Prediction of miRNAs targeting Cf-9

Prediction of miRNAs targeting Cf-9
MicroRNAs targeting the Cf-9 gene was predicted using the
SoMART database (http://somart.ist.berkeley.edu) as described
[18]. Briefly, the Cf-9 mRNA sequence was input and potential
miRNAs targeting this gene were predicted using Slicer Detector
program and SLY1 as tomato sequence database. The targets of the
predicted miRNAs were confirmed using dRNA Mapper program
with degradome database. The pre-miRNA sequences of the predicted
miRNAs were obtained using PreMIR Detector program.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ประมาณการเป้าหมาย Cf-9 miRNAsMicroRNAs ที่กำหนดเป้าหมายยีน Cf-9 ถูกคาดการณ์โดยใช้การฐานข้อมูล SoMART (http://somart.ist.berkeley.edu) ตามที่อธิบายไว้[18] . สั้น ๆ ลำดับ Cf-9 mRNA ถูกป้อนเข้า และมีศักยภาพmiRNAs กำหนดเป้าหมายยีนนี้ถูกคาดการณ์โดยใช้เครื่องตรวจจับเครื่องตัดโปรแกรมและ SLY1 เป็นฐานข้อมูลลำดับของมะเขือเทศ เป้าหมายของการคาดการณ์ miRNAs ได้รับการยืนยันโดยใช้โปรแกรม dRNA Mapperด้วยฐานข้อมูล degradome ลำดับก่อนเที่ยวของการคาดการณ์miRNAs ได้รับโดยใช้โปรแกรมตรวจจับ PreMIR

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การคาดการณ์ของ miRNAs กำหนดเป้าหมาย CF-9
microRNAs กำหนดเป้าหมาย CF-9 ยีนเป็นที่คาดการณ์โดยใช้
ฐานข้อมูล SoMART (http://somart.ist.berkeley.edu) ตามที่อธิบาย
[18] สั้น ๆ , CF-9 ลำดับ mRNA คือการป้อนข้อมูลและศักยภาพ
miRNAs กำหนดเป้าหมายยีนนี้ได้รับการคาดการณ์โดยใช้เครื่องตัดเครื่องตรวจจับ
โปรแกรมและ SLY1 เป็นฐานข้อมูลลำดับมะเขือเทศ เป้าหมายของ
miRNAs คาดการณ์ได้รับการยืนยันการใช้โปรแกรม dRNA Mapper
กับฐานข้อมูล degradome ลำดับก่อน miRNA ของคาดการณ์
miRNAs ที่ได้รับการใช้โปรแกรมตรวจจับ PreMIR

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

คำทำนายของ mirnas เป้าหมาย cf-9micrornas เป้าหมาย cf-9 สามารถทำนายการใช้ยีนฐานข้อมูล somart ( http://somart.ist.berkeley.edu ) ตามที่อธิบายไว้[ 18 ] สั้น ๆ , ลำดับของ cf-9 เป็น input และศักยภาพmirnas เป้าหมายยีนนี้ถูกคาดการณ์การใช้เครื่องตัดโปรแกรมและฐานข้อมูลลำดับ sly1 เป็นมะเขือเทศ เป้าหมายของทำนาย mirnas ได้ยืนยันการใช้โปรแกรม Mapper drnaด้วยฐานข้อมูล degradome . ก่อน mirna ลำดับของพยากรณ์mirnas ได้รับการใช้โปรแกรมตรวจจับ premir .