Watermelon (Citrullus lanatus L.) i

Watermelon (Citrullus lanatus L.) is an important vegetable crop worldwide, but a high-density genetic map of elite watermelon cultivars has not yet been reported. The present study reported the large-scale discovery of single nucleotide polymorphisms (SNPs) by specific length amplified fragment sequencing (SLAF-seq) for high-density genetic map construction using two elite watermelon cultivars. The map contained 2634 SNPs distributed on 11 linkage groups (LGs) corresponding to the number of chromosome pairs in watermelon. The total length of the linkage map was 1,906.31 cM, with an average distance of 0.72 cM between adjacent markers. Notably, 35 unmapped scaffolds, which contained 91 SNPs and covered 4.56 Mb, were dispersedly anchored to LG1, LG2, LG4, LG7, LG8, LG9 and LG11. Although disagreements were observed on LG1 and LG11, the local collinearity between the genetic and physical distances, haplotype map and heat map indicated that the genetic map herein is of high quality. The present study reports the first high-density linkage map of two watermelon elite parents.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แตงโม (Citrullus lanatus L.) เป็นพืชผักสำคัญทั่วโลก แต่ยังไม่ได้รายงานแผนที่ทางพันธุกรรมความหนาแน่นสูงของยอดแตงโมพันธุ์ การศึกษารายงานการค้นพบหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) ขนาดใหญ่ โดยเฉพาะความยาวส่วนขยาย (SLAF seq) การจัดลำดับสำหรับก่อสร้างแผนที่พันธุกรรมความหนาแน่นสูงที่ใช้พันธุ์ยอดแตงโมสอง แผนที่มีอยู่กระจายใน 11 เชื่อมโยงกลุ่มแก็ส) ที่สอดคล้องกับจำนวนคู่โครโมโซมในแตงโม SNPs 2634 มีความเชื่อมโยงแผนที่ยาวรวม 1,906.31 ซม. มีระยะห่างเฉลี่ย 0.72 เซนติเมตรระหว่างเครื่องหมายที่อยู่ติดกัน ยวด scaffolds แม็ป 35 ซึ่งมีอยู่ 91 SNPs และครอบคลุม 4.56 Mb ถูก dispersedly ทอดสมอ LG1, LG2, LG4, LG7, LG8, LG9 และ LG11 แม้ว่าความขัดแย้งถูกตั้งข้อสังเกต LG1 และ LG11 ภาวะร่วมเส้นตรงภายในระหว่างระยะทางพันธุกรรม และทางกายภาพ haplotype แผนที่และแผนที่ความร้อนแสดงว่า แผนที่พันธุกรรมนี้มีคุณภาพสูง การศึกษารายงานแผนที่ความหนาแน่นสูงเชื่อมโยงแรกของพ่อยอดแตงโม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แตงโม (แตงโม L. ) เป็นพืชผักที่สำคัญทั่วโลก แต่แผนที่ทางพันธุกรรมที่มีความหนาแน่นสูงแตงโมชนชั้นพันธุ์ยังไม่ได้รับรายงาน การศึกษาครั้งนี้ได้รายงานการค้นพบขนาดใหญ่ของหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) โดยความยาวเฉพาะชิ้นส่วนขยายลำดับ (SLAF-seq) สำหรับความหนาแน่นสูงก่อสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมโดยใช้ชนชั้นสองพันธุ์แตงโม แผนที่บรรจุ 2,634 SNPs กระจายใน 11 กลุ่มเชื่อมโยง (LGS) ที่สอดคล้องกับจำนวนคู่โครโมโซมในแตงโม ความยาวรวมของแผนที่เชื่อมโยงเป็น 1,906.31 เซนติเมตรระยะทางเฉลี่ย 0.72 ซมเครื่องหมายที่อยู่ติดกัน ยวด 35 โครง unmapped ซึ่งประกอบด้วย 91 SNPs และปกคลุม 4.56 ล้านบาททอดสมอกลาดเกลื่อนไป LG1, LG2, LG4, LG7, LG8, LG9 และ LG11 แม้ว่าความขัดแย้งถูกตั้งข้อสังเกตใน LG1 และ LG11 ที่ collinearity ท้องถิ่นระหว่างระยะทางพันธุกรรมและทางกายภาพแผนที่ haplotype และแผนที่ความร้อนชี้ให้เห็นว่าแผนที่ทางพันธุกรรมในเอกสารฉบับนี้เป็นของที่มีคุณภาพสูง การศึกษาครั้งนี้รายงานความหนาแน่นสูงแผนที่เชื่อมโยงครั้งแรกของพ่อแม่ชนชั้นสองแตงโม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แตงโม ( citrullus lanatus L . ) ที่สำคัญคือ ผักพืชทั่วโลก แต่เป็นแผนที่พันธุกรรมของพันธุ์แตงโมที่มียอดยังไม่ได้รับรายงาน รายงานการศึกษารายงานการค้นพบความหลากหลายขนาดใหญ่ของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว ( snps ) โดยความยาวเฉพาะ amplified fragment ลำดับ ( slaf seq ) สำหรับความหนาแน่นสูงแผนที่พันธุกรรมก่อสร้างโดยใช้ 2 พันธุ์แตงโมท แผนที่ที่มีอยู่ 2634 snps กระจายในกลุ่มเชื่อมโยง 11 ( อปท. ) ที่สอดคล้องกับจำนวนของโครโมโซมคู่ในแตงโม ความยาวทั้งหมดของแผนที่เชื่อมโยงเป็น 1906.31 ซม. มีระยะทางเฉลี่ย 0.72 ซม. ระหว่างติดกันเครื่องหมาย ยวด , 35 unmapped นั่งร้านซึ่งมี 91 snps และครอบคลุม 4.56 MB ก็ถึงกับยึด lg1 lg2 , lg4 lg7 lg8 , , , , และ lg9 lg11 . แม้ว่าความขัดแย้งที่พบใน lg1 และ lg11 , collinearity ท้องถิ่นระหว่างความแตกต่างทางพันธุกรรม และกายภาพ พบแผนที่และแผนที่ความร้อนพบว่าแผนที่พันธุกรรมนี้มีคุณภาพสูง การศึกษารายงานครั้งแรกที่มีการเชื่อมโยงแผนที่สองแตงโมชนชั้นผู้ปกครอง