Milkfish (Chanos chanos), an import

Milkfish (Chanos chanos), an important marine aquaculture species in southern Taiwan,
show considerable euryhalinity but have low tolerance to sudden drops in water temperatures
in winter. Here, we used high throughput next-generation sequencing (NGS) to identify
molecular and biological processes involved in the responses to environmental changes.
Preliminary tests revealed that seawater (SW)-acclimated milkfish tolerated lower temperatures
than the fresh water (FW)-acclimated group. Although FW- and SW-acclimated milkfish
have different levels of tolerance for hypothermal stress, to date, the molecular physiological
basis of this difference has not been elucidated. Here, we performed a next-generation
sequence analysis of mRNAs from four groups of milkfish.We obtained 29669 unigenes with
an average length of approximately 1936 base pairs. Gene ontology (GO) analysis was performed
after gene annotation. A large number of genes for molecular regulation were identified
through a transcriptomic comparison in a KEGG analysis. Basal metabolic pathways
involved in hypothermal tolerance, such as glycolysis, fatty acid metabolism, amino acid
catabolism and oxidative phosphorylation, were analyzed using PathVisio and Cytoscape
software. Our results indicate that in response to hypothermal stress, genes for oxidative
phosphorylation, e.g., succinate dehydrogenase, were more highly up-regulated in SW than
FW fish. Moreover, SW and FWmilkfish used different strategies when exposed to hypothermal
stress: SW milkfish up-regulated oxidative phosphorylation and catabolism genes to produce
more energy budget, whereas FWmilkfish down-regulated genes related to basal
metabolism to reduce energy loss.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ปลานวลจันทร์ทะเล (Chanos chanos) สายพันธุ์การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำทางทะเลที่สำคัญในไต้หวันภาคใต้แสดง euryhalinity มาก แต่มีความอดทนต่ำจะลดลงอย่างฉับพลันในอุณหภูมิของน้ำในฤดูหนาว ที่นี่ เราใช้อัตราความเร็วสูงยุค sequencing (NGS) ระบุโมเลกุล และชีวภาพกระบวนการมีส่วนร่วมในการตอบสนองการเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อมการทดสอบเบื้องต้นเปิดเผยว่า น้ำทะเล (SW) -ปลานวลจันทร์ทะเลเหมือนเขามั้ยวะยอมรับอุณหภูมิต่ำกว่าน้ำจืด (FW) -กลุ่มเหมือนเขามั้ยวะ แม้ว่าปลานวลจันทร์ทะเล FW - และ SW-เหมือนเขามั้ยวะมีแตกต่างกันของค่าเผื่อสำหรับความเครียด hypothermal วันที่ ที่โมเลกุลทางสรีรวิทยาไม่ได้อธิบายพื้นฐานของความแตกต่างนี้ ที่นี่ เราทำรุ่นต่อไปวิเคราะห์ลำดับของ mRNAs จากสี่กลุ่มของปลานวลจันทร์ทะเล เรารับ 29669 unigenes ด้วยมีความยาวเฉลี่ยประมาณ 1936 ฐานคู่ ทำการวิเคราะห์ยีนภววิทยา (GO)หลังจากอธิบายยีน ระบุยีนสำหรับควบคุมโมเลกุลจำนวนมากผ่านการเปรียบเทียบ transcriptomic ในการวิเคราะห์ KEGG ฐานทางเดินเผาผลาญการมีส่วนร่วมในความอดทน hypothermal เช่น glycolysis เผาผลาญกรดไขมัน กรดอะมิโนแคแทบอลิซึมและฟฟอสโฟรี ถูกวิเคราะห์โดยใช้ PathVisio และ Cytoscapeซอฟต์แวร์ ผลลัพธ์ของเราระบุว่า ในการตอบเพื่อความเครียด hypothermal ยีนสำหรับการออกซิเดชันphosphorylation เช่น พร่อง succinate ถูกสูงขึ้นควบคุมใน SW มากกว่าปลา FW นอกจากนี้ SW และ FWmilkfish ใช้กลยุทธ์ที่แตกต่างเมื่อสัมผัส hypothermalความเครียด: SW ปลานวลจันทร์ทะเลขึ้นควบคุมฟฟอสโฟและยีนแคแทบอลิซึมในการผลิตงบประมาณพลังงาน ในขณะที่ FWmilkfish ลงควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับฐานเผาผลาญเพื่อลดการสูญเสียพลังงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ปลานวลจันทร์ทะเล (Chanos Chanos) ที่สำคัญชนิดเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำทางทะเลในภาคใต้ของไต้หวัน
แสดง euryhalinity มาก แต่มีความอดทนต่ำจะลดลงอย่างฉับพลันในอุณหภูมิของน้ำ
ในช่วงฤดูหนาว ที่นี่เราใช้อัตราความเร็วสูงรุ่นต่อไปลำดับ (NGS) เพื่อระบุ
กระบวนการทางชีวภาพโมเลกุลและการมีส่วนร่วมในการตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงด้านสิ่งแวดล้อม.
การทดสอบเบื้องต้นเปิดเผยว่าน้ำทะเล (SW) ปลานวลจันทร์ทะเล -acclimated ทนอุณหภูมิต่ำ
กว่าน้ำจืด (FW) -acclimated กลุ่ม. แม้ว่า FW- และปลานวลจันทร์ทะเล SW-acclimated
มีระดับที่แตกต่างกันของความอดทนสำหรับความเครียด hypothermal, วันที่สรีรวิทยาโมเลกุล
พื้นฐานของความแตกต่างนี้ไม่ได้รับการอธิบาย ที่นี่เราจะทำรุ่นต่อไป
การวิเคราะห์ลำดับของ mRNAs จากสี่กลุ่มที่ได้รับ milkfish.We 29669 unigenes มี
ความยาวเฉลี่ยประมาณ 1,936 ฐานคู่ ยีนอภิปรัชญา (ไป) การวิเคราะห์ได้ดำเนินการ
หลังจากที่คำอธิบายประกอบยีน จำนวนมากของยีนสำหรับการควบคุมโมเลกุลที่ถูกระบุ
ผ่านการเปรียบเทียบ transcriptomic ในการวิเคราะห์ KEGG ฐานเผาผลาญเซลล์
มีส่วนร่วมในความอดทน hypothermal เช่น glycolysis การเผาผลาญกรดไขมันกรดอะมิโน
catabolism และ oxidative phosphorylation ถูกวิเคราะห์โดยใช้ PathVisio และ Cytoscape
ซอฟแวร์ ผลของเราแสดงให้เห็นว่าในการตอบสนองต่อความเครียด hypothermal ยีนสำหรับ oxidative
phosphorylation เช่น succinate dehydrogenase เป็นมากขึ้นสูงขึ้นควบคุมใน SW กว่า
ปลา FW นอกจากนี้ SW และ FWmilkfish ใช้กลยุทธ์ที่แตกต่างเมื่อสัมผัสกับ hypothermal
ความเครียด: SW ปลานวลจันทร์ทะเลขึ้นควบคุม phosphorylation oxidative และยีน catabolism การผลิต
งบประมาณพลังงานมากขึ้นในขณะที่ FWmilkfish ควบคุมลงยีนที่เกี่ยวข้องกับฐาน
การเผาผลาญเพื่อลดการสูญเสียพลังงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปลานวลจันทร์ทะเล ( chanos chanos ) สำคัญทางทะเล การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชนิดในภาคใต้ของไต้หวันแสดง euryhalinity มากแต่ได้น้อย ความอดทนแบบฉับพลันในอุณหภูมิของน้ำหยดในฤดูหนาว ที่นี่เราใช้ลำดับ throughput สูงรุ่นใหม่ ( ภาพหลุด ) เพื่อระบุกระบวนการโมเลกุลทางชีววิทยา และมีส่วนร่วมในการตอบสนองต่อ การเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อมการทดสอบเบื้องต้นพบว่าน้ำทะเล ( SW ) - ทนอุณหภูมิลดลงความสุขแบบกว่าน้ำสด ( FW ) - ชินกรุ๊ป แต่ FW และ SW acclimated ปลานวลจันทร์ทะเลที่มีระดับของความอดทนต่อความเครียด hypothermal วันที่ , โมเลกุล สรีรวิทยาพื้นฐานของความแตกต่างนี้ยังไม่ได้ทำการ . ที่นี่เราแสดงรุ่นต่อไปลำดับการวิเคราะห์รหัสจากสี่กลุ่มของความสุข เราได้รับ 29669 unigenes กับมีความยาวโดยเฉลี่ยประมาณ 2479 ฐานคู่ ยีนอภิปรัชญา ( ไป ) การวิเคราะห์หลังจากที่ยีนหมายเหตุ . ตัวเลขขนาดใหญ่ของยีนควบคุมโมเลกุลถูกระบุผ่าน transcriptomic เปรียบเทียบการวิเคราะห์ KEGG เป็นต้น การเผาผลาญเซลล์แรกเริ่มที่เกี่ยวข้องในการ hypothermal เช่นไกลโคไลซิสการเผาผลาญกรดไขมัน กรดอะมิโน ,กระบวนการสลายและออกซิเดทีฟฟอสโฟรีเลชัน วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ pathvisio cytoscape , และซอฟต์แวร์ ผลของเราระบุว่าในการตอบสนองต่อความเครียดจากออกซิเดทีฟ hypothermal ,ปฏิกิริยาฟอสโฟรีเลชัน เช่น ซัคซิเนท ดีไฮโดรจีเนส มีคา SW มากกว่าFW ปลา นอกจากนี้ fwmilkfish SW ใช้กลยุทธ์ต่าง ๆ และเมื่อสัมผัสกับ hypothermalความเครียด : SW ตีจากและกระตุ้นกระบวนการสลายยีนผลิตตัวละครชาวออสเตรเลียพลังงานเพิ่มเติมงบประมาณ ในขณะที่ fwmilkfish ลงควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับฐานการเผาผลาญพลังงาน ลดการสูญเสียพลังงาน