Next generation sequencing (NGS) is

Next generation sequencing (NGS) is revolutionizing genomics and is providing novel insights into genome
organization, evolution and function. The number of plant genomes targeted for sequencing is rising. For
the moment, however, the acquisition of full genome sequences in large genome species remains difficult,
largely because the short reads produced by NGS platforms are inadequate to cope with repeat-rich DNA,
which forms a large part of these genomes. The problem of sequence redundancy is compounded in polyploids,
which dominate the plant kingdom. An approach to overcoming some of these difficulties is to reduce the full
nuclear genome to its individual chromosomes using flow-sorting. The DNA acquired in this way has proven
to be suitable for many applications, including PCR-based physical mapping, in situ hybridization, forming
DNA arrays, the development of DNA markers, the construction of BAC libraries and positional cloning. Coupling
chromosome sorting with NGS offers opportunities for the study of genome organization at the single chromosomal
level, for comparative analyses between related species and for the validation of whole genome assemblies.
Apart from the primary aim of reducing the complexity of the template, taking a chromosome-based
approach enables independent teams to work in parallel, each tasked with the analysis of a different chromosome(
s). Given that the number of plant species tractable for chromosome sorting is increasing, the likelihood
is that chromosome genomics – the marriage of cytology and genomics – will make a significant contribution
to the field of plant genetics.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับเบส (NGS) รุ่นต่อไปเป็น revolutionizing genomics และให้ลึกจีโนมนวนิยายองค์กร วิวัฒนาการ และฟังก์ชัน จำนวน genomes พืชเป้าหมายลำดับสูงขึ้น สำหรับขณะนี้ อย่างไรก็ตาม ซื้อลำดับกลุ่มเต็มรูปแบบในกลุ่มขนาดใหญ่ชนิดยังคงยากส่วนใหญ่เนื่องจากอ่านสั้นผลิตโดย แพลตฟอร์ม NGS มีไม่เพียงพอจะรับมือกับดีเอ็นเอซ้ำริชซึ่งรูปแบบส่วนใหญ่ของ genomes เหล่านี้ ปัญหาความซ้ำซ้อนของลำดับจะเพิ่มใน polyploidsซึ่งครองราชอาณาจักรพืช วิธีการบางอย่างของปัญหาเหล่านี้มากเพียงใดจะลดเต็มกลุ่มนิวเคลียร์การ chromosomes ของแต่ละที่ใช้เรียงลำดับขั้นตอน มีพิสูจน์ดีเอ็นเอที่ได้มาด้วยวิธีนี้เพื่อให้เหมาะสำหรับการใช้งานหลาย รวมทั้งผลทางกายภาพการแม็ป ในซิ hybridization ขึ้นรูปดีเอ็นเออาร์เรย์ การพัฒนาเครื่องหมายดีเอ็นเอ การก่อสร้างของไลบรารีบัคและโคลนตำแหน่ง คลัปโครโมโซมเรียงลำดับกับ NGS นำเสนอโอกาสสำหรับการศึกษาของกลุ่มองค์กรที่เดียวของโครโมโซมระดับ การวิเคราะห์เปรียบเทียบระหว่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้อง และตรวจสอบแอสเซมบลีทั้งจีโนมนอกจากจุดมุ่งหมายหลักของการลดความซับซ้อนของแบบ การโครโมโซมโดยใช้วิธีช่วยให้ทีมอิสระในการทำงานพร้อมกัน แต่ละได้รับมอบหมาย ด้วยการวิเคราะห์(โครโมโซมแตกต่างกันs) ระบุว่าจำนวนชนิดพืช tractable การเรียงโครโมโซมเพิ่มขึ้น โอกาสคือ ว่า โครโมโซม genomics –แต่งงานเซลล์วิทยาและ genomics – จะทำให้ส่วนสำคัญเขตข้อมูลของพืชพันธุศาสตร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รุ่นถัดไปของลำดับ ( ภาพหลุด ) ปฏิวัติพันธุกรรมและให้ข้อมูลเชิงลึกใหม่ในองค์กรจีโนม
, วิวัฒนาการและหน้าที่ หมายเลขลำดับจีโนมของพืชเป้าหมายให้สูงขึ้น สำหรับ
ตอนนี้ อย่างไรก็ตาม การเข้าซื้อกิจการของลำดับจีโนมเต็มชนิดจีโนมขนาดใหญ่ยังคงยาก
ส่วนใหญ่เพราะสั้นอ่านผลิตโดยเทคแพลตฟอร์มที่มีไม่เพียงพอที่จะรับมือกับย้ำรวยดีเอ็นเอ
ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งที่มีขนาดใหญ่ของจีโนมเหล่านี้ ปัญหาความซ้ำซ้อนของลำดับ คือ ประกอบใน polyploids
ซึ่งครองพืช , สหราชอาณาจักร วิธีการที่จะเอาชนะบางส่วนของปัญหาเหล่านี้คือการลดจีโนมนิวเคลียร์เต็ม
ให้โครโมโซมของแต่ละการไหลของการเรียงลำดับดีเอ็นเอที่ได้มาในลักษณะนี้ได้พิสูจน์
จะเหมาะสมกับการใช้งานมาก รวมถึงเทคนิคการทำแผนที่ทางกายภาพอยู่ใน situ hybridization รูป
ดีเอ็นเออาร์เรย์ , การพัฒนาเครื่องหมายดีเอ็นเอ , โครงสร้างของห้องสมุด และตำแหน่งการโคลน BAC . Coupling
กร้าวกับเทคเสนอโอกาสในการศึกษาขององค์การจีโนมในระดับโครโมโซม
โสดการวิเคราะห์เปรียบเทียบระหว่างชนิดและการตรวจสอบของการประกอบจีโนมทั้งหมด
นอกเหนือจากจุดประสงค์หลักของการลดความซับซ้อนของการใช้แม่แบบและวิธีการช่วยให้ทีมงานอิสระ
ทำงานในขนาน แต่ละ tasked กับการวิเคราะห์โครโมโซมที่แตกต่างกัน (
s )ระบุว่าจำนวนของชนิดพืชดัดแปลงได้ง่ายสำหรับกร้าวมากขึ้น โอกาสที่ยีนและโครโมโซม
การแต่งงานของไต้ก๋งและลักษณะทางพันธุกรรมที่คาดว่าจะให้การสนับสนุน
สําคัญด้านพันธุศาสตร์พืช