Studies in conservation genetics of

Studies in conservation genetics often attempt to determine genetic differentiation between two or more
temporally or geographically distinct sample collections. Pairwise p-values from Fisher’s exact tests or
contingency Chi-square tests are commonly reported with a Bonferroni correction for multiple tests. While
the Bonferroni correction controls the experiment-wise a, this correction is very conservative and results in
greatly diminished power to detect differentiation among pairs of sample collections. An alternative is to
control the false discovery rate (FDR) that provides increased power, but this method only maintains
experiment-wise a when none of the pairwise comparisons are significant. Recent modifications to the FDR
method provide a moderate approach to determining significance level. Simulations reveal that critical
values of multiple comparison tests with both the Bonferroni method and a modified FDR method
approach a minimum asymptote very near zero as the number of tests gets large, but the Bonferroni
method approaches zero much more rapidly than the modified FDR method. I compared pairwise significance
from three published studies using three critical values corresponding to Bonferroni, FDR, and
modified FDR methods. Results suggest that the modified FDR method may provide the most biologically
important critical value for evaluating significance of population differentiation in conservation genetics.
Ultimately, more thorough reporting of statistical significance is needed to allow interpretation of
biological significance of genetic differentiation among populations.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ศึกษาพันธุศาสตร์อนุรักษ์มักจะพยายามสร้างความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่างสองหรือมากกว่าตัวอย่างความแตกต่างกันทางภูมิศาสตร์ หรือ temporally คอลเลกชัน พี แพร์ไวส์ค่าจากการทดสอบของ Fisher แน่นอน หรือทดสอบ Chi-square ฉุกเฉินโดยทั่วไปรายงานกับการแก้ไข Bonferroni ทดสอบหลาย ในขณะที่การแก้ไข Bonferroni ควบคุมการ experiment-wise การ การแก้ไขนี้จะหัวเก่ามาก และส่งผลลดลงอำนาจในการตรวจสอบสร้างความแตกต่างระหว่างคู่ของคอลเลกชันตัวอย่างมาก ทางเลือกคือควบคุมอัตราค้นหาเท็จ (FDR) ที่ให้พลังงานเพิ่มขึ้น แต่วิธีนี้รักษาเฉพาะexperiment-wise เมื่อไม่มีการเปรียบเทียบแพร์ไวส์สำคัญ FDR ปรับเปลี่ยนล่าสุดวิธีให้วิธีปานกลางจะกำหนดระดับนัยสำคัญ จำลองเปิดเผยที่สำคัญค่าทดสอบเปรียบเทียบหลายวิธี Bonferroni และ FDR วิธีแก้ไขวิธี asymptote ต่ำมากใกล้ศูนย์เป็นจำนวนได้รับทดสอบขนาดใหญ่ แต่ Bonferroniวิธีแจ้งอย่างรวดเร็วมากขึ้นกว่าวิธี FDR แก้ไข ผมเปรียบเทียบความสำคัญแพร์ไวส์ที่ 3 ประกาศใช้ค่าวิกฤตที่สามตรงกับ Bonferroni, FDR การศึกษา และปรับเปลี่ยนวิธี FDR ผลแนะนำว่า วิธี FDR แก้ไขอาจให้มากที่สุดชิ้นค่าสำคัญสำคัญในการประเมินความสำคัญของการสร้างความแตกต่างของประชากรในพันธุศาสตร์เชิงอนุรักษ์สุด รายงานอย่างละเอียดเพิ่มเติมของนัยสำคัญทางสถิติจำเป็นต้องให้ตีความความสำคัญทางชีวภาพของสร้างความแตกต่างทางพันธุกรรมในประชากร

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในการศึกษาพันธุศาสตร์เพื่อการอนุรักษ์พันธุกรรมมักจะพยายามที่จะกำหนดความแตกต่างระหว่างสองคนหรือมากกว่า
ชั่วคราวหรือคอลเลกชันตัวอย่างที่แตกต่างกันทางภูมิศาสตร์ คู่ p-values จากฟิชเชอร์แน่นอนการทดสอบไคสแควร์ การทดสอบหรือ
ฉุกเฉินมักรายงานกับบอนเฟอร์โรนีแก้ไขสำหรับการทดสอบหลาย ในขณะที่
บอนเฟอร์โรนีแก้ไขการควบคุมการทดลองปัญญา ,การแก้ไขนี้เป็นอนุรักษ์นิยมมากและผลในการตรวจสอบความแตกต่าง
เป็นอย่างมากลดพลังของคู่ของคอลเลกชันของตัวอย่าง ทางเลือกคือ
ควบคุมอัตราการค้นพบเท็จ ( FDR ) ที่ให้พลังงานเพิ่มขึ้น แต่วิธีนี้เท่านั้นที่ยังคง
ทดลองปัญญา เมื่อไม่มีของเปรียบเทียบคู่เป็นสำคัญ แก้ไขล่าสุดโดย
อึงอลวิธีให้แนวทางปานกลางเพื่อกำหนดระดับนัยสำคัญ จำลอง เปิดเผยว่า วิกฤต
ค่าของการทดสอบการเปรียบเทียบพหุคูณด้วยวิธีทั้งบอนเฟอร์โรนีและดัดแปลงวิธีการวิธีการขั้นมูลฐาน
อึงอล อยู่ใกล้ศูนย์เป็นหมายเลขของการทดสอบได้รับการขนาดใหญ่ แต่บอนเฟอร์โรนี
วิธีเข้าใกล้ศูนย์มากขึ้นอย่างรวดเร็วกว่า FDR ดัดแปลงวิธี ผมเปรียบเทียบความสำคัญ
ตอนจากสามเผยแพร่การศึกษาโดยใช้ค่าวิกฤตที่บอนเฟอร์โรนี FDR FDR และ
วิธีการแก้ไข พบว่าวิธีแก้ไข FDR อาจให้มากที่สุด ทางชีวภาพ
ค่าวิกฤตสำคัญสำหรับการประเมินความสำคัญของความแตกต่างในการอนุรักษ์ประชากรพันธุศาสตร์ .
ในที่สุดรายงานอย่างละเอียดมากขึ้นของสถิติที่จำเป็นเพื่อให้ตีความ
ความสำคัญทางชีวภาพของความแตกต่างทางพันธุกรรมของประชากร