The second group included 86 strain

The second group included 86 strains with a single ampli-
fied band, specific for the absence of the IS6110 insertion in
the target locus, hence indicative of other than the LAM family
(Table S1). Few observations can be made regarding the
discrepancies with spoligotype-defined families. Four of the
studied strains belonged to SIT41 defined in SITVIT_WEB as
LAM7-TUR. However, no LAM-specific band was amplified in
these strains; hence they cannot be defined as LAM. Indeed,
another online resource for M. tuberculosis molecular typing (MIRU-VNTRplus.org) defines the family of these strains as
TUR, based on the analysis of different molecular markers,
including VNTRs and SNPs. It is also interesting to note that
all studied strains of the SIT125, which had an uncertain family
definition (LAM/S in earlier SpolDB4 and T2/LAM3 in
SITVIT_WEB), did not have a LAM-specific band; hence their
family status cannot be LAM. Finally, two strains of SIT1588
had a single non-LAM band which is intriguing, since these
strains had a prototype LAM signature (see SIT42 in Fig. 1),
in addition to the deleted first signals. This profile may be a
result of the convergent evolution of the DR locus, and more
strains of this spoligotype SIT1588 should be studied in order
to verify its family status.
Regarding the third and smallest group of strains, it
included 4 strains with only LAM-specific band amplified.
One of them–strain 52–was assigned to LAM in SITVIT_WEB;
strain 8 was assigned to T5-RUS1, but it was recently shown
to belong to LAM [9]. In its turn, strain 126 (‘new’ spoligotype,
‘unknown’ family in SITVIT_WEB) may indeed belong to LAM
as confirmed herein by LAM-PCR. At the same time, strain 81
(SIT453/T) had LAM-specific band amplified, but intact
spacers 21–24; this discrepancy is unexpected and questions
the value of this IS6110-PCR as LAM-specific.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กลุ่มที่สองรวม 86 เงียเดียว ampli-วงฟอง เฉพาะสำหรับการขาดงานของการแทรก IS6110 ในเป้าหมายโลกัสโพล ดังนั้นส่อไม่ใช่ครอบครัวลำ(ตาราง S1) สังเกตไม่ได้เกี่ยวกับการความขัดแย้งกับครอบครัวกำหนด spoligotype สี่ศึกษาสายพันธุ์ที่เป็นสมาชิกใน SITVIT_WEB เป็น SIT41LAM7-TUR. อย่างไรก็ตาม ไม่เฉพาะลำวงถูกขยายใน สายพันธุ์เหล่านี้ ดังนั้น พวกเขาไม่สามารถกำหนดเป็นลำ แน่นอนทรัพยากรออนไลน์อื่นสำหรับม.