Identification of F. culmorum revea

Identification of F. culmorum revealed that out of four primer sets
only two, Fc01F/Fc01R (Nicholson et al., 1998) and OPT18F470/
OPT18R470 (Schilling et al., 1996) are species specific. Both sets are
commonly used to determine F. culmorum in plant tissue as well as for
pure fungal isolates. The primer set designed by Nicholson et al.
(1998) enabled their authors to confirm the species affiliation of all
strains previously identified by them using traditional method as
F. culmorum. This set also proved to be reliable for identification of the
Polish strains tested in this work. Using these primers, Quarta et al.
(2005) confirmed classification of 55 isolates originated from
different plants and European countries to the species F. culmorum,
as did Demeke et al. (2005) in 12 isolates from Canada. Waalwijk et al.
(2003) used the same primers for the identification of F. culmorum
strains, confirming previous morphological evaluation. Fc01F/Fc01R
were also used successfully by Akinsanmi et al. (2004), Brennan et al.
(2007), Jennings et al. (2004), Stępień et al. (2008) and Zezza et al.
(2006). The test with primers OPT18F470/OPT18R470 (Schilling et al.,
1996) did not fully confirm the results of F. culmorum identification
with Fc01F/Fc01R and with using traditional microscopic methods
based on morphology. An analogous result was obtained by the
primers authors, who confirmed identification of 65 out of 69 isolates
of F. culmorum, although Southern hybridization analysis showed that possible to detect changes in the genome, such as genomic alterations
in the primer annealing sites, of the strains that gave no product with
SCAR primers. This may explain the results presented here and
indicates that these isolates may represent a small percentage of the
population of F. culmorum — in our study it was 6%. Their presence
indicates, however, that the identification of this species with
OPT18F470/OPT18R470 can sometimes give false negative results. In
general, these primers allow for full identification of the species, e.g.
morphological identification of a hundred F. culmorum isolates from
Tunisia was confirmed using this primer set (Kammoun et al., 2010).
Bakan et al. (2001) obtained a positive result for all 60 French isolates
and Toth et al. (2004) — for 37 European and American isolates. These
primers were also effective in tests conducted by Brandfass and
Karlovsky (2006), Klemsdal and Elen (2006), Nedělník et al. (2007)
and Tomczak et al. (2002). As in our studies, Kulik et al. (2005) did not
receive a product in reaction with OPT18F470/OPT18R470 in the case of
