Metabolomics provides the quantitat

Metabolomics provides the quantitative measurement of the dynamic multiparametric metabolic response of living systems to pathophysiological stimuli or genetic modification. Over the last decades, metabolic profiling has been increasingly applied to classify diseases and diagnose onset of disease (Goodacre et al., 2004). Using metabolomic approaches, Kashyap et al investigated how host mucus glycan composition interacted with dietary carbohydrate content to influence the composition and expressed functions of a human gut microbiome (Kashyap et al., 2013). Antunes et al studied the changes elicited bySalmonella in the chemical composition of bile through a metabolomics approach and revealed that phospholipids are important nutrient sources during Salmonella growth in vitro and in vivo ( Antunes et al., 2011). Fast and sensitive techniques, led by a variety of mass spectrometry platforms, have been developed and implemented to detect and characterize microbial pathogens based on microbial metabolite analysis ( Kaluzna-Czaplinska, 2011). Gilreel et al recently examined the metabolic potential of multi-drug resistant uropathogenic Escherichia coli and demonstrate metabolic activity of members of the ST131 lineage correlated with antibiotic susceptibility profiles ( Gibreel et al., 2012). Robroeks et al studied metabolomics of volatile organic compounds (VOCs) in cystic fibrosis patients and controls and revealed that metabolomics of VOCs in exhaled breath was reproducible and was able to discriminate not only between patients and controls but also between patients with or without Pseudomonas colonization (Robroeks et al., 2010). VOCs such as nicotinic acid have been found to be promising biomarkers forMycobacterium tuberculosis infections ( Syhre et al., 2009).
The availability of sophisticated and increasingly inexpensive nucleic acid sequencing techniques has revolutionized the fields of genomics resulting in unprecedented advances in medical microbiology. Use of non-genomic technologies such as transcriptomics, proteomics and metabolomics allows full inventories to be made of bacterial genes, their time- and place-dependent expression and the resulting proteins as well as their outcome metabolites, thus further substantiating and broadening the medical microbiology armamentarium. What seems certain is that the advanced techniques will increasingly change and enhance the research and practice of medical microbiology.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Metabolomics แสดงการประเมินเชิงปริมาณของไดนามิก multiparametric เผาผลาญผลตอบรับของระบบชีวิต pathophysiological สิ่งเร้าหรือการปรับเปลี่ยนทางพันธุกรรม ทศวรรษ สร้างโพรไฟล์เผาผลาญมากขึ้นใช้กับจำแนกโรค และวินิจฉัยการเริ่มมีอาการของโรค (Goodacre et al., 2004) ใช้วิธี metabolomic, Kashyap et al ตรวจสอบว่าโฮสต์มูก glycan องค์ประกอบอาจ มีเนื้อหาอาหารคาร์โบไฮเดรตจะมีผลต่อองค์ประกอบ และแสดงฟังก์ชันของ microbiome ลำไส้มนุษย์ (Kashyap et al., 2013) Antunes et al bySalmonella elicited เปลี่ยนแปลงในองค์ประกอบทางเคมีของน้ำดีโดยวิธี metabolomics ศึกษา และเปิดเผยว่า phospholipids