วัณโรคโมเลกุลพิมพ์ (MIRU-VNTRplus.org) กำหนดราคาของสายพันธุ์เหล่านี้เป็นTUR ตามการวิเคราะห์ของเครื่องหมายโมเลกุลที่แตกต่างกันรวม VNTRs และ SNPs ก็ยังน่าสนใจให้ทราบที่สายพันธุ์ทั้งหมด studied ของ SIT125 ซึ่งมีครอบครัวไม่แน่นอนคำจำกัดความ (ลำ/S ใน SpolDB4 ก่อนและ T2/LAM3 ในไม่มี SITVIT_WEB), วงเฉพาะลำ ดังนั้นของพวกเขาสถานภาพไม่ลำ SIT1588 สุด สองสายพันธุ์มีวงดนตรีไม่ใช่ลำเดียวซึ่งน่า ตั้งแต่นี้สายพันธุ์มีลำต้นแบบลายเซ็น (โปรดดู SIT42 ใน Fig. 1),นอกจากสัญญาณแรกถูกลบ ส่วนกำหนดค่านี้อาจเป็นผลของการวิวัฒนาการ convergent ของโลกัสโพล DR และอื่น ๆสายพันธุ์ของ spoligotype นี้ SIT1588 ที่ควรศึกษาตามลำดับเพื่อตรวจสอบสถานะของครอบครัวเกี่ยวกับสายพันธุ์ กลุ่มที่สาม และน้อยที่สุดมันรวม 4 สายพันธุ์ มีเฉพาะลำเฉพาะวงขยายหนึ่งของพวกเขา – ต้องใช้ 52 – ถูกกำหนดให้กับลำใน SITVIT_WEBต้องใช้ 8 ถูกกำหนดให้กับ T5 RUS1 แต่มันถูกแสดงล่าสุดเป็นสมาชิกของลำ [9] ในการเปิด สายพันธุ์ 126 ('ใหม่' spoligotypeครอบครัว 'ไม่รู้จัก' ใน SITVIT_WEB) อาจเป็นของจริงลำขณะนี้ยืนยันจากลำ PCR ในเวลาเดียวกัน สายพันธุ์ 81(SIT453 T) มีเฉพาะลำวงขยาย แต่เหมือนเดิมspacers 21-24 ความขัดแย้งนี้ไม่คาดคิด และคำถามค่าของ PCR IS6110 นี้เป็นเฉพาะลำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กลุ่มที่ 2 รวม 86 สายพันธุ์เดียวกับ ampli -
fied วงดนตรีที่เฉพาะเจาะจงสำหรับการขาดของสายพันธุ์ปักกิ่ง 10
สถานที่เป้าหมาย ดังนั้น ซึ่งนอกจากลำครอบครัว
( ตาราง S1 ) ตัวอย่างไม่กี่สามารถทำเกี่ยวกับความขัดแย้งกับ spoligotype
กำหนดครอบครัว 4
ศึกษาสายพันธุ์ที่เป็นของ sit41 ที่กําหนดไว้ใน sitvit_web เป็น
lam7-tur . อย่างไรก็ตามไม่เฉพาะลำวงได้มา
สายพันธุ์เหล่านี้ ดังนั้นพวกเขาไม่สามารถนิยามว่า แลม แน่นอน
ทรัพยากรออนไลน์อื่นสำหรับวัณโรคโมเลกุลพิมพ์ดีด ( มิรุ vntrplus . org ) กำหนดครอบครัวของสายพันธุ์เหล่านี้เช่น
เธอตามการวิเคราะห์เครื่องหมายโมเลกุลที่แตกต่างกันและรวมถึง vntrs
snps . มันน่าสนใจที่จะทราบว่าทุกสายพันธุ์ของ sit125
) ,ซึ่งมีนิยามครอบครัว
ไม่แน่ใจ ( ลำ / s เร็ว spoldb4 และ T2 / lam3 ใน
sitvit_web ) ไม่ได้มีลำเฉพาะกลุ่ม ดังนั้นตน
สถานะทางครอบครัวไม่สามารถ Lam ในที่สุด สองสายพันธุ์ของ sit1588
มีเดี่ยวไม่ลำวงที่น่าสนใจ เนื่องจากสายพันธุ์เหล่านี้
มีต้นแบบลำลายเซ็น ( ดู sit42 ในรูปที่ 1 ) ,
นอกจากจะลบก่อนสัญญาณ โปรไฟล์นี้อาจจะเป็น
ผลของการวิวัฒนาการของความเชื่อ ดร และ สายพันธุ์นี้ spoligotype มากขึ้น

sit1588 ควรจะศึกษาเพื่อตรวจสอบสถานะของครอบครัว .
เกี่ยวกับกลุ่มที่สามและที่เล็กที่สุดของสายพันธุ์ มัน
รวม 4 สายพันธุ์ที่มีเพียงลำวงเฉพาะขยาย .
หนึ่งของพวกเขา–สายพันธุ์ 52 – ได้รับมอบหมายให้ลำ สายพันธุ์ใน sitvit_web ;
8 ได้รับมอบหมายให้ t5-rus1 แต่มันแสดง
เมื่อเร็วๆ นี้เป็นของลำ [ 9 ] ในการเปิดของมัน สายพันธุ์ 126 ( 'new spoligotype ' , '
'unknown ครอบครัวใน sitvit_web ) แท้จริงอาจเป็นลำ
ยืนยันข้อ lam-pcr . ในเวลาเดียวกัน , สายพันธุ์ 81
( sit453 / T ) มีลำเฉพาะกลุ่มขยาย แต่เหมือนเดิม
spacers 21 24 – ; ความแตกต่างนี้เป็นที่ไม่คาดคิดและคำถาม
ค่า is6110-pcr นี้เป็นลำที่เฉพาะเจาะจง