molecular methods is necessary to a

molecular methods is necessary to assess the strain heterogeneity
within this fish pathogen. In the current study, analysis of
fish S. dysgalactiae isolates by using restriction endonuclease
of SmaI and partial sequencing tuf revealed new insight into
the identification and epidemiology of S. dysgalactiae.
Several studies have been performed on the molecular
identification of the genus Streptococcus by using the
sequencing method targeting some housekeeping genes
[5,7,8,11,20,23,31,32]. The elongation factor (tuf) gene is concerned
in protein biosynthesis that facilitates the elongation of
polypeptides from the ribosome and aminoacyl-tRNA throughout
translation. It is universally distributed and in most
Gram-positive bacteria just one tuf gene has been found. The
tuf sequences of streptococci usually provide additional discrimination
power than 16S rDNA sequences and may enable
identification at the species level of even most closely related
streptococcal species; therefore it is ideally fitted to phylogenetic
studies [22,33,34]. The sequencing of the tuf gene was performed
to match different isolates collected from geographically distinct
areas. A 100% sequence identity was determined among
S. dysgalactiae isolates irrespective of their country of origin,
aside from three isolates. Thus, the phylogenetic analysis
demonstrated that fish S. dysgalactiae isolates belonged to one
cluster and distinct from other Streptococcus species.
Interestingly, S. dysgalactiae of fish origin appeared to be
more related to S. pyogenes rather than S. dysgalactiae subsp.
equisimilis. Therefore, these results suggested that tuf gene
analysis could be a valid tool for identifying S. dysgalactiae
subsp. dysgalactiae to the subspecies level. Our results
suggested that tuf gene analysis also could be a valid tool for
inferring relationships among closely related bacterial species.
However, the lack of tuf sequence variations in S. dysgalactiae
isolates collected from moribund fishes showed its inadequacy
for any intraspecific relationship analysis (e.g., as a typing tool
at the strain level).
On the other hand, PFGE is considered to be superior for
interpreting inter-strain relationships among enterococci [35].
The most common method used for typing streptococci consists
of the restriction of genomic DNA with SmaI endonuclease,
followed by PFGE analysis [11,36]. In previous studies,
the SmaI analysis was performed for the genotypic comparison
characterization between Japanese fish and mammalian isolates
of S. dysgalactiae [19], and genetic characterization of
S. dysgalactiae recovered from Nile tilapia in Brazil [11]. In
this study, all fish S. dysgalactiae isolates were belonged to
the major types-classified based on the macrorestriction patterns
obtained by digestion with Sma. We were particularly
interested to determine whether there were localized geographical
strains clustering or whether S. dysgalactiae was clonally
related on a multinational level. All Japanese isolates were
indistinguishable and presented type A. The results obtained
in this study supported those obtained in previous publication
by Nomoto et al. [19] and Nishiki et al. [20] who demonstrated
that the Japanese isolates of S. dysgalactiae were clonally related
to each other. All Taiwanese isolates (except 95985) were
indistinguishable and presented type B and apparently differed
from other isolates, including the Japanese, Indonesian, and
Malaysian isolates. Thus, we can conclude that S. dysgalactiae
isolates collected from different countries are localized geographically
and differed on a multinational level. Our results
contradict our previous assumptions [8] in which the fingerprint
variations obtained by digestion with ApaI of S. dysgalactiae

