Background: The global spread of HI

Background: The global spread of HIV-1 has been accompanied by the emergence of genetically distinct viral strains. Over
the past two decades subtype C viruses, which predominate in Southern and Eastern Africa, have spread rapidly throughout
parts of South America. Phylogenetic studies indicate that subtype C viruses were introduced to South America through a
single founder event that occurred in Southern Brazil. However, the external route via which subtype C viruses spread to the
South American continent has remained unclear.
Methodology/Principal Findings: We used automated genotyping to screen 8,309 HIV-1 subtype C pol gene sequences
sampled within the UK for isolates genetically linked to the subtype C epidemic in South America. Maximum likelihood and
Bayesian approaches were used to explore the phylogenetic relationships between 54 sequences identified in this screen,
and a set of globally sampled subtype C reference sequences. Phylogenetic trees disclosed a robustly supported
relationship between sequences from Brazil, the UK and East Africa. A monophyletic cluster comprised exclusively of
sequences from the UK and Brazil was identified and dated to approximately the early 1980s using a Bayesian coalescentbased
method. A sub-cluster of 27 sequences isolated from homosexual men of UK origin was also identified and dated to
the early 1990s.
Conclusions: Phylogenetic, demographic and temporal data support the conclusion that the UK was a crucial staging post
in the spread of subtype C from East Africa to South America. This unexpected finding demonstrates the role of diffuse
international networks in the global spread of HIV-1 infection, and the utility of globally sampled viral sequence data in
revealing these networks. Additionally, we show that subtype C viruses are spreading within the UK amongst men who have
sex with men.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: แพร่กระจายทั่วโลกของเชื้อเอชไอวี-1 ได้รับมาพร้อมกับการเกิดขึ้นของสายพันธุ์ไวรัสแปลงพันธุกรรมที่แตกต่างกัน มากกว่าทศวรรษที่สองชนิดย่อย C ไวรัส ที่ predominate ในแอฟริกาใต้ และภาคตะวันออก ได้แพร่กระจายอย่างรวดเร็วตลอดส่วนของอเมริกาใต้ ศึกษา phylogenetic บ่งชี้ว่า ไวรัสชนิดย่อย C ถูกนำไปอเมริกาใต้ที่ผ่านการผู้ก่อตั้งเดียวเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นในภาคใต้ของบราซิล อย่างไรก็ตาม กระบวนการภายนอกผ่านไวรัสชนิดย่อย C ที่แพร่กระจายไปอเมริกาใต้ทวีปได้ยังคงไม่ชัดเจนค้นพบวิธีการ/หลัก: เราใช้ genotyping อัตโนมัติจอ 8,309 1 เอชไอวีชนิดย่อย C pol ยีนลำดับตัวอย่างภายในสหราชอาณาจักรสำหรับแยกแปลงพันธุกรรมกับโรคระบาดชนิดย่อย C ในอเมริกาใต้ ความเป็นไปได้สูงสุด และใช้แนวทฤษฎีแห่งความสัมพันธ์ phylogenetic ระหว่าง 54 ลำดับที่ระบุในหน้าจอนี้และชุดของลำดับการอ้างอิงย่อยทั่วโลกตัวอย่าง C ต้นไม้ phylogenetic เปิดเผยสนับสนุนอย่างทนทานความสัมพันธ์ระหว่างลำดับจากบราซิล สหราชอาณาจักร และแอฟริกาตะวันออก Monophyletic คลัสเตอร์ประกอบด้วยโดยเฉพาะลำดับจากสหราชอาณาจักรและประเทศบราซิลระบุ และลงไปประมาณต้นทศวรรษ 1980 โดยใช้ coalescentbased ทฤษฎีวิธีการ คลัสเตอร์ย่อยลำดับ 27 แยกต่างหากจากผู้ชายเกย์ของสหราชอาณาจักรยังระบุ และลงไปช่วงปี 1990บทสรุป: Phylogenetic ประชากร และขมับข้อมูลสนับสนุนการสรุปว่า สหราชอาณาจักรที่สำคัญจัดเตรียมโพสต์ในการแพร่กระจายของชนิดย่อย C จากแอฟริกาตะวันออกไปยังทวีปอเมริกาใต้ ค้นหาที่ไม่คาดคิดนี้แสดงให้เห็นถึงบทบาทของการกระจายเครือข่ายระหว่างประเทศในการแพร่กระจายทั่วโลกติดเชื้อเอชไอวี-1 ยูทิลิตี้ไวรัสลำดับทั่วโลกตัวอย่างข้อมูลในเปิดเผยเครือข่ายเหล่านี้ นอกจากนี้ เราแสดงว่า มีการแพร่กระจายไวรัสชนิดย่อย C ภายในสหราชอาณาจักรอยู่ท่ามกลางคนที่มีเพศสัมพันธ์กับผู้ชาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พื้นหลัง: การแพร่กระจายทั่วโลกของเอชไอวี 1 ได้รับมาโดยการเกิดขึ้นของไวรัสสายพันธุ์ทางพันธุกรรมที่แตกต่างกัน กว่าสองทศวรรษที่ผ่านไวรัสชนิดย่อยซีซึ่งครอบงำในภาคใต้และภาคตะวันออกของทวีปแอฟริกามีการแพร่กระจายอย่างรวดเร็วทั่วส่วนของทวีปอเมริกาใต้ phylogenetic ศึกษาแสดงให้เห็นว่าไวรัสชนิดย่อย C ได้รับการแนะนำให้รู้จักกับอเมริกาใต้ผ่านเหตุการณ์ก่อตั้งเดียวที่เกิดขึ้นในภาคใต้ของบราซิล อย่างไรก็ตามเส้นทางภายนอกผ่านทางซึ่งไวรัสชนิดย่อย C แพร่กระจายไปยังทวีปอเมริกาใต้ยังคงไม่มีความชัดเจน. วิธีการ / ผลการวิจัยที่สำคัญ: เราใช้อัตโนมัติ genotyping ไปที่หน้าจอ 8309 HIV-1 ชนิดย่อยลำดับยีน C เพศตัวอย่างที่อยู่ในสหราชอาณาจักรสำหรับสายพันธุ์ที่เชื่อมโยงทางพันธุกรรมไปชนิดย่อย C การแพร่ระบาดในทวีปอเมริกาใต้ ความน่าจะเป็นสูงสุดและวิธีเบส์ถูกนำมาใช้ในการสำรวจความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการระหว่าง 54 ลำดับที่ระบุไว้ในหน้าจอนี้และชุดของชิมทั่วโลกชนิดย่อยC ลำดับการอ้างอิง ต้นไม้ที่เปิดเผยได้รับการสนับสนุนอย่างทนทานความสัมพันธ์ระหว่างลำดับจากบราซิล, สหราชอาณาจักรและแอฟริกาตะวันออก คลัสเตอร์ไฟย์เลติประกอบด้วยเฉพาะของลำดับจากสหราชอาณาจักรและบราซิลที่ถูกระบุและวันประมาณช่วงต้นปี 1980 โดยใช้ coalescentbased คชกรรมวิธี ย่อยกลุ่มของ 27 ลำดับที่แยกได้จากชายรักร่วมเพศของสหราชอาณาจักรแหล่งกำเนิดถูกระบุด้วยและวันที่ในช่วงต้นปี1990. สรุป: วิวัฒนาการข้อมูลประชากรและขมับสนับสนุนข้อสรุปว่าสหราชอาณาจักรเป็นฉากหลังที่สำคัญในการแพร่กระจายของชนิดย่อยC จาก แอฟริกาตะวันออกไปอเมริกาใต้ การค้นพบที่ไม่คาดคิดนี้แสดงให้เห็นถึงบทบาทของการกระจายเครือข่ายระหว่างประเทศในการแพร่กระจายทั่วโลกของเอชไอวี 1 การติดเชื้อและยูทิลิตี้ชิมทั่วโลกข้อมูลลำดับไวรัสในการเปิดเผยเครือข่ายเหล่านี้ นอกจากนี้เราแสดงให้เห็นว่าไวรัสชนิดย่อย C มีการแพร่กระจายในสหราชอาณาจักรในหมู่ผู้ชายที่มีเพศสัมพันธ์กับชาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประวัติ : การแพร่กระจายทั่วโลกของเชื้อเอชไอวีที่ได้รับมาพร้อมกับวิวัฒนาการของพันธุกรรมที่แตกต่างกันของไวรัสสายพันธุ์ กว่าสองทศวรรษที่ผ่านมากลุ่ม C
ไวรัส ซึ่งการศึกษาในภาคใต้และตะวันออกแอฟริกาได้แพร่กระจายอย่างรวดเร็วทั่วประเทศ
ส่วนของอเมริกาใต้ ซึ่งจากการศึกษาพบว่า กลุ่ม C ไวรัสแนะนำอเมริกาใต้ผ่าน
เดี่ยวผู้ก่อตั้งเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นในภาคใต้ของบราซิล อย่างไรก็ตาม เส้นทางผ่านทั้งภายนอกที่ C ไวรัสแพร่กระจายไปยัง
อเมริกาใต้ทวีปยังคงไม่ชัดเจน ค้นพบวิธีการ /
หลักที่เราใช้ในการอ่านหน้าจออัตโนมัติในกลุ่ม C โดยยีน ลำดับ
ตัวอย่างภายใน UK สำหรับสายพันธุ์ทางพันธุกรรมที่เชื่อมโยงกับชนิดย่อย C ระบาดในอเมริกาใต้โอกาสสูงสุดและวิธีเบส์
ถูกใช้เพื่อสำรวจความสัมพันธ์ระหว่างลำดับ phylogenetic 54 ระบุในหน้าจอนี้
และชุดทั่วโลกและกลุ่ม C อ้างอิงดังนี้ ต้นไม้ phylogenetic เปิดเผยทนทานได้รับการสนับสนุน
ความสัมพันธ์ระหว่างลำดับจากบราซิล , อังกฤษ และ แอฟริกาตะวันออก กลุ่ม monophyletic ประกอบด้วยเฉพาะของ
ลำดับจากอังกฤษ และ บราซิล พบ ลงวันที่ประมาณต้นทศวรรษ 1980 โดยใช้วิธี coalescentbased
คชกรรม . กลุ่มของ 27 ลำดับย่อยแยกจากกลุ่มชายรักชายของ UK ที่มายังระบุลงวันที่
ช่วงต้นทศวรรษ 1990
สรุปยืนยันสนับสนุนข้อสรุปว่าอังกฤษเป็นสำคัญดำเนินการ
ส่วนบุคคลและข้อมูลชั่วคราวในการแพร่กระจายของชนิดย่อย C จากตะวันออกกลางแอฟริกาอเมริกาใต้ การค้นหาที่ไม่คาดคิดนี้แสดงให้เห็นถึงบทบาทของการแพร่กระจายทั่วโลก
เครือข่ายระหว่างประเทศในการติดเชื้อ และสาธารณูปโภคของทั่วโลกและลำดับข้อมูลไวรัสใน
เปิดเผยเครือข่ายเหล่านี้ นอกจากนี้เราพบว่าชนิดย่อย C ไวรัสจะแพร่กระจายภายในสหราชอาณาจักรในหมู่คนที่
เพศกับผู้ชาย