an isolate that was determined as F. culmorum with Fc01F/Fc01R.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รหัสของ F. culmorum เปิดเผยว่า จากพื้น 4 ชุดFc01F สอง Fc01R (Nicholson et al., 1998) และ OPT18F470 /OPT18R470 (Schilling et al., 1996) เป็นสปีชีส์เฉพาะ ทั้งสองชุดโดยทั่วไปใช้ในการกำหนด culmorum F. ในเนื้อเยื่อพืชด้วยเป็นการบริสุทธิ์เชื้อราที่แยกได้ ชุดรองพื้นออกแบบโดย Nicholson et al(1998) ผู้เขียนของพวกเขาเพื่อยืนยันการเข้าสังกัดของสปีชีส์ทั้งหมดที่เปิดใช้งานสายพันธุ์ที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้ โดยพวกเขาใช้วิธีแบบดั้งเดิมเป็นF. culmorum นี้ตั้งยัง proved จะเชื่อถือได้สำหรับรหัสของการทดสอบสายพันธุ์โปแลนด์ในงานนี้ ใช้ไพรเมอร์เหล่านี้ Quarta et al(2005) ได้รับการยืนยันการจัดประเภท 55 แยกมาจากต้นไม้และชนิด F. culmorum ประเทศยุโรปเป็นไม่ Demeke et al. (2005) ใน 12 ที่แยกได้จากประเทศแคนาดา Waalwijk et al(2003) ใช้ไพรเมอร์เดียวกันสำหรับรหัสของ F. culmorumสายพันธุ์ ยืนยันการประเมินของก่อนหน้านี้ Fc01F/Fc01Rนอกจากนี้ยังใช้สำเร็จโดย Akinsanmi et al. (2004), เบรนแนน et al(2007), Jennings และ al. (2004), Stępień และ al. (2008) และ Zezza et al(2006) ทดสอบกับไพรเมอร์ OPT18F470/OPT18R470 (Schilling et al.,1996) ได้ไม่เต็มยืนยันผลลัพธ์ของรหัส F. culmorumFc01F/Fc01R และใช้วิธีดั้งเดิมด้วยกล้องจุลทรรศน์ตามสัณฐานวิทยา ผลคู่ได้รับโดยการไพรเมอร์ผู้ ยืนยันรหัสแยก 65 จากทั้งหมด 69ของ F. culmorum แม้ว่า hybridization ภาคใต้วิเคราะห์พบว่าสามารถตรวจพบการเปลี่ยนแปลงในจีโนม เช่นเปลี่ยนแปลง genomicในพื้นที่เว็บไซต์ ของสายพันธุ์ที่ให้ผลิตภัณฑ์ไม่มีการอบเหนียวไพรเมอร์รอยแผลเป็น นี้อาจอธิบายผลลัพธ์ที่แสดงที่นี่ และบ่งชี้ว่า แยกเหล่านี้อาจแสดงเล็กเปอร์เซ็นต์ของการประชากรของ F. culmorum ซึ่งในการศึกษาของเรา มันเป็น 6% พวกหมายถึง อย่างไร ตามรหัสของชนิดนี้ด้วยOPT18F470/OPT18R470 บางครั้งผลลบปลอม ในทั่วไป ไพรเมอร์เหล่านี้อนุญาตให้สำหรับรหัสเต็มชนิด เช่นรหัสสัณฐานของร้อย F. culmorum ที่แยกได้จากตูนีเซียถูกยืนยันโดยใช้รองพื้นนี้ตั้ง (Kammoun et al., 2010)Bakan et al. (2001) ได้ผลเป็นบวกทั้งหมด 60 ฝรั่งเศสแยกToth et al. (2004) และ — ใน 37 ยุโรป และสหรัฐอเมริกาแยก เหล่านี้ไพรเมอร์ได้ยังมีประสิทธิภาพในการทดสอบที่ดำเนินการ โดย Brandfass และKarlovsky (2006), Klemsdal และ Elen (2006), Nedělník et al. (2007)และ Tomczak et al. (2002) ในการศึกษาของเรา al. et Kulik (2005) ได้ไม่ได้รับผลิตภัณฑ์ในปฏิกิริยากับ OPT18F470/OPT18R470 ในกรณีของตัวแยกที่กำหนดเป็น F. culmorum กับ Fc01F/Fc01R

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัตรประจำตัวของ culmorum เอฟเปิดเผยว่าจากสี่ชุดไพรเมอร์
เพียงสอง Fc01F / Fc01R (นิโคลสัน et al., 1998) และ OPT18F470 /
OPT18R470 (ชิลลิง et al., 1996) เป็นสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจง ทั้งสองชุดมีการ
ใช้กันทั่วไปในการกำหนด F. culmorum ในเนื้อเยื่อพืชเช่นเดียวกับ
สายพันธุ์ของเชื้อราบริสุทธิ์ ชุดไพรเมอร์ที่ออกแบบโดยนิโคลสัน et al.
(1998) ที่เปิดใช้งานเขียนของพวกเขาเพื่อยืนยันความร่วมมือของทุกสายพันธุ์
สายพันธุ์ที่ระบุก่อนหน้านี้โดยพวกเขาใช้วิธีการแบบดั้งเดิมเช่น
เอฟ culmorum ชุดนี้ยังมีการพิสูจน์แล้วว่ามีความน่าเชื่อถือในการจำแนก
สายพันธุ์โปแลนด์ทดสอบในงานนี้ การใช้ไพรเมอร์เหล่านี้พุธ et al.
(2005) ได้รับการยืนยันการจำแนกประเภทของ 55 สายพันธุ์มาจาก
พืชที่แตกต่างกันและประเทศในยุโรปสายพันธุ์เอฟ culmorum,
เช่นเดียวกับ Demeke และคณะ (2005) ใน 12 สายพันธุ์จากประเทศแคนาดา วาลไวก์ et al.
