Sequencing and bioinformatic analys

Sequencing and bioinformatic analysis of 3351 ESTs from two SSH libraries yielded 1692 unique transcripts. Of which, 618 transcripts were unknown/novel genes and the remaining 1074 were similar to 743 known genes and 105 unannotated mRNA sequences available in public databases. A total of 161 transcripts were classified to the category "response to stimulus" and 115 to "immune system process". We identified 25 significantly up-regulated genes (including 2 unknown transcripts) and 4 down-regulated genes associated with immune-related processes upon challenge with LPS. Quantitative real-time PCR confirmed the differential expression of these genes after LPS challenge.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ลำดับและผลเชิงวิวัฒนาการของ ESTs 3351 จากไลบรารีของ SSH ที่สองหา 1692 เฉพาะใบแสดงผล ของ 618 ที่ ใบแสดงผลได้ไม่รู้จัก/นวนิยายยีนและเหลือ 1074 ได้คล้ายกับยีน 743 รู้จัก และ 105 unannotated mRNA ลำดับในฐานข้อมูลสาธารณะ จำนวน 161 ใบแสดงผลถูกจัดประเภท "การตอบสนองต่อการกระตุ้นเศรษฐกิจ" และ 115 "กระบวนการระบบภูมิคุ้มกัน" เราระบุ 25 มากขึ้นควบคุมยีน (รวม 2 ใบแสดงผลที่ไม่รู้จัก) และ 4 ลงควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันเมื่อความท้าทายกับ LPS เชิงปริมาณแบบ real-time PCR ยืนยันค่าแตกต่างของยีนเหล่านี้หลังจาก LPS ท้าทาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับและการวิเคราะห์ของชีววิทยา 3351 ESTs จากสองห้องสมุด SSH ผล 1,692 ยีนที่ไม่ซ้ำกัน ซึ่ง 618 ยีนที่เป็นที่รู้จัก / ยีนใหม่และส่วนที่เหลืออีก 1,074 มีความคล้ายคลึงกับ 743 ยีนที่รู้จักและ 105 ลำดับ mRNA unannotated ที่มีอยู่ในฐานข้อมูลสาธารณะ รวม 161 ยีนที่จะถูกจัดหมวดหมู่ "การตอบสนองต่อสิ่งเร้า" และ 115 "ขั้นตอนของระบบภูมิคุ้มกันของร่างกาย" เราระบุ 25 อย่างมีนัยสำคัญขึ้นควบคุมยีน (รวมทั้ง 2 ยีนที่ไม่ทราบ) และ 4 ยีนควบคุมลงที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันเมื่อความท้าทายกับ LPS PCR เชิงปริมาณแบบ real-time ได้รับการยืนยันการแสดงออกที่แตกต่างกันของยีนเหล่านี้หลังจากที่ท้าทาย LPS

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับการวิเคราะห์ไบโอ นฟ ์เมติกของเอเซียจากสองฐานข้อมูลห้องสมุด SSH จาก 1692 ใบไม่ซ้ำกัน ซึ่งถ้าต้นฉบับเป็นยีน / นวนิยายที่ไม่รู้จัก และอีกตัวนี้ มีความคล้ายคลึงกับแกรู้จักยีนและ 105 unannotated mRNA ลำดับที่มีอยู่ในฐานข้อมูลสาธารณะ ทั้งหมด 161 ใบจัดในหมวดหมู่ " การตอบสนองต่อสิ่งเร้า และ 115 กระบวนการ " ภูมิคุ้มกัน "เราสามารถระบุ 25 ระดับยีน ( รวม 2 ใบที่ไม่รู้จัก ) และ 4 ลงควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันเมื่อท้าทายกับหล่อลื่น . เชิงปริมาณแบบ PCR ยืนยันความแตกต่างการแสดงออกของยีนเหล่านี้หลังจากที่หล่อลื่นท้าทาย