wastewater, an anaerobic sludge bla

wastewater, an anaerobic sludge blanket reactor and a sulfidogenic
fluidized-bed reactor. Strains H53214 andDY22619 differ
from each other in hydrogenase number and type, although they
both belong to the same genus, Caloranaerobacter. This could
be one of the main reasons why strain DY22619 has a higher
hydrogen yield than strain H53214.
3.7. Modular structure of [FeFe] hydrogenases of the
genus Caloranaerobacter
The hydrogenases in the genus Caloranaerobacter found in
this report are putatively monomeric, dimeric and trimeric, in
agreement with the characteristics of clostridial [FeFe] hydrogenases
[17]. The different modular structures of hydrogenases
in Caloranaerobacter were determined as described
previously and were shown in Table 2. The modular structures
M3 clustered inside group A1 and all belonged to trimeric
hydrogenases except for KP004413, which probably lost a
beta subunit due to sequencing problems. In group A1, there
were no large differences in the length of catalytic alpha
subunits, which ranged from 573 to 600 aa, while there were
some differences in the length of beta subunits among clusters
1, 2, 3 and 4, which possessed 597, 419, 430, 632 amino acids,
respectively. The modular structure M2 belonging to group C
contained dimeric enzymes and the representatives of group D
were monomeric. The size of polypeptides KIA70856,
KP004405 and KGG80999 were 881, 882 and 574 aa, with a
short thioredoxin-like second subunit (119, 119 and 81 aa),
respectively. The modular structure of KGG80999 was distinct
from the two other hydrogenase sequences. Within Group D,
the monomeric hydrogenases had M2e modular structures and
were 392 and 413 aa in length, respectively. Group B3 was
monomeric with a similar structure to M3. In this study, B3
was only found in strain H53214, with 486 aa in length.
It is evident that the trimeric hydrogenase in anaerobic
species requires both reduced ferredoxin and NADH to efficiently
catalyze H2 production [47]. Strain DY22619 has four
trimeric hydrogenases belonging to group A1, which may
mean the isolate has a higher yield of hydrogen production
than strain H53214. In bacteria, PAS domains are usually
related to a histidine kinase domain or a sensor protein that
regulates a histidine kinase, and thereby can monitor changes
in the electron transport system [48]. Group C hydrogenase
contains enzyme with PAS/PAC sensory domains in C-termini.
In this study, strain H53214 has two group C hydrogenases and
one group B hydrogenase, the latter of which is absent in strain
DY22619. The existence of these hydrogenases could indicate
a more complex H2 metabolism in strain H53214 compared to
strain DY22619. As we know, the presence of numerous
distinct [FeFe] hydrogenases in clostridia may help them to
effectively respond to environmental variations [17]. In this
study, we found that Caloranaerobacter contained multiple
forms of the enzyme, which could be advantageous for bacteria
of this genus compared with other microbes under the
extremophilic and variable hydrothermal vent systems.
In summary, this study discovered a variety of fermentative
hydrogen-producing microbes in deep-sea hydrothermal vent
environments, including Caloranaerobacter, Clostridium,
Caminicella, Desulfotomaculum and Caulobacter. Among
them, Caloranaerobacter species are found in all tested hydrothermal
samples of global oceans and likely play a role in
element biogeochemical cycling coupled with energy followup.