(2003) ที่ใช้ไพรเมอร์เช่นเดียวกันสำหรับบัตรประจำตัวของเอฟ culmorum
สายพันธุ์ยืนยันการประเมินลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่ก่อนหน้านี้ Fc01F / Fc01R
ยังถูกนำมาใช้ประสบความสำเร็จโดย Akinsanmi และคณะ (2004), เบรนแนน et al.
(2007), เจนนิงส์และคณะ (2004), Stępieńและคณะ (2008) และ Zezza et al.
(2006) การทดสอบกับไพร OPT18F470 / OPT18R470 (ชิลลิง et al.,
1996) ไม่ได้อย่างเต็มที่ยืนยันผลการตรวจพิสูจน์ F. culmorum
กับ Fc01F / Fc01R และมีการใช้วิธีการแบบดั้งเดิมกล้องจุลทรรศน์
ขึ้นอยู่กับลักษณะทางสัณฐานวิทยา ผลคล้ายที่ได้รับโดย
ผู้เขียนไพรเมอร์ที่ได้รับการยืนยันบัตรประจำตัวของ 65 จาก 69 สายพันธุ์
ของเอฟ culmorum แม้ว่าการวิเคราะห์โดย Southern hybridization แสดงให้เห็นว่าเป็นไปได้ที่จะตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในจีโนมเช่นการเปลี่ยนแปลงจีโนม
ในเว็บไซต์หลอมไพรเมอร์ของ สายพันธุ์ที่ทำให้ไม่มีสินค้าที่มี
ไพร SCAR นี้อาจอธิบายผลที่นำเสนอนี้และ
แสดงให้เห็นว่าเชื้อเหล่านี้อาจจะเป็นกี่เปอร์เซ็นต์ของ
ประชากร F. culmorum - ในการศึกษาของเรามันเป็น 6% สถานะของพวกเขา
แสดงให้เห็น แต่ที่บัตรประจำตัวของสปีชีส์นี้กับ
OPT18F470 / OPT18R470 บางครั้งอาจให้ผลลบเท็จ ใน
ทั่วไปไพรเหล่านี้ช่วยให้สำหรับประชาชนเต็มรูปแบบของสายพันธุ์เช่น
การระบุลักษณะทางสัณฐานวิทยาของร้อย F. culmorum แยกจาก
ตูนิเซียได้รับการยืนยันการใช้ชุดไพรเมอร์นี้ (Kammoun et al., 2010).
Bakan และคณะ (2001) ที่ได้รับผลบวกทั้งหมด 60 สายพันธุ์ฝรั่งเศส
และ Toth และคณะ (2004) - 37 สายพันธุ์ยุโรปและอเมริกา เหล่านี้
เป็นไพรเมอร์ยังมีประสิทธิภาพในการทดสอบที่ดำเนินการโดย Brandfass และ
Karlovsky (2006), และ Klemsdal Elen (2006), Nedělníkและคณะ (2007)
และ Tomczak และคณะ (2002) ในขณะที่การศึกษาของเรา Kulik และคณะ (2005) ไม่ได้
รับสินค้าในการทำปฏิกิริยากับ OPT18F470 / OPT18R470 ในกรณีของการ
แยกที่ถูกกำหนดเป็นเอฟ culmorum กับ Fc01F / Fc01R

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตัว F . culmorum เปิดเผยว่าจากสี่สีชุด
เพียงสอง fc01f / fc01r ( นิโคลสัน et al . , 1998 ) และ opt18f470 /
opt18r470 ( ชิลลิ่ง et al . , 1996 ) เป็นชนิดที่เฉพาะเจาะจง ทั้งชุดปกติที่ใช้ในการตรวจสอบ F .
culmorum เนื้อเยื่อพืชเช่นเดียวกับ
บริสุทธิ์เชื้อราเชื้อ ไพรเมอร์ชุดออกแบบโดยนิโคลสัน et al .
