University at Albnay, SUNY, Albany,

University at Albnay, SUNY, Albany, NY, USA.
Non-equilibrium thermodynamics is indispensible in studying mechanical unfolding
of single RNA molecules. In a typical experiment, single RNA molecules
are pulled and relaxed at fast loading/unloading rate that structure
transitions occur under non-equilibrium. Work dissipation is reflected by hysteresis
between forward and reverse trajectories in force-extension curve. Ligand
and protein binding can stabilize a specific domain within a large RNA,
which further complicates work dissipation in mechanical unfolding. Using experiment
and simulation, we examined mechanical unfolding of large RNAs
containing secondary and tertiary folding. The RNAs follow hierarchical folding
pathways. Secondary structure forms before tertiary contacts, and tertiary
interaction is disrupted before unfolding of secondary structure. Factors that selectively
bind and stabilize tertiary structure lead to increased work dissipation
by protecting secondary structure from unfolding. Furthermore, work dissipation
is quantified as a function of pulling rate and factor binding
Rensselaer Polytechnic Institute, Troy, NY, USA.
Retroviruses require two copies of their ssRNA genomes in order to form infectious
virus particles. This is accomplished via a Dimerization Initiation Site
(DIS), which forms a rivet-like ‘‘kissing-loop’’ that binds the two genomes together.
Retroviral DIS kissing-loops have been shown to be unusually resistant
to heat denaturation or mechanical pulling, given the small number (2-6) of
Watson-Crick base-pairs involved. High mechanical stability is apparently required
for retroviral fitness, as mutations that destabilize the DIS loop in-vitro
also result in greatly reduced virus infectivity rates in-vivo. DIS kissing-loops
are therefore attractive targets for antiretroviral therapeutic design; however,
we must first understand the physical determinants that give rise to enhanced
DIS kissing-loop stability

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มหาวิทยาลัยที่ Albnay, SUNY อัลบานี NY สหรัฐอเมริกาอุณหพลศาสตร์สมดุลไม่เป็น indispensible เรียนแฉกลของโมเลกุลเดี่ยวของอาร์เอ็นเอ ในการทดลองทั่วไป เดี่ยวโมเลกุลอาร์เอ็นเอจะดึง และผ่อนคลายที่รวดเร็วในการโหลด/การโหลดอัตราโครงสร้างนั้นช่วงการเปลี่ยนภาพที่เกิดขึ้นภายใต้ไม่สมดุล กระจายงานเป็นประจำ โดยการสัมผัสระหว่างไปข้างหน้า และย้อนกลับ trajectories ในโค้งต่อกองทัพ ลิแกนด์และโปรตีนรวมสามารถอาโดเมนเฉพาะในอาร์เอ็นเอขนาดใหญ่เพิ่มเติมที่ complicates กระจายทำงานในกลุ่มเครื่องจักรกล โดยใช้การทดลองและจำลอง เราตรวจสอบแฉกลของ RNAs ขนาดใหญ่ประกอบด้วยพับรอง และระดับตติยภูมิ RNAs ทำตามลำดับชั้นพับมนต์ รูปแบบโครงสร้างรองก่อนติดต่อระดับตติยภูมิ และตติยโต้ตอบได้ระหว่างสองวันก่อนแฉของโครงสร้างรอง ปัจจัยที่เลือกผูก และมุ่งเป้าหมายโครงสร้างระดับตติยภูมิเพื่อกระจายการทำงานเพิ่มขึ้นโดยปกป้องโครงสร้างรองจากกลุ่ม นอกจากนี้ งานกระจายquantified เป็นฟังก์ชันของการดึงอัตราและสัดส่วนรวมเรนส์ซเลียร์ Troy, NY, USARetroviruses ต้องสำเนาของ ssRNA genomes ของพวกเขาเพื่อการติดเชื้ออนุภาคไวรัส นี้สำเร็จลุล่วงผ่านไซต์เริ่มต้น Dimerization(DIS), ซึ่งใช้ rivet เหมือน ''จูบวน '' ที่ binds genomes สองเข้าด้วยกันได้รับการแสดง retroviral DIS จูบลูปจะทนปกติdenaturation ความร้อน หรือเครื่องดึง กำหนดหมายเลขขนาดเล็ก (2-6) ของวัตสันคริกฐานคู่เกี่ยวข้องกัน เห็นได้ชัดว่าจำเป็นต้องมีเสถียรภาพทางกลสูงสำหรับออกกำลังกาย retroviral เป็นการกลายพันธุ์ที่สั่นคลอน หรือไม่??วนรอบเครื่องนอกจากนี้ยัง ส่งผลในไวรัสลด infectivity ราคาใน-vivo โรคจูบลูปดังเป้าหมายที่น่าสนใจสำหรับออกแบบบำบัดด้วย อย่างไรก็ตามเราต้องเข้าใจดีเทอร์มิแนนต์ทางกายภาพที่ให้สูงขึ้นเพื่อปรับปรุงก่อนเสถียรภาพวนจูบหรือไม่??

