3.2.5. Predictable or non-predictab

3.2.5. Predictable or non-predictable changes in metabolites in SGT
lines
The observed changes in the major glycoalkaloids a-solanine
and a-chaconine were as predicted from the enzymes encoded
by the SGT1, SGT2 and SGT3 genes (McCue et al., 2005, 2006,
2007) although in the present study a-chaconine did not increase
to compensate for lower a-solanine levels in SGT1 lines as reported
by McCue et al. (2005). However, in other studies we have indeed
seen such a compensatory effect (unpublished data), but the reasons
for the inconsistency are unclear. The SGT2 lines also show
a compensatory response with a-solanine increasing as a-chaconine
decreased. However, for SGT2 lines this does not take the
total glycoalkaloid levels back to those of the WT. The increases
in b-sitosterol and fucosterol levels in SGT3 lines may well indicate
an overall decrease in flux from sterols into glycoalkaloids as a
result of down-regulating the specific sterol glycosyltransferase
reactions. Total glycoalkaloid content is indeed lowest in SGT3
lines. However, total glycoalkaloid levels were also significantly
lower than the WT in two out of three SGT2 lines (sgt2-11 and
sgt2-18), and again this was associated with increases in b-sitosterol
and fucosterol. Arnqvist, Dutta, Jonsson, and Sitbon (2003)
showed that over-expressing a soybean SMT1 gene (which encodes
a key enzyme of an isoprenoid branch pathway leading to plasma
membrane alkylated sterols) decreased tuber glycoalkaloid content
by ca. 60% with associated increases in both isofucosterol
and sitosterol. The increases in b-sitosterol and fucosterol in
SGT2 lines were not accompanied by overall decreases in total glycoalkaloid
levels so are less easily explained without knowledge of
glycoalkaloid turnover rates and fluxes into and out of sterol pools.
In this study, compared with the WT control there were major
reductions in glucose and fructose levels in all other controls used
and all of the SGT lines assessed. A very similar pattern emerged
for levels of chlorogenic acid and its parent cinnamic and caffeic
acids. Given the fact that these phenotypes were apparent in lines
that had only been regenerated through tissue culture (non-transgenic),
or that had been transformed with an empty vector (no
antisense SGT gene sequences) prior to regeneration, these effects
cannot be explained by targeted modifications to glycoalkaloid
biosynthesis. The effects could therefore be regarded as unintended
consequences of the processes used to regenerate plants.
With regard to genetically modified organisms, there continues
to be a major interest in the academic, industrial and regulatory
sectors in unintended effects resulting from targeted modified
expression of endogenous genes, from the insertion of new genes
and target proteins, and indeed from the process of genetic modi-
fication itself (Herman & Price 2013, and references therein). Some
of these effects may be unintended, but predictable, in terms of
known interactions between metabolic pathways. Others may
not be predictable and, in theory, could result from, for example,
the interruption by the insert of endogenous genes or regulatory
elements. Whilst such effects could be argued for the transgenic
SGT and the empty vector (BIN+) lines used in our study, it would
seem extremely unlikely that the common biochemical phenotypes
observed for sugars and specific phenolic acids result from
the interruption, by independent insertion events, of similar/identical
host genes. The effect is also seen in the non-transgenic, tissue
culture (TC)-derived control (see also Shepherd, McNicol, Razzo,
Taylor, & Davies, 2006). In a recent study the phytonutrient profiles
in more than 800 somaclones of potato developed through somatic
embryogenesis were assessed (Nassar, Kubow, Leclerc, & Donnelly,
2014). Several phenolics, including chlorogenic acid, caffeic acid
derivatives, ferulic acid derivatives as well as the flavonoid rutin,
ranged in concentration from 10- to 100-fold, with some lines
exceeding control tuber concentrations by >7-fold. Similarly,
ascorbic acid ranged >3-fold, with some lines showing significantly
greater concentrations than the control. Thus a more likely

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.2.5 การคาดการณ์ หรือคาดเดาไม่ได้เปลี่ยนแปลงในสารในส่วนที่เหลือบรรทัดสังเกตการเปลี่ยนแปลงสำคัญ glycoalkaloids มี solanineและ a chaconine ถูกเป็นคาดการณ์จากเอนไซม์ถูกเข้ารหัสโดยยีน SGT1, SGT2 และ SGT3 (McCue et al. 2005, 20062007) แม้ว่าในการศึกษา ต่อ chaconine ไม่เพิ่มเพื่อชดเชยระดับระดับล่างมี solanine ในบรรทัด SGT1 เป็นรายงานโดย McCue et al. (2005) อย่างไรก็ตาม ในการศึกษาอื่นๆ เรามีแน่นอนเห็นเช่นชดเชยผล (ไม่เปิดเผยข้อมูล), แต่ในเหตุผลไม่สอดคล้องกันชัดเจน แสดงบรรทัด SGT2การตอบสนองชดเชย ด้วยเพิ่มเป็น a chaconine มี solanineลดลง อย่างไรก็ตาม SGT2 บรรทัดนี้ ไม่มีการระดับรวม glycoalkaloid กลับไปของ WT การเพิ่มในระดับ b-sitosterol และ fucosterol ใน SGT3 บรรทัดเดียวอาจการลดลงโดยรวมฟลักซ์จากสเตอรอลส์เป็น glycoalkaloids เป็นการผลของการควบคุมลงได้ glycosyltransferase เฉพาะสเตอรอลปฏิกิริยา เนื้อหารวม glycoalkaloid เป็นจริงต่ำที่สุดใน SGT3บรรทัด อย่างไรก็ตาม ระดับ glycoalkaloid รวมก็มากต่ำกว่า WT ในบรรทัด SGT2 สองในสาม (sgt2-11 และsgt2-18), และอีกครั้ง นี้เกี่ยวข้องกับการเพิ่มขึ้นใน b sitosterolและ fucosterol Arnqvist บินายัคดัตตา Jonsson และ Sitbon (2003)แสดงให้เห็นว่ามากกว่าถ่ายทอดยีน SMT1 ถั่วเหลือง (ซึ่ง encodesเอนไซม์สำคัญของเดินสาขา isoprenoid ที่ต่อเมมเบรนคีเลตสเตอรอลส์) ลดลงเนื้อหา glycoalkaloid หัวca. 60% กับการเพิ่มขึ้นที่เกี่ยวข้องในทั้ง isofucosterolและ sitosterol เพิ่มใน b sitosterol และ fucosterol ในบรรทัด SGT2 ได้มาพร้อมกับส่วนลดลงโดยรวมในรวม glycoalkaloidระดับดังนั้นอธิบายได้ โดยความรู้น้อยได้อย่างง่ายดายอัตราการหมุนเวียน glycoalkaloid และตัวช่วยหลอมเข้า และออก จากสระว่ายน้ำสเตอรอลในการศึกษานี้ เมื่อเทียบกับการควบคุมน้ำหนัก ก็สำคัญลดระดับกลูโคสและฟรักโทสในตัวควบคุมอื่น ๆ ที่ใช้และบรรทัดที่เหลือทั้งหมดประเมิน โผล่ออกมารูปแบบคล้ายกันมากสำหรับระดับของกรดขึ้นและหลักของ cinnamic และ caffeicกรด ให้ความจริงที่ว่า ไทป์เหล่านี้ได้ปรากฏในบรรทัดที่ได้ถูกสร้างผ่านเนื้อเยื่อ (ไม่ใช่จำลอง),หรือที่มีกลายกับเวกเตอร์ว่างเปล่า (ไม่มียีน antisense SGT ลำดับ) ก่อนการฟื้นฟู ผลกระทบเหล่านี้ไม่สามารถอธิบายได้ โดยการปรับเปลี่ยนเป้าหมาย