Contents
1 Introduction 3 1.1 Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
2 Basic Concepts 4 2.1 Image Concepts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 2.2 KNIME Concepts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 2.2.1 Data Tables and Data Types . . . . . . . . . . . . . . . 7 2.2.2 Node Views . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 2.2.3 Hiliting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 2.2.4 Loops . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
3 Important Nodes and Basic Workflows for Image Processing 11 3.1 Image I/O Nodes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 3.2 Image Pre-processing Nodes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 3.3 Image Processing Nodes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 3.4 Image Dimension-Handling Nodes . . . . . . . . . . . . . . . . 12 3.5 Image Metadata-Handling Nodes . . . . . . . . . . . . . . . . 13 3.6 Segmentation Nodes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 3.7 Segment and Feature-Calculation Nodes . . . . . . . . . . . . 13 3.8 GroupBy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 3.9 Basic Segmentation Workflow Example . . . . . . . . . . . . . 16
4 Resources 16