To overcome this limitation,Voter p

To overcome this limitation,
Voter provided a method for accelerating the molecular dynamics,
i.e., hyper-MD, which made it possible to simulate atomic dynamics on the scale of a microsecond
or longer.



Choudhary and Clancy applied this method to the
production of amorphous silicon, and obtained significant time of
boosts in the range of 4–12 for a small system without changing
the dynamics of the evolution. However, although numerical minimization
methods were proposed to efficiently obtain a numerical
approximation for a bias potential without the diagonalization
of the Hessian matrix, the computational time for each
hyper-MD step is still much longer than that of a conventional
MD step, and the cost for calculating the bias potential scales as
the square of the number of moving atoms is high, which prohibits
its application to large systems.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อเอาชนะข้อ จำกัด นี้
ผู้มีสิทธิเลือกตั้งที่จัดไว้ให้วิธีการในการเร่งการเปลี่ยนแปลงโมเลกุล
เช่น Hyper-MD ซึ่งทำให้มันเป็นไปได้ที่จะจำลองการเปลี่ยนแปลงอะตอมโยไมโคร
หรือนานกว่า. Choudhary แคลนซีและใช้วิธีการนี้ในการผลิตซิลิคอนอสัณฐาน และได้รับเวลาที่สำคัญของการช่วยเพิ่มในช่วง 4-12 สำหรับระบบขนาดเล็กโดยไม่ต้องเปลี่ยนการเปลี่ยนแปลงของวิวัฒนาการ อย่างไรก็ตามแม้ว่าการลดตัวเลขวิธีการได้รับการเสนอให้มีประสิทธิภาพได้รับตัวเลขประมาณศักยภาพอคติโดยไม่ต้อง diagonalization ของเมทริกซ์รัฐเวลาการคำนวณสำหรับแต่ละขั้นตอน Hyper-MD ยังคงนานกว่าที่ของการชุมนุมขั้นตอน MD, และค่าใช้จ่าย สำหรับการคำนวณอคติเครื่องชั่งน้ำหนักที่มีศักยภาพเป็นที่สองของจำนวนของอะตอมเคลื่อนไหวอยู่ในระดับสูงซึ่งห้ามการประยุกต์ใช้กับระบบขนาดใหญ่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อเอาชนะข้อจำกัดนี้ผู้มีสิทธิเลือกตั้งให้วิธีการสำหรับการเปลี่ยนแปลงระดับโมเลกุลเช่น ไฮเปอร์ MD ซึ่งทำให้มันเป็นไปได้ที่จะจำลองพลศาสตร์ของอะตอมในระดับของไมโครเซคคั่นหรือนานกว่านั้นchoudhary และใช้วิธีนี้กับแคลนซีการผลิตซิลิคอนอสัณฐานและได้รับเวลาที่สำคัญของเพิ่มในช่วง 4 – 12 สำหรับระบบขนาดเล็ก โดยไม่มีการเปลี่ยนแปลงพลวัตของการวิวัฒนาการ อย่างไรก็ตาม แม้ว่าการเชิงตัวเลขวิธีการเสนอขอรับตัวเลขได้อย่างมีประสิทธิภาพการประมาณค่าสำหรับ อคติ ที่มีศักยภาพ โดย diagonalizationของ Hessian matrix เวลาการคำนวณสำหรับแต่ละขั้นตอนที่ MD ไฮเปอร์ ยังนานกว่าที่ของปกติMD ขั้นตอนและค่าใช้จ่ายเพื่อคำนวณศักยภาพระดับเป็นอคติตารางที่ของจำนวนของการย้ายอะตอมสูงซึ่งห้ามการประยุกต์ใช้ในระบบขนาดใหญ่