Figure 6. Differentiated and segreg

Figure 6. Differentiated and segregating SNPs between and within groups. For this analysis isolates that were shown to be mixtures of clones or hybrids between groups were removed (indicated by ‘*’, see also Materials and methods). Groups sizes after removal of those isolates are specified in panels A and C. (A) FST values between pairwise group comparisons. The fraction of differentially fixed SNPs (FST = 1) for each pairwise group comparison is indicated at the top right corner of each plot. Percentages larger than 50% are coloured in red, otherwise blue. (B) The number of marker SNPs for each group, that is SNPs that are differentially fixed in one group versus all others. (C) Number of SNPs that are differentially fixed between sets of groups. Groups fixed for the same allele are indicated in the bottom panel through connecting points corresponding to the specific groups. Grey and black lines connect sets of groups monomorphic for the alternate and reference allele, respectively. (D) Number and density of SNPs segregating in the respective groups. As sample sizes of the different groups vary, figures are also shown for three random sub-samples of the larger groups. Results of sub-sampling are displayed as mean and sd. The online version of this article includes the following figure supplement(s) for figure 6: Figure supplement 1. Polymorphism sharing between groups.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รูปที่ 6 สร้างความแตกต่างและแยก SNP ระหว่างและภายในกลุ่ม สำหรับการวิเคราะห์นี้ แยกที่แสดงให้เห็นว่าเป็นของผสมของโคลนหรือลูกผสมระหว่างกลุ่มถูกลบออก (ระบุด้วย '*' โปรดดูวัสดุและวิธีการด้วย) ขนาดกลุ่มหลังจากการลบไอโซเลทเหล่านั้นจะถูกระบุในแผง A และ C (A) ค่า FST ระหว่างการเปรียบเทียบกลุ่มแบบคู่ เศษส่วนของ SNP คงที่ที่แตกต่างกัน (FST = 1) สำหรับการเปรียบเทียบกลุ่มแบบคู่แต่ละกลุ่มจะแสดงที่มุมขวาบนของแต่ละพล็อต เปอร์เซ็นต์ที่มากกว่า 50% จะถูกแสดงเป็นสีแดง หรือสีน้ำเงิน (B) จำนวนเครื่องหมาย SNP สำหรับแต่ละกลุ่ม นั่นคือ SNP ที่ได้รับการแก้ไขที่แตกต่างกันในกลุ่มเดียวเมื่อเทียบกับกลุ่มอื่นทั้งหมด (C) จำนวน SNP ที่ได้รับการแก้ไขที่แตกต่างกันระหว่างชุดของกลุ่ม กลุ่มที่ถูกกำหนดไว้สำหรับอัลลีลเดียวกันจะถูกระบุในแผงด้านล่างผ่านจุดเชื่อมต่อที่สอดคล้องกับกลุ่มเฉพาะ เส้นสีเทาและสีดำเชื่อมต่อชุดของกลุ่ม monomorphic