results.bioinformatic analysis of t

results.
bioinformatic analysis of the ''cellulose synthase-like''(cslAsc) gene in S.coelicolor.
The S.coelicolor genome contains only one gene (SCO2836) encoding a cellulose synthase-like protein has weak similarity to the catalytic subunits ofcellulose synthases from bacteria and plants. We there fore named SCO2836 cslAsc (cellulose synthase-like gene of S.coelicolor) . Orthologs of cslAsc were also found in streptomyces avermitilis MA-4680(19) and Streptomyces nanchangensis (35). Structure prediction suggested that the protein has seven transmembrane domains. with the N terminus being cytoplasmid and the C terminus outsids the membrane. the large cytoplasmid domain in the middle region contains domains that match entries pfam03552 (cellulose synthase)(E value,2e-9), from aa 338 to 451,and PF00535(glycosycosyltransferasefamily)(E value, le-7),from aa 166 to 342(26). The central active site of cellulose synthases is thought to comprise four particulaarly conserved subregions (U1 through U4) that contain the conserved Asp(D) residues(in U1 to U3 )and the motif QXXRW (in U4)(32).These are considered essential for substrate binding and catalysis (32),and they are present in CslA(Fig. 1A). The residue of a normally conserved KAG motif is replaced by H and aQTP motif is not conserved in CslAsc, but the function of these two motifs in cellulose synthase are not yet establihed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผล.
วิเคราะห์ชีวสารสนเทศของเซลลูโลส'' เทสเหมือน'' (cslasc) ยีนใน s.coelicolor.
จีโนม s.coelicolor มีเพียงหนึ่งยีน (sco2836) การเข้ารหัสโปรตีนเทสเหมือนเซลลูโลสมีความคล้ายคลึงกันในการเร่งปฏิกิริยาอ่อนแอ หน่วยย่อย ofcellulose synthases จากเชื้อแบคทีเรียและพืช เราก่อนมีชื่อ sco2836 cslasc (ยีนเซลลูโลสเทสเหมือน s.coelicolor)orthologs ของ cslasc นอกจากนี้ยังพบใน Streptomyces avermitilis ma-4680 (19) และ Streptomyces nanchangensis (35) ทำนายโครงสร้างชี้ให้เห็นว่าโปรตีนที่มีเจ็ดโดเมนรน ด้วย n ปลายทางถูก cytoplasmid c และปลายทาง outsids เมมเบรน โดเมน cytoplasmid ขนาดใหญ่ในพื้นที่ตรงกลางจะมีโดเมนที่ตรงกับรายการ pfam03552 (เทสเซลลูโลส) (ค่าอี2e-9) จาก AA 338-451 และ pf00535 (glycosycosyltransferasefamily) (ค่าอี le-7) จาก AA 166-342 (26) การใช้งานเว็บไซต์กลางของ synthases เซลลูโลสเป็นความคิดที่ประกอบด้วยสี่ภูมิภาคย่อยอนุรักษ์ particulaarly (u1 ผ่าน U4) ที่มีงูเห่าป่าสงวน (ง) ตกค้าง (u1 ในการ u3) และ qxxrw เด่น (ใน U4) (32). เหล่านี้ถือว่าเป็น สารตั้งต้นที่จำเป็นสำหรับการมีผลผูกพันและการเร่งปฏิกิริยา (32)และพวกเขามีอยู่ใน CSLA (รูปที่ 1a) สารตกค้างของมาตรฐาน kag อนุรักษ์ปกติจะถูกแทนที่ด้วยชั่วโมงและมาตรฐาน aqtp ไม่ได้อยู่ในป่าสงวน cslasc แต่ฟังก์ชั่นของทั้งสองสำคัญในเทสเซลลูโลสไม่ establihed ยัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลลัพธ์
วิเคราะห์ผลเชิงวิวัฒนาการของการ '' ยีน synthase-like''(cslAsc) เซลลูโลสในจีโนม S.coelicolor.
The S.coelicolor ประกอบด้วยเพียงหนึ่งยีน (SCO2836) เข้ารหัสเป็นโปรตีนเช่น synthase เซลลูโลสได้คล้ายอ่อน synthases ofcellulose subunits ตัวเร่งปฏิกิริยาจากแบคทีเรียและพืช เรามีก่อนชื่อ SCO2836 cslAsc (เซลลูโลส synthase เหมือนยีนของ S.coelicolor) นอกจากนี้ยังพบ Orthologs cslAsc streptomyces avermitilis MA-4680(19) และ Streptomyces nanchangensis (35) คาดเดาโครงสร้างแนะนำว่า โปรตีนที่มีโดเมน transmembrane เจ็ด มีนัส N เป็น cytoplasmid และ outsids นัสของ C เมมเบรน โดเมน cytoplasmid ขนาดใหญ่ในภาคกลางประกอบด้วยโดเมนที่ตรงกับรายการ pfam03552 (synthase เซลลูโลส)(E value,2e-9), เอเอ 338-451 และ PF00535(glycosycosyltransferasefamily) (E ค่า เลอ-7), จาก aa 166 กับ 342(26) ใช้งานเวปไซต์ของเซลลูโลส synthases เป็นความคิดประกอบด้วย subregions particulaarly ที่อยู่ 4 (U1 ผ่าน U4) ที่ประกอบด้วยการตก Asp(D) นำ (ใน U1 กับ U3) และแปลน QXXRW (ใน U4)(32)เหล่านี้จะถือว่าจำเป็นสำหรับการรวมพื้นผิวและการเร่งปฏิกิริยา (32),และพวกเขาจะอยู่ใน CslA(Fig. 1A) สารตกค้างของแปลน KAG นำโดยปกติจะถูกแทนที่ โดย H และแปลน aQTP ไม่มีอยู่ใน CslAsc แต่การทำงานของเหล่านี้โดดเด่นสองในเซลลูโลส synthase ยังไม่ establihed

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผล.
bioinformatic การวิเคราะห์ของ"เซลลูโลส synthase - เหมือน"( cslasc )ยีนใน S . coelicolor .
ที่. coelicolor ยีนมีเพียงหนึ่งยีน( SCO 2836 )การเข้ารหัสที่เซลลูโลส synthase - เช่นโปรตีนมีอ่อนแออย่างเดียวกันกับที่มีเครื่องฟอกไอเสีย subunits ofcellulose synthases จากแบคทีเรียและพันธุ์ไม้ต่างๆ. เรามีหน้าชื่อ SCO 2836 cslasc (ยีน synthase - เช่นเซลลูโลสของ coelicolor . S . S .)orthologs ของ cslasc ก็พบว่าในหน่วย mA avermitilis streptomyces -4680 ( 19 )และ nanchangensis streptomyces ( 35 ) โครงสร้างการคาดการณ์ที่ว่าโปรตีนมีเจ็ด transmembrane โดเมนด้วย n สถานีปลายทางที่ cytoplasmid และ C สถานีปลายทาง outsids ที่เยื่อในขนาดใหญ่ cytoplasmid โดเมนในส่วนกลาง ภูมิภาค ประกอบด้วยโดเมนที่ตรงกับรายการ pfam 03552 (เซลลูโลส synthase )( E มูลค่า,2 e - 9 )จาก AA 338 ถึง 451 และ PF 00535 ( glycosycosyltransferasefamily )( E มูลค่า Le - 7 )จาก AA 166 เพื่อ 342 ( 26 ) ที่ส่วนกลางใช้งานเว็บไซต์ของเซลลูโลส synthases คือคิดว่าจะรักษาไว้ซึ่งประกอบด้วยสี่ particulaarly subregions ( U 1 ผ่าน U 4 )ที่มีพื้นที่ ASP ( D )สารตกค้าง(ใน U 1 U 3 )และที่โดดเด่น qxxrw (ใน U 4 )( 32 ).เหล่านี้ได้รับการพิจารณาให้เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับผิวหน้ามีผลผูกพันและ catalysis ( 32 )และพวกเขาอยู่ใน csla (รูปที่ 1 ) คราบของความโดดเด่นตามปกติ kag สงวนที่จะถูกแทนที่ด้วยความโดดเด่นและ aqtp ไม่ได้สงวนไว้ใน cslasc แต่หน้าที่ของสองความโดดเด่นตามแบบนี้ใน synthase เซลลูโลสไม่ establihed แต่