcriptome วิเคราะห์ใน C. reinhardtii(ตรวจทาน โดยหลิวและ Benning, 2013) ได้เปิดเผยที่ย่อยของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์แท็ก เช่นเข้ารหัสบางอย่างacyl CoA: diacylglycerol acyltransferases แสดงมากนิพจน์พิเศษ หรือเกือบเฉพาะในปราศจากไนโตรเจนเซลล์ ข้อสังเกตเหล่านี้แนะนำยีนที่ silencing กลไกแน่นอนอาจเกี่ยวข้องกับเกี่ยวตอบเผาผลาญความเครียดใน microalgae เฉพาะยีนสำหรับสังเคราะห์ผสมเก็บจะเป็น repressed ภายใต้สภาพแวดล้อมปกติเมื่อพวกเขาอาจไม่ถูกต้อง และเรียกใช้งานหลักภายใต้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในซี reinhardtii (โมลนา, et al, 2007;. Zhao et al, 2007;. Yamasaki
, et al, 2013;. Voshall, et al, 2014.) และ V. carteri (Li et al, 2014.)
และภายนอกที่มีศักยภาพ เป้าหมายที่ได้รับการคาดการณ์โดยการคำนวณ
วิธีการ (โมลนา, et al, 2007;. Zhao et al, 2007;. Li
et al, 2014;.. Voshall, et al, 2014) อย่างไรก็ตามการระบุยีนเป้าหมาย
เป็นปัญหาที่ท้าทาย (โทมัสและคณะ, 2010;.. Voshall, et al,
2014) และอัตราการทำนายเท็จบวกสำหรับเป้าหมาย miRNA ใน
สาหร่ายในขณะนี้ไม่เป็นที่รู้จัก ที่น่าสนใจมากที่สุดมีลักษณะเฉพาะ
โรงงานที่ดิน miRNAs ปรากฏในการควบคุมใบรับรองผลการเรียนที่มีความสมบูรณ์สูง
เว็บไซต์ผูกพันและชอบเรียก endonucleolytic ของพวกเขา
แตกแยกโดยโปรตีน Argonaute (Bartel 2009; Axtell,
2013; โรเจอร์สและ Chen, 2013) นอกจากนี้ยังดูเหมือนจะเป็นกรณี
สำหรับ miRNAs บางส่วนทั้งในและ C. reinhardtii V. carteri ที่
คาดว่าผลิตภัณฑ์แตกแยก RNA เป้าหมายได้รับการทดลอง
ตรวจพบ (โมลนา, et al, 2007;.. Zhao et al, 2007; Li และคณะ. 2014;
. Voshall, et al, 2014) แต่น้อยมากที่มีการรายงาน Chlamydomonas
หรือ Volvox miRNAs มีเป้าหมายที่สามารถระบุตัวกับ complementarity ใกล้ที่สมบูรณ์แบบ
(โมลนา, et al, 2007;. Li et al, 2014;.. Voshall, et al,
2014) และหลักฐานที่ผ่านมาแสดงให้เห็นว่ากฎระเบียบของ miRNA หลักฐาน
การแสดงออก ใน Chlamydomonas อาจดำเนินการอย่างน้อยสำหรับบาง
เป้าหมายโดยการปราบปรามการแปล (Ma, et al, 2013;. Yamasaki
, et al, 2013;.. Voshall, et al, 2014).
ในการสรุปกลไกการแทรกแซงอาร์เอ็นเอที่ดูเหมือนจะ
ขาดจากกันอย่างสิ้นเชิง บางสาหร่ายและบทบาททางชีวภาพของมัน (s) ใน
สปีชีส์ที่มีส่วนประกอบเครื่องจักร RNAi แกน
เข้าใจ มีหลักฐาน จำกัด แสดงให้เห็นว่าทางเดิน siRNA
อาจดำเนินการเป็นกลไกการป้องกัน transposon
ระดมและอาจเป็นไปได้ในการสร้างภูมิคุ้มกันต้านไวรัส ทางเดิน miRNA,
เมื่อปัจจุบันอาจนำไปสู่การควบคุมยีนภายนอก.
อย่างไรก็ตามการระบุเป้าหมาย miRNA แท้ยังคงเป็น
ความท้าทายและจนถึงปัจจุบันยังไม่มีการเผาผลาญอาหารที่เฉพาะเจาะจงหรือกระบวนการทางสรีรวิทยา
ควบคุมหรือปรับโดย miRNAs ได้รับการกำหนดไว้อย่างชัดเจน
ในสาหร่าย ฟังก์ชั่นที่เป็นไปได้อื่น ๆ ของ RNAi ในปรากฏการณ์ดังกล่าว
เป็นรูปแบบ heterochromatin, methylation ดีเอ็นเอซ่อมแซมดีเอ็นเอหรือ
การบำรุงรักษาเสถียรภาพของจีโนมเพื่อความรู้ของเรายังไม่ได้รับ
การสำรวจในสิ่งมีชีวิตเหล่านี้.
