Two-dimensional polyacrylamide gel

Two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-D PAGE) followed by mass
spectrometric identification of the proteins in the protein spots has become a central tool in
proteomics. CMT167(H), CMT64(M) and CMT170(L) cell lines, selected from a spontaneous
mouse lung adenocarcinoma, with high-, middle- or low-metastatic potential have been
characterized in vivo. In this study, the comprehensive protein expression profiles of the CMT
cell lineswere analyzed at passages 5, 15 and 35 in order to assess the cell line stability. During
the passages 5 to 15, the expression profiles of CMT cells remained reasonably stable as
evidenced by only 0.7%, 3.9% and 1.1%proteins changed in CMT167(H), CMT64(M) and CMT170
(L) respectively. However, the number of differentially expressed proteins were considerably
increased at passage 35 in CMT64(M) and CMT170(L) while CMT167(H) remained stable. Based
on our selection criteria, 22, 109 and 84 spots in CMT167(H), CMT64(M) and CMT170(L) were
selected for protein identification byMSand 99unique proteinswere identified. Bioinformatics
analysis indicatedthatmost of these proteinsparticipate incellularmetabolism.In conclusion,
proteomics was found to be a useful tool for assessing differences in cell line stability. This
approach provided a tool to select the best cell line and optimal subculture period for studies of
cancer related phenomena and for testing the effect of potential anticancer drugs.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Electrophoresis เจ polyacrylamide สองมิติ (2 D หน้า) ตาม ด้วยมวลรหัส spectrometric ของโปรตีนในจุดโปรตีนได้กลายเป็น เครื่องมือกลางในโปรตีโอมิกส์ CMT167(H), CMT64(M) และ CMT170(L) เซลล์รายการ เลือกจากที่อยู่ปอดมะเร็งชนิดต่อมเมาส์ สูง กลาง - หรือศักยภาพต่ำ metastatic ได้ลักษณะในสัตว์ทดลอง ในการศึกษานี้ ส่วนกำหนดค่านิพจน์อย่างโปรตีนของ CMTlineswere เซลล์วิเคราะห์เพื่อประเมินเสถียรภาพเส้นเซลล์ในทางเดินที่ 5, 15 และ 35 ในระหว่างการทางเดิน 5-15 ค่านิพจน์ของ CMT เซลล์ยังคงมีเสถียรภาพความเป็นเป็นหลักฐานเพียง 0.7%, 3.9% และ 1.1%proteins การเปลี่ยนแปลงใน CMT167(H), CMT64(M) และ CMT170(L) ตามลำดับ อย่างไรก็ตาม จำนวนโปรตีน differentially แสดงได้มากเพิ่มขึ้นในเส้นทาง 35 ใน CMT64(M) และ CMT170(L) ในขณะที่ CMT167(H) ยังคงมีเสถียรภาพ ตามเราเลือกเงื่อนไข 22, 109 และ 84 จุดใน CMT167(H), CMT64(M) และ CMT170(L) ได้เลือกสำหรับโปรตีนรหัส byMSand 99unique proteinswere ระบุ Bioinformaticsindicatedthatmost การวิเคราะห์ของ incellularmetabolism proteinsparticipate เหล่านี้ในสรุปพบโปรตีโอมิกส์เพื่อให้เครื่องมือมีประโยชน์สำหรับการประเมินความแตกต่างของเซลล์เส้นเสถียรภาพ นี้วิธีจัดเตรียมเครื่องมือเพื่อเลือกเซลล์สุดบรรทัดและระยะเหมาะสมวัฒนธรรมศึกษาของปรากฏการณ์ที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งและ การทดสอบผลของยาอาจ anticancer