Moreover, Caloranaerobacter has high potential for
hydrogen production at elevated temperatures, which could be
considered an alternative model for biohydrogen production
studies.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

น้ำเสีย เครื่องปฏิกรณ์แบบใช้ตะกอน และการ sulfidogenicเครื่องปฏิกรณ์เทอร์เตียง สายพันธุ์ H53214 andDY22619 แตกต่างกันจากอื่น ๆ ในจำนวน hydrogenase และชนิด แม้ว่าพวกเขาทั้งสองอยู่ในสกุลเดียวกัน Caloranaerobacter นี้สามารถเป็นหนึ่งในเหตุผลหลักที่ทำไมสายพันธุ์ DY22619 มีสูงผลผลิตไฮโดรเจนมากกว่าสายพันธุ์ H532143.7. โมดูโครงสร้างของ hydrogenases [FeFe] ของการสกุล CaloranaerobacterHydrogenases สกุล Caloranaerobacter พบในรายงานนี้มี monomeric putatively, dimeric และ trimeric ในกับลักษณะของ clostridial hydrogenases [FeFe][17] . โครงสร้างแบบแยกส่วนต่างของ hydrogenasesใน Caloranaerobacter ถูกกำหนดตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ และถูกแสดงในตารางที่ 2 โครงสร้างแบบโมดูลาร์M3 คลัสเตอร์ภายในกลุ่ม A1 และทั้งหมดที่มีอยู่ถึง trimerichydrogenases ยกเว้น KP004413 ซึ่งอาจจะหายไปเป็นงานย่อยเบต้าเนื่องจากปัญหาการจัดลำดับ ในกลุ่ม A1 มีไม่มีความแตกต่างกันขนาดใหญ่ยาวของตัวเร่งปฏิกิริยาอัลฟากำหนด ซึ่งอยู่ในช่วงจาก 573 600 aa ในขณะที่มีความแตกต่างในความยาวของเบต้ากำหนดท่ามกลาง1, 2, 3 และ 4 ซึ่งครอบครอง 597, 419, 430 กรดอะมิโน 632ตามลาดับ โมดูลโครงสร้าง M2 เป็นกลุ่ม Cประกอบด้วยเอนไซม์ dimeric และตัวแทนของกลุ่ม Dมี monomeric ขนาดของพอลิเปปไทด์ KIA70856KP004405 และ KGG80999 881, 882 และ 574 aa มีการสั้นเหมือน thioredoxin สองย่อย (119, 119 และ 81 aa),ตามลาดับ โครงสร้างแบบโมดูลาร์ของ KGG80999 ไม่ทันจากสองอื่น ๆ hydrogenase ลำดับที่ ภายในกลุ่ม Dmonomeric hydrogenases มีโครงสร้างแบบโมดูลาร์ M2e และมี 392 และ 413 aa ยาว ตามลำดับ กลุ่ม B3 ถูกmonomeric มีโครงสร้างคล้ายกับ M3 ในการศึกษานี้ B3พบเฉพาะในสายพันธุ์ H53214 มี 486 aa ยาวจะเห็นที่ hydrogenase trimeric ในไม่ใช้ออกซิเจนพันธุ์ที่ต้องการลด ferredoxin และ NADH ไปอย่างมีประสิทธิภาพกระตุ้นการผลิต H2 [47] สายพันธุ์ DY22619 มีสี่hydrogenases trimeric เป็นสมาชิกของกลุ่ม A1 ซึ่งอาจหมายถึง โปรตีนมีผลผลิตสูงกว่าการผลิตไฮโดรเจนกว่าสายพันธุ์ H53214 ในแบคทีเรีย โดเมน PAS มักเกี่ยวข้องกับโดไคเนส histidine หรือเซนเซอร์โปรตีนที่ควบคุมไคเนส histidine เป็น และจึงสามารถตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในระบบขนส่งอิเล็กตรอน [48] กลุ่ม C hydrogenaseประกอบด้วยเอนไซม์กับโดเมนประสาท PAS/PAC ในเทอร์มิ Cในการศึกษานี้ สายพันธุ์ H53214 มีสองกลุ่ม C hydrogenases และหนึ่งกลุ่ม B hydrogenase หลังที่มีมาในสายพันธุ์DY22619 การดำรงอยู่ของ hydrogenases เหล่านี้อาจบ่งชี้ว่าเผาผลาญ H2 ที่ซับซ้อนมากขึ้นในสายพันธุ์ H53214 เมื่อเทียบกับสายพันธุ์ DY22619 เรารู้ว่า ของจำนวนมากhydrogenases [FeFe] แตกใน clostridia อาจช่วยให้พวกเขามีประสิทธิภาพตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อม [17] ในที่นี้การศึกษา เราพบว่า Caloranaerobacter มีอยู่หลายรูปแบบของเอนไซม์ ซึ่งอาจเป็นประโยชน์สำหรับแบคทีเรียของสกุลนี้เปรียบเทียบกับจุลินทรีย์อื่น ๆ ภายใต้การระบบปล่อง extremophilic และตัวแปรในสรุป การศึกษานี้พบความหลากหลายของหมักจุลินทรีย์ที่ผลิตไฮโดรเจนในปล่องลึกสภาพแวดล้อม รวมทั้ง Caloranaerobacter แพทย์Caminicella, Desulfotomaculum และ Caulobacter ในหมู่พวกเขา Caloranaerobacter สายพันธุ์ที่พบในการทดสอบ hydrothermalตัวอย่าง ของมหาสมุทรทั่วโลก และมีแนวโน้มมีบทบาทในองค์ประกอบของ biogeochemical ขี่จักรยานด้วยเพื่อติดตามงานพลังงานนอกจากนี้ Caloranaerobacter มีศักยภาพสูงผลิตไฮโดรเจนที่อุณหภูมิสูง ซึ่งอาจจะพิจารณารูปแบบทางเลือกสำหรับผลิต biohydrogenการศึกษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

น้ำเสียที่ไม่ใช้ออกซิเจนเครื่องปฏิกรณ์ตะกอนและ sulfidogenic
เครื่องปฏิกรณ์เตียง fluidized สายพันธุ์ H53214 andDY22619 แตกต่าง
จากคนอื่น ๆ ในจำนวนและประเภท hydrogenase แม้ว่าพวกเขา
ทั้งสองอยู่ในสกุลเดียวกัน Caloranaerobacter ซึ่งอาจ
จะเป็นหนึ่งในเหตุผลหลักว่าทำไมความเครียด DY22619 มีสูงกว่า
อัตราผลตอบแทนไฮโดรเจนกว่าสายพันธุ์ H53214.
3.7 โครงสร้างแบบแยกส่วนของ [Fefe] hydrogenases ของ
สกุล Caloranaerobacter
hydrogenases ในสกุล Caloranaerobacter พบใน
รายงานนี้คือสมมุติ monomeric, dimeric และ trimeric ใน
ข้อตกลงกับลักษณะของ clostridial [Fefe] hydrogenases
[17] โครงสร้างแบบแยกส่วนที่แตกต่างกันของ hydrogenases
ใน Caloranaerobacter ได้รับการพิจารณาตามที่อธิบายไว้
ก่อนหน้านี้และมีการแสดงในตารางที่ 2 โครงสร้างแบบแยกส่วน
M3 คลัสเตอร์ภายในกลุ่มและทุก A1 เป็น trimeric
hydrogenases ยกเว้น KP004413 ซึ่งอาจสูญเสีย
subunit เบต้าเนื่องจากปัญหาลำดับ ในกลุ่ม A1 มี
ไม่แตกต่างกันขนาดใหญ่ในความยาวของอัลฟาตัวเร่งปฏิกิริยา
หน่วยย่อยซึ่งอยู่ในช่วง 573-600 AA, ในขณะที่มี
ความแตกต่างบางอย่างในความยาวของหน่วยย่อยเบต้าหมู่คลัสเตอร์
1, 2, 3 และ 4 ซึ่งครอบครอง 597, 419, 430, 632 กรดอะมิโน
ตามลำดับ M2 โครงสร้างของโมดูลที่อยู่ในกลุ่ม C
มีเอนไซม์ dimeric และตัวแทนของกลุ่มของ D
เป็น monomeric ขนาดของ polypeptides KIA70856,
KP004405 และ KGG80999 เป็น 881, 882 และ 574 AA กับ
สั้น Thioredoxin เหมือน subunit สอง (119, 119 และ 81 AA),
ตามลำดับ โครงสร้างแบบแยกส่วนของ KGG80999 เป็นที่แตกต่าง
จากสองลำดับ hydrogenase อื่น ๆ ภายในกลุ่ม D
hydrogenases monomeric มีโครงสร้างแบบแยกส่วน M2E และ
เป็น 392 และ 413 AA ยาวตามลำดับ กลุ่ม B3 เป็น
monomeric มีโครงสร้างคล้ายกับ M3 ในการศึกษานี้ B3
ถูกพบได้เฉพาะในสายพันธุ์ H53214 กับ 486 AA ยาว.
เห็นได้ชัดว่า hydrogenase trimeric ในแบบไม่ใช้ออกซิเจน
ชนิดต้องใช้ทั้งลด ferredoxin และ NADH ได้อย่างมีประสิทธิภาพ
กระตุ้นการผลิต H2 [47] สายพันธุ์ DY22619 มีสี่
hydrogenases trimeric อยู่ในกลุ่ม A1 ซึ่งอาจ
หมายถึงการแยกมีอัตราผลตอบแทนที่สูงขึ้นของการผลิตไฮโดรเจน
กว่าสายพันธุ์ H53214 ในแบคทีเรียโดเมน PAS มักจะ
เกี่ยวข้องกับโดเมนฮิสติดีนไคเนสหรือโปรตีนเซ็นเซอร์ที่
ควบคุมไคเนสฮิสติดีนและจึงสามารถตรวจสอบการเปลี่ยนแปลง
ในระบบการขนส่งอิเล็กตรอน [48] กลุ่ม C hydrogenase
มีเอนไซม์ที่มี PAS / PAC โดเมนประสาทสัมผัสใน C-Termini.
ในการศึกษานี้ความเครียด H53214 มีสองกลุ่ม hydrogenases ซีและ
กลุ่มหนึ่ง B hydrogenase หลังซึ่งเป็นสายพันธุ์ที่ไม่อยู่ใน
DY22619 การดำรงอยู่ของ hydrogenases เหล่านี้อาจบ่งชี้ว่า
การเผาผลาญอาหาร H2 ที่ซับซ้อนมากขึ้นในสายพันธุ์ H53214 เมื่อเทียบกับ
สายพันธุ์ DY22619 ที่เรารู้ว่าการปรากฏตัวของจำนวนมาก
ที่แตกต่างกัน [Fefe] hydrogenases ใน clostridia อาจช่วยให้พวกเขา
ได้อย่างมีประสิทธิภาพตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงด้านสิ่งแวดล้อม [17] ในการนี้
การศึกษาเราพบว่า Caloranaerobacter มีหลาย
รูปแบบของเอนไซม์ซึ่งอาจจะเป็นประโยชน์สำหรับเชื้อแบคทีเรีย
ชนิดนี้เมื่อเทียบกับจุลินทรีย์อื่น ๆ ภายใต้
extremophilic และตัวแปรระบบ hydrothermal ระบาย.
ในการสรุปการศึกษาครั้งนี้ค้นพบความหลากหลายของการหมัก
ไฮโดรเจนผลิต จุลินทรีย์ในทะเลลึก hydrothermal ระบาย
สภาพแวดล้อมรวมทั้ง Caloranaerobacter, Clostridium,
Caminicella, Desulfotomaculum และ Caulobacter ในหมู่
พวกเขา Caloranaerobacter ชนิดที่พบในทุก hydrothermal ทดสอบ
ตัวอย่างของมหาสมุทรทั่วโลกและมีแนวโน้มที่มีบทบาทสำคัญใน
องค์ประกอบการขี่จักรยาน biogeochemical ควบคู่ไปกับการติดตามผลการใช้พลังงาน.
นอกจากนี้ Caloranaerobacter มีศักยภาพสูงในการ
ผลิตไฮโดรเจนที่อุณหภูมิสูงซึ่งอาจจะ
ถือว่าเป็นรูปแบบทางเลือกสำหรับ การผลิตไฮโดรเจน
ศึกษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ถังปฏิกรณ์บำบัดน้ำเสีย , ผ้าห่มและ sulfidogenicเครื่องปฏิกรณ์แบบฟลูอิไดซ์เบด . สายพันธุ์ h53214 anddy22619 แตกต่างกันจากแต่ละอื่น ๆในจํานวนไฮโดรจีเนสและชนิด แม้ จะทั้งสองอยู่ในจีนัสเดียวกัน caloranaerobacter . นี้สามารถเป็นหนึ่งในเหตุผลหลักว่าทำไม dy22619 ความเครียดมีสูงh53214 ไฮโดรเจนผลผลิตมากกว่าสายพันธุ์3.7 โครงสร้างของโมดูลของ [ fefe ] hydrogenases ของcaloranaerobacter สกุลการ hydrogenases ในสกุล caloranaerobacter พบในรายงานนี้เป็น putatively เกิด trimeric ท้องเฟ้อ , และในข้อตกลงกับลักษณะของ clostridial [ fefe ] hydrogenases[ 17 ] โมดูลโครงสร้างที่แตกต่างกันของ hydrogenasesใน caloranaerobacter ตัดสินใจตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้และถูกแสดงในตารางที่ 2 โครงสร้างโมดูลM3 แบบภายในกลุ่ม A1 และทั้งหมดเป็นของ trimerichydrogenases ยกเว้น kp004413 ซึ่งอาจสูญเสียเบต้า ซึ่งเกิดจากปัญหาของ ในกลุ่ม A1 , มีไม่มีขนาดใหญ่ความแตกต่างในความยาวของตัวเร่งปฏิกิริยา อัลฟ่าหน่วยย่อยซึ่งอยู่ระหว่าง 573 600 AA , ในขณะที่มีมีความแตกต่างในความยาวของหน่วยย่อยของกลุ่มเบต้า1 , 2 , 3 และ 4 ซึ่งครอบครอง 597 419 430 , 632 , กรดอะมิโนตามลำดับ โครงสร้างแบบโมดูลาร์ M2 ของกลุ่ม ซีที่มีอยู่ท้องเฟ้อเอนไซม์และตัวแทนของกลุ่ม ดีได้เกิด . ขนาดของ kia70856 โปรตีน ,และมี kp004405 kgg80999 881 882 และ 574 , AA , กับสั้น thioredoxin ชอบใบที่สอง ( 119 , 119 และ 81 AA )ตามลำดับ โครงสร้างแบบโมดูลาร์ของ kgg80999 ได้ชัดเจนไฮโดรจีเนสจากสองอื่น ๆดังนี้ ภายในกลุ่ม Dการ hydrogenases เกิด m2e โครงสร้าง modular และมีเป็นและแต่ AA ในความยาว ตามลำดับ กลุ่ม C คือวิธีที่มีโครงสร้างคล้ายคลึงกับ M3 ในการศึกษานี้ , B3ถูกพบใน h53214 ความเครียดกับคุณ AA ในความยาวจะเห็นได้ว่า trimeric แอนไฮโดรจีเนสชนิดที่ต้องใช้ทั้งลดลงและมีประสิทธิภาพการ ferredoxinเร่งผลิต H2 [ 47 ] สายพันธุ์ dy22619 ได้สี่trimeric hydrogenases เป็นของกลุ่ม A1 ซึ่งอาจหมายถึงแยกได้ผลผลิตที่สูงขึ้นของการผลิตไฮโดรเจนกว่า h53214 สายพันธุ์ ในแบคทีเรีย ขั้นตอนโดเมนมักจะที่เกี่ยวข้องกับฮิสติดีน ไคเนสโปรตีนที่มีโดเมน หรือ เซ็นเซอร์ควบคุมีนไคเนส และจึงสามารถตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในระบบการขนส่งอิเล็กตรอน [ 48 ] กลุ่ม C ไฮโดรจีเนสประกอบด้วยเอนไซม์กับ pas / PAC และโดเมนใน c-termini .ในการศึกษาครั้งนี้มี 2 กลุ่ม ซี hydrogenases h53214 สายพันธุ์และหนึ่งในกลุ่ม B ไฮโดรจีเนส , หลังซึ่งไม่ได้อยู่ในสายพันธุ์dy22619 . การดำรงอยู่ของ hydrogenases เหล่านี้บ่งบอกได้ว่าการเผาผลาญอาหาร H2 ที่ซับซ้อนมากขึ้นใน h53214 เมื่อยเมื่อเทียบกับสายพันธุ์ dy22619 . อย่างที่เราทราบ มีหลายแตกต่าง [ fefe ] hydrogenases Clostridia อาจช่วยให้พวกเขาในได้อย่างมีประสิทธิภาพตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อมการเปลี่ยนแปลง [ 17 ] ในนี้การศึกษาพบว่า caloranaerobacter ที่มีอยู่หลายรูปแบบของเอนไซม์ ซึ่งจะเป็นประโยชน์สำหรับ แบคทีเรียประเภทนี้เมื่อเทียบกับจุลินทรีย์อื่น ๆภายใต้extremophilic และระบบระบายด้วยตัวแปรโดยสรุปการศึกษานี้พบความหลากหลายของวิศวกรรมเคมีไฮโดรเจนผลิตจุลินทรีย์ในทะเลลึกปล่องไฮโดรเทอร์มอลสภาพแวดล้อม รวมทั้ง caloranaerobacter , Clostridium ,caminicella desulfotomaculum caulobacter , และ . ระหว่างพวกเขา caloranaerobacter ชนิดที่พบในการทดสอบทั้งหมดด้วยตัวอย่างของมหาสมุทรทั่วโลก และอาจมีบทบาทในองค์ประกอบชีวธรณีเคมีจักรยานควบคู่ไปกับการประหยัดพลังงานนอกจากนี้ caloranaerobacter มีศักยภาพสูงการผลิตไฮโดรเจนที่อุณหภูมิสูง ซึ่งอาจเป็นถือว่าเป็นรูปแบบทางเลือกในการผลิตไบโอไฮโดรเจนศึกษา