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิธีโมเลกุลเป็นสิ่งที่จำเป็นในการประเมินความหลากหลายสายพันธุ์
ปลาภายในเชื้อโรคนี้ ในการศึกษาในปัจจุบันการวิเคราะห์ของ
ปลา S. dysgalactiae แยกโดยใช้ endonuclease ข้อ จำกัด
ของเบสและ TUF ลำดับบางส่วนเปิดเผยความเข้าใจใหม่ใน
การระบุและระบาดวิทยาของเอส dysgalactiae.
การศึกษาจำนวนมากได้รับการดำเนินการในระดับโมเลกุล
บัตรประจำตัวของสกุล Streptococcus โดยใช้
วิธีการกำหนดเป้าหมายลำดับยีนแม่บ้านทำความสะอาดบาง
[5,7,8,11,20,23,31,32] ปัจจัยการยืดตัว (TUF) ยีนที่เกี่ยวข้อง
ในการสังเคราะห์โปรตีนที่อำนวยความสะดวกในการยืดตัวของ
polypeptides จากไรโบโซมและ aminoacyl-tRNA ตลอด
การแปล มันมีการกระจายอย่างกว้างขวางและในที่สุด
เชื้อแบคทีเรียแกรมบวกเพียงหนึ่งยีน TUF มีการค้นพบ
ลำดับ TUF ของเชื้อมักจะให้การเลือกปฏิบัติเพิ่มเติม
อำนาจกว่าลำดับ 16S rDNA และอาจช่วยให้
การระบุในระดับชนิดแม้ที่สุดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
สายพันธุ์เชื้อ; จึงจะสามารถติดตั้งอย่างยิ่งสำหรับการวิวัฒนาการ
การศึกษา [22,33,34] ลำดับของยีน TUF ได้รับการดำเนินการ
เพื่อให้ตรงกับสายพันธุ์ที่แตกต่างกันที่เก็บได้จากความแตกต่างทางภูมิศาสตร์
พื้นที่ ลำดับบัตร 100% ถูกกำหนดในหมู่
เอส dysgalactiae แยกโดยไม่คำนึงถึงประเทศต้นกำเนิด,
นอกเหนือจากสามสายพันธุ์ ดังนั้น phylogenetic วิเคราะห์
แสดงให้เห็นว่าปลา S. dysgalactiae แยกเป็นหนึ่ง
คลัสเตอร์และแตกต่างจากคนอื่น ๆ สายพันธุ์ Streptococcus.
ที่น่าสนใจเอ dysgalactiae ต้นกำเนิดของปลาที่ดูเหมือนจะ
เกี่ยวข้องกับ S. pyogenes มากกว่า S. dysgalactiae subsp.
equisimilis ดังนั้นผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่ายีน TUF
วิเคราะห์อาจจะเป็นเครื่องมือที่ถูกต้องสำหรับการระบุ S. dysgalactiae
subsp dysgalactiae การย่อยระดับ ผลของเรา
ชี้ให้เห็นว่าการวิเคราะห์ยีน TUF ยังสามารถเป็นเครื่องมือที่ถูกต้องสำหรับ
การอนุมานความสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดแบคทีเรีย.
แต่ขาดของการเปลี่ยนแปลงลำดับทียูเอฟเอ dysgalactiae
แยกเก็บรวบรวมจากปลาตายได้แสดงให้เห็นความไม่เพียงพอของ
สำหรับการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของสำนวนใด ๆ (เช่น เป็นเครื่องมือในการพิมพ์
ที่ระดับความเครียด).
ในทางตรงกันข้าม, PFGE จะถือเป็นที่เหนือกว่าสำหรับ
การตีความความสัมพันธ์ระหว่างความเครียดในหมู่ enterococci [35].
วิธีการที่พบมากที่สุดที่ใช้สำหรับการพิมพ์ streptococci ประกอบด้วย
ข้อ จำกัด ของดีเอ็นเอที่มีเบส endonuclease,
ตามด้วยการวิเคราะห์ PFGE [11,36] ในการศึกษาก่อนหน้านี้
การวิเคราะห์เบสได้รับการดำเนินการสำหรับการเปรียบเทียบทางพันธุกรรม
ลักษณะระหว่างญี่ปุ่นและปลาสายพันธุ์เลี้ยงลูกด้วยนม
ของเอส dysgalactiae [19], และลักษณะทางพันธุกรรมของ
เอส dysgalactiae หายจากปลานิลในบราซิล [11] ใน
การศึกษาครั้งนี้ปลาเอสไอโซเลท dysgalactiae ทุกคนเป็น
ประเภทจัดที่สำคัญขึ้นอยู่กับรูปแบบการ macrorestriction
ที่ได้จากการย่อยด้วย Sma โดยเฉพาะอย่างยิ่งเรามีความ
สนใจที่จะตรวจสอบว่ามีการแปลเป็นภาษาท้องถิ่นทางภูมิศาสตร์
การจัดกลุ่มสายพันธุ์หรือไม่ว่าจะเป็นเอส dysgalactiae ถูก clonally
ที่เกี่ยวข้องในระดับข้ามชาติ ทุกสายพันธุ์ญี่ปุ่น
ชนิดแยกไม่ออกและนำเสนอ A. ผลที่ได้รับ
ในการศึกษานี้สนับสนุนผู้ที่ได้รับการตีพิมพ์ในก่อนหน้านี้
โดย Nomoto และคณะ [19] และนิชิกิและคณะ [20] ที่แสดงให้เห็น
ว่าสายพันธุ์ญี่ปุ่นของเอส dysgalactiae เป็น clonally ที่เกี่ยวข้อง
กับแต่ละอื่น ๆ ทุกสายพันธุ์ไต้หวัน (ยกเว้น 95985) เป็น
ชนิด B แยกไม่ออกและนำเสนอความแตกต่างที่เห็นได้ชัดและ
จากสายพันธุ์อื่น ๆ รวมทั้งญี่ปุ่น, อินโดนีเซีย, และ
สายพันธุ์มาเลเซีย ดังนั้นเราจึงสามารถสรุปได้ว่าเอส dysgalactiae
แยกเก็บจากประเทศที่แตกต่างกันมีการแปลเป็นภาษาท้องถิ่นทางภูมิศาสตร์
และความแตกต่างในระดับข้ามชาติ ผลของเรา
ขัดแย้งกับสมมติฐานเดิมของเรา [8] ซึ่งลายนิ้วมือ
รูปแบบที่ได้จากการย่อยด้วยอภัยของเอส dysgalactiae

