We investigated enrichment with sal

We investigated enrichment with salicylate as a method to stimulate the degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) by a microbial community from a bioreactor treating PAH-contaminated soil. DNA-based stable isotope probing (SIP) was used to compare the effect of alternate methods of salicylate addition (spike vs slow, continuous addition) on the diversity of the enriched microbial community. After identification of salicylate degraders by SIP, real-time quantitative PCR (qPCR) primers were developed to quantify the abundances of three groups containing salicylate-utilizing organisms in the bioreactor community before and after enrichment. The different methods of salicylate addition were found to select for different microbial communities. Two groups containing salicylate-degrading bacteria increased in abundance substantially after enrichment by continuous addition of salicylate but did not increase in abundance in response to the spike addition, whereas a third group increased in abundance in response to both methods of salicylate addition. The initial rate of naphthalene mineralization increased significantly after enrichment by spike addition of salicylate, but neither phenanthrene nor benzo[a]

pyrene mineralization rates were enhanced. Continuous addition of salicylate did not enhance the mineralization rate for any of the PAHs. These results suggest that enrichment with salicylate can select for naphthalene-degrading bacteria, but does not select for organisms responsible for degrading PAHs of higher molecular weight. Differences in microbial selection observed in this study that resulted from different rates of carbon source addition also have implications for the design of SIP experiments with water-soluble carbon sources.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราตรวจสอบบ่อ มีซาลิไซเลตเป็นวิธีการที่จะกระตุ้นการสลายตัวของไฮโดรคาร์บอนหอม polycyclic (PAHs) โดยชุมชนจุลินทรีย์จากการ bioreactor treating ละปนเปื้อนดิน ดีเอ็นเอโดยใช้ไอโซโทปอาศัย (SIP) ถูกใช้เพื่อเปรียบเทียบผลของวิธีการอื่นนอกจากซาลิไซเลต (ชั่วกับช้า ต่อเนื่องเพิ่ม) บนความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์ค่อน หลังจากรหัสของ degraders ซาลิไซเลตโดย SIP ไพรเมอร์ PCR (qPCR) เชิงปริมาณแบบเรียลไทม์ได้พัฒนาวัดปริมาณ abundances ของกลุ่มที่สามที่ประกอบด้วยซาลิไซเลตใช้ชีวิตในชุมชน bioreactor ก่อน และ หลังการเติมเต็ม พบวิธีการแตกต่างกันของซาลิไซเลตนี้เลือกชุมชนจุลินทรีย์ กลุ่มที่สองประกอบด้วยซาลิไซเลตลดแบคทีเรียที่เพิ่มขึ้นในความอุดมสมบูรณ์มากหลังจากเติมเต็มเพิ่มอย่างต่อเนื่องของซาลิไซเลต แต่ได้ไม่เพิ่มขึ้นมากมายในการตอบสนองนี้ชั่ว ในขณะที่กลุ่มที่สามที่เพิ่มขึ้นในความอุดมสมบูรณ์ในการตอบสนองทั้งสองวิธีนี้ซาลิไซเลต อัตราเริ่มต้นของ mineralization แนฟทาลีนที่เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญหลังจากเติมเต็มชั่วแห่งซาลิไซ เลต แต่ไม่ฟีแนนทรีน หรือ benzo [a]ไพรีน mineralization ราคาถูกปรับปรุง ซาลิไซเลตเพิ่มอย่างต่อเนื่องไม่ได้เพิ่มอัตรา mineralization ของ PAHs ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำที่ โดดเด่นกับซาลิไซเลตสามารถเลือกสำหรับแบคทีเรียลดแนฟทาลีน แต่ไม่ได้เลือกสำหรับสิ่งมีชีวิตที่ชอบลด PAHs ของน้ำหนักโมเลกุลสูง