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

polyacrylamide สองมิติเจลอิเล็ก (2-D PAGE) ตามด้วยมวล
spectrometric ประจำตัวของโปรตีนในจุดโปรตีนที่ได้กลายเป็นเครื่องมือสำคัญในการ
โปรตีน CMT167 (H), CMT64 (M) และ CMT170 (L) เซลล์, การคัดเลือกจากธรรมชาติ
เมาส์มะเร็งปอดที่มีสูง, กลางหรือที่มีศักยภาพต่ำระยะแพร่กระจายได้รับการ
ที่โดดเด่นในร่างกาย ในการศึกษานี้การแสดงออกของโปรตีนที่ครอบคลุมของ CMT
เซลล์ lineswere วิเคราะห์ทางเดินที่ 5, 15 และ 35 เพื่อประเมินความมั่นคงเซลล์เส้น ในระหว่าง
ทางเดิน 5-15, การแสดงออกของเซลล์ CMT ยังคงมีเสถียรภาพพอสมควรเป็น
หลักฐานโดยเฉพาะ 0.7%, 3.9% และ 1.1% โปรตีนเปลี่ยนแปลงใน CMT167 (H), CMT64 (M) และ CMT170
(L) ตามลำดับ อย่างไรก็ตามจำนวนของโปรตีนที่แสดงออกแตกต่างกันอย่างมากที่ได้รับ
เพิ่มขึ้นในทาง 35 ใน CMT64 (M) และ CMT170 (L) ในขณะที่ CMT167 (H) ยังคงมีเสถียรภาพ ตาม
เกณฑ์การเลือกของเรา, 22, 109 และ 84 จุดใน CMT167 (H), CMT64 (M) และ CMT170 (L) ได้รับ
เลือกในการจำแนกโปรตีน byMSand proteinswere 99unique ระบุ ชีวสารสนเทศศาสตร์
การวิเคราะห์ indicatedthatmost ของ proteinsparticipate incellularmetabolism.In เหล่านี้สรุป
โปรตีนถูกพบว่าเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการประเมินความแตกต่างในความมั่นคงสายพันธุ์ของเซลล์ นี้
วิธีการให้เครื่องมือในการเลือกสายพันธุ์ของเซลล์ที่ดีที่สุดและช่วงเวลาที่เหมาะสมสำหรับการวัฒนธรรมการศึกษา
ปรากฏการณ์ที่เกี่ยวข้องกับโรคมะเร็งและการทดสอบผลกระทบของยาต้านมะเร็งที่มีศักยภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2 dimensional gel electrophoresis ( 2 หน้า ) ตามด้วยมวล
ความรหัสของโปรตีนในโปรตีนจุดได้กลายเป็นเครื่องมือสำคัญใน
โปรตีโอมิกส์ . cmt167 ( H ) , cmt64 ( M ) และ cmt170 ( L ) เซลล์ที่เลือกจากธรรมชาติ
เมาส์ปอด adenocarcinoma , สูง - กลาง - ต่ำ หรืออาจแพร่กระจายได้
ลักษณะในสิ่งมีชีวิต ในการศึกษานี้ครอบคลุมการแสดงออกโปรตีนโปรไฟล์ของ CMT
เซลล์ lineswere วิเคราะห์ในหัวข้อที่ 5 , 15 และ 35 เพื่อประเมินเซลล์สายความมั่นคง ระหว่าง
หัวข้อ 5 ถึง 15 สำนวนโปรไฟล์ของ CMT เซลล์ยังคงเหมาะสมมีความเสถียร
ไม่ยุ่งยากเพียง 0.7% , 3.9% และโปรตีน 1.1 % การเปลี่ยนแปลงใน cmt167 ( H ) , cmt64 ( M ) และ cmt170
( L ) ตามลำดับ อย่างไรก็ตามจำนวนโปรตีนที่แสดงออกแตกต่างกันได้มากเพิ่มขึ้นในเส้นทาง 35 cmt64
( M ) และ cmt170 ( L ) ในขณะที่ cmt167 ( H ) ยังคงมีเสถียรภาพ โดย
ในเกณฑ์การคัดเลือก , 22 , 109 และ 84 จุดใน cmt167 ( H ) , cmt64 ( M ) และ cmt170 ( L )
เลือกโปรตีน bymsand 99unique proteinswere ระบุ ชีวสารสนเทศศาสตร์
การวิเคราะห์ indicatedthatmost เหล่านี้ proteinsparticipate incellularmetabolism สรุป
โปรตีโอมิกส์พบว่าเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการประเมินความมั่นคงบรรทัดความแตกต่างในเซลล์ วิธีการนี้
ให้เครื่องมือในการเลือกที่ดีที่สุดและระยะเวลาที่เหมาะสมสำหรับสายเซลล์วัฒนธรรมการศึกษา
ปรากฏการณ์โรคมะเร็งที่เกี่ยวข้องสำหรับการทดสอบและผลของยาต้านมะเร็งที่มีศักยภาพ .