The Genome of the PapayaRingspot Vi

The Genome of the Papaya
Ringspot Virus (PRSV)
PRSV is of the genus Potyvirus and of the family Potyviridae.
The genome of PRSV consists of 800–900 nm long
nonenveloped flexuous filamentous particles with an ssRNA
genome of about 10,324 nucleotides [27]. The virion contains
94.5% protein and 5.5% nucleic acid by weight. The PRSV
genome encodes a single large protein (3,344 amino acids)
which is subsequently cleaved into smaller proteins with
various functions.The suggested map of the PRSV polyprotein
is outlined in Figure 1.
The proposed locations of the cleavage sites predict eight
to nine proteins consisting of P1 (63K), helper component
(HC-Pro, 52K), P3 (46K), cylindrical inclusion protein (C1,
72K), nuclear inclusion protein a (NIa, 48K), nuclear inclusion
protein b (NIb, 59K), and coat protein (CP, 35K) [27].
The P1 protein is encoded by the Potyvirus genome and
autocatalytically cleaves.The P1 protein is the least conserved
protein and can move systemically in infected plants [28].
The helper component (HC-Pro) is amultifunctional protein
which mediates aphid transmission, symptom expression,
long distance movement, genome amplification, and suppression
of posttranscriptional gene silencing (PTGS). HCPro
is a highly effective suppressor of RNA silencing [29].
It can affect the microRNA-mediated development pathway
in plants and help in the establishment of the heterologous
virus. The long distance movement and genome replication
of HC-Pro depends on PTGS suppression [30]. HC-Pro is
responsible for synergismbetween polyviruses and unrelated
viruses that can cause severe symptoms and an accumulation
of virus in infected leaves [31]. The C1 protein of PRSV
has NTP binding, NTPase, RNA binding, and RNA helicase
activity [32, 33]. The NIa has two domains defined as the
N-terminal genome-linked protein (VPg) and C-terminal
domain.The VPg is required for priming RNA synthesis. Nib
is a codependent RNA polymerase that has been shown to
have replicase activity. CP is involved in aphid transmission
systemic movement and the encapsidation of the viral RNA
[28]. The PRSV is divided into two major biotypes or strains
based on their host range. The PRSV-Wtype affects cucurbits
but not papaya while the PRSV-P type affects papaya and
cucurbits.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มะละกอจีโนไวรัส Ringspot (PRSV)PRSV เป็นสกุล Potyvirus และครอบครัว Potyviridaeประกอบด้วยจีโน PRSV ยาว 800-900 nmnonenveloped flexuous ด้ายอนุภาคกับ ssRNA การจีโนนิวคลีโอไทด์ประมาณ 10,324 [27] ใน virion ประกอบด้วย94.5% 5.5% และโปรตีนกรดนิวคลีอิก โดยน้ำหนัก การ PRSVพันธุจแมปเดียวใหญ่โปรตีน (กรดอะมิโน 3,344)ซึ่งต่อมาคือแหวกเป็นโปรตีนขนาดเล็กด้วยฟังก์ชันต่าง ๆ แนะนำแผนที่ PRSV polyproteinอธิบายในรูปที่ 1สถานนำเสนอสถานที่ความแตกแยกทายว่า แปดกับเก้าโปรตีนประกอบด้วย P1 (63K), คอมโพเนนต์ช่วย(K HC-Pro, 52), P3 (46K), โปรตีนรวมทรงกระบอก (C1ทาง 72 ที่ K), โปรตีนรวมนิวเคลียร์การ (NIa, 48 K), รวมนิวเคลียร์โปรตีน b (ปลายปากกา 59K), และตราโปรตีน (CP, 35K) [27]โปรตีน P1 จะถูกเข้ารหัส โดยจีโน Potyvirus และautocatalytically แข็งกระด้าง โปรตีน P1 ที่นำอย่างน้อยโปรตีน และสามารถย้าย systemically ในพืชติดเชื้อ [28]คอมโพเนนต์ตัวช่วย (HC-Pro) เป็นโปรตีน amultifunctionalซึ่ง mediates ส่ง aphid อาการแสดงย้ายระยะไกล ขยายพันธุ และปราบปรามของยีน posttranscriptional สมร (PTGS) HCProเป็นการจับที่มีประสิทธิภาพสูงของ RNA สมร [29]มันมีผลต่อทางเดินมี microRNA พัฒนาในพืชและช่วยในการจัดตั้งการ heterologousไวรัส การจำลองการเคลื่อนไหวและพันธุระยะไกลของ HC-Pro ขึ้นปราบปราม PTGS [30] มี HC-Proรับผิดชอบ synergismbetween polyviruses และไม่เกี่ยวข้องไวรัสที่ทำให้เกิดอาการรุนแรงและสะสมไวรัสในใบติดเชื้อ [31] โปรตีน C1 ของ PRSVมีผลผูกพัน NTP, NTPase, RNA รวม และ RNA helicaseกิจกรรม [32, 33] สนชมีโดเมนที่สองเป็นการN-เทอร์มินัลเชื่อมโยงพันธุโปรตีน (VPg) และ C-เทอร์มินัลโดเมน VPg จำเป็นสำหรับการสังเคราะห์ RNA สามารถดูดได้ หัวปากกาเป็นพอลิเมอเรส RNA ทำให้ codependent ที่มีการมีกิจกรรม replicase เกี่ยวข้องกับ CP ส่ง aphidระบบการเคลื่อนไหวและ encapsidation ของ RNA ไวรัส[28] . PRSV ในแบ่งเป็นสองหลัก biotypes หรือสายพันธุ์ตามช่วงการโฮสต์ PRSV-Wtype ผล cucurbitsแต่ไม่มะละกอในขณะที่ชนิด PRSV P ผลมะละกอ และcucurbits