4. Results 4.1. Analytical sensitiv

4. Results 4.1. Analytical sensitivity comparison of six commercial and five in-house rRT-PCR assays. Each of the six commercial and five in-house assays was evaluated by end-point dilution using 5-fold dilutions of two culture-derived full-length V genome RNAs, related to isolates collected in Guinea in March 2014 (named C5 and C15 RNAs)(Fig. 1 and Table S2). While all 11 assays could detect RNA from both isolates, the commercial kits tended to be more sensitive. Since the in-house real-time RT-PCRs provided no advantages in terms of performance or ease of use, they were not selected for further evaluation. We did not retain the Lifetech Ebola Virus (Zaire 2014) assay for further testing either, as it was less sensitive than its lyophilized counter- part and lacked its practical advantages. The LOD was determined for the five most promising assays (Altona Screen, Altona Type, Roche, FTD, andLifetech L), using serial dilutions of quantified in vitro transcribed RNAs (Fig. 2, Table 1). As can be seen in Fig. 2, which represents two separate experiments performed seven months apart, the inter-assay variability is very small.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

4. ผล 4.1 เปรียบเทียบวิเคราะห์ความไวของหกพาณิชย์และห้าในบ้าน rRT-PCR assays พาณิชย์หกและ assays ห้าในบ้านรับการประเมิน โดยเลือกจุดเจือจาง ใช้เจือจาง 5-fold ของสองวัฒนธรรมมาแบบเต็มตัว V จีโนมที่ RNAs ที่เกี่ยวข้องกับแยกเก็บในกินีใน 2557 มีนาคม (ชื่อ C5 และ C15 RNAs) (รูปที่ 1 และ S2 ตาราง) ในขณะที่ assays 11 ทั้งหมดสามารถตรวจพบ RNA จากทั้งสองแยก ชุดเชิงพาณิชย์แนวโน้มที่จะอ่อนไหวมาก เนื่องจากในสถานที่แบบเรียลไทม์ PCRs RT ให้ไม่มีประโยชน์ในแง่ของประสิทธิภาพการทำงานหรือใช้งานง่าย พวกเขาไม่ได้ถูกเลือกสำหรับการประเมินผลต่อไป นอกจากนี้เราไม่ได้เก็บทดสอบ Lifetech ไวรัสอีโบลา (2014 ซาอีร์) สำหรับการทดสอบเพิ่มเติม อย่างใดอย่างหนึ่ง เป็นมันน้อยกว่าส่วนเคาน์เตอร์ของ lyophilized และขาดประโยชน์ของจริง LOD ที่กำหนดสำหรับการห้าว่า assays (Altona จอ ชนิด Altona, Roche, FTD, andLifetech L), ใช้เจือจาง serial ของวัด RNAs ทับในหลอดทดลอง (รูป 2 ตารางที่ 1) สามารถเห็นได้ในรูป 2 ซึ่งแสดงถึงการทดลองแยกดำเนินการ 7 เดือนกัน ความแปรปรวนระหว่างทดสอบมีขนาดเล็กมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

4. ผลการค้นหา 4.1 การเปรียบเทียบความไวเชิงวิเคราะห์ในเชิงพาณิชย์และหกห้าในบ้าน RRT-PCR ตรวจ แต่ละหกเชิงพาณิชย์และห้าชุดตรวจในบ้านถูกประเมินโดยจุดสิ้นสุดการลดสัดส่วนการใช้เจือจาง 5 เท่าของสองวัฒนธรรมที่ได้มาจากความยาวเต็ม RNAs วีจีโนมที่เกี่ยวข้องกับการแยกเก็บในกินีมีนาคม 2014 (ชื่อ C5 และ C15 RNAs ) (รูป. 1 และตาราง S2) ในขณะที่ทั้งหมด 11 ชุดตรวจสามารถตรวจสอบจากทั้งอาร์เอ็นเอสายพันธุ์, ชุดพาณิชย์มักจะมีความสำคัญมากขึ้น ตั้งแต่ในบ้านแบบ real-time RT-PCRs จัดให้มีข้อได้เปรียบที่ไม่มีในแง่ของประสิทธิภาพหรือความสะดวกในการใช้งานพวกเขาไม่ได้เลือกสำหรับการประเมินผลต่อไป เราไม่ได้รักษาไวรัสอีโบลา LifeTech (ซาอีร์ 2014) การทดสอบสำหรับการทดสอบต่อไปอย่างใดอย่างหนึ่งตามที่มันเป็นที่มีความสำคัญน้อยกว่าส่วนที่เคาน์เตอร์ของแห้งและขาดความได้เปรียบในการปฏิบัติ ล็อดถูกกำหนดสำหรับห้าการวิเคราะห์แนวโน้มมากที่สุด (อัลโตหน้าจอ, Altona ประเภทโรช FTD, andLifetech L) โดยใช้เจือจางอนุกรมของปริมาณในหลอดทดลองคัดลอก RNAs (รูป. 2 ตารางที่ 1) ที่สามารถเห็นได้ในรูป 2 ซึ่งหมายถึงการทดลองทั้งสองแยกจากกันดำเนินเจ็ดเดือนนอกเหนือความแปรปรวนระหว่างการทดสอบมีขนาดเล็กมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

4 . ผลลัพธ์ 4.1 . การเปรียบเทียบความไวเชิงพาณิชย์และห้าในหก RRT PCR ) . แต่ละหกพาณิชย์และห้าในบ้านหรือที่ประเมินโดยการใช้วิธีการสองวัฒนธรรมความหมาย : ผู้อื่นได้มาเต็ม 5 จีโนม RNAs เกี่ยวข้องกับไอโซในกินีในเดือนมีนาคม 2014 ( ชื่อและ C5 c15 RNAs ) ( รูปที่ 1 และตาราง S1 ) ในขณะที่ทั้งหมด 11 ) สามารถตรวจหาอาร์เอ็นเอจากทั้งสองสายพันธุ์ชุดพาณิชย์มีแนวโน้มที่สำคัญมากขึ้น เนื่องจากในเวลาจริง RT pcrs ให้ประโยชน์ในแง่ของประสิทธิภาพหรือใช้งานง่าย พวกเขาไม่ได้ถูกเลือกสำหรับการประเมินผลต่อไป เราไม่ได้รักษาไวรัสอีโบล่า ไลฟ์เทค ( Zaire 2014 ) การทดสอบสำหรับการทดสอบต่อไปอย่างใดอย่างหนึ่ง มันอ่อนไหวน้อยกว่าไลโอเคาน์เตอร์ - ส่วนขาดข้อดีและประโยชน์ของ LOD ตั้งใจสำหรับห้าแนวโน้มมากที่สุด ( อัลโต ) หน้าจอ , ประเภท , อัลโต FTD โรช , , andlifetech L ) โดยใช้วิธีการวัดแบบอนุกรมในหลอดทดลองและ RNAs ( รูปที่ 2 , ตารางที่ 1 ) ที่สามารถเห็นได้ในรูปที่ 2 ซึ่งแสดงถึงสองแยกการทดลองเจ็ดเดือนกัน , อินเตอร์ ) ซึ่งมีขนาดเล็กมาก