The nonheterocystous filamentous cy

The nonheterocystous filamentous cyanobacterium, strain ESFC-1, is a recently described member of the order Oscillatoriales within the Cyanobacteria. ESFC-1 has been shown to be a major diazotroph in the intertidal microbial mat system at Elkhorn Slough, CA, USA. Based on phylogenetic analyses of the 16S RNA gene, ESFC-1 appears to belong to a unique, genus-level divergence; the draft genome sequence of this strain has now been determined. Here we report features of this genome as they relate to the ecological functions and capabilities of strain ESFC-1. The 5,632,035 bp genome sequence encodes 4914 protein-coding genes and 92 RNA genes. One striking feature of this cyanobacterium is the apparent lack of either uptake or bi-directional hydrogenases typically expected within a diazotroph. Additionally, a large genomic island is found that contains numerous low GC-content genes and genes related to extracellular polysaccharide production and cell wall synthesis and maintenance.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Nonheterocystous cyanobacterium ด้าย สายพันธุ์ ESFC-1 เป็นสมาชิกของใบสั่ง Oscillatoriales ภายใน Cyanobacteria ที่อธิบายเมื่อเร็ว ๆ นี้ ESFC-1 ได้รับการแสดงจะ เป็น diazotroph ที่สำคัญในระบบแผ่นจุลินทรีย์ intertidal ที่ Elkhorn คราบ CA, USA จากการวิเคราะห์ผลยีน 16S RNA, ESFC-1 จะ เป็นของแตกต่างไม่ซ้ำกัน ระดับสกุล ตอนนี้ได้รับการพิจารณาลำดับจีโนมที่ร่างของสายพันธุ์นี้ ที่นี่เรารายงานของกลุ่มนี้เกี่ยวข้องกับระบบนิเวศฟังก์ชันและความสามารถของสายพันธุ์ ESFC-1 ลำดับจีโนมที่ bp 5,632,035 encodes 4914 รหัสโปรตีนยีนและยีน RNA 92 คุณสมบัติหนึ่งที่โดดเด่นของ cyanobacterium นี้คือ การขาดการดูดซึมหรือ hydrogenases สองทิศทางโดยทั่วไปคาดว่าภายใน diazotroph ชัดเจน นอกจากนี้ เกาะออกขนาดใหญ่จะพบที่ประกอบด้วยจำนวนมากต่ำเนื้อหา GC ยีน และยีนที่เกี่ยวข้องกับสาร polysaccharide ผลิต และสังเคราะห์ผนังเซลล์ และการบำรุงรักษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไซยาโนแบคทีเรียใย nonheterocystous ความเครียด ESFC-1 เป็นสมาชิกเมื่อเร็ว ๆ นี้อธิบายของคำสั่ง Oscillatoriales ภายในไซยาโนแบคทีเรีย ESFC-1 ได้รับการแสดงที่จะเป็นแบคทีเรียที่ตรึงไนโตรเจนได้ที่สำคัญในระบบ intertidal เสื่อจุลินทรีย์ที่คอร์นตม, CA, USA บนพื้นฐานของการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของยีน 16S อาร์เอ็นเอ ESFC-1 จะปรากฏขึ้นเพื่อเป็นของที่ไม่ซ้ำกันความแตกต่างในระดับสกุล; ลำดับจีโนมร่างของสายพันธุ์นี้ในขณะนี้ได้รับการพิจารณา ที่นี่เรารายงานคุณสมบัติของจีโนมนี้ที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของระบบนิเวศและความสามารถของสายพันธุ์ ESFC-1 ลำดับจีโนม 5,632,035 bp encodes 4914 ยีนโปรตีนเข้ารหัสและ 92 ยีนอาร์เอ็นเอ คุณสมบัติที่โดดเด่นของไซยาโนแบคทีเรียหนึ่งนี่คือการขาดความชัดเจนของการดูดซึมอย่างใดอย่างหนึ่งหรือสองทิศทาง hydrogenases คาดว่าปกติภายในแบคทีเรียที่ตรึงไนโตรเจนได้ นอกจากนี้เป็นเกาะขนาดใหญ่จีโนมพบว่ามียีน GC-เนื้อหามากมายต่ำและยีนที่เกี่ยวข้องกับการผลิตสาร polysaccharide และการสังเคราะห์ผนังเซลล์และการบำรุงรักษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ nonheterocystous เป็นไซยาโนแบคทีเรียสายพันธุ์ esfc-1 , เป็นเมื่อเร็ว ๆนี้อธิบาย สมาชิกของคำสั่ง oscillatoriales ในไซยาโนแบคทีเรีย . esfc-1 ได้ถูกแสดงเป็น สาขาเวสต์มินสเตอร์ในป่าโกงกางจุลินทรีย์เสื่อระบบที่เลย์เ คอร์นลอกคราบ , CA , สหรัฐอเมริกาบนพื้นฐานของการวิเคราะห์ 16S RNA ชนิดของยีน esfc-1 ปรากฏเป็นของที่เป็นเอกลักษณ์ แตกต่างระดับสกุล ; ร่างจีโนมลำดับของสายพันธุ์นี้ได้ถูกกำหนดไว้ ที่นี่เรารายงานคุณลักษณะของจีโนมนี้เช่นที่พวกเขาเกี่ยวข้องกับหน้าที่ทางนิเวศวิทยาและความสามารถของ esfc-1 สายพันธุ์ การ 5632035 BP จีโนมลำดับรหัสโปรตีนยีน encodes 4914 92 อาร์เอ็นเอยีน หนึ่งในคุณสมบัติที่โดดเด่นของไซยาโนแบคทีเรียสายพันธุ์นี้คือ การขาดความชัดเจนของการใช้หรือสองทิศทาง hydrogenases มักจะคาดว่าภายในเวสต์มินสเตอร์ . นอกจากนี้ เกาะที่มีขนาดใหญ่ พบว่า มีจำนวนมากน้อย GC เนื้อหายีนและยีนที่เกี่ยวข้องกับการผลิตสารสำคัญและการสังเคราะห์ผนังเซลล์และการบํารุงรักษา