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วิธีโมเลกุลจำเป็นเพื่อประเมินความเครียดสามารถ
ภายในนี้ปลาเชื้อโรค ในการศึกษาปัจจุบัน การวิเคราะห์
S . dysgalactiae สายพันธุ์ปลาโดยการตัดด้วยเอนไซม์ตัดจำเพาะ และการใช้บางส่วนของกำไร

พบใหม่ลึกเข้าไปในการระบุและระบาดวิทยาของเอส dysgalactiae .
การศึกษาหลายแห่งได้แสดงบนโมเลกุล
การจำแนกชนิดเชื้อแบคทีเรียโดยใช้วิธีการจัดลำดับยีนเป้าหมายบาง

[ แม่บ้าน 5,7,8,11,20,23,31,32 ] ปัจจัยการยืดตัว ( ไฮยีน ) เป็นห่วง
โปรตีนช่วยในการยืดตัวของไรโบโซม และ aminoacyl
โปรตีนจากการเมารถตลอด
แปล มันสามารถแจกจ่าย และในที่สุด
แบคทีเรียกรัมบวกเพียงหนึ่งโดยยีนได้ถูกค้นพบ
โดยลำดับของเชื้อมักจะให้เพิ่มเติมการเลือกปฏิบัติ
พลังกว่า 16S rDNA ลำดับและอาจเปิดตัวในระดับสปีชีส์ของ

streptococcal แม้ส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิด ดังนั้น จึงเป็นจุดเริ่มต้นที่เหมาะสมกับการศึกษา phylogenetic
[ 22,33,34 ] การจัดลำดับของยีนโดยการ
กับราคาที่แตกต่างกันทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน
ไอโซจากพื้นที่ ตัวตนดับ 100% ตั้งใจระหว่าง
S . dysgalactiae ไอโซโดยไม่คำนึงถึงประเทศต้นทาง ,
นอกเหนือจากสามเชื้อ ดังนั้น การวิเคราะห์ ซึ่งแสดงให้เห็นว่าปลา