5 ยีนกลไกเงียบและเชื้อเพลิงชีวภาพ / วัสดุชีวภาพ
การผลิต
สาหร่ายแสดงศักยภาพในการผลิตที่หลากหลายของ
สารตั้งต้นของเชื้อเพลิงชีวภาพและชีวภาพและความก้าวหน้าในฟังก์ชั่นสาหร่าย
พันธุวิศวกรรมและชีววิทยาสังเคราะห์อาจอำนวยความสะดวกใน
การพัฒนาสายพันธุ์ที่เหมาะสมกับอุตสาหกรรมการผลิตเฉพาะ
วัตถุประสงค์ อย่างไรก็ตามข้อ จำกัด อย่างจริงจังเพื่อการปรับปรุงสายพันธุ์เป็น
ความเข้าใจที่ไม่สมบูรณ์ของเราของยีนและการควบคุมการเผาผลาญของเครือข่าย
มากที่สุดในสายพันธุ์สาหร่าย ในยูคาริโอหลายสมรยีน
กลไกการมีส่วนเกี่ยวข้องในบริบทย้อนกลับได้ขึ้นอยู่กับ
การปราบปรามยีนเป็นองค์ประกอบที่สำคัญของเครือข่ายของยีน
ที่เกี่ยวข้องในการตอบสนองต่อความเครียดและในโปรแกรมการพัฒนา
(กฎหมายและจาคอป, 2010; บันไดและ Kouzarides, 2011;
. Ohsawa และคณะ, 2013; Derkacheva และหนิก, 2014) ที่น่าสนใจ
มากที่สุดสาหร่ายสะสมสารประกอบเชื้อเพลิงชีวภาพ-สารตั้งต้นเช่น
แป้งและ triacylglycerols (แท็ก) ส่วนใหญ่อยู่ภายใต้เงื่อนไขความเครียด
(Hu et al, 2008;. Radakovits et al, 2010;. La Russa, et al, 2012;.
หลิวและเบนนิ่ง 2013) ยีนวิเคราะห์ในซี reinhardtii
(สอบทานโดยหลิวและเบนนิ่ง 2013) ได้เปิดเผยว่าเซต
ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ TAG เช่นบางเข้ารหัสผู้
acyl-CoA: acyltransferases diacylglycerol จอแสดงผลอย่างมาก
ที่เพิ่มขึ้นหรือการแสดงออก แต่เพียงผู้เดียวเกือบไนโตรเจนที่ถูกลิดรอน
เซลล์ ข้อสังเกตเหล่านี้แสดงให้เห็นว่ากลไกการยับยั้งการแสดงออกของยีน
แน่นอนอาจจะมีส่วนร่วมในการปรับการตอบสนองการเผาผลาญอาหารที่จะ
ความเครียดในสาหร่าย ยีนที่เฉพาะเจาะจงสำหรับการจัดเก็บสารสังเคราะห์
ดูเหมือนจะอัดอั้นภายใต้สภาพแวดล้อมปกติ
เมื่อพวกเขาอาจจะไม่จำเป็นและเปิดใช้งานเป็นหลักภายใต้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สมบูรณ์ของเราความเข้าใจของยีนและการควบคุมในเครือข่ายการสลาย
ชนิดของสาหร่ายมากที่สุด ในหลายยูแคริโอต ยีน silencing
กลไกได้รับการเกี่ยวข้องในบริบทแบบผันกลับได้
ยีนถูกปราบปราม เป็นองค์ประกอบที่สำคัญของเครือข่ายที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองความเครียดและยีน

( โปรแกรมในการพัฒนากฎหมายและ Jacobsen , 2010 ; บันได และ kouzarides 2011 ;
โอซาว่า et al . , 2013 ;C . reinhardtii ( โมลเนอร์ et al . , 2007 ; Zhao et al . , 2007 ; ยามาซากิ
et al . , 2013 ; voshall et al . , 2010 ) และ V . carteri ( Li et al . , 2010 ) ,
และเป้าหมายในศักยภาพได้ถูกคาดการณ์โดยวิธีการเชิงคำนวณ
( โมลเนอร์ et al . , 2007 ; Zhao et al . , 2007 ; Li
et al . , 2014 ; voshall et al . , 2010 ) อย่างไรก็ตาม เป้าหมายของการเป็นปัญหาที่ท้าทาย
( โทมัส et al . , 2010voshall et al . ,
2014 ) และการพยากรณ์อัตรา false-positive สำหรับ mirna เป้าหมาย
สาหร่ายขนาดเล็กเป็นหลักแหล่ง ที่น่าสนใจมากที่สุด ลักษณะที่ดิน mirnas
พืชปรากฏควบคุมบันทึกกับประกอบอย่างมาก
ผูกพันเว็บไซต์และ preferentially ก่อความแตกแยก endonucleolytic
โดยโปรตีน argonaute ( บาร์เทิล , 2009 ; แอกซ์เทลล์
, 2013 ; โรเจอร์ และ เฉิน , 2013 )นี้ยังปรากฏเป็นกรณี
บาง mirnas ทั้ง C และ reinhardtii โวลต์ carteri ที่
คาดว่าเป้าหมายอาร์เอ็นเอตัวผลิตภัณฑ์มีขนาด
ตรวจพบ ( โมลเนอร์ et al . , 2007 ; Zhao et al . , 2007 ; Li et al . , 2014 ;
voshall et al . , 2010 ) แต่มากน้อยของรายงานคลาไมโดโมแนส
หรือ volvox mirnas มีเป้าหมายระบุตัวที่อยู่ใกล้ที่สมบูรณ์แบบข้อมูล
( โมลเนอร์ et al . , 2007 ;ชนิดที่มีส่วนประกอบหลัก RNAi เครื่องจักร
ไม่ค่อยเข้าใจ . หลักฐานที่ชี้ให้เห็นว่าบริษัทเส้นทางจำกัด
อาจทำงานเป็นกลไกการป้องกันต่อต้านการ ? ? ? ? ?