สำคัญธาตุอาหารเป็นแหล่งที่ระหว่างระดับการเจริญเติบโตในหลอดทดลอง และในสัตว์ทดลอง (Antunes et al., 2011) เทคนิคสำคัญ และรวดเร็ว โดยความหลากหลายของแพลตฟอร์มรเมท มีการพัฒนา และดำเนิน การตรวจสอบลักษณะของจุลินทรีย์โรคตาม metabolite จุลินทรีย์วิเคราะห์ (Kaluzna-Czaplinska, 2011) Gilreel et al เพิ่งตรวจสอบศักยภาพการเผาผลาญของยาหลายทน uropathogenic Escherichia coli และสาธิตกิจกรรมการเผาผลาญของสมาชิกของคนเชื้อสาย ST131 correlated กับโพรไฟล์ภูมิไวรับยาปฏิชีวนะ (Gibreel et al., 2012) Robroeks et al ศึกษา metabolomics ระเหยสารอินทรีย์ (VOCs) ในผู้ป่วยโบรซิสและควบคุม และเปิดเผยว่า metabolomics ของ VOCs ในลมหายใจ exhaled ถูกจำลอง และสามารถเหยียดไม่เพียง ระหว่างผู้ป่วยและควบคุม แต่ยัง ระหว่างผู้ป่วยที่มี หรือไม่ มีสนามลี (Robroeks et al., 2010) พบ VOCs เช่นกรด nicotinic จะสัญญา biomarkers forMycobacterium ติดเชื้อวัณโรค (Syhre et al., 2009)The availability of sophisticated and increasingly inexpensive nucleic acid sequencing techniques has revolutionized the fields of genomics resulting in unprecedented advances in medical microbiology. Use of non-genomic technologies such as transcriptomics, proteomics and metabolomics allows full inventories to be made of bacterial genes, their time- and place-dependent expression and the resulting proteins as well as their outcome metabolites, thus further substantiating and broadening the medical microbiology armamentarium. What seems certain is that the advanced techniques will increasingly change and enhance the research and practice of medical microbiology.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

metabolomics ให้การวัดเชิงปริมาณของการตอบสนองต่อการเผาผลาญแบบไดนามิก multiparametric ของระบบที่อยู่อาศัยสิ่งเร้า pathophysiological หรือการดัดแปลงพันธุกรรม กว่าทศวรรษที่ผ่านมาโปรไฟล์การเผาผลาญอาหารได้ถูกนำมาใช้มากขึ้นในการจำแนกโรคและการวินิจฉัยอาการของโรค (Goodacre et al., 2004) ใช้วิธีการ metabolomic, Kashyap และคณะตรวจสอบว่าเมือกโฮสต์องค์ประกอบไกลแคนมีความสัมพันธ์กับปริมาณคาร์โบไฮเดรตในอาหารที่มีอิทธิพลต่อองค์ประกอบและแสดงการทำงานของลำไส้ของมนุษย์ microbiome (Kashyap et al., 2013) ตูนและคณะศึกษาการเปลี่ยนแปลงที่เกิด bySalmonella ในองค์ประกอบทางเคมีของน้ำดีผ่านวิธีการ metabolomics และเปิดเผยว่าฟอสโฟเป็นแหล่งสารอาหารที่สำคัญในช่วงการเจริญเติบโตของเชื้อ Salmonella ในหลอดทดลองและในร่างกาย (ตูนส์ et al., 2011) เทคนิคอย่างรวดเร็วและที่สำคัญนำโดยความหลากหลายของแพลตฟอร์มมวลสารได้รับการพัฒนาและดำเนินการตรวจสอบและลักษณะเชื้อโรคจุลินทรีย์ที่ใช้ในการวิเคราะห์ metabolite ของจุลินทรีย์ (Kaluzna-Czaplinska 2011) Gilreel และคณะเมื่อเร็ว ๆ นี้การตรวจสอบที่มีศักยภาพของการเผาผลาญอาหารที่ดื้อยาหลายชนิด uropathogenic Escherichia coli และแสดงให้เห็นถึงกิจกรรมการเผาผลาญของสมาชิกของเชื้อสาย ST131 มีความสัมพันธ์กับความไวต่อยาปฏิชีวนะโปรไฟล์ (Gibreel et al., 2012) Robroeks และคณะศึกษา metabolomics สารอินทรีย์ระเหยง่าย (VOCs) ในผู้ป่วยโรคปอดเรื้อรังและการควบคุมและเปิดเผยว่า metabolomics ของสารอินทรีย์ระเหยในลมหายใจหายใจออกก็สามารถทำซ้ำและก็สามารถที่จะเห็นความแตกต่างไม่เพียง แต่ระหว่างผู้ป่วยและการควบคุม แต่ยังระหว่างผู้ป่วยที่มีหรือไม่มีการล่าอาณานิคม Pseudomonas ( Robroeks et al., 2010) VOCs เช่นกรด nicotinic ได้รับพบว่ามีแนวโน้มที่ biomarkers forMycobacterium การติดเชื้อวัณโรค (Syhre et al., 2009).