S . dysgalactiae แยกเป็นของ หนึ่งกลุ่ม และแตกต่างจากชนิดอื่น ๆที่น่าสนใจคือ Streptococcus .
Sdysgalactiae กำเนิดปลาปรากฏเป็น
มากขึ้นที่เกี่ยวข้องกับสัตว์มากกว่า . . dysgalactiae subsp .
equisimilis . ดังนั้น ผลที่ได้แสดงให้เห็นว่าการวิเคราะห์ยีน
เนื่องจากอาจเป็นเครื่องมือที่ถูกต้องสำหรับการระบุ s . dysgalactiae
subsp . dysgalactiae กับชนิดย่อย ) ผลของเรา
แนะนำว่าการวิเคราะห์ยีน โดยยังสามารถเป็นเครื่องมือที่ถูกต้องสำหรับ
สำหรับความสัมพันธ์ระหว่างแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิด .
แต่ขาดโดยลำดับการเปลี่ยนแปลงในสหรัฐอเมริกา dysgalactiae
ไอโซจากสิงโตปลาพบ
เพียงพอสำหรับการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ใด ๆเซ็นต์ ( เช่นเป็นพิมพ์เครื่องมือ
ระดับความเครียด ) .
บนมืออื่น ๆ , PFGE ถือว่าเหนือกว่า
การตีความระหว่างความเครียดความสัมพันธ์ระหว่างมาตรฐาน [ 3 ] .
วิธีที่พบมากที่สุดที่ใช้ในการพิมพ์ครั้งประกอบด้วย
ของข้อจํากัดของ genomic DNA กับเอนโดนิวคลีเอสสมัย , ตามการวิเคราะห์
[ PFGE 11,36 ] ในการศึกษาวิเคราะห์การใช้

สำหรับการทดสอบการเปรียบเทียบคุณสมบัติระหว่างญี่ปุ่นและเลี้ยงปลาสายพันธุ์
S . dysgalactiae [ 19 ]และคุณสมบัติทางพันธุกรรมของ
S . dysgalactiae หายจากปลานิลในบราซิล [ 11 ] ใน
การศึกษานี้ปลาทั้งหมด . dysgalactiae ไอโซเลทเป็นของ
ประเภทจำแนกตามรูปแบบ macrorestriction
ได้โดยการย่อยด้วย SMA . เราโดยเฉพาะอย่างยิ่ง
สนใจที่จะตรวจสอบว่ามีข้อมูลหรือไม่ถิ่นทางภูมิศาสตร์
สายพันธุ์ Sdysgalactiae คือ clonally
ที่เกี่ยวข้องในระดับข้ามชาติ ญี่ปุ่นทุกไอโซเลทและแยกประเภท A
นำเสนอผลลัพธ์ที่ได้ในการศึกษานี้ ได้รับการสนับสนุนเหล่านั้น

เคยเผยแพร่ในโดย nomoto et al . [ 19 ] และ นิชิกิ และคณะ [ 20 ] ที่แสดงที่ญี่ปุ่น พบว่า S .

dysgalactiae เป็น clonally ที่เกี่ยวข้องกับแต่ละอื่น ๆทุกสายพันธุ์ ( ยกเว้น ไต้หวัน 95985 )
อกนำเสนอและชนิด B และเห็นได้ชัดว่าแตกต่างจากอื่น ๆ
ไอโซเลท ได้แก่ ญี่ปุ่น อินโดนีเซีย และมาเลเซีย
เชื้อ ดังนั้นเราจึงสามารถสรุปได้ว่า . dysgalactiae
ไอโซจากประเทศที่แตกต่างกันทางภูมิศาสตร์
ถิ่น และแตกต่างในระดับข้ามชาติ
ผลของเราขัดแย้งกับสมมติฐานเดิมของเรา [ 8 ] ซึ่งในรูปแบบต่าง ๆ ที่ได้จากการย่อยด้วยลายนิ้วมือ
S . dysgalactiae อภัย