The global trade in fresh produce a

The global trade in fresh produce and the vagility of plant viruses: a case study in garlic.
Wylie SJ1, Li H1, Saqib M2, Jones MG1.
Author information
Abstract
As cuisine becomes globalized, large volumes of fresh produce are traded internationally. The potential exists for pathogens infecting fresh produce to hitchhike to new locations and perhaps to establish there. It is difficult to identify them using traditional methods if pathogens are novel, scarce, and/or unexpected. In an attempt to overcome this limitation, we used high-throughput sequencing technology as a means of detecting all RNA viruses infecting garlic (Allium sativum L.) bulbs imported into Australia from China, the USA, Mexico, Argentina and Spain, and those growing in Australia. Bulbs tested were grown over multiple vegetative generations and all were stably infected with one or more viruses, including two species not previously recorded in Australia. Present in various combinations from 10 garlic bulbs were 41 virus isolates representing potyviruses (Onion yellow dwarf virus, Leek yellow stripe virus), carlaviruses (Shallot latent virus, Garlic common latent virus) and allexiviruses (Garlic virus A, B, C, D, and X), for which 19 complete and 22 partial genome sequences were obtained, including the first complete genome sequences of two isolates of GarVD. The most genetically distinct isolates of GarVA and GarVX described so far were identified from Mexico and Argentina, and possible scenarios explaining this are presented. The complete genome sequence of an isolate of the potexvirus Asparagus virus 3 (AV3) was obtained in Australia from wild garlic (A. vineale L.), a naturalized weed. This is first time AV3 has been identified from wild garlic and the first time it has been identified beyond China and Japan. The need for routine generic diagnosis and appropriate legislation to address the risks to primary production and wild plant communities from pathogens spread through the international trade in fresh produce is discussed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การค้าสากลในสดและ vagility ของไวรัสพืช: กรณีศึกษาในกระเทียมWylie SJ1, Li H1, Saqib M2, MG1 โจนส์ผู้เขียนข้อมูลบทคัดย่อAs cuisine becomes globalized, large volumes of fresh produce are traded internationally. The potential exists for pathogens infecting fresh produce to hitchhike to new locations and perhaps to establish there. It is difficult to identify them using traditional methods if pathogens are novel, scarce, and/or unexpected. In an attempt to overcome this limitation, we used high-throughput sequencing technology as a means of detecting all RNA viruses infecting garlic (Allium sativum L.) bulbs imported into Australia from China, the USA, Mexico, Argentina and Spain, and those growing in Australia. Bulbs tested were grown over multiple vegetative generations and all were stably infected with one or more viruses, including two species not previously recorded in Australia. Present in various combinations from 10 garlic bulbs were 41 virus isolates representing potyviruses (Onion yellow dwarf virus, Leek yellow stripe virus), carlaviruses (Shallot latent virus, Garlic common latent virus) and allexiviruses (Garlic virus A, B, C, D, and X), for which 19 complete and 22 partial genome sequences were obtained, including the first complete genome sequences of two isolates of GarVD. The most genetically distinct isolates of GarVA and GarVX described so far were identified from Mexico and Argentina, and possible scenarios explaining this are presented. The complete genome sequence of an isolate of the potexvirus Asparagus virus 3 (AV3) was obtained in Australia from wild garlic (A. vineale L.), a naturalized weed. This is first time AV3 has been identified from wild garlic and the first time it has been identified beyond China and Japan. The need for routine generic diagnosis and appropriate legislation to address the risks to primary production and wild plant communities from pathogens spread through the international trade in fresh produce is discussed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การค้าโลกในการผลิตสดและ vagility ของพืชไวรัส: กรณีศึกษาในกระเทียม.
ไวลี SJ1 หลี่ H1, Saqib M2 โจนส์ MG1.
