The 16S rRNA genes were amplified u

The 16S rRNA genes were amplified using the forward primer
the PRBA338F with a GC clamp and the reverse primer PRUN518R
(Heuer et al., 1997). The 16S rRNA gene fragments were separated
by DGGE. The DGGE gel was performed on 8% polyacrylamide
gels with a 30–60% denaturant gradient. Prominent DGGE bands
were excised and the eluted DNA as templates was reamplified
as described above, followed by the second DGGE. The single
bands on the second DGGE were sequenced by a commercial
sequencing service. All sequences were used to search in the Gen-
Bank using BLAST-n tool. Alignment and phylogenetic analysis
of the DNA sequences were performed using the MEGA4 software.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีน 16S rRNA ที่ขยายการใช้รองพื้นไปข้างหน้าPRBA338F คีมหนีบ GC และพื้นกลับ PRUN518R(Heuer et al., 1997) มีแยกชิ้นส่วนยีน 16S rRNAโดย DGGE เจ DGGE ทำตาม polyacrylamide 8%เจกับไล่ denaturant 30 – 60% วง DGGE เด่นมี excised และดีเอ็นเอ eluted เป็นแม่แบบได้ reamplifiedตามที่อธิบายไว้ข้างต้น ตาม DGGE ที่สอง เดียววงบน DGGE ที่สองถูกเรียงลำดับตามการพาณิชย์บริการจัดลำดับ ลำดับทั้งหมดถูกใช้เพื่อค้นหา Gen-ธนาคารที่ใช้เครื่องมือระเบิด-n จัดตำแหน่งและวิเคราะห์ phylogeneticของดีเอ็นเอใน ลำดับถูกทำโดยใช้ซอฟต์แวร์ MEGA4

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ยีน 16S rRNA ถูกขยายโดยใช้ไพรเมอร์ไปข้างหน้า
PRBA338F กับยึด GC และไพรเมอร์กลับ PRUN518R
(Heuer et al., 1997) 16S rRNA ชิ้นส่วนของยีนที่ถูกแยกออก
โดย DGGE เจล DGGE ได้ดำเนินการในวันที่ 8% polyacrylamide
เจลที่มีความลาดชัน 30-60% denaturant วง DGGE ที่โดดเด่น
และได้รับการตัดดีเอ็นเอชะเป็นแม่แบบที่ถูก reamplified
ตามที่อธิบายไว้ข้างต้นตามด้วยสอง DGGE เดียว
วงที่สอง DGGE มีลำดับขั้นตอนโดยการค้า
บริการการเรียงลำดับ ลำดับทั้งหมดถูกนำมาใช้ในการค้นหาใน Gen-
ธนาคารใช้เครื่องมือระเบิด-n การจัดและการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ
ของลำดับดีเอ็นเอที่ถูกดำเนินการโดยใช้ซอฟแวร์ MEGA4

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ส่วนเบส 16S rRNA ยีนขยายการใช้ไพรเมอร์ ส่งต่อ prba338f
ด้วยแคลมป์ GC และย้อนกลับ ไพรเมอร์ prun518r
( Heuer et al . , 1997 ) ส่วนเบส 16S rRNA ยีนกระจายตัวแยกกัน
โดยการทดลอง . ในการทดลองคือใช้เจลอะคริลาไมด์เจลที่มี 8 %
30 – 60 % ไล่ระดับทำให้ผิดธรรมชาติ . การทดลองที่โดดเด่นวง
ถูกตัดและตัวอย่าง DNA เป็นแม่แบบที่ถูก reamplified
ตามที่อธิบายไว้ข้างต้นตามด้วยการทดลองที่สอง วงเดียว
ในการทดลองที่สอง ลำดับ โดยโฆษณา
ลำดับบริการ ทั้งหมดถูกใช้ในการค้นหาลำดับใน Gen -
blast-n ธนาคารโดยใช้เครื่องมือ การจัดตำแหน่งและชนิดของดีเอ็นเอลำดับ
การวิเคราะห์การใช้ mega4 ซอฟต์แวร์