และอาจในภูมิคุ้มกันต่างๆ เป็น mirna ทางเดิน
เมื่อปัจจุบันอาจมีผลต่อการควบคุมยีนโครงสร้าง .
แต่กำหนดเป้าหมาย mirna แท้ยังคง
ท้าทายและวันที่ไม่เฉพาะการเผาผลาญอาหารหรือกระบวนการทางสรีรวิทยา
ควบคุมหรือปรับโดย mirnas ได้ชัดเจน
ใน Server ฟังก์ชั่นอื่น ๆที่เป็นไปได้ของ RNAi ในปรากฏการณ์ดังกล่าว
เป็นการดีเอ็นเอ methylation ซ่อมแซมดีเอ็นเอสปีชีส์ หรือ รักษาเสถียรภาพ
( เพื่อความรู้ของเรา ได้สำรวจสิ่งมีชีวิตเหล่านี้
.
5 ยีนไซเลนซิง กลไก และเชื้อเพลิงชีวภาพ /
ินสาหร่ายผลิต
แสดงศักยภาพในการผลิตที่หลากหลายของ
ตั้งต้นเชื้อเพลิงชีวภาพและ bioproducts และความก้าวหน้าในสาหร่าย Genomics ,
พันธุวิศวกรรมและชีววิทยาสังเคราะห์อาจจะอำนวยความสะดวกในการพัฒนาสายพันธุ์ที่เหมาะสมกับอุตสาหกรรมการผลิต
วัตถุประสงค์ที่เฉพาะเจาะจง อย่างไรก็ตาม ข้อจำกัดในการปรับปรุงสายพันธุ์คือ
ร้ายแรงLi et al . , 2014 ; voshall et al . ,
2014 ) และหลักฐานล่าสุดชี้ว่า การควบคุมการแสดงออกของ mirna Transcript
ในคลาไมโดโมแนสอาจทำงานได้ อย่างน้อยก็เพื่อเป้าหมายบางอย่าง โดยการปราบปราม
แปล ( ma et al . , 2013 ; ยามาซากิ
et al . , 2013 ; voshall et al . , 2010 ) .
สรุปได้ว่า การแทรกแซงกลไก RNA จะ
ทั้งหมดไม่อยู่จากสาหร่ายขนาดเล็กและบทบาทของชีวภาพ ( s )
สมบูรณ์ของเราความเข้าใจของยีนและการควบคุมในเครือข่ายการสลาย
ชนิดของสาหร่ายมากที่สุด ในหลายยูแคริโอต ยีน silencing
กลไกได้รับการเกี่ยวข้องในบริบทแบบผันกลับได้
ยีนถูกปราบปราม เป็นองค์ประกอบที่สำคัญของเครือข่ายที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองความเครียดและยีน

( โปรแกรมในการพัฒนากฎหมายและ Jacobsen , 2010 ; บันได และ kouzarides 2011 ;
โอซาว่า et al . , 2013 ;และ derkacheva เฮนนิค 2014 ) ทั้งนี้ คาดว่าส่วนใหญ่สะสมเชื้อเพลิงตั้งต้น

เป็นสารประกอบ เช่น แป้ง และไตรกลีเซอรอล ( แท็ก ) , หลักภายใต้ความเครียด
( Hu et al . , 2008 ; radakovits et al . , 2010 ; Russa ลา et al . , 2012 ;
หลิว และ เบนนิ่ง , 2013 ) การวิเคราะห์ทราน ริปโตม reinhardtii C .
( ตรวจสอบโดย หลิว และ เบนนิ่ง , 2013 ) ได้เปิดเผยว่า ส่วนย่อย