สำหรับอัลลีลสำรองและอัลลีลอ้างอิงตามลำดับ (D) จำนวนและความหนาแน่นของ SNP ที่แยกออกเป็นกลุ่มตามลำดับ เนื่องจากขนาดของกลุ่มตัวอย่างที่แตกต่างกันแตกต่างกันไป จึงมีการแสดงตัวเลขสำหรับตัวอย่างย่อยแบบสุ่มสามกลุ่มของกลุ่มขนาดใหญ่ด้วย ผลลัพธ์ของการสุ่มตัวอย่างย่อยจะแสดงเป็นค่าเฉลี่ยและ sd เวอร์ชันออนไลน์ของบทความนี้ประกอบด้วยส่วนเสริมของรูปที่ 6 ต่อไปนี้: ส่วนเสริมของรูปที่ 1 การแบ่งปันความหลากหลายระหว่างกลุ่ม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปที่ 6 แยกแยะและแยก SNPs ระหว่างกลุ่มและภายในกลุ่ม ในการวิเคราะห์นี้พืชแยกที่พิสูจน์แล้วว่าเป็นส่วนผสมโคลนหรือไฮบริดระหว่างกลุ่มจะถูกลบออก (แสดงด้วย "*" และดูวัสดุและวิธีการ) ขนาดของกลุ่มหลังจากถอดแยกเหล่านี้จะถูกระบุในแผง A และ C (A) ค่า FST ระหว่างการเปรียบเทียบกลุ่มเป็นคู่ คะแนนของ SNPs (FST = 1) จะถูกระบุที่มุมขวาบนของแต่ละกราฟสำหรับความแตกต่างในการเปรียบเทียบแต่ละคู่ มากกว่า 50% ของเปอร์เซ็นต์เป็นสีแดงหรือสีน้ำเงิน (B) จำนวน SNP ที่ทำเครื่องหมายไว้สำหรับแต่ละกลุ่ม ได้แก่ SNP ที่ถูกแก้ไขในกลุ่มเดียวและแตกต่างจากกลุ่มอื่น ๆ ทั้งหมด (C) จำนวน SNP ที่มีความแตกต่างคงที่ระหว่างกลุ่ม กลุ่มที่ยึดติดกับอัลลีลเดียวกันจะแสดงในแผงด้านล่างผ่านจุดเชื่อมต่อที่สอดคล้องกับกลุ่มเฉพาะ เส้นสีเทาและสีดําเชื่อมต่อกลุ่มสถานะเดียวของอัลลีลสลับและอัลลีลอ้างอิงตามลําดับ (

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่ 6 . แยกแยะและแยกSNPsระหว่างและภายในกลุ่ม สําหรับการวิเคราะห์นี้การแยกที่แสดงเป็นส่วนผสมโคลนหรือไฮบริดระหว่างกลุ่มจะถูกลบออก(แสดงด้วย" * "ดูวัสดุและวิธีการ) ขนาดของกลุ่มหลังจากการแยกเหล่านี้จะระบุไว้ในรูปที่aและc ( a )ค่าFSTระหว่างการเปรียบเทียบกลุ่ม คะแนนของSNPsคงที่( FST =1)จะปรากฏที่มุมบนขวาของแต่ละกราฟ เปอร์เซ็นต์มากกว่า50 %จะแสดงเป็นสีแดงมิฉะนั้นจะแสดงเป็นสีน้ําเงิน ( b )จํานวนSNPsที่ติดฉลากในแต่ละกลุ่มนั่นคือSNPsที่แตกต่างกันไปในกลุ่มหนึ่งเมื่อเทียบกับกลุ่มอื่นๆทั้งหมด ( c )จํานวนSNPที่แตกต่างกันระหว่างกลุ่ม กลุ่มที่ถาวรของอัลลีลเดียวกันจะปรากฏในแผงด้านล่างโดยใช้จุดเชื่อมต่อที่สอดคล้องกับกลุ่มเฉพาะ เส้นสีเทาและสีดําเชื่อมต่อกับโมโนเมอร์ของอัลลีลทางเลือกและอ้างอิงตามลําดับ ( d )จํานวนและความหนาแน่นของSNPsที่แยกออกจากแต่ละกลุ่ม เนื่องจากขนาดตัวอย่างที่แตกต่างกันในกลุ่มที่แตกต่างกันตัวอย่างย่อยสุ่มสามตัวอย่างของกลุ่มที่ใหญ่ขึ้นจะปรากฏในภาพ ผลการสุ่มตัวอย่างย่อยจะแสดงเป็นค่าเฉลี่ยและค่าเบี่ยงเบนมาตรฐาน ฉบับออนไลน์ของบทความนี้ประกอบด้วยภาพประกอบต่อไปนี้สําหรับรูปที่6 :ภาพประกอบ1 การแบ่งปันความหลากหลายระหว่างกลุ่ม