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มหาวิทยาลัย Albnay, SUNY ออลบานี, นิวยอร์ก, สหรัฐอเมริกา.
อุณหพลศาสตร์ไม่สมดุลเป็นที่ขาดไม่ได้ในการศึกษากลแฉ
ของโมเลกุล RNA เดียว ในการทดลองโดยทั่วไปโมเลกุล RNA เดียว
ถูกดึงและผ่อนคลายที่รวดเร็วในการโหลด / ขนถ่ายว่าโครงสร้างอัตรา
การเปลี่ยนเกิดขึ้นภายใต้ที่ไม่สมดุล การกระจายการทำงานจะเป็นตัวสะท้อน hysteresis
ระหว่างเดินหน้าและถอยหลังในวิถีโค้งแรงขยาย แกนด์
และโปรตีนสามารถปรับโดเมนเฉพาะภายใน RNA ขนาดใหญ่
ซึ่งต่อไปจะมีความซับซ้อนในการทำงานในการกระจายกลแฉ การใช้การทดลอง
และการจำลองเราตรวจสอบกลแฉของ RNAs ขนาดใหญ่
ที่มีการพับมัธยมศึกษาและอุดมศึกษา RNAs ปฏิบัติตามพับลำดับชั้น
ทางเดิน รองโครงสร้างรูปแบบก่อนที่รายชื่อตติยภูมิและตติยภูมิ
ปฏิสัมพันธ์จะหยุดชะงักก่อนที่จะแฉของโครงสร้างทุติยภูมิ ปัจจัยที่มีการคัดเลือก
ผูกพันและความมั่นคงนำโครงสร้างในระดับอุดมศึกษาที่จะกระจายการทำงานที่เพิ่มขึ้น
โดยการปกป้องโครงสร้างทุติยภูมิจากการแฉ นอกจากนี้การกระจายการทำงาน
จะวัดเป็นหน้าที่ของการดึงอัตราและปัจจัยที่มีผลผูกพัน
เยสถาบันโพลีเทคนิค, ทรอย, NY, USA.
Retroviruses ต้องใช้สองสำเนาของจีโนม ssRNA ของพวกเขาเพื่อให้รูปแบบการติดเชื้อ
ไวรัสอนุภาค นี่คือความสำเร็จผ่าน dimerization Initiation เว็บไซต์
(DIS) ซึ่งรูปแบบหมุดย้ำเหมือน '' จูบวง '' ที่ผูกสองจีโนมด้วยกัน.
Retroviral DIS จูบ-ลูปได้รับการแสดงที่จะมีความต้านทานผิดปกติ
ให้ความร้อนสูญเสียสภาพธรรมชาติหรือกลดึง รับจำนวนน้อย (2-6) ของ
วัตสันลำคลองคู่ฐานที่เกี่ยวข้อง เสถียรภาพสูงจะต้องเห็นได้ชัด
สำหรับการออกกำลังกายไวรัสเช่นการกลายพันธุ์ที่ทำให้ไม่มั่นคงห่วง DIS ในหลอดทดลอง
นอกจากนี้ยังส่งผลในการลดลงอย่างมากอัตราการติดเชื้อไวรัสในร่างกาย DIS จูบลูป
จึงเป็นเป้าหมายที่น่าสนใจสำหรับการรักษาด้วยยาต้านไวรัสการออกแบบ; แต่
เราต้องเข้าใจปัจจัยทางกายภาพที่ก่อให้เกิดการเพิ่ม
ความมั่นคง DIS จูบวง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มหาวิทยาลัยอัลบานี SUNY albnay , , , NY , USA
ไม่สมดุลอุณหพลศาสตร์จะขาดไม่ได้ในการศึกษากลไกของโมเลกุล rna แฉ
โสด ในการทดลองทั่วไป
rna โมเลกุลเดี่ยวจะถูกดึงและผ่อนคลายที่รวดเร็วในการโหลด / ขนถ่าย ซึ่งการเปลี่ยนโครงสร้าง
เกิดขึ้นภายใต้ไม่สมดุล . การกระจายงานสะท้อนแบบ
โดยระหว่างไปข้างหน้าและย้อนกลับวิถีโค้งในการบังคับ ลิแกนด์
โปรตีนสามารถรักษาเสถียรภาพและโดเมนที่เฉพาะเจาะจงภายใน RNA ขนาดใหญ่มีความซับซ้อนในการทำงาน
ซึ่งต่อไปการเครื่องกล แฉ . การใช้การทดลอง
และการจำลอง เราตรวจสอบเครื่องจักรกลขนาดใหญ่ขึ้น RNAs
ที่มีพับทุติยภูมิและตติยภูมิ พวก RNAs ตามลำดับชั้นพับ
วิถี .โครงสร้างตติยรูปแบบก่อนที่จะติดต่อและปฏิสัมพันธ์ตติย
กระจัดกระจาย ก่อนแฉของโครงสร้างทุติยภูมิ ปัจจัยที่เลือก
ผูกและความมั่นคงของโครงสร้างตติยาเพิ่มงานกระจาย
โดยการปกป้องโครงสร้างทุติยภูมิจากแฉ . นอกจากนี้ การกระจายงานเป็นปริมาณ
เป็นฟังก์ชันของการดึงอัตราและปัจจัยที่มีผลผูกพัน
Rensselaer Polytechnic Institute , ทรอย , นิวยอร์ก , สหรัฐอเมริกา
รีโทรไวรัสต้องใช้สองชุดของจีโนม ssrna ของพวกเขาเพื่อสร้างอนุภาค
ไวรัสที่ติดเชื้อ นี้ได้ผ่านทางเว็บไซต์
( DIS ) สหชาตริเริ่มซึ่งรูปแบบเกาหลีอย่าง ' ' ' ' 'kissing-loop ที่ผูกสองหาด้วยกัน
retroviral DIS ลูปจูบได้รับการแสดงที่จะทนผิดปกติ
ความร้อน ( หรือกลดึงให้เบอร์เล็ก ( 2-6 )
วัตสันคริกฐานคู่ที่เกี่ยวข้อง เสถียรภาพสูงจะเห็นได้ชัดว่าต้องการ
สำหรับ retroviral ฟิตเนส , การกลายพันธุ์ที่สั่นคลอนจากห่วงร่างกาย
ยังส่งผลในการติดเชื้อไวรัสลดลงอย่างมาก อัตรา ปี 2544 . DIS ลูป
จูบจึงเป็นเป้าหมายที่น่าสนใจสำหรับการออกแบบการรักษา อย่างไรก็ตาม
เราต้องเข้าใจปัจจัยทางกายภาพที่ก่อให้เกิดการเพิ่มห่วงเสถียรภาพ
จากจูบ