ความแตกต่างในตัวเลือกจุลินทรีย์ที่พบในการศึกษานี้เป็นผลมาจากราคาแตกต่างกันของคาร์บอนแหล่งนี้ยังมีผลกระทบสำหรับการออกแบบการทดลองจิบกับแหล่งคาร์บอนที่ละลายใน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราตรวจสอบการตกแต่งด้วยซาลิไซเลตเป็นวิธีการกระตุ้นให้เกิดการสลายตัวของ polycyclic หอมไฮโดรคาร์บอน (PAHs) โดยชุมชนจุลินทรีย์จากเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพรักษาดิน PAH ที่ปนเปื้อน ดีเอ็นเอที่ใช้ไอโซโทปละเอียดที่มีเสถียรภาพ (SIP) ถูกใช้ในการเปรียบเทียบผลของวิธีการอื่นนอกจากนี้ซาลิไซ (เข็มเทียบช้านอกจากนี้อย่างต่อเนื่อง) เกี่ยวกับความหลากหลายของชุมชนที่อุดมด้วยจุลินทรีย์ หลังจากที่บัตรประจำตัวของซาลิไซ degraders โดย SIP แบบ real-time PCR เชิงปริมาณ (qPCR) ไพรเมอร์ได้รับการพัฒนาที่จะหาจำนวนปริมาณของสามกลุ่มที่มีชีวิตซาลิไซ-ใช้ในชุมชนเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพก่อนและหลังการเพิ่มคุณค่า วิธีการที่แตกต่างกันนอกจากนี้ซาลิไซเลตพบว่าเลือกสำหรับกลุ่มจุลินทรีย์ที่แตกต่างกัน ทั้งสองกลุ่มที่มีเชื้อแบคทีเรียซาลิไซย่อยสลายเพิ่มขึ้นในความอุดมสมบูรณ์อย่างมากหลังจากการตกแต่งโดยการเพิ่มอย่างต่อเนื่องของซาลิไซเลต แต่ไม่ได้เพิ่มขึ้นในความอุดมสมบูรณ์ในการตอบสนองนอกจากขัดขวางในขณะที่กลุ่มที่สามเพิ่มขึ้นในความอุดมสมบูรณ์ในการตอบสนองต่อวิธีการทั้งสองนอกจากนี้ซาลิไซเลต อัตราการเริ่มต้นของแร่เหม็นเพิ่มขึ้นอย่างมากหลังจากการเพิ่มคุณค่าโดยนอกเหนือขัดขวางของซาลิไซเลต แต่ไม่ฟีแนนทรีหรือ benzo [] pyrene อัตราแร่ที่ถูกเพิ่ม นอกจากนี้อย่างต่อเนื่องของซาลิไซเลตไม่ได้เสริมสร้างอัตราแร่ใด ๆ ของพีเอเอช ผลการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่าการเพิ่มคุณค่าด้วยซาลิไซเลตสามารถเลือกสำหรับแบคทีเรียย่อยสลายเหม็น แต่ไม่ได้เลือกสำหรับสิ่งมีชีวิตที่รับผิดชอบในการย่อยสลายสาร PAHs น้ำหนักโมเลกุลสูง ความแตกต่างในการเลือกจุลินทรีย์พบในการศึกษาครั้งนี้เป็นผลมาจากอัตราที่แตกต่างกันนอกจากนี้แหล่งคาร์บอนยังมีผลกระทบต่อการออกแบบการทดลอง SIP กับแหล่งคาร์บอนที่ละลายน้ำได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราได้เสริมกับซาลิไซเลตเป็นวิธีการกระตุ้นการย่อยสลายสารโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน ( PAHs ) โดยชุมชนจุลินทรีย์จากถังปฏิกรณ์ชีวภาพการปนเปื้อนในดิน ดีเอ็นเอจากเจ็ดเทพโจรสลัดละเอียด ( SIP ) ถูกใช้เพื่อเปรียบเทียบผลของวิธีการอื่นนอกเหนือจากซาลิซิเลต ( เข็ม VS ช้าเพิ่มต่อเนื่อง ) ในความหลากหลายของความเป็นชุมชนของจุลินทรีย์ หลังจากระบุความสามารถในการย่อยสลายคน โดยจิบเวลา ปริมาณ PCR ( qpcr ) โดยพัฒนาให้วัด abundances สามกลุ่มที่มีคนใช้สิ่งมีชีวิตในชุมชน ( ก่อนและหลังการเสริมสมรรถนะวิธีการที่แตกต่างกันของคน พบว่า โดยเลือกชุมชนจุลินทรีย์ต่าง ๆ สองกลุ่มที่มีแบคทีเรียย่อยสลายคนเพิ่มขึ้นในความอุดมสมบูรณ์อย่างมากหลังจากการเพิ่มอย่างต่อเนื่อง โดยคน แต่ไม่ได้เพิ่มขึ้นมากมายในการตอบสนองที่จะขัดขวางสำหรับส่วนกลุ่มที่สามเพิ่มขึ้นมากมายในการตอบสนองของคนทั้ง 2 วิธี อัตราเริ่มต้นของแนพทาลีน การเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญหลังจากเสริมด้วยเข็มและซาลิไซเลท แต่ทั้งฟีแนนทรีนและเบนโซ [ ]

สำหรับการอัตรากำลังเพิ่ม นอกจากนี้อย่างต่อเนื่องของซาลิไซเลทไม่ได้เพิ่มอัตราการใด ๆของพลาสเตอร์ยาผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า การอยู่กับคนสามารถเลือกสำหรับแบคทีเรียที่ได้รับแนพทาลีน แต่ไม่ได้เลือกสำหรับสิ่งมีชีวิตรับผิดชอบสลายพีเอเอชสูงกว่าโมเลกุล .ความแตกต่างในการตรวจสอบจุลินทรีย์ในการศึกษานี้เป็นผลมาจากอัตราที่แตกต่างกันนอกจากนี้ยังมีแหล่งคาร์บอนสำหรับการออกแบบของจิบทดลองแหล่งคาร์บอนละลายน้ำ .