Analysis was performed by using the software package MEGA
version 2.1 (Kumar et al., 2001), after multiple alignments of the data via CLUSTAL X (Thompson et al., 1997). The distance matrix method (distance options according to Kimura’s twoparameter model), including clustering by neighbour-joining (Saitou & Nei, 1987) (Fig. 1) and a discrete character-based maximum-parsimony method (Kluge & Farris, 1969), was used. In each case, bootstrap values were calculated based on 1000 replications. The 16S rRNA gene sequence of strain CC-SBABM117
Twas a continuous stretch of 1400 bp. Sequence similarity calculations indicated that strain CC-SBABM117
Twas related most closely to Pannonibacter phragmitetus C6/19
T(92.5 %; Borsodi et al., 2003), Methylopila capsulata IM1
T(92.3 %; Doronina et al., 1998), Prosthecomicrobium pneumaticum MBIC3489
(92.3 %; Staley, 1968; Jenkins et al., 2005), Nesiotobacter exalbescens LA33B
T(91.5 %; Donachie et al., 2006), Pleomorphomonas oryzae IAM15079
TT(91.1 %; Xie & Yokota, 2005) and Stappia
การวิเคราะห์ได้รับการดำเนินการโดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์ล้าน
รุ่น 2.1 (kumar et al,., 2001) หลังจากที่หลายการจัดแนวของข้อมูลผ่านทาง x clustal (thompson, et al., 1997) วิธีเมทริกซ์ระยะทาง (ระยะทางที่ตัวเลือกตามรูปแบบของ twoparameter คิมูระ) รวมทั้งการจัดกลุ่มโดยเพื่อนบ้านเข้า (Saitou & Nei, 1987) (รูปที่1) และตัวอักษรที่ใช้วิธีการประหยัดสูงสุดต่อเนื่อง (Kluge & Farris, 1969) ถูกนำมาใช้ ในแต่ละกรณีค่าบูตถูกคำนวณตาม 1000 ซ้ำ 16s ลำดับยีนของสายพันธุ์ rrna cc-sbabm117
twas ยืดอย่างต่อเนื่อง 1400 bp ลำดับการคำนวณความคล้ายคลึงกันชี้ให้เห็นว่าความเครียด cc-sbabm117
twas ที่เกี่ยวข้องมากที่สุดอย่างใกล้ชิดกับ pannonibacter phragmitetus c6/19
T (92.5%;. Borsodi et al, 2003), methylopila capsulata IM1
T (92.3%. Doronina และคณะ, 1998), prosthecomicrobium pneumaticum mbic3489
(92.3%; สเตลีย์, 1968;. เจนกินส์และอัล, 2005), exalbescens nesiotobacter la33b
T (91.5%. Donachie et al, 2006), pleomorphomonas oryzae iam15079
tt (91.1%; Xie &โยโกตะ, 2005) และ stappia
การแปล กรุณารอสักครู่..

ทำการวิเคราะห์ โดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์ร็อค
รุ่น 2.1 (Kumar et al., 2001), หลังจากการจัดแนวหลายข้อมูลผ่าน CLUSTAL X (ทอมป์สันและ al., 1997) วิธีเมตริกซ์ระยะทาง (ระยะทางเลือกตามรูปแบบของคิมุระโย twoparameter), รวมทั้งคลัสเตอร์ โดยรวมเพื่อนบ้าน (Saitou & Nei, 1987) (ฟิก 1) และแยกกันใช้ตัวอักขระสูงสุด parsimony วิธีการ (Kluge & Farris, 1969), ใช้ ในแต่ละกรณี ค่าเริ่มต้นระบบได้คำนวณตามระยะ 1000 ลำดับ 16S rRNA ยีนของต้องใช้ CC SBABM117
Twas ทอดยาวต่อเนื่อง 1400 bp. คล้ายลำดับคำนวณระบุที่สายพันธุ์ CC SBABM117
Twas เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดกับ Pannonibacter phragmitetus C6/19
T (92.5% Borsodi และ al., 2003), Methylopila capsulata IM1
T (92.3% Doronina และ al., 1998), Prosthecomicrobium pneumaticum MBIC3489
(92.3 %; Staley, 1968 เจงกินส์ et al., 2005), Nesiotobacter exalbescens LA33B
T (91.5% Donachie และ al., 2006), แห้งระดับต่าง ๆ Pleomorphomonas IAM15079
TT (91.1% โยโกเจีย&ต้า 2005) และ Stappia
การแปล กรุณารอสักครู่..

การวิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยการใช้แพคเกจซอฟต์แวร์เวอร์ชัน 2.1 เมกะ
(ทำงานนอกเหนือหน้า et al . 2001 )หลังจาก alignments หลายๆชุดของข้อมูลโดยผ่านทาง clustal x (ธอมป์สัน et al . 1997 ) วิธีการ Matrix Storage ระยะทาง(ตัวเลือกระยะห่างตามรุ่น twoparameter ของใน)รวมถึงระบบคลัสเตอร์โดยเพื่อนบ้าน - เข้าร่วม( saitou & Chao Nei Dai Jie 1987 )(รูปที่1 )และวิธีการสูงสุด - ตระหนี่ถี่ถ้วนแบบตัวอักษรแบบแยกต่างหาก( Kluge & farris 1969 )ได้นำมาใช้ ในแต่ละกรณีค่า Bootstrap Processor ได้คำนวณตาม 1000 replications หมายเลข 16 S rrna ยีนที่มีความตึงเครียด CC sbabm 117
เชื่องยืดอย่างต่อเนื่องของ 1400 bp. การคำนวณขนาดของแหล่งจ่ายไฟออกตามลำดับที่ระบุว่าความเมื่อยล้า CC - sbabm 117
เชื่องที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมากที่สุดเพื่อ pannonibacter phragmitetus C 6/19
T ( 92.5%borsodi et al ., 2003 ), methylopila capsulata ฉัน 1 ~ t ( 92.3% , doronina et al ., 1998 ), prosthecomicrobium pneumaticum mbic 3489
( 92.3% ,จริงๆ!!, 1968 ;ว่าไง et al ., 2005 ), nesiotobacter exalbescens La 33 B
T ( 91.5% , donachie et al ., 2006 ), pleomorphomonas oryzae Kum Iam 15079
TT ( 91.1% ,เห& yokota , 2005 )และ stappia
การแปล กรุณารอสักครู่..