ข้อมูลผู้เขียน
บทคัดย่อ
เป็นอาหารจะกลายเป็นยุคโลกาภิวัตน์ปริมาณมากของผักผลไม้สดที่มีการซื้อขายในระดับสากล ที่มีศักยภาพที่มีอยู่สำหรับเชื้อโรคที่ติดไวรัสผักผลไม้สดที่จะโบกรถไปยังสถานที่ใหม่และอาจจะมีการสร้าง มันเป็นเรื่องยากที่จะระบุพวกเขาโดยใช้วิธีการแบบเดิมถ้าเชื้อโรคเป็นนวนิยายที่ขาดแคลนและ / หรือที่ไม่คาดคิด ในความพยายามที่จะเอาชนะข้อ จำกัด นี้เราใช้เทคโนโลยีลำดับสูงผ่านเป็นวิธีการตรวจจับไวรัส RNA ติดไวรัสกระเทียม (Allium sativum L. ) หลอดไฟนำเข้ามาจากประเทศจีนออสเตรเลีย, สหรัฐอเมริกา, เม็กซิโก, อาร์เจนตินาและสเปนและผู้ที่กำลังเติบโต ในประเทศออสเตรเลีย หลอดทดสอบปลูกพืชมากกว่ารุ่นหลายและมีการติดเชื้อไวรัสเสถียรหนึ่งหรือมากกว่ารวมทั้งสองสายพันธุ์ที่ไม่ได้บันทึกไว้ก่อนหน้านี้ในออสเตรเลีย อยู่ในชุดต่างๆตั้งแต่ 10 หลอดกระเทียม 41 แยกเชื้อไวรัสที่เป็นตัวแทนของ potyviruses (หัวหอมสีเหลืองไวรัสแคระหอมไวรัสแถบสีเหลือง) carlaviruses (หอมแดงไวรัสแฝงกระเทียมที่พบไวรัสที่แฝงอยู่) และ allexiviruses (กระเทียมไวรัส A, B, C, D, และ X) ซึ่ง 19 ที่สมบูรณ์และ 22 ลำดับจีโนมบางส่วนที่ได้รับรวมทั้งจีโนมลำดับแรกที่สมบูรณ์ของทั้งสองสายพันธุ์ของ GarVD สายพันธุ์ส่วนใหญ่ทางพันธุกรรมที่แตกต่างของ GarVA และ GarVX อธิบายเพื่อให้ห่างไกลที่ถูกระบุจากเม็กซิโกและอาร์เจนตินาและสถานการณ์ที่เป็นไปอธิบายนี้จะถูกนำเสนอ ลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของการแยกของ potexvirus หน่อไม้ฝรั่งไวรัส 3 (AV3) ที่ได้รับในประเทศออสเตรเลียจากกระเทียมป่า (ก vineale L. ), วัชพืชสัญชาติ นี่เป็นครั้งแรก AV3 ได้รับการยืนยันจากกระเทียมป่าและเป็นครั้งแรกที่จะได้รับการระบุว่านอกเหนือจากจีนและญี่ปุ่น ความจำเป็นในการวินิจฉัยโรคทั่วไปประจำและกฎหมายที่เหมาะสมเพื่อรับมือกับความเสี่ยงในการผลิตหลักและพืชป่าชุมชนจากเชื้อโรคแพร่กระจายผ่านการค้าระหว่างประเทศในผักผลไม้สดจะกล่าวถึง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การค้าทั่วโลกในการผลิตสดและ vagility ไวรัสพืช : กรณีศึกษาในกระเทียม
ไวลี่ sj1 Li H1 , saqib M2 , โจนส์ mg1 .
ข้อมูลผู้เขียน

เป็นนามธรรมอาหารกลายเป็นโลกาภิวัตน์ขนาดใหญ่ปริมาณของผลิตผลสดซื้อขายระหว่างประเทศ ศักยภาพที่มีอยู่สำหรับเชื้อโรคติดผลิตผลสดเพื่อโบกรถไปยังสถานที่ใหม่และอาจจะสร้างที่นั่นมันเป็นเรื่องยากที่จะระบุได้โดยใช้วิธีการแบบดั้งเดิม ถ้าเชื้อโรคมีนวนิยายที่ขาดแคลน และ / หรือ ที่ไม่คาดคิด ในความพยายามที่จะเอาชนะข้อ จำกัด นี้ เราใช้เทคโนโลยีช่วยการเป็นวิธีการตรวจหาอาร์เอ็นเอไวรัสทั้งหมดติดกระเทียม ( เลี่ยม sativum L . ) หลอดไฟนำเข้าออสเตรเลีย จากประเทศจีน , อเมริกา , เม็กซิโก , อาร์เจนตินา และ สเปน และ ผู้ที่เติบโตในออสเตรเลียหลอดทดลองปลูกพืชหลายรุ่นและมีเสถียร ติดเชื้อไวรัสสองชนิดหรือมากกว่า รวมทั้งไม่บันทึกไว้ก่อนหน้านี้ในออสเตรเลีย ปัจจุบันในชุดต่าง ๆจาก 10 กระเทียมเป็น 41 ไวรัสสายพันธุ์แทน potyviruses ( หัวหอมสีเหลืองแคระไวรัส ไวรัส ลีคสีเหลืองลาย ) , carlaviruses ( หอมแดงไวรัสที่ซ่อนเร้นไวรัสที่แฝงอยู่ทั่วไป ) และกระเทียม ( กระเทียม allexiviruses ไวรัส A , B , C , D , และ X ) ที่ 19 และ 22 ส่วนลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ได้ รวมทั้งให้สมบูรณ์ก่อนลำดับจีโนมของเชื้อ garvd . ที่สุดทางพันธุกรรมแตกต่างกัน พบว่า garva garvx และอธิบายจนถูกระบุจากเม็กซิโก และ อาร์เจนตินา และสถานการณ์ที่เป็นไปได้อธิบายนี้จะนำเสนอลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของการแยกของไวรัสในกลุ่ม potexvirus หน่อไม้ฝรั่ง 3 ไวรัส ( av3 ) ได้ในออสเตรเลียจากกระเทียม ( A . vineale L . ) , สัญชาติวัชพืช นี่เป็นครั้งแรกที่ av3 ได้รับการระบุจากกระเทียมและครั้งแรกที่มีการระบุว่า นอกเหนือจากจีน และญี่ปุ่นต้องการงานประจำทั่วไปและกฎหมายเพื่อแก้ไขการวินิจฉัยที่เหมาะสมต่อการผลิตหลักและสังคมพืชป่าจากเชื้อโรคที่แพร่กระจายผ่านการค้าระหว่างประเทศในการผลิตใหม่นี้