ความพร้อมของความซับซ้อนและมีราคาไม่แพงมากขึ้นเทคนิคการหาลำดับนิวคลีอิกกรดมีการปฏิวัติด้านของฟังก์ชั่นที่เกิดขึ้นในความก้าวหน้าเป็นประวัติการณ์ในจุลชีววิทยาทางการแพทย์ การใช้เทคโนโลยีที่ไม่จีโนมเช่น transcriptomics, โปรตีนและ metabolomics ช่วยให้สินค้าคงเหลือเต็มรูปแบบที่จะทำของยีนของแบคทีเรียเวลาและสถานที่การแสดงออกขึ้นอยู่กับพวกเขาและโปรตีนที่เกิดขึ้นเช่นเดียวกับผลที่ได้รับสารจึงต่อ substantiating และขยายจุลชีววิทยาทางการแพทย์ Armamentarium สิ่งที่ดูเหมือนว่าบางอย่างที่เทคนิคขั้นสูงมากขึ้นจะเปลี่ยนและเพิ่มการวิจัยและการปฏิบัติของจุลชีววิทยาทางการแพทย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เมตะโบโลมิกมีการวัดเชิงปริมาณแบบไดนามิก multiparametric การเผาผลาญการตอบสนองของระบบชีวิตกระตุ้นพยาธิสรีรวิทยาหรือการดัดแปลงทางพันธุกรรม กว่าทศวรรษที่ผ่านมา มีการใช้มากขึ้นเพื่อสลายการวินิจฉัยแยกโรคและอาการของโรค ( กู๊ดาเคอร์ et al . , 2004 ) metabolomic โดยใช้วิธี ,ตรวจสอบว่าโฮสต์ Kashyap et al , น้ำมูกไกลแคนองค์ประกอบมากกว่าปริมาณคาร์โบไฮเดรตอาหารจะมีผลต่อองค์ประกอบและแสดงฟังก์ชันของไมโครไบโไส้มนุษย์ ( Kashyap et al . , 2013 )แอนทูเนส et al ได้ศึกษาการเปลี่ยนแปลงโดยใช้ bysalmonella ในองค์ประกอบทางเคมีของน้ำดีผ่านวิธีการเมตะโบโลมิก และพบว่า กลุ่มเป้าหมายเป็นสำคัญ แหล่งสารอาหารในระหว่างการเจริญเติบโตเชื้อซัลโมเนลลาในหลอดทดลองและในสัตว์ทดลอง ( แอนทูเนส et al . , 2011 ) เทคนิคที่รวดเร็วและไว นำโดยความหลากหลายของแพลตฟอร์ม spectrometry มวลได้ถูกพัฒนาและดำเนินการตรวจสอบและวิเคราะห์จุลินทรีย์เชื้อโรคจากการวิเคราะห์ต้นตอของจุลินทรีย์ ( kaluzna czaplinska , 2011 ) gilreel et al เพิ่งตรวจสอบศักยภาพการเผาผลาญของหลายดื้อยา uropathogenic Escherichia coli และสาธิตกิจกรรมการสลายของสมาชิกของ st131 วงศ์ตระกูล มีความสัมพันธ์กับสภาพกลุ่มยาปฏิชีวนะ ( gibreel et al . ,2012 ) robroeks et al ) เมตะโบโลมิกสารระเหยอินทรีย์ในประเทศเมียนมาร์ ผู้ป่วยและการควบคุมและเปิดเผยว่า เมตะโบโลมิกของสารอินทรีย์ระเหยง่ายในหายใจออกลมหายใจอยู่ ) และก็สามารถที่จะเลือกปฏิบัติไม่เพียง แต่ระหว่างผู้ป่วยและการควบคุม แต่ยังระหว่างผู้ป่วยที่มีหรือไม่มีของการล่าอาณานิคม ( robroeks et al . , 2010 )สารอินทรีย์ระเหยง่าย เช่น กรดนิโคตินิก ถูกพบว่าเป็นแนวโน้มใหม่ formycobacterium เชื้อวัณโรค ( syhre et al . , 2009 ) .
ความพร้อมทันสมัยและราคาไม่แพงมากขึ้นเทคนิคกรดนิวคลีอิกลำดับมีการปฏิวัติด้านพันธุกรรมส่งผลให้มีความก้าวหน้าในสาขาจุลชีววิทยาทางการแพทย์ การใช้เทคโนโลยี เช่น ทราน ริปโตมิกไม่พบ ,และช่วยให้เต็มขีดความสามารถเมตะโบโลมิกสินค้าคงเหลือที่ถูกสร้างจากยีนของพวกเขา เวลา และสถานที่ที่เกิดขึ้นกับการแสดงออกและโปรตีน รวมทั้งสารผลของพวกเขา ดังนั้น substantiating ขยายเพิ่มเติมและ armamentarium จุลชีววิทยาทางการแพทย์สิ่งที่ดูเหมือนบางอย่างที่เทคนิคขั้นสูงมากขึ้นจะเปลี่ยนและเพิ่มการวิจัยและปฏิบัติการจุลชีววิทยาทางการแพทย์