( 1998 ) ทำให้ผู้เขียนเพื่อยืนยันชนิดของทุกสังกัด
สายพันธุ์ระบุก่อนหน้านี้ โดยเขาใช้วิธีแบบดั้งเดิมเป็น
F . culmorum . ชุดนี้ยังพิสูจน์ให้เป็นที่เชื่อถือได้สำหรับการระบุของ
โปแลนด์สายพันธุ์ทดสอบในงานนี้ ใช้ไพรเมอร์เหล่านี้ quarta et al .
( 2005 ) ยืนยันการจำแนกสายพันธุ์มาจาก
55พืชต่าง ๆ และประเทศในยุโรปเพื่อชนิด F . culmorum
, เช่นเดียวกับ demeke et al . ( 2005 ) ใน 12 ไอโซเลตจากแคนาดา Waalwijk et al .
( 2003 ) ใช้วิธีเดียวกันเพื่อระบุตัวตนของ F . culmorum
สายพันธุ์ ยืนยันก่อนหน้านี้เกี่ยวกับการประเมินผล fc01f / fc01r
ถูกใช้เรียบร้อยแล้ว โดย akinsanmi et al . ( 2004 ) , เบรน et al .
( 2007 ) , เจนนิงส์ et al . ( 2004 ) , เซนต์ęพายń et al .( 2008 ) และ zezza et al .
( 2006 ) การทดสอบด้วยวิธี opt18f470 / opt18r470 ( ชิลลิ่ง et al . ,
1996 ) ยังไม่ยืนยันผลของเอฟ culmorum ประจำตัว
กับ fc01f / fc01r อย่างเต็มที่และมีการใช้วิธีการแบบดั้งเดิมตามสัณฐานด้วย
. ผลที่คล้ายกันได้รับโดย
ไพรเมอร์ผู้เขียนผู้ยืนยันตัว 65 จาก 69 ไอโซเลทของ culmorum
F ,แม้ว่าการวิเคราะห์ ( ภาคใต้ พบว่า สามารถตรวจจับการเปลี่ยนแปลงพันธุกรรม เช่น
ดัดแปลงจีโนมในไพรเมอร์ขนาดเว็บไซต์ของสายพันธุ์ที่ให้ผลิตภัณฑ์ด้วย
รอยแผลเป็นรองพื้น นี้อาจอธิบายผลลัพธ์ที่นำเสนอที่นี่และ
แสดงว่าจำนวนอาจหมายถึงเปอร์เซ็นต์ขนาดเล็กของประชากรของ F -
culmorum ในการศึกษาของเราอยู่ที่ 6% การแสดงตนของพวกเขา
บ่งชี้ , อย่างไรก็ตาม , ที่ระบุสายพันธุ์นี้ด้วย
opt18f470 / opt18r470 บางครั้งสามารถให้ผลเชิงลบเท็จ ใน
ทั่วไป , ไพรเมอร์เหล่านี้อนุญาตให้สำหรับการเต็มรูปแบบของพืช เช่น ลักษณะการร้อย F .

culmorum แยกจากตูนิเซียได้รับการยืนยันการใช้ไพรเมอร์ชุดนี้ ( kammoun et al . , 2010 ) .
รัฐมนตรี et al .( 2001 ) ได้ผลลัพธ์ที่เป็นบวกสำหรับภาษาฝรั่งเศสทั้งหมด 60 ไอโซเลทและ
ทอธ et al . ( 2004 ) - 37 ยุโรปและอเมริกาของเชื้อ ไพรเมอร์เหล่านี้
ยังมีประสิทธิภาพในการทดสอบโดย brandfass และ
karlovsky ( 2006 ) , และ klemsdal elen ( 2006 ) , เน็ดěในí k et al . ( 2007 ) และ
tomczak et al . ( 2002 ) ในการศึกษาของเรา คูลิค et al . ( 2005 ) ไม่ได้
รับผลิตภัณฑ์ในปฏิกิริยากับ opt18f470 / opt18r470 ในกรณีของการแยกที่ถูกกำหนดเป็น
F . culmorum กับ fc01f / fc01r .