glycoalkaloidสังเคราะห์ ดังนั้นจะถือว่าผลกระทบไม่ตั้งใจเป็นผลของกระบวนการที่ใช้การสร้างพืชเกี่ยวกับสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรม ยังคงมีจะ สนใจสำคัญในการศึกษา อุตสาหกรรม และกฎระเบียบเป้าหมายภาคไม่ตั้งใจผลกระทบที่เกิดจากแก้ไขแสดงออกของยีนภายนอก จากการแทรกของยีนใหม่และ โปรตีนเป้าหมาย และแน่นอน จากกระบวนการทางพันธุกรรม modi -fication เอง (Herman และ 2013 ราคา และอ้างอิงในนั้น) บางผลกระทบเหล่านี้อาจจะไม่ได้ตั้งใจ แต่คาด การณ์ ในแง่ของปฏิสัมพันธ์ที่รู้จักระหว่างทางเดินเผาผลาญ คนอื่น ๆ อาจไม่สามารถคาดการณ์ และ ในทางทฤษฎี อาจส่งผล เช่นหยุดชะงัก โดยการแทรก ของยีนภายนอก หรือข้อบังคับองค์ประกอบ ในขณะที่ผลกระทบดังกล่าวอาจโต้เถียงสำหรับการจำลองส่วนที่เหลือ และบรรทัดว่างเวกเตอร์ (ช่อง +) ใช้ในการศึกษาของเรา มันจะดูเหมือนไม่น่ามากที่ไทป์ชีวเคมีทั่วไปน้ำตาลและกรดฟีนอเฉพาะผลจากสังเกตขัดจังหวะ โดยอิสระแทรกเหตุการณ์ ความคล้ายคลึงและเหมือนกันยีนที่โฮสต์ ยังเห็นผลในการปลอดจำลอง เนื้อเยื่อวัฒนธรรม (TC) -มาควบคุม (ดู Shepherd, McNicol, Razzoเทย์เลอร์ และเดวีส์ 2006) ในการศึกษาประวัติ phytonutrientใน somaclones กว่า 800 ของมันฝรั่งทอดกายการเกิดเอ็มบริโอได้ราคาประเมิน (Nassar, Kubow, Leclerc และ Donnelly2014) หลาย phenolics รวมขึ้นกรด กรด caffeicตราสารอนุพันธ์ อนุพันธ์กรด ferulic เป็น flavonoid rutinอยู่ในช่วงในความเข้มข้นจาก 10-การ 100-fold มีบางบรรทัดเกินควบคุมความเข้มข้นของหัวโดย > 7-fold ในทำนองเดียวกันกรดแอสคอร์บิโจมตีระยะไกล > 3-fold มีบางบรรทัดแสดงอย่างมีนัยสำคัญความเข้มข้นมากขึ้นกว่าการควบคุม จึงมีแนวโน้มมากขึ้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.2.5 การเปลี่ยนแปลงที่คาดการณ์หรือไม่สามารถคาดเดาได้ในสารใน SGT
สาย
การเปลี่ยนแปลงที่สังเกตใน glycoalkaloids สำคัญ-solanine
และ-chaconine ถูกเป็นที่คาดการณ์จากเอนไซม์เข้ารหัส
โดย SGT1, SGT2 และ SGT3 ยีน (McCue et al., 2005 2006
2007) ถึงแม้ว่าในการศึกษาปัจจุบัน A-chaconine ไม่ได้เพิ่มขึ้น
เพื่อชดเชยการลดระดับ A-solanine ในสาย SGT1 ตามที่รายงาน
โดย McCue et al, (2005) อย่างไรก็ตามในการศึกษาอื่น ๆ ที่เราได้แน่นอน
เห็นเช่นผลการชดเชย (ข้อมูลที่ไม่ถูกเผยแพร่) แต่เหตุผล
สำหรับความไม่สอดคล้องกันไม่ชัดเจน เส้น SGT2 ยังแสดงให้เห็น
การตอบสนองการชดเชยด้วย-solanine เพิ่มขึ้นเป็น A-chaconine
ลดลง แต่สำหรับสาย SGT2 นี้ไม่ได้ใช้
ระดับ glycoalkaloid ทั้งหมดกลับไปยังผู้ของ WT เพิ่มขึ้น
ใน B-sitosterol และ fucosterol ระดับในสาย SGT3 ดีอาจบ่งชี้ถึงการ
ลดลงโดยรวมในของเหลวจาก sterols เข้า glycoalkaloids เป็น
ผลมาจากการลงควบคุมการไกลโคซิ sterol เฉพาะ
ปฏิกิริยา เนื้อหา glycoalkaloid รวมเป็นจริงต่ำสุดใน SGT3
สาย อย่างไรก็ตามระดับ glycoalkaloid รวมอย่างมีนัยสำคัญ
ต่ำกว่า WT ในสองสามคนออกจากเส้น SGT2 (sgt2-11 และ
sgt2-18) และอีกครั้งนี้มีความสัมพันธ์กับการเพิ่มขึ้นของ B-sitosterol
และ fucosterol Arnqvist, Dutta, จอนส์และ Sitbon (2003)
แสดงให้เห็นว่าการแสดงมากกว่ายีน SMT1 ถั่วเหลือง (ซึ่ง encodes
เอนไซม์ที่สำคัญของสาขาทางเดิน isoprenoid นำไปสู่พลาสมา
เมมเบรน sterols alkylated) ลดลงเนื้อหาหัว glycoalkaloid
โดย CA 60% กับการเพิ่มขึ้นที่เกี่ยวข้องทั้งใน isofucosterol
และ sitosterol เพิ่มขึ้นใน B-sitosterol และ fucosterol ใน
สาย SGT2 ไม่ได้มาพร้อมกับการลดลงโดยรวมใน glycoalkaloid รวม
ระดับเพื่อให้มีการอธิบายน้อยได้อย่างง่ายดายโดยไม่ต้องมีความรู้ใน
อัตราการหมุนเวียน glycoalkaloid และฟลักซ์เข้าและออกจากสระว่ายน้ำ sterol ของ.
ในการศึกษาครั้งนี้เมื่อเทียบกับการควบคุมน้ำหนัก ที่สำคัญมี
การลดลงของน้ำตาลกลูโคสและฟรุกโตสระดับในการควบคุมอื่น ๆ ทั้งหมด
และทุกสาย SGT ประเมิน รูปแบบคล้ายกันมากโผล่ออกมา
ในระดับของกรด chlorogenic และซินนามิกแม่และ caffeic
กรด ให้ความจริงที่ phenotypes เหล่านี้เห็นได้ชัดในสาย
ที่ได้รับเพียงสร้างใหม่ผ่านการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อ (Non-ดัดแปรพันธุกรรม)
หรือที่ได้รับการเปลี่ยนกับเวกเตอร์ว่างเปล่า (ไม่มี
ลำดับ antisense SGT ยีน) ก่อนที่จะมีการฟื้นฟูผลกระทบเหล่านี้
ไม่สามารถอธิบายได้ด้วย การปรับเปลี่ยนการกำหนดเป้าหมายไป glycoalkaloid
สังเคราะห์ ผลกระทบจึงจะได้รับการยกย่องในฐานะที่ไม่ได้ตั้งใจ
ผลกระทบของกระบวนการที่ใช้ในการงอกใหม่พืช.
เกี่ยวกับการมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรมด้วยมีอย่างต่อเนื่อง
ที่จะเป็นที่น่าสนใจที่สำคัญในทางวิชาการ, อุตสาหกรรมและการกำกับดูแล
ภาคการในลักษณะที่ไม่ได้ตั้งใจที่เกิดจากการปรับเปลี่ยนการกำหนดเป้าหมาย
การแสดงออกของยีนภายนอก จากการแทรกของยีนใหม่
และโปรตีนเป้าหมายและแน่นอนจากกระบวนการของการ modi- ทางพันธุกรรม
การตรวจตัวเอง (เฮอร์แมนและราคาปี 2013 และการอ้างอิงในนั้น) บางส่วน
ของผลกระทบเหล่านี้อาจจะไม่ได้ตั้งใจ แต่คาดเดาได้ในแง่ของ
การมีปฏิสัมพันธ์ที่รู้จักกันระหว่างเผาผลาญเซลล์ คนอื่นอาจจะ
ไม่สามารถคาดเดาได้และในทางทฤษฎีอาจจะเป็นผลมาจากตัวอย่างเช่น
การหยุดชะงักโดยแทรกของยีนภายนอกหรือกฎระเบียบที่
องค์ประกอบ ขณะที่ผลกระทบดังกล่าวอาจจะเป็นที่ถกเถียงกันสำหรับยีน
SGT และเวกเตอร์ว่าง (BIN +) เส้นที่ใช้ในการศึกษาของเราก็จะ
ดูเหมือนไม่น่าเป็นอย่างยิ่งว่า phenotypes ทางชีวเคมีทั่วไป
สังเกตน้ำตาลและกรดฟีนอลที่เฉพาะเจาะจงเป็นผลมาจาก
การหยุดชะงักโดยเหตุการณ์แทรกอิสระ คล้าย / เหมือน
ยีนโฮสต์ ผลยังมีให้เห็นในไม่ดัดแปรพันธุกรรมเนื้อเยื่อ
วัฒนธรรม (TC) ควบคุม -derived (เห็นต้อน McNicol, Razzo,
เทย์เลอร์และเดวีส์, 2006) ในการศึกษาล่าสุดโปรไฟล์ phytonutrient
ในกว่า 800 somaclones มันฝรั่งพัฒนาผ่านร่างกายของ
เอมบริโอได้รับการประเมิน (Nassar, Kubow, Leclerc และ Donnelly,
2014) ฟีนอลหลายแห่งรวมถึงกรด chlorogenic กรด caffeic
อนุพันธ์อนุพันธ์ของกรด ferulic เช่นเดียวกับรูติน flavonoid,
อยู่ในช่วงความเข้มข้นจาก 10 ถึง 100 เท่าที่มีเส้นบาง
เกินความเข้มข้นของการควบคุมโดยหัว> 7 เท่า ในทำนองเดียวกัน
วิตามินซีอยู่ระหว่าง> 3 เท่ามีบางสายอย่างมีนัยสำคัญที่แสดงให้เห็น
ความเข้มข้นมากขึ้นกว่ากลุ่มควบคุม ดังนั้นมีโอกาสมากขึ้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

งานการ . ทายทายหรือไม่การเปลี่ยนแปลงสารในค้นหาเส้นสังเกตการเปลี่ยนแปลงใน a-solanine ไกลโคอัลคาลอยด์หลักและ a-chaconine เป็นคาดการณ์จากเอนไซม์การเข้ารหัสโดย sgt1 sgt2 sgt3 , และยีน ( แมคคิว et al . , 2005 , 20062007 ) แม้ว่าใน a-chaconine การศึกษาปัจจุบันไม่ได้เพิ่มขึ้นเพื่อชดเชยการลดลง a-solanine ในระดับสาย sgt1 ตามที่รายงานโดย แมคคิว et al . ( 2005 ) แต่ในการศึกษาอื่น ๆเราได้แน่นอนเห็นเช่นผลชดเชย ( ข้อมูลเผยแพร่ ) แต่เหตุผลเพื่อความชัดเจน การ sgt2 เส้นแสดงการตอบสนองเป็นไปด้วย a-solanine a-chaconine เพิ่มขึ้นเป็นลดลง อย่างไรก็ตาม สำหรับสาย sgt2 นี้ไม่ได้เอารวม glycoalkaloid ระดับกลับของน้ำหนักที่เพิ่มขึ้นในเบ้าซิโตสเตอรอลและระดับ fucosterol ในบรรทัด sgt3 อาจระบุโดยรวมลดลงจากสเตอรอลเป็นไกลโคอัลคาลอยด์เป็นมูกเลือดผลของการควบคุมเดกซ์สเตอรอลที่เฉพาะเจาะจงปฏิกิริยา เนื้อหาทั้งหมดใน sgt3 glycoalkaloid แท้ ถูกที่สุดเส้น อย่างไรก็ตาม ทั้งหมด glycoalkaloid อย่างมีนัยสำคัญที่ระดับกว่า WT สองออกจากสามบรรทัด sgt2 ( sgt2-11 และsgt2-18 ) , และอีกครั้งนี้เกี่ยวข้องกับการเพิ่มขึ้นในเบ้าซิโตสเตอรอลและ fucosterol . arnqvist อาทิ จอนสัน , และ sitbon ( 2003 )พบว่าถั่วเหลือง smt1 แสดงยีนที่เข้ารหัสเอนไซม์กุญแจของซปรีนอยด์สาขา ทางเดินที่นำไปสู่พลาสมาเยื่อ alkylated สเตอรอลลดลงหัว glycoalkaloid เนื้อหาโดยประมาณ 60 % ที่เพิ่มขึ้นทั้งใน isofucosterolและ sitosterol . มากขึ้น และ fucosterol ในเบ้าซิโตสเตอรอลsgt2 เส้นไม่ได้มาพร้อมกับโดยรวมลดลง glycoalkaloid ทั้งหมดระดับเพื่อจะอธิบายได้อย่างง่ายดายโดยไม่มีความรู้น้อยglycoalkaloid อัตราการหมุนเวียนทั้งเข้า และออก ของสเตอรอลสระในการศึกษานี้ เมื่อเปรียบเทียบกับการควบคุมน้ำหนักมีหลักการลดลงของระดับกลูโคสและฟรักโทสอื่น ๆทั้งหมดที่ใช้ในการควบคุมและทั้งหมดของจ่าสายประเมิน รูปแบบคล้ายกันมากออกมาระดับของกรดคลอโรจีนิก และของผู้ปกครอง และ Caffeic ซินนามิกกรด ให้ความจริงที่เกิดเหล่านี้ปรากฏในบรรทัดที่เพิ่งถูกสร้างใหม่โดยการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อ ( ไม่ใช่พันธุกรรม )หรือที่ถูกแปลงเป็นเวกเตอร์ที่ว่างเปล่า ( ไม่มีจ่ายีน antisense ลำดับ ) ก่อนที่จะเกิดผลกระทบเหล่านี้ไม่สามารถอธิบายได้โดยการปรับเปลี่ยนเป้าหมาย glycoalkaloidชีวสังเคราะห์ . ผลที่ได้จึงถือว่าไม่ตั้งใจผลของกระบวนการที่ใช้ในการสร้างพืชเกี่ยวกับสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรม มันยังคงมีความสนใจที่สำคัญในอุตสาหกรรม และกฎระเบียบทางวิชาการส่วนผลกระทบที่เกิดจากเป้าหมายโดยไม่ได้ตั้งใจการแสดงออกของยีนที่พบจากการแทรกของยีนใหม่และโปรตีนเป้าหมาย และแน่นอนจากกระบวนการทางพันธุกรรม - สมัครงานfication ตัวเอง ( เฮอร์แมนและราคา 2013 และอ้างอิง ) บางของผลกระทบเหล่านี้อาจจะไม่ตั้งใจ แต่คาดเดาได้ ในแง่ของรู้จักการปฏิสัมพันธ์ระหว่างเส้นทางการเผาผลาญ . คนอื่น ๆอาจไม่สามารถคาดเดาได้และในทางทฤษฎีอาจจะมีผลจากตัวอย่างการขัดจังหวะโดยแทรกยีนหรือกฎระเบียบภายในองค์ประกอบ ขณะที่ผลกระทบดังกล่าวอาจจะเถียงเพื่ออุตสาหกรรมจ่าและเวกเตอร์ที่ว่างเปล่า ( บิน + ) ใช้เส้นในการศึกษาของเรา มันจะดูยากมากว่าเกิดบ่อยชีวเคมีสังเกตสำหรับน้ำตาลและกรดฟีโนลิก ผลจากที่เฉพาะเจาะจงแทรกขัดจังหวะ โดยเหตุการณ์อิสระ คล้าย / เหมือนกันยีนต์ ผลก็เห็นไม่ใช่พันธุ์เนื้อเยื่อวัฒนธรรม ( TC ) และการควบคุม ( เห็นเชพ mcnicol ขอให้สนุก , , ,เทเลอร์ แอนด์ เดวีส์ , 2006 ) ในการศึกษาล่าสุด โพรไฟล์ ไฟโตนิวเทรียนมากกว่า 800 กลุ่มมันฝรั่งพัฒนาผ่านทางกายเอ็มบริโอมีการประเมิน ( nassar คูโบว์ Leclerc , , , และ ดอนเนลลี่2014 ) หลายผล รวมทั้งกรด Caffeic กรดคลอโรจีนิก ,อนุพันธ์อนุพันธ์กรดเฟอรูลิกเป็นฟลาโวนอยด์รูติน ,อยู่ในระดับตั้งแต่ 10 - 100 เท่า กับเส้นบางเกินควบคุมหัวความเข้มข้นมากกว่า 12 เท่า . ในทํานองเดียวกันกรดแอสคอร์บิคอยู่ > 3-fold กับเส้นบางแสดงอย่างมากความเข้มข้นมากกว่าการควบคุม จึงมีโอกาสมากขึ้น