Genomic DNA for use in PCR was extracted from freeze-dried
and ground fungal material using Fastprep FP120 with 350 ll of
TEN buffer (500 mM NaCl, 400 mM Tris–HCl, 50 mM EDTA, pH
8.0), 1% beta-mercaptoethanol, 5 mM 1,10 phenanthroline and
2% (w/v) polyvinylpyrrolidone K30. The resulting suspension
was then mixed thoroughly with 350 ll of 2% (w/v) SDS and
incubated for 30 min at 65 C. Following the addition of 300 ll
of ice-cold ammonium acetate (7.5 M) the sample was kept on
ice for 20 min and then centrifuged at 13,000 rpm for 10 min.
An equal volume of cold isopropanol (20 C) was added to
the supernatant and centrifuged for 5 min. The DNA pellet was
washed in ice-cold 70% v/v ethanol and dissolved in sterile
distilled water. All DNA samples were quantified using a Thermo
Scientific NanoDropTM 1000 Spectrophotometer and diluted to
10 ng/ll for use in PCR. All PCR products were sequenced
(MWG Eurofins Operon, Germany) using the corresponding Forward and/or Reverse primers (Table 2)
ออกดีเอ็นเอสำหรับใช้ใน PCR ถูกแยกจากชนิดแห้งและพื้นวัสดุเชื้อราด้วย Fastprep FP120 350 ll ของสิบบัฟเฟอร์ (500 มม. NaCl, pH ทริสเรทติ้ง – HCl, EDTA 50 มม. 400 มม.8.0), เบต้า 1%-mercaptoethanol, phenanthroline 5 มม. 1, 10 และ2% (w/v) polyvinylpyrrolidone K30 ระบบกันสะเทือนได้ถูกผสมอย่างกับ 350 แล้ว ll 2% (w/v) SDS และนาทีที่ 65 c ได้รับการกก ต่อการเพิ่ม 300 llของแอมโมเนียฉ่ำ acetate (7.5 เมตร) ตัวอย่างถูกเก็บไว้บนน้ำแข็ง 20 นาทีแล้ว จากที่ 13,000 rpm 10 นาทีถูกเย็น isopropanol (20 C) ปริมาณเท่ากับการ supernatant และเหวี่ยง 5 นาที เป็นเม็ดดีเอ็นเอล้างในฉ่ำ 70% v/v เอทานอล และละลายในการฆ่าเชื้อน้ำกลั่น ตัวอย่างดีเอ็นเอทั้งหมดถูกวัดโดยใช้ความร้อนวิทยาศาสตร์ NanoDropTM 1000 สเปค และเจือจางไป10 ฉบับ/ll สำหรับใช้ใน PCR ผลิตภัณฑ์ PCR ทั้งหมดถูกเรียงลำดับ(MWG Eurofins Operon เยอรมัน) ใช้สอดคล้องกันไปข้างหน้า หรือย้อนกลับไพรเมอร์ (ตาราง 2)
การแปล กรุณารอสักครู่..
