The National Cancer Institute (NCI)

The National Cancer Institute (NCI) Cancer Biomedical Informatics Grid® (caBIG®) program established standards and best practices for biorepository data management by creating an infrastructure to propagate biospecimen resource sharing while maintaining data integrity and security. caTissue suite, a biospecimen data management software tool, has evolved from this effort. More recently, the caTissue suite continues to evolve as an open source initiative known as OpenSpecimen. The essential functionality of OpenSpecimen includes the capture and representation of highly granular, hierarchically-structured data for biospecimen processing, quality assurance, tracking, and annotation. Ideal for multi-user and multi-site biorepository environments, OpenSpecimen permits role-based access to specific sets of data operations through a user-interface designed to accommodate varying workflows and unique user needs. The software is interoperable, both syntactically and semantically, with an array of other bioinformatics tools given its integration of standard vocabularies thus enabling research involving biospecimens. End-users are encouraged to share their day-to-day experiences in working with the application, thus providing to the community board insight into the needs and limitations which need be addressed. Users are also requested to review and validate new features through group testing environments and mock screens. Through this user interaction, application flexibility and interoperability have been recognized as necessary developmental focuses essential for accommodating diverse adoption scenarios and biobanking workflows to catalyze advances in biomedical research and operations. Given the diversity of biobanking practices and workforce roles, efforts have been made consistently to maintain robust data granularity while aiding user accessibility, data discoverability, and security within and across applications by providing a lower learning curve in using OpenSpecimen. Iterative development and testing cycles provide continuous maintenance and up-to-date capabilities for this freely available, open-access, web-based software application that is globally-adopted at over 25 institutions.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

®ตารางสารสนเทศทางชีวการแพทย์โรคมะเร็งสถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NCI) (caBIG ®) โปรแกรมสร้างมาตรฐานและวิธีปฏิบัติสำหรับการจัดการข้อมูล biorepository โดยการสร้างโครงสร้างพื้นฐานการสืบ biospecimen ทรัพยากรที่ใช้ร่วมกันในขณะที่รักษาความสมบูรณ์ของข้อมูลและความปลอดภัย สวีท caTissue การ biospecimen ข้อมูลซอฟต์แวร์บริหาร มีพัฒนาจากความพยายามนี้ เมื่อเร็ว ๆ นี้ ท caTissue ยังคงฐานะความคิดริเริ่มมาเปิดที่เรียกว่า OpenSpecimen หน้าที่สำคัญของ OpenSpecimen รวมถึงจับภาพและการแสดงของ granular สูง โครง สร้างชั้นข้อมูลสำหรับการประมวลผล biospecimen ประกันคุณภาพ การติดตาม และคำอธิบาย เหมาะสำหรับสภาพแวดล้อมแบบหลายผู้ใช้ และหลาย biorepository, OpenSpecimen ตามบทบาทถึงชุดเฉพาะของข้อมูลการดำเนินงานผ่านการติดต่อผู้ใช้ออกแบบมาเพื่อรองรับกระแสงานที่แตกต่างและความต้องการเฉพาะผู้ใช้ที่อนุญาต ซอฟต์แวร์ได้ interoperable ทั้งประโยค และความ หมาย ด้วยเครื่องมืออื่น ๆ bioinformatics ให้การบูรณาการ vocabularies มาตรฐานที่เปิดใช้งานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับ biospecimens ผู้มีกำลังใจจะแบ่งปันประสบการณ์ประจำวันของพวกเขาในการทำงานกับโปรแกรมประยุกต์ ดังนั้น ให้เข้าใจคณะกรรมการชุมชนในความต้องการและข้อจำกัดที่ต้องได้รับการ ผู้ใช้ยังได้ร้องขอการตรวจทาน และตรวจสอบคุณลักษณะใหม่กลุ่มทดสอบสภาพแวดล้อม และซ่อมหน้าจอ ผ่านการโต้ตอบผู้ใช้นี้ โปรแกรมประยุกต์มีความยืดหยุ่นและทำงานร่วมกันได้รับรู้เป็นโฟกัสที่พัฒนาจำเป็นจำเป็นสำหรับการรองรับสถานการณ์ยอมรับหลากหลายและเวิร์กโฟลว์ biobanking เพื่อความก้าวหน้าในการวิจัยทางชีวการแพทย์และการดำเนินงานสถาบันการ ให้ความหลากหลายของ biobanking ปฏิบัติและบทบาทของบุคลากร ความพยายามได้ทำอย่างสม่ำเสมอเพื่อรักษาส่วนประกอบของข้อมูลที่แข็งแกร่งในขณะที่ช่วยงานการเข้าถึงของผู้ใช้ ข้อมูลยก และความปลอดภัยภายใน และโปรแกรมประยุกต์โดยให้เส้นโค้งการเรียนรู้ต่ำกว่าใช้ OpenSpecimen พัฒนาซ้ำและทดสอบวงจรให้การบำรุงรักษาอย่างต่อเนื่องและความสามารถล่าสุดสำหรับโปรแกรมประยุกต์นี้ซอฟต์แวร์พร้อมใช้งานได้อย่างอิสระ เปิดเข้า เว็บที่ทั่วโลกนำที่ 25 สถาบัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NCI) มะเร็งสารสนเทศชีวการแพทย์Grid® (caBIG®) โปรแกรมกำหนดมาตรฐานและแนวทางปฏิบัติที่ดีที่สุดสำหรับการจัดการข้อมูล biorepository โดยการสร้างโครงสร้างพื้นฐานในการเผยแพร่ใช้ทรัพยากรร่วมกัน biospecimen ขณะที่ยังคงความสมบูรณ์ของข้อมูลและการรักษาความปลอดภัย caTissue ชุดเครื่องมือซอฟต์แวร์การจัดการข้อมูล biospecimen, มีวิวัฒนาการมาจากความพยายามนี้ เมื่อเร็ว ๆ นี้ชุด caTissue ยังคงมีวิวัฒนาการเป็นความคิดริเริ่มที่มาเปิดที่รู้จักกันเป็น OpenSpecimen การทำงานที่สำคัญของ OpenSpecimen รวมถึงการจับภาพและการเป็นตัวแทนของเม็ดสูงข้อมูลลำดับชั้นโครงสร้างสำหรับการประมวลผล biospecimen การประกันคุณภาพการติดตามและคำอธิบายประกอบ เหมาะอย่างยิ่งสำหรับผู้ใช้หลายคนและหลายสถานที่สภาพแวดล้อม biorepository, OpenSpecimen อนุญาตให้เข้าถึงตามบทบาทชุดเฉพาะของข้อมูลการดำเนินงานผ่านส่วนติดต่อผู้ใช้ออกแบบมาเพื่อรองรับขั้นตอนการทำงานที่แตกต่างกันและความต้องการของผู้ใช้ที่ไม่ซ้ำกัน ซอฟแวร์คือการทำงานร่วมกันทั้ง syntactically และความหมายกับอาร์เรย์ของเครื่องมือรสอื่น ๆ ที่ได้รับการรวมกลุ่มของคำศัพท์มาตรฐานจึงทำให้การวิจัยที่เกี่ยวข้องกับการ biospecimens ผู้ใช้งานได้รับการสนับสนุนที่จะแบ่งปันประสบการณ์แบบวันต่อวันของพวกเขาในการทำงานกับแอพลิเคชันจึงให้ไปยังคณะกรรมการชุมชนเข้าใจถึงความต้องการและข้อ จำกัด ที่จำเป็นต้องได้รับการแก้ไข ผู้ใช้บริการจะขอตรวจสอบและตรวจสอบคุณสมบัติใหม่ที่ผ่านการทดสอบสภาพแวดล้อมของกลุ่มและหน้าจอจำลอง ผ่านการโต้ตอบกับผู้ใช้นี้มีความยืดหยุ่นในการทำงานร่วมกันของโปรแกรมประยุกต์และได้รับการยอมรับว่าเป็นสิ่งที่จำเป็นในการพัฒนามุ่งเน้นสิ่งจำเป็นสำหรับการรองรับสถานการณ์การยอมรับความหลากหลายและเวิร์กโฟลว์ biobanking เพื่อกระตุ้นความก้าวหน้าในการวิจัยทางการแพทย์และการดำเนินงาน ได้รับความหลากหลายของการปฏิบัติ biobanking และบทบาทแรงงานมีความพยายามทำอย่างต่อเนื่องเพื่อรักษาเมล็ดข้อมูลที่มีประสิทธิภาพในขณะที่การช่วยเหลือผู้ใช้เข้าถึงข้อมูลการค้นพบและการรักษาความปลอดภัยภายในและระหว่างการใช้งานโดยการให้การเรียนรู้ที่ต่ำกว่าในการใช้ OpenSpecimen พัฒนาซ้ำและรอบการทดสอบอย่างต่อเนื่องให้การบำรุงรักษาและความสามารถขึ้นไปวันนี้ที่มีอยู่ได้อย่างอิสระเปิดการเข้าถึงการประยุกต์ใช้ซอฟต์แวร์บนเว็บที่จะนำมาใช้ทั่วโลกกว่า 25 สถาบัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สถาบันมะเร็งแห่งชาติ ( NCI ) มะเร็งชีวการแพทย์สารสนเทศตาราง® ( cabig ® ) โปรแกรมสร้างมาตรฐานและการปฏิบัติที่ดีที่สุดสำหรับการจัดการข้อมูล biorepository โดยการสร้างโครงสร้างพื้นฐานเพื่อเผยแพร่ biospecimen ทรัพยากรร่วมกันในขณะที่การรักษาความสมบูรณ์ของข้อมูลและการรักษาความปลอดภัย catissue แต่งงาน , biospecimen การจัดการข้อมูลเครื่องมือซอฟต์แวร์ที่ได้พัฒนาขึ้นจากความพยายามนี้ เมื่อเร็วๆ นี้การ catissue แต่งงาน ยังคงพัฒนาเป็นแหล่งเปิดโครงการที่เรียกว่า openspecimen . ฟังก์ชันการทำงานที่สำคัญของ openspecimen รวมถึงการจับและการขอแบบโครงสร้างสาธารณูปการข้อมูลสำหรับการประมวลผล biospecimen การประกันคุณภาพ การติดตามและบันทึกย่อ . เหมาะสำหรับผู้ใช้หลายคนและหลายเว็บไซต์ biorepository สภาพแวดล้อม ,openspecimen อนุญาตให้ผู้ใช้เข้าถึงชุดเฉพาะของข้อมูลการดำเนินงานผ่านอินเตอร์เฟซผู้ใช้ที่ออกแบบมาเพื่อรองรับการเวิร์กโฟลว์และความต้องการของผู้ใช้ที่ไม่ซ้ำกัน ซอฟต์แวร์ร่วมกัน ทั้งการ และองค์ประกอบอื่น ๆที่มีความหลากหลายของเครื่องมือรสนได้รับการบูรณาการมาตรฐานศัพท์จึงทำให้การวิจัยที่เกี่ยวข้องกับ biospecimens .ผู้ใช้ควรที่จะแบ่งปันประสบการณ์แบบวันต่อวันของพวกเขาในการทำงานกับโปรแกรม จึงให้คณะกรรมการชุมชนความเข้าใจในความต้องการ และข้อจำกัดที่ต้อง addressed ผู้ใช้ยังร้องขอให้ทบทวนและตรวจสอบคุณสมบัติใหม่ผ่านกลุ่มการทดสอบสภาพแวดล้อมและหน้าจอเสมือนจริง ผ่านการโต้ตอบกับผู้ใช้นี้ความยืดหยุ่นโปรแกรมประยุกต์และวิธีการได้รับการยอมรับเท่าที่จำเป็นเพื่อรองรับสถานการณ์ที่จำเป็นสำหรับการพัฒนาการยอมรับความหลากหลาย และ biobanking เวิร์กโฟลว์เพื่อเร่งความก้าวหน้าในการดำเนินการวิจัยและชีว ให้ความหลากหลายของ biobanking การปฏิบัติและบทบาทของบุคลากรความพยายามได้รับการทำอย่างต่อเนื่องเพื่อรักษาข้อมูลที่แข็งแกร่งในขณะที่การช่วยงาน granularity เข้าถึงผู้ใช้ความสามารถของข้อมูลและการรักษาความปลอดภัยภายในและระหว่างการใช้งาน โดยการให้การเรียนรู้ที่ลดลงในการใช้ openspecimen . การพัฒนาและทดสอบซ้ำรอบการบำรุงรักษาอย่างต่อเนื่องและทันสมัยเพื่อให้ความสามารถในการเข้าถึงนี้เปิดใช้ได้อย่างอิสระซอฟต์แวร์บนเว็บที่สมัครทั่วโลกยอมรับกว่า 25 สถาบัน