Correlations between gene expressio

Correlations between gene expression and metabolite/phytohormone levels under abiotic stress conditions have been reported for
Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). However, little is known about these correlations in rice (Oryza sativa‘Nipponbare’), despite its
importance as a model monocot. We performed an integrated analysis to clarify the relationships among cold- and dehydrationresponsive metabolites, phytohormones, and gene transcription in rice. An integrated analysis of metabolites and gene expression
indicated that several genes encoding enzymes involved in starch degradation, sucrose metabolism, and the glyoxylate cycle are upregulated in rice plants exposed to cold or dehydration and that these changes are correlated with the accumulation of glucose (Glc),
fructose, and sucrose. In particular, high expression levels of genes encoding isocitrate lyase and malate synthase in the glyoxylate
cycle correlate with increased Glc levels in rice, but not in Arabidopsis, under dehydration conditions, indicating that the regulation
of the glyoxylate cycle may be involved in Glc accumulation under dehydration conditions in rice but not Arabidopsis. An integrated
analysis of phytohormones and gene transcripts revealed an inverse relationship between abscisic acid (ABA) signaling and
cytokinin (CK) signaling under cold and dehydration stresses; these stresses increase ABA signaling and decrease CK signaling.
High levels ofOryza sativa 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts correlate with ABA accumulation, and low levels of
Cytochrome P450 (CYP) 735Atranscripts correlate with decreased levels of a CK precursor in rice. This reduced expression of
CYP735Asoccurs in rice but not Arabidopsis. Therefore, transcriptional regulation ofCYP735Asmight be involved in regulating
CK levels under cold and dehydration conditions in rice but not Arabidopsis

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีการรายงานความสัมพันธ์ระหว่างยีนและระดับ metabolite/phytohormone สภาวะเครียด abioticArabidopsis (Arabidopsis thaliana) อย่างไรก็ตาม น้อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับความสัมพันธ์เหล่านี้ข้าว (Oryza sativa'Nipponbare') แม้มีความความสำคัญเป็น monocot รุ่น เราทำการวิเคราะห์วงจรเพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ระหว่างเย็น และ dehydrationresponsive metabolites, phytohormones และ transcription ของยีนในข้าว การวิเคราะห์วงจรของ metabolites และยีนระบุว่า หลายยีนเอนไซม์เข้าเกี่ยวข้องกับแป้งย่อยสลาย เผาผลาญซูโครส และวัฏจักรเป็น upregulated ในพืชข้าวสัมผัสเย็นการคายน้ำ และการที่เปลี่ยนแปลงเหล่านี้มี correlated กับการสะสมของน้ำตาลกลูโคส (Glc),ฟรักโทส และซูโครส ในระดับยีนเข้า isocitrate lyase และมาลา synthase ใน glyoxylate ในนิพจน์เฉพาะ สูงวงจรความสัมพันธ์เพิ่มขึ้นระดับ Glc ในข้าว แต่ไม่ใช่ ใน Arabidopsis สภาวะ คายน้ำเพื่อระบุว่า ข้อบังคับของ glyoxylate ใน วงจรอาจจะเกี่ยวข้องใน Glc สะสมภายใต้เงื่อนไขการคายน้ำในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis การรวมphytohormones และยีนใบแสดงผลการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ผกผันระหว่างกรดแอบไซซิก (ABA) ตามปกติที่เปิดเผย และcytokinin (CK) ตามปกติภายใต้เย็นและคายน้ำเครียด ความเครียดเหล่านี้เพิ่ม ABA ตามปกติและลดสัญญาณ CKระดับสูง ofOryza ซา 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts เชื่อมโยงกับ ABA สะสม และระดับต่ำ735Atranscripts cytochrome P450 (CYP) สร้างความสัมพันธ์กับระดับการลดลงของสารตั้งต้น CK ในข้าว นิพจน์นี้ลดลงของCYP735Asoccurs ข้าวแต่ไม่ Arabidopsis ดังนั้น ofCYP735Asmight transcriptional ระเบียบเกี่ยวข้องในการควบคุมระดับ CK สภาวะเย็นและการคายน้ำในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความสัมพันธ์ระหว่างการแสดงออกของยีนและระดับอุณหภูมิ / phytohormone ภายใต้สภาวะความเครียด การทดลองได้มีการรายงาน
Arabidopsis ( Arabidopsis thaliana ) แต่น้อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับความสัมพันธ์เหล่านี้ในข้าว ( Oryza sativa'nipponbare ' ) แม้จะมีความสําคัญของ
เป็นพืชใบเลี้ยงเดี่ยว แบบจำลองเราทำการวิเคราะห์แบบบูรณาการเพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ระหว่างเย็นและ dehydrationresponsive metabolites phytohormones และยีนถอดความในข้าว การวิเคราะห์แบบบูรณาการและพบว่าสาร
การแสดงออกของยีนหลายยีนเข้ารหัสเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญแป้ง โดยการย่อยสลายและวงจรทฤษฎีบทเวียนบังเกิดเป็น upregulated ในต้นข้าวสัมผัสกับน้ำเย็นหรือน้ำและการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้มีความสัมพันธ์กับการสะสมกลูโคส ( glc )
ฟรุคโตสและซูโครส โดยเฉพาะระดับการแสดงออกของยีนเข้ารหัสสูง lyase ไอโซซิเตรตและ malate synthase ในวงจรทฤษฎีบทเวียนบังเกิด
ที่มีระดับเพิ่มขึ้น glc ในข้าว แต่ไม่ใช่ใน Arabidopsis ,ภายใต้สภาวะขาดน้ำ ระบุว่า ระเบียบ
จากวงจรทฤษฎีบทเวียนบังเกิดอาจเกี่ยวข้องกับ glc สะสมภายใต้สภาวะ dehydration ในข้าว แต่ไม่ Arabidopsis . การวิเคราะห์แบบบูรณาการ
ของ phytohormones และยีนยีนเปิดเผยความสัมพันธ์ผกผันระหว่าง abscisic acid ( ABA ) การส่งสัญญาณและ
) ( CK ) ส่งสัญญาณในเย็นและการเน้น ;การเพิ่มและลดความเครียดเหล่านี้ ABA CK ส่งสัญญาณ
ระดับสูง oforyza , 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts สัมพันธ์กับการสะสม ABA และระดับต่ำของ
โครมพี 450 ( CYP ) 735atranscripts มีความสัมพันธ์กับระดับของ CK ลดลง โปรตีนในข้าว ลดการแสดงออกของ
cyp735asoccurs ในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis . ดังนั้นลอง ofcyp735asmight มีส่วนร่วมในการออกข้อบังคับ ระเบียบ หรือ เย็น และแห้ง
ระดับภายใต